MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_021902	CG	3	6	4884826	4884831	0 %	0 %	50 %	50 %	528821523
103002	NC_021902	CGC	2	6	4884860	4884865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821523
103003	NC_021902	CAGG	2	8	4884869	4884876	25 %	0 %	50 %	25 %	528821523
103004	NC_021902	TCC	2	6	4884882	4884887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528821523
103005	NC_021902	CGCC	2	8	4884943	4884950	0 %	0 %	25 %	75 %	528821523
103006	NC_021902	GCC	4	12	4884956	4884967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821523
103007	NC_021902	CTG	2	6	4885001	4885006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821523
103008	NC_021902	CCAGCG	2	12	4885015	4885026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	528821523
103009	NC_021902	TGCCC	2	10	4885027	4885036	0 %	20 %	20 %	60 %	528821523
103010	NC_021902	CGG	2	6	4885061	4885066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821523
103011	NC_021902	CTG	3	9	4885082	4885090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821523
103012	NC_021902	GCTTTC	2	12	4885104	4885115	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	528821523
103013	NC_021902	TCA	2	6	4885119	4885124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821523
103014	NC_021902	CGC	2	6	4885150	4885155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821523
103015	NC_021902	CCG	2	6	4885186	4885191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821523
103016	NC_021902	CG	3	6	4885230	4885235	0 %	0 %	50 %	50 %	528821523
103017	NC_021902	GAG	2	6	4885236	4885241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528821523
103018	NC_021902	ACGCC	2	10	4885243	4885252	20 %	0 %	20 %	60 %	528821523
103019	NC_021902	CCG	2	6	4885267	4885272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821523
103020	NC_021902	TTC	2	6	4885301	4885306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528821523
103021	NC_021902	CAT	2	6	4885319	4885324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821523
103022	NC_021902	T	6	6	4885420	4885425	0 %	100 %	0 %	0 %	528821523
103023	NC_021902	GCG	2	6	4885429	4885434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821523
103024	NC_021902	GC	3	6	4885459	4885464	0 %	0 %	50 %	50 %	528821523
103025	NC_021902	CG	3	6	4885472	4885477	0 %	0 %	50 %	50 %	528821523
103026	NC_021902	CAT	2	6	4885526	4885531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821523
103027	NC_021902	CTGACG	2	12	4885618	4885629	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528821524
103028	NC_021902	GCG	2	6	4885682	4885687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821524
103029	NC_021902	CTCA	2	8	4885696	4885703	25 %	25 %	0 %	50 %	528821524
103030	NC_021902	TGC	2	6	4885716	4885721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821524
103031	NC_021902	TCAA	2	8	4885757	4885764	50 %	25 %	0 %	25 %	528821524
103032	NC_021902	GCC	2	6	4885774	4885779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821524
103033	NC_021902	AG	3	6	4885810	4885815	50 %	0 %	50 %	0 %	528821524
103034	NC_021902	CCG	2	6	4885826	4885831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821524
103035	NC_021902	TGA	2	6	4885848	4885853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821524
103036	NC_021902	GC	3	6	4885854	4885859	0 %	0 %	50 %	50 %	528821524
103037	NC_021902	ACT	2	6	4885970	4885975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821524
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103039	NC_021902	GCCGG	2	10	4886027	4886036	0 %	0 %	60 %	40 %	528821524
103040	NC_021902	CCG	2	6	4886120	4886125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821524
103041	NC_021902	AGCG	2	8	4886147	4886154	25 %	0 %	50 %	25 %	528821524
103042	NC_021902	GTC	2	6	4886173	4886178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821524
103043	NC_021902	AGT	2	6	4886218	4886223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821524
103044	NC_021902	T	7	7	4886253	4886259	0 %	100 %	0 %	0 %	528821524
103045	NC_021902	CAG	2	6	4886347	4886352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821524
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103047	NC_021902	GCC	3	9	4886516	4886524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821524
103048	NC_021902	GAA	2	6	4886532	4886537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821524
103049	NC_021902	TCG	2	6	4886627	4886632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821524
103050	NC_021902	CAA	2	6	4886661	4886666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821524
103051	NC_021902	AAC	2	6	4886687	4886692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821524
103052	NC_021902	CAG	2	6	4886716	4886721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821524
103053	NC_021902	GCC	2	6	4886944	4886949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821524
103054	NC_021902	AC	3	6	4887028	4887033	50 %	0 %	0 %	50 %	528821524
103055	NC_021902	CG	3	6	4887090	4887095	0 %	0 %	50 %	50 %	528821524
103056	NC_021902	CCG	2	6	4887176	4887181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821524
103057	NC_021902	CAC	2	6	4887262	4887267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821524
103058	NC_021902	GC	3	6	4887311	4887316	0 %	0 %	50 %	50 %	528821524
103059	NC_021902	GC	3	6	4887321	4887326	0 %	0 %	50 %	50 %	528821524
103060	NC_021902	GTG	3	9	4887353	4887361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821524
103061	NC_021902	TTTA	2	8	4887384	4887391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103062	NC_021902	CTCA	2	8	4887440	4887447	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103063	NC_021902	TAC	2	6	4887459	4887464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103064	NC_021902	ATT	2	6	4887511	4887516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103065	NC_021902	TATT	2	8	4887535	4887542	25 %	75 %	0 %	0 %	528821525
103066	NC_021902	TTG	2	6	4887610	4887615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821525
103067	NC_021902	ACCT	2	8	4887649	4887656	25 %	25 %	0 %	50 %	528821525
103068	NC_021902	TCG	2	6	4887716	4887721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821525
103069	NC_021902	TGA	2	6	4887789	4887794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821525
103070	NC_021902	TCGCG	2	10	4887795	4887804	0 %	20 %	40 %	40 %	528821525
103071	NC_021902	CGG	2	6	4887835	4887840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821525
103072	NC_021902	GGC	2	6	4887939	4887944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528821525
103073	NC_021902	GC	3	6	4887943	4887948	0 %	0 %	50 %	50 %	528821525
103074	NC_021902	CAG	2	6	4887961	4887966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821525
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103077	NC_021902	GAA	2	6	4888034	4888039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821525
103078	NC_021902	CATCG	2	10	4888042	4888051	20 %	20 %	20 %	40 %	528821525
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103081	NC_021902	GTG	2	6	4888118	4888123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528821525
103082	NC_021902	ACGG	2	8	4888173	4888180	25 %	0 %	50 %	25 %	528821525
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103085	NC_021902	T	6	6	4888456	4888461	0 %	100 %	0 %	0 %	528821525
103086	NC_021902	CGT	2	6	4888462	4888467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821525
103087	NC_021902	TTC	2	6	4888473	4888478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103088	NC_021902	TGT	2	6	4888501	4888506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528821526
103089	NC_021902	CGAC	2	8	4888580	4888587	25 %	0 %	25 %	50 %	528821526
103090	NC_021902	TCAAT	2	10	4888604	4888613	40 %	40 %	0 %	20 %	528821526
103091	NC_021902	CAC	2	6	4888680	4888685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821526
103092	NC_021902	CAT	2	6	4888746	4888751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528821526
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103098	NC_021902	GC	3	6	4889155	4889160	0 %	0 %	50 %	50 %	528821527
103099	NC_021902	GCC	2	6	4889166	4889171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821527
103100	NC_021902	TGA	2	6	4889209	4889214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821527
103101	NC_021902	CGGG	2	8	4889222	4889229	0 %	0 %	75 %	25 %	528821527
103102	NC_021902	TGC	2	6	4889262	4889267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821527
103103	NC_021902	CGT	2	6	4889276	4889281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528821527
103104	NC_021902	CAC	2	6	4889282	4889287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821527
103105	NC_021902	CAA	3	9	4889321	4889329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821527
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103107	NC_021902	GAT	2	6	4889353	4889358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821527
103108	NC_021902	GC	3	6	4889379	4889384	0 %	0 %	50 %	50 %	528821527
103109	NC_021902	ACA	2	6	4889440	4889445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528821527
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103112	NC_021902	CTGC	2	8	4889758	4889765	0 %	25 %	25 %	50 %	528821527
103113	NC_021902	ACC	2	6	4889777	4889782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821527
103114	NC_021902	T	6	6	4889801	4889806	0 %	100 %	0 %	0 %	528821527
103115	NC_021902	GC	3	6	4889825	4889830	0 %	0 %	50 %	50 %	528821527
103116	NC_021902	GTA	2	6	4889874	4889879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821527
103117	NC_021902	CCA	2	6	4889929	4889934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821527
103118	NC_021902	ATG	2	6	4889982	4889987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821527
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103130	NC_021902	CTC	2	6	4890454	4890459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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103132	NC_021902	ATA	2	6	4890574	4890579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103135	NC_021902	T	6	6	4890758	4890763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103136	NC_021902	TCC	2	6	4890800	4890805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103137	NC_021902	GC	3	6	4890814	4890819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103138	NC_021902	CTT	2	6	4890836	4890841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103139	NC_021902	TTC	2	6	4890858	4890863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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103223	NC_021902	GACT	2	8	4895597	4895604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103224	NC_021902	TC	3	6	4895695	4895700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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103230	NC_021902	CA	3	6	4896170	4896175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103231	NC_021902	CTTT	2	8	4896257	4896264	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103232	NC_021902	ATG	2	6	4896267	4896272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103233	NC_021902	GCT	2	6	4896273	4896278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103234	NC_021902	GTT	2	6	4896363	4896368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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103236	NC_021902	GT	3	6	4896400	4896405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103237	NC_021902	TCGGT	2	10	4896609	4896618	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103238	NC_021902	CA	3	6	4896793	4896798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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103240	NC_021902	GTCA	2	8	4896906	4896913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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103471	NC_021902	AAG	2	6	4907567	4907572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821538
103472	NC_021902	ACC	2	6	4907641	4907646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821538
103473	NC_021902	CGA	2	6	4907679	4907684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821538
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103475	NC_021902	CAT	2	6	4907782	4907787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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103481	NC_021902	TAGC	2	8	4908184	4908191	25 %	25 %	25 %	25 %	528821539
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103492	NC_021902	GCC	3	9	4908706	4908714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528821539
103493	NC_021902	TAACAA	2	12	4908737	4908748	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	528821539
103494	NC_021902	AGC	2	6	4908766	4908771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821539
103495	NC_021902	A	6	6	4908875	4908880	100 %	0 %	0 %	0 %	528821539
103496	NC_021902	CAG	2	6	4908933	4908938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821539
103497	NC_021902	GAA	2	6	4908969	4908974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528821539
103498	NC_021902	AGT	2	6	4909025	4909030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528821539
103499	NC_021902	ACG	2	6	4909040	4909045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528821539
103500	NC_021902	CAC	2	6	4909137	4909142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528821539

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