MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella bongori N268-08 plasmid RM1

Total Repeats: 1848

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021871	CGG	2	6	48100	48105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230666
1002	NC_021871	GAAAT	2	10	48163	48172	60 %	20 %	20 %	0 %	526230666
1003	NC_021871	CAG	2	6	48281	48286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230666
1004	NC_021871	TCA	2	6	48297	48302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230666
1005	NC_021871	T	6	6	48323	48328	0 %	100 %	0 %	0 %	526230666
1006	NC_021871	CGC	2	6	48389	48394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_021871	GCG	2	6	48399	48404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021871	AGC	2	6	48445	48450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230667
1009	NC_021871	GGC	2	6	48453	48458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230667
1010	NC_021871	GAT	2	6	48480	48485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230667
1011	NC_021871	TCA	2	6	48534	48539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230667
1012	NC_021871	CCG	2	6	48573	48578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230667
1013	NC_021871	ATCA	2	8	48598	48605	50 %	25 %	0 %	25 %	526230667
1014	NC_021871	TTC	3	9	48646	48654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230667
1015	NC_021871	ATTCC	2	10	48711	48720	20 %	40 %	0 %	40 %	526230667
1016	NC_021871	CCG	2	6	48741	48746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230667
1017	NC_021871	CTCA	2	8	48790	48797	25 %	25 %	0 %	50 %	526230667
1018	NC_021871	CGC	2	6	48884	48889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230668
1019	NC_021871	CGT	2	6	49086	49091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230669
1020	NC_021871	GGC	2	6	49093	49098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230669
1021	NC_021871	GC	3	6	49112	49117	0 %	0 %	50 %	50 %	526230669
1022	NC_021871	CGG	2	6	49200	49205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230669
1023	NC_021871	GT	3	6	49258	49263	0 %	50 %	50 %	0 %	526230669
1024	NC_021871	TCGG	2	8	49304	49311	0 %	25 %	50 %	25 %	526230669
1025	NC_021871	GTG	2	6	49312	49317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230669
1026	NC_021871	CCAGC	2	10	49336	49345	20 %	0 %	20 %	60 %	526230669
1027	NC_021871	T	6	6	49552	49557	0 %	100 %	0 %	0 %	526230669
1028	NC_021871	TCG	2	6	49598	49603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230669
1029	NC_021871	ATA	2	6	49706	49711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230669
1030	NC_021871	AGG	2	6	49774	49779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021871	CTG	2	6	49802	49807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_021871	CGC	2	6	49821	49826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_021871	T	7	7	49871	49877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021871	CGC	2	6	49975	49980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_021871	GTCC	2	8	49990	49997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_021871	CG	3	6	50041	50046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_021871	AGC	2	6	50059	50064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021871	CAT	2	6	50069	50074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_021871	CCTG	2	8	50079	50086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_021871	TCG	2	6	50154	50159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230670
1041	NC_021871	ATG	2	6	50253	50258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230670
1042	NC_021871	CTG	2	6	50278	50283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230670
1043	NC_021871	CCA	2	6	50327	50332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230670
1044	NC_021871	CAA	2	6	50437	50442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230670
1045	NC_021871	ATTG	2	8	50470	50477	25 %	50 %	25 %	0 %	526230671
1046	NC_021871	CAT	2	6	50514	50519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230671
1047	NC_021871	TGC	2	6	50525	50530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230671
1048	NC_021871	CGC	2	6	50542	50547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230671
1049	NC_021871	AG	3	6	50567	50572	50 %	0 %	50 %	0 %	526230671
1050	NC_021871	CAGC	2	8	50595	50602	25 %	0 %	25 %	50 %	526230671
1051	NC_021871	CAG	2	6	50615	50620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230671
1052	NC_021871	TCG	2	6	50627	50632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230671
1053	NC_021871	GTT	2	6	50649	50654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230671
1054	NC_021871	AC	3	6	50703	50708	50 %	0 %	0 %	50 %	526230671
1055	NC_021871	GTTCCA	2	12	50722	50733	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526230671
1056	NC_021871	TCA	2	6	50735	50740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230671
1057	NC_021871	CGC	2	6	50829	50834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230671
1058	NC_021871	AGG	2	6	50942	50947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021871	TCG	2	6	50986	50991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_021871	TCG	2	6	51044	51049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021871	ACG	2	6	51119	51124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021871	CCCGT	2	10	51147	51156	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1063	NC_021871	G	6	6	51185	51190	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021871	ACA	2	6	51226	51231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021871	AGGGA	2	10	51239	51248	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021871	AGG	2	6	51257	51262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_021871	CTC	2	6	51292	51297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_021871	TTA	2	6	51305	51310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230673
1069	NC_021871	ATA	2	6	51409	51414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230673
1070	NC_021871	TA	3	6	51418	51423	50 %	50 %	0 %	0 %	526230673
1071	NC_021871	CGG	2	6	51520	51525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230672
1072	NC_021871	GCCG	2	8	51536	51543	0 %	0 %	50 %	50 %	526230672
1073	NC_021871	GGA	3	9	51554	51562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230672
1074	NC_021871	TTC	2	6	51606	51611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230672
1075	NC_021871	CTG	2	6	51771	51776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230672
1076	NC_021871	GAA	2	6	51810	51815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230672
1077	NC_021871	GTG	2	6	51831	51836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230672
1078	NC_021871	TGG	2	6	51951	51956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230674
1079	NC_021871	TAA	2	6	51964	51969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230674
1080	NC_021871	CG	3	6	51985	51990	0 %	0 %	50 %	50 %	526230674
1081	NC_021871	CTG	2	6	52007	52012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230674
1082	NC_021871	GGA	2	6	52027	52032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230674
1083	NC_021871	AAG	2	6	52061	52066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230674
1084	NC_021871	AC	3	6	52071	52076	50 %	0 %	0 %	50 %	526230674
1085	NC_021871	CAC	2	6	52084	52089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230674
1086	NC_021871	GCA	2	6	52096	52101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230674
1087	NC_021871	TCA	2	6	52122	52127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230674
1088	NC_021871	CCG	2	6	52208	52213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230674
1089	NC_021871	CAG	2	6	52217	52222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230674
1090	NC_021871	ACG	2	6	52256	52261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230674
1091	NC_021871	GGCA	2	8	52275	52282	25 %	0 %	50 %	25 %	526230674
1092	NC_021871	GCC	2	6	52304	52309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230674
1093	NC_021871	CAT	2	6	52447	52452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230674
1094	NC_021871	AGGC	2	8	52509	52516	25 %	0 %	50 %	25 %	526230674
1095	NC_021871	TTTG	2	8	52561	52568	0 %	75 %	25 %	0 %	526230674
1096	NC_021871	GAGC	2	8	52591	52598	25 %	0 %	50 %	25 %	526230674
1097	NC_021871	ACT	2	6	52696	52701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230674
1098	NC_021871	ATAA	2	8	52789	52796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021871	ATT	2	6	52837	52842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230675
1100	NC_021871	TC	3	6	52853	52858	0 %	50 %	0 %	50 %	526230675
1101	NC_021871	CG	3	6	52953	52958	0 %	0 %	50 %	50 %	526230675
1102	NC_021871	TTC	2	6	52970	52975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230675
1103	NC_021871	AGG	2	6	53012	53017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230675
1104	NC_021871	TCG	2	6	53076	53081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230675
1105	NC_021871	CAT	2	6	53110	53115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230675
1106	NC_021871	GCC	2	6	53262	53267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230675
1107	NC_021871	TTGA	2	8	53324	53331	25 %	50 %	25 %	0 %	526230675
1108	NC_021871	TCA	2	6	53424	53429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230675
1109	NC_021871	GAA	2	6	53552	53557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230675
1110	NC_021871	CTG	2	6	53558	53563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230675
1111	NC_021871	ATA	2	6	53580	53585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230675
1112	NC_021871	CTT	2	6	53730	53735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230675
1113	NC_021871	GTCA	2	8	53741	53748	25 %	25 %	25 %	25 %	526230675
1114	NC_021871	TCT	2	6	53795	53800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230675
1115	NC_021871	GCT	2	6	53876	53881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230676
1116	NC_021871	CAT	2	6	53913	53918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230676
1117	NC_021871	CTT	2	6	54021	54026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230676
1118	NC_021871	GT	3	6	54107	54112	0 %	50 %	50 %	0 %	526230676
1119	NC_021871	TCGA	2	8	54122	54129	25 %	25 %	25 %	25 %	526230676
1120	NC_021871	GGCT	2	8	54147	54154	0 %	25 %	50 %	25 %	526230676
1121	NC_021871	GAA	2	6	54167	54172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230676
1122	NC_021871	GGA	2	6	54191	54196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230676
1123	NC_021871	CA	3	6	54357	54362	50 %	0 %	0 %	50 %	526230676
1124	NC_021871	TTC	2	6	54460	54465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230676
1125	NC_021871	AGC	2	6	54493	54498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230676
1126	NC_021871	TACA	2	8	54675	54682	50 %	25 %	0 %	25 %	526230676
1127	NC_021871	TA	3	6	54876	54881	50 %	50 %	0 %	0 %	526230676
1128	NC_021871	GGC	2	6	54883	54888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230676
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1253	NC_021871	A	6	6	61498	61503	100 %	0 %	0 %	0 %	526230688
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1258	NC_021871	GAGC	2	8	61707	61714	25 %	0 %	50 %	25 %	526230687
1259	NC_021871	ATC	2	6	61720	61725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230687
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1273	NC_021871	T	6	6	62309	62314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_021871	GC	3	6	62347	62352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1275	NC_021871	TCA	2	6	62356	62361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_021871	TTG	2	6	62398	62403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230690
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1279	NC_021871	GATC	2	8	62573	62580	25 %	25 %	25 %	25 %	526230691
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1382	NC_021871	A	7	7	67316	67322	100 %	0 %	0 %	0 %	526230694
1383	NC_021871	ACTGA	2	10	67374	67383	40 %	20 %	20 %	20 %	526230694
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1499	NC_021871	A	6	6	74239	74244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1500	NC_021871	GT	3	6	74300	74305	0 %	50 %	50 %	0 %	526230710

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