MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021871	CGGGC	2	10	1078	1087	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021871	CAGTT	2	10	4789	4798	20 %	40 %	20 %	20 %	526230606
3	NC_021871	CTGCC	2	10	11645	11654	0 %	20 %	20 %	60 %	526230609
4	NC_021871	ATGTT	2	10	13361	13370	20 %	60 %	20 %	0 %	526230610
5	NC_021871	TCAGC	2	10	20287	20296	20 %	20 %	20 %	40 %	526230616
6	NC_021871	CAGGT	2	10	20925	20934	20 %	20 %	40 %	20 %	526230616
7	NC_021871	ACGGT	2	10	23887	23896	20 %	20 %	40 %	20 %	526230620
8	NC_021871	TGTTC	2	10	24761	24770	0 %	60 %	20 %	20 %	526230622
9	NC_021871	TGAAC	2	10	24807	24816	40 %	20 %	20 %	20 %	526230622
10	NC_021871	GACCA	2	10	25791	25800	40 %	0 %	20 %	40 %	526230622
11	NC_021871	GCCAG	2	10	28571	28580	20 %	0 %	40 %	40 %	526230626
12	NC_021871	GCACG	2	10	31171	31180	20 %	0 %	40 %	40 %	526230631
13	NC_021871	GCCAT	2	10	32773	32782	20 %	20 %	20 %	40 %	526230634
14	NC_021871	ATCAC	2	10	33313	33322	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021871	GCAAA	2	10	33859	33868	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021871	CGGGC	2	10	35050	35059	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_021871	AGGAA	2	10	35518	35527	60 %	0 %	40 %	0 %	526230638
18	NC_021871	CCGCC	2	10	38479	38488	0 %	0 %	20 %	80 %	526230646
19	NC_021871	ACTGA	2	10	39832	39841	40 %	20 %	20 %	20 %	526230648
20	NC_021871	CTGCG	2	10	43723	43732	0 %	20 %	40 %	40 %	526230653
21	NC_021871	CTTTT	2	10	45060	45069	0 %	80 %	0 %	20 %	526230657
22	NC_021871	GGCCA	2	10	45258	45267	20 %	0 %	40 %	40 %	526230657
23	NC_021871	GGAGA	2	10	45726	45735	40 %	0 %	60 %	0 %	526230659
24	NC_021871	CGACA	2	10	46594	46603	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_021871	CGCAG	2	10	46644	46653	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_021871	CCGCC	2	10	46965	46974	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
27	NC_021871	TGCGC	2	10	47594	47603	0 %	20 %	40 %	40 %	526230665
28	NC_021871	GAAAT	2	10	48163	48172	60 %	20 %	20 %	0 %	526230666
29	NC_021871	ATTCC	2	10	48711	48720	20 %	40 %	0 %	40 %	526230667
30	NC_021871	CCAGC	2	10	49336	49345	20 %	0 %	20 %	60 %	526230669
31	NC_021871	CCCGT	2	10	51147	51156	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_021871	AGGGA	2	10	51239	51248	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021871	CGCCA	2	10	62038	62047	20 %	0 %	20 %	60 %	526230689
34	NC_021871	AAGTA	2	10	62280	62289	60 %	20 %	20 %	0 %	526230689
35	NC_021871	CTGGT	2	10	66297	66306	0 %	40 %	40 %	20 %	526230693
36	NC_021871	ACTGA	2	10	67374	67383	40 %	20 %	20 %	20 %	526230694
37	NC_021871	CATCA	2	10	68413	68422	40 %	20 %	0 %	40 %	526230700
38	NC_021871	ACGGC	2	10	71624	71633	20 %	0 %	40 %	40 %	526230705
39	NC_021871	TCACT	2	10	73115	73124	20 %	40 %	0 %	40 %	526230707
40	NC_021871	AGAAA	2	10	73336	73345	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021871	CCGGA	2	10	75076	75085	20 %	0 %	40 %	40 %	526230711
42	NC_021871	TTTTA	2	10	76226	76235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021871	CTCAA	2	10	79761	79770	40 %	20 %	0 %	40 %	526230717
44	NC_021871	TTATT	2	10	79819	79828	20 %	80 %	0 %	0 %	526230717
45	NC_021871	ATTTG	2	10	81982	81991	20 %	60 %	20 %	0 %	526230720
46	NC_021871	AAATT	2	10	84798	84807	60 %	40 %	0 %	0 %	526230720
47	NC_021871	GTATG	2	10	86725	86734	20 %	40 %	40 %	0 %	526230721
48	NC_021871	GTGAT	2	10	87399	87408	20 %	40 %	40 %	0 %	526230723
49	NC_021871	ATCGC	2	10	88184	88193	20 %	20 %	20 %	40 %	526230723
50	NC_021871	TTATC	2	10	88206	88215	20 %	60 %	0 %	20 %	526230723
51	NC_021871	ATTGG	2	10	88738	88747	20 %	40 %	40 %	0 %	526230724

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.