MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. USMARC-S3124.1

Total Repeats: 103630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021902	GCGA	2	8	22956	22963	25 %	0 %	50 %	25 %	528816740
502	NC_021902	CAG	2	6	23064	23069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816740
503	NC_021902	GCT	2	6	23078	23083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816740
504	NC_021902	GCC	2	6	23104	23109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816740
505	NC_021902	ACG	2	6	23128	23133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816740
506	NC_021902	CG	3	6	23147	23152	0 %	0 %	50 %	50 %	528816740
507	NC_021902	CGA	2	6	23162	23167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816740
508	NC_021902	TGA	2	6	23233	23238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816740
509	NC_021902	ATG	2	6	23244	23249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816740
510	NC_021902	TCT	2	6	23347	23352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816740
511	NC_021902	CGG	2	6	23384	23389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816740
512	NC_021902	GCT	2	6	23405	23410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816740
513	NC_021902	GCGCT	2	10	23457	23466	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
514	NC_021902	CG	3	6	23550	23555	0 %	0 %	50 %	50 %	528816741
515	NC_021902	CGT	2	6	23593	23598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816741
516	NC_021902	GATC	2	8	23610	23617	25 %	25 %	25 %	25 %	528816741
517	NC_021902	CGC	2	6	23662	23667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816741
518	NC_021902	GC	3	6	23679	23684	0 %	0 %	50 %	50 %	528816741
519	NC_021902	ATC	2	6	23695	23700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816741
520	NC_021902	CGC	2	6	23740	23745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816741
521	NC_021902	AAT	2	6	23814	23819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816741
522	NC_021902	TGC	2	6	23846	23851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816741
523	NC_021902	CAG	2	6	23905	23910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816741
524	NC_021902	CG	3	6	23965	23970	0 %	0 %	50 %	50 %	528816741
525	NC_021902	GC	3	6	24122	24127	0 %	0 %	50 %	50 %	528816741
526	NC_021902	A	6	6	24169	24174	100 %	0 %	0 %	0 %	528816741
527	NC_021902	A	7	7	24278	24284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021902	CA	3	6	24289	24294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_021902	CCT	2	6	24341	24346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_021902	CAA	2	6	24370	24375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816742
531	NC_021902	CAC	2	6	24378	24383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816742
532	NC_021902	ACG	2	6	24439	24444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816742
533	NC_021902	ACC	2	6	24559	24564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816742
534	NC_021902	TGGCGC	2	12	24620	24631	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528816742
535	NC_021902	GAT	2	6	24768	24773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816742
536	NC_021902	ATG	2	6	24835	24840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816742
537	NC_021902	TCG	2	6	24863	24868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816742
538	NC_021902	TGC	2	6	24917	24922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816742
539	NC_021902	TAT	2	6	24942	24947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	528816742
540	NC_021902	GCG	2	6	24976	24981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816742
541	NC_021902	CAT	2	6	24993	24998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816742
542	NC_021902	ACG	2	6	25003	25008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816742
543	NC_021902	CGC	2	6	25058	25063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816742
544	NC_021902	CTC	2	6	25164	25169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816742
545	NC_021902	TGTT	2	8	25247	25254	0 %	75 %	25 %	0 %	528816742
546	NC_021902	CGG	2	6	25358	25363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816742
547	NC_021902	CTG	2	6	25384	25389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816742
548	NC_021902	CGC	2	6	25403	25408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816742
549	NC_021902	GCC	2	6	25422	25427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816742
550	NC_021902	CGG	3	9	25433	25441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816742
551	NC_021902	GC	3	6	25442	25447	0 %	0 %	50 %	50 %	528816742
552	NC_021902	TGA	2	6	25466	25471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816742
553	NC_021902	CGG	2	6	25532	25537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816742
554	NC_021902	ATG	2	6	25540	25545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816742
555	NC_021902	TGA	2	6	25601	25606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816742
556	NC_021902	TGA	2	6	25699	25704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816742
557	NC_021902	G	6	6	25724	25729	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021902	CCA	2	6	25820	25825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816743
559	NC_021902	CGC	2	6	25862	25867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816743
560	NC_021902	TCA	2	6	25886	25891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816743
561	NC_021902	GAT	2	6	25925	25930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816743
562	NC_021902	GC	4	8	25938	25945	0 %	0 %	50 %	50 %	528816743
563	NC_021902	GCT	2	6	26000	26005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816743
564	NC_021902	TTC	2	6	26035	26040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816743
565	NC_021902	GCC	2	6	26043	26048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816743
566	NC_021902	GAC	2	6	26082	26087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816743
567	NC_021902	GCTG	2	8	26127	26134	0 %	25 %	50 %	25 %	528816743
568	NC_021902	CTG	2	6	26148	26153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816743
569	NC_021902	GCG	2	6	26195	26200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816743
570	NC_021902	CCA	2	6	26243	26248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816743
571	NC_021902	CAG	2	6	26280	26285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816743
572	NC_021902	T	6	6	26322	26327	0 %	100 %	0 %	0 %	528816743
573	NC_021902	GGC	2	6	26357	26362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816744
574	NC_021902	GAC	2	6	26386	26391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816744
575	NC_021902	GC	3	6	26406	26411	0 %	0 %	50 %	50 %	528816744
576	NC_021902	GC	3	6	26551	26556	0 %	0 %	50 %	50 %	528816744
577	NC_021902	TCAT	2	8	26604	26611	25 %	50 %	0 %	25 %	528816744
578	NC_021902	TGA	2	6	26650	26655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816744
579	NC_021902	GGT	2	6	26801	26806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816744
580	NC_021902	ACGCC	2	10	26809	26818	20 %	0 %	20 %	60 %	528816744
581	NC_021902	AAT	2	6	26894	26899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816744
582	NC_021902	AAG	2	6	26948	26953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816744
583	NC_021902	TCG	2	6	26978	26983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816744
584	NC_021902	GCAG	2	8	26988	26995	25 %	0 %	50 %	25 %	528816744
585	NC_021902	AG	3	6	27023	27028	50 %	0 %	50 %	0 %	528816744
586	NC_021902	GGT	2	6	27238	27243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816745
587	NC_021902	CA	3	6	27286	27291	50 %	0 %	0 %	50 %	528816745
588	NC_021902	ATA	2	6	27323	27328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816745
589	NC_021902	GC	3	6	27381	27386	0 %	0 %	50 %	50 %	528816745
590	NC_021902	TGG	2	6	27400	27405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816745
591	NC_021902	GCGCG	2	10	27429	27438	0 %	0 %	60 %	40 %	528816745
592	NC_021902	GGC	2	6	27465	27470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816745
593	NC_021902	CAT	2	6	27542	27547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816745
594	NC_021902	GAT	2	6	27638	27643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816745
595	NC_021902	ACA	2	6	27677	27682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816745
596	NC_021902	AATC	2	8	27689	27696	50 %	25 %	0 %	25 %	528816745
597	NC_021902	CTG	2	6	27849	27854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816745
598	NC_021902	ATC	3	9	27874	27882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816745
599	NC_021902	GCG	2	6	27884	27889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816745
600	NC_021902	GCC	2	6	27895	27900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816745
601	NC_021902	CG	3	6	27917	27922	0 %	0 %	50 %	50 %	528816745
602	NC_021902	TGA	2	6	27928	27933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816745
603	NC_021902	GCG	2	6	28004	28009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816745
604	NC_021902	GCG	2	6	28025	28030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816745
605	NC_021902	CCG	2	6	28088	28093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816745
606	NC_021902	TTC	2	6	28195	28200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816746
607	NC_021902	CAG	2	6	28240	28245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
608	NC_021902	GCC	2	6	28313	28318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528816746
609	NC_021902	TGA	2	6	28333	28338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816746
610	NC_021902	GC	3	6	28382	28387	0 %	0 %	50 %	50 %	528816746
611	NC_021902	AACC	2	8	28428	28435	50 %	0 %	0 %	50 %	528816746
612	NC_021902	GAC	2	6	28591	28596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
613	NC_021902	CAG	2	6	28666	28671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
614	NC_021902	GTG	2	6	28718	28723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816746
615	NC_021902	A	6	6	28742	28747	100 %	0 %	0 %	0 %	528816746
616	NC_021902	CGG	3	9	28764	28772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816746
617	NC_021902	CGA	2	6	28774	28779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
618	NC_021902	AGCC	2	8	28798	28805	25 %	0 %	25 %	50 %	528816746
619	NC_021902	AAT	2	6	28852	28857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816746
620	NC_021902	CAC	2	6	28921	28926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816746
621	NC_021902	AAT	2	6	28964	28969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816746
622	NC_021902	TCG	2	6	28994	28999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816746
623	NC_021902	CCA	2	6	29025	29030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816746
624	NC_021902	AGC	2	6	29034	29039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
625	NC_021902	GAA	2	6	29058	29063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816746
626	NC_021902	CAT	2	6	29119	29124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528816746
627	NC_021902	GC	3	6	29133	29138	0 %	0 %	50 %	50 %	528816746
628	NC_021902	CGA	2	6	29139	29144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816746
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671	NC_021902	TCT	2	6	31253	31258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816748
672	NC_021902	GAA	2	6	31263	31268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816748
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756	NC_021902	GGC	2	6	35562	35567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816752
757	NC_021902	CTC	2	6	35598	35603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528816752
758	NC_021902	CG	4	8	35660	35667	0 %	0 %	50 %	50 %	528816752
759	NC_021902	CTGC	2	8	35829	35836	0 %	25 %	25 %	50 %	528816752
760	NC_021902	GAC	2	6	35856	35861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816752
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763	NC_021902	CGG	2	6	36122	36127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816752
764	NC_021902	TAA	2	6	36158	36163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	528816752
765	NC_021902	CG	3	6	36168	36173	0 %	0 %	50 %	50 %	528816752
766	NC_021902	TGG	2	6	36205	36210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816752
767	NC_021902	GAA	2	6	36245	36250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816752
768	NC_021902	GCA	2	6	36306	36311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816752
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770	NC_021902	GAA	2	6	36396	36401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528816752
771	NC_021902	CGG	2	6	36428	36433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816752
772	NC_021902	GCG	2	6	36552	36557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816752
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776	NC_021902	AC	4	8	36715	36722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
777	NC_021902	AT	3	6	36743	36748	50 %	50 %	0 %	0 %	528816753
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781	NC_021902	CGG	2	6	37124	37129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816753
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785	NC_021902	CAG	2	6	37368	37373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528816753
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787	NC_021902	GC	3	6	37531	37536	0 %	0 %	50 %	50 %	528816753
788	NC_021902	CG	3	6	37555	37560	0 %	0 %	50 %	50 %	528816753
789	NC_021902	GCGG	2	8	37624	37631	0 %	0 %	75 %	25 %	528816753
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801	NC_021902	CGG	2	6	38184	38189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816754
802	NC_021902	AACTGG	2	12	38234	38245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	528816754
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823	NC_021902	CGT	2	6	39025	39030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528816754
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827	NC_021902	GC	3	6	39214	39219	0 %	0 %	50 %	50 %	528816754
828	NC_021902	CTCTC	2	10	39232	39241	0 %	40 %	0 %	60 %	528816754
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832	NC_021902	CTT	2	6	39384	39389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528816754
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851	NC_021902	CAC	2	6	40477	40482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816755
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855	NC_021902	GTTT	2	8	40697	40704	0 %	75 %	25 %	0 %	528816755
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862	NC_021902	CAA	2	6	40956	40961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	528816755
863	NC_021902	GGC	2	6	40969	40974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528816755
864	NC_021902	CAC	2	6	41008	41013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528816755
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866	NC_021902	CG	3	6	41149	41154	0 %	0 %	50 %	50 %	528816755
867	NC_021902	CTGC	2	8	41265	41272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
868	NC_021902	GCAG	2	8	41276	41283	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
869	NC_021902	TGGT	2	8	41307	41314	0 %	50 %	50 %	0 %	528816756
870	NC_021902	T	6	6	41317	41322	0 %	100 %	0 %	0 %	528816756
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879	NC_021902	GTA	2	6	41755	41760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816756
880	NC_021902	GGT	2	6	41806	41811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528816756
881	NC_021902	GCAT	2	8	41822	41829	25 %	25 %	25 %	25 %	528816756
882	NC_021902	GAT	2	6	41836	41841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528816756
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