MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella bongori N268-08

Total Repeats: 3226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021870	TCCGG	2	10	1322	1331	0 %	20 %	40 %	40 %	526225955
2	NC_021870	AGGTA	2	10	2578	2587	40 %	20 %	40 %	0 %	526225955
3	NC_021870	ATTGC	2	10	3421	3430	20 %	40 %	20 %	20 %	526225956
4	NC_021870	CGGCG	2	10	4169	4178	0 %	0 %	60 %	40 %	526225957
5	NC_021870	TGAGA	2	10	5892	5901	40 %	20 %	40 %	0 %	526225958
6	NC_021870	GGCCG	2	10	7029	7038	0 %	0 %	60 %	40 %	526225959
7	NC_021870	CCGCG	2	10	7206	7215	0 %	0 %	40 %	60 %	526225959
8	NC_021870	ATGAG	2	10	9320	9329	40 %	20 %	40 %	0 %	526225962
9	NC_021870	CGTGA	2	10	9373	9382	20 %	20 %	40 %	20 %	526225962
10	NC_021870	GAAAA	2	10	10530	10539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021870	AATAA	2	10	11284	11293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021870	TCTTT	2	10	11782	11791	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021870	GTTGC	2	10	13016	13025	0 %	40 %	40 %	20 %	526225967
14	NC_021870	GCGTG	2	10	14450	14459	0 %	20 %	60 %	20 %	526225968
15	NC_021870	AGGCG	2	10	14756	14765	20 %	0 %	60 %	20 %	526225968
16	NC_021870	TGTTT	2	10	15301	15310	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021870	TATTG	2	10	18036	18045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021870	AGAGC	2	10	19869	19878	40 %	0 %	40 %	20 %	526225973
19	NC_021870	TCTTA	2	10	24326	24335	20 %	60 %	0 %	20 %	526225975
20	NC_021870	CTGAA	2	10	24459	24468	40 %	20 %	20 %	20 %	526225975
21	NC_021870	TATTT	2	10	25934	25943	20 %	80 %	0 %	0 %	526225977
22	NC_021870	CGCAG	2	10	26888	26897	20 %	0 %	40 %	40 %	526225978
23	NC_021870	AGGCC	2	10	27822	27831	20 %	0 %	40 %	40 %	526225978
24	NC_021870	CAATG	2	10	28579	28588	40 %	20 %	20 %	20 %	526225978
25	NC_021870	CAGAA	2	10	29055	29064	60 %	0 %	20 %	20 %	526225979
26	NC_021870	TTACG	2	10	31519	31528	20 %	40 %	20 %	20 %	526225982
27	NC_021870	GCTAT	2	10	33615	33624	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021870	CAAAA	2	10	33899	33908	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021870	TTTGT	2	10	34161	34170	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021870	TGAAA	2	10	36235	36244	60 %	20 %	20 %	0 %	526225989
31	NC_021870	CTGGA	2	10	37337	37346	20 %	20 %	40 %	20 %	526225989
32	NC_021870	TTTTA	2	10	37814	37823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021870	ACGGT	2	10	40974	40983	20 %	20 %	40 %	20 %	526225992
34	NC_021870	TTTAT	2	10	41477	41486	20 %	80 %	0 %	0 %	526225992
35	NC_021870	GGGCT	2	10	42676	42685	0 %	20 %	60 %	20 %	526225993
36	NC_021870	TGTGC	2	10	45503	45512	0 %	40 %	40 %	20 %	526225997
37	NC_021870	TTCGC	2	10	46092	46101	0 %	40 %	20 %	40 %	526225997
38	NC_021870	TCACG	2	10	47173	47182	20 %	20 %	20 %	40 %	526225998
39	NC_021870	CGGCG	2	10	49482	49491	0 %	0 %	60 %	40 %	526225999
40	NC_021870	AGCGT	2	10	49592	49601	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021870	TTCAC	2	10	49738	49747	20 %	40 %	0 %	40 %	526226000
42	NC_021870	GAACG	2	10	54665	54674	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021870	GTGAT	2	10	54803	54812	20 %	40 %	40 %	0 %	526226006
44	NC_021870	ATTTA	2	10	54981	54990	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021870	GCGAA	2	10	58183	58192	40 %	0 %	40 %	20 %	526226008
46	NC_021870	TTGCC	2	10	60709	60718	0 %	40 %	20 %	40 %	526226010
47	NC_021870	CGTCC	2	10	60819	60828	0 %	20 %	20 %	60 %	526226010
48	NC_021870	AAGCG	2	10	61172	61181	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021870	TCAGC	2	10	63927	63936	20 %	20 %	20 %	40 %	526226013
50	NC_021870	GGCCA	2	10	64075	64084	20 %	0 %	40 %	40 %	526226013
51	NC_021870	GTACG	2	10	66646	66655	20 %	20 %	40 %	20 %	526226015
52	NC_021870	CAGAA	2	10	67359	67368	60 %	0 %	20 %	20 %	526226015
53	NC_021870	TTTTA	2	10	67880	67889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021870	TGATG	2	10	69148	69157	20 %	40 %	40 %	0 %	526226018
55	NC_021870	CCGCA	2	10	69478	69487	20 %	0 %	20 %	60 %	526226018
56	NC_021870	CGGTT	2	10	69983	69992	0 %	40 %	40 %	20 %	526226019
57	NC_021870	TGGCG	2	10	71764	71773	0 %	20 %	60 %	20 %	526226021
58	NC_021870	TAAAA	2	10	75085	75094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021870	TTCCC	2	10	75522	75531	0 %	40 %	0 %	60 %	526226025
60	NC_021870	GTGGC	2	10	76090	76099	0 %	20 %	60 %	20 %	526226025
61	NC_021870	TGCAC	2	10	78487	78496	20 %	20 %	20 %	40 %	526226028
62	NC_021870	ACGTT	2	10	79173	79182	20 %	40 %	20 %	20 %	526226029
63	NC_021870	AGCGC	2	10	81225	81234	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_021870	AACGT	2	10	82417	82426	40 %	20 %	20 %	20 %	526226032
65	NC_021870	ATCTG	2	10	85858	85867	20 %	40 %	20 %	20 %	526226036
66	NC_021870	CGGTA	2	10	86446	86455	20 %	20 %	40 %	20 %	526226036
67	NC_021870	GCTTC	2	10	86654	86663	0 %	40 %	20 %	40 %	526226036
68	NC_021870	TGATC	2	10	88641	88650	20 %	40 %	20 %	20 %	526226038
69	NC_021870	GGGCG	2	10	88791	88800	0 %	0 %	80 %	20 %	526226038
70	NC_021870	AAGCG	2	10	89138	89147	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021870	AAAGT	2	10	92642	92651	60 %	20 %	20 %	0 %	526226040
72	NC_021870	CGTGT	2	10	94802	94811	0 %	40 %	40 %	20 %	526226042
73	NC_021870	TAATT	2	10	95854	95863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021870	ATTTT	2	10	95880	95889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021870	CAGAT	2	10	96064	96073	40 %	20 %	20 %	20 %	526226044
76	NC_021870	GCGTG	2	10	96764	96773	0 %	20 %	60 %	20 %	526226045
77	NC_021870	CAGCG	2	10	97194	97203	20 %	0 %	40 %	40 %	526226046
78	NC_021870	TTGCC	2	10	102566	102575	0 %	40 %	20 %	40 %	526226050
79	NC_021870	GCGCA	2	10	102709	102718	20 %	0 %	40 %	40 %	526226050
80	NC_021870	CACCG	2	10	103271	103280	20 %	0 %	20 %	60 %	526226051
81	NC_021870	CCCAG	2	10	105260	105269	20 %	0 %	20 %	60 %	526226052
82	NC_021870	TAGTG	2	10	105892	105901	20 %	40 %	40 %	0 %	526226053
83	NC_021870	TTGGG	2	10	108060	108069	0 %	40 %	60 %	0 %	526226056
84	NC_021870	AAGCG	2	10	109157	109166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_021870	GGTAA	2	10	110843	110852	40 %	20 %	40 %	0 %	526226058
86	NC_021870	TGGTC	2	10	113866	113875	0 %	40 %	40 %	20 %	526226060
87	NC_021870	ATTCC	2	10	116238	116247	20 %	40 %	0 %	40 %	526226064
88	NC_021870	CCCGG	2	10	116423	116432	0 %	0 %	40 %	60 %	526226064
89	NC_021870	AAAGC	2	10	118539	118548	60 %	0 %	20 %	20 %	526226066
90	NC_021870	TTGTT	2	10	119658	119667	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021870	GACCC	2	10	120924	120933	20 %	0 %	20 %	60 %	526226068
92	NC_021870	AGTTC	2	10	121443	121452	20 %	40 %	20 %	20 %	526226068
93	NC_021870	GTTTG	2	10	128099	128108	0 %	60 %	40 %	0 %	526226074
94	NC_021870	CCTGG	2	10	128902	128911	0 %	20 %	40 %	40 %	526226075
95	NC_021870	CGTAT	2	10	129570	129579	20 %	40 %	20 %	20 %	526226075
96	NC_021870	CGGGG	2	10	130782	130791	0 %	0 %	80 %	20 %	526226076
97	NC_021870	ATCAG	2	10	131406	131415	40 %	20 %	20 %	20 %	526226077
98	NC_021870	TGCGT	2	10	135164	135173	0 %	40 %	40 %	20 %	526226080
99	NC_021870	CCTTG	2	10	138446	138455	0 %	40 %	20 %	40 %	526226083
100	NC_021870	CGCGG	2	10	138803	138812	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_021870	CCGGC	2	10	139507	139516	0 %	0 %	40 %	60 %	526226084
102	NC_021870	ACTCT	2	10	139721	139730	20 %	40 %	0 %	40 %	526226084
103	NC_021870	CGATG	2	10	142640	142649	20 %	20 %	40 %	20 %	526226086
104	NC_021870	TAGCG	2	10	147617	147626	20 %	20 %	40 %	20 %	526226092
105	NC_021870	AGTGT	2	10	147950	147959	20 %	40 %	40 %	0 %	526226092
106	NC_021870	GCCCG	2	10	148675	148684	0 %	0 %	40 %	60 %	526226093
107	NC_021870	GGCGC	2	10	151164	151173	0 %	0 %	60 %	40 %	526226096
108	NC_021870	ATGAC	2	10	151690	151699	40 %	20 %	20 %	20 %	526226096
109	NC_021870	CTGGA	2	10	152280	152289	20 %	20 %	40 %	20 %	526226097
110	NC_021870	TTCGC	2	10	152358	152367	0 %	40 %	20 %	40 %	526226097
111	NC_021870	CAGAA	2	10	154398	154407	60 %	0 %	20 %	20 %	526226099
112	NC_021870	ATGTG	2	10	156799	156808	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021870	TTATT	2	10	156861	156870	20 %	80 %	0 %	0 %	526226103
114	NC_021870	GCCGC	2	10	157672	157681	0 %	0 %	40 %	60 %	526226102
115	NC_021870	AAAGT	2	10	159004	159013	60 %	20 %	20 %	0 %	526226105
116	NC_021870	GACTG	2	10	162227	162236	20 %	20 %	40 %	20 %	526226109
117	NC_021870	AGCAA	2	10	162639	162648	60 %	0 %	20 %	20 %	526226109
118	NC_021870	TGGTC	2	10	165351	165360	0 %	40 %	40 %	20 %	526226110
119	NC_021870	AACGA	2	10	167505	167514	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021870	TGGCA	2	10	167738	167747	20 %	20 %	40 %	20 %	526226112
121	NC_021870	GGCCA	2	10	168160	168169	20 %	0 %	40 %	40 %	526226113
122	NC_021870	GCGCC	2	10	168173	168182	0 %	0 %	40 %	60 %	526226113
123	NC_021870	CCCAC	2	10	179499	179508	20 %	0 %	0 %	80 %	526226123
124	NC_021870	TGGTG	2	10	180006	180015	0 %	40 %	60 %	0 %	526226123
125	NC_021870	AAGCG	2	10	182089	182098	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021870	TTTCA	2	10	186515	186524	20 %	60 %	0 %	20 %	526226130
127	NC_021870	GCCGC	2	10	190216	190225	0 %	0 %	40 %	60 %	526226135
128	NC_021870	GCACT	2	10	190367	190376	20 %	20 %	20 %	40 %	526226135
129	NC_021870	GAACC	2	10	192450	192459	40 %	0 %	20 %	40 %	526226137
130	NC_021870	GCCCA	2	10	194016	194025	20 %	0 %	20 %	60 %	526226139
131	NC_021870	CGTTT	2	10	195578	195587	0 %	60 %	20 %	20 %	526226139
132	NC_021870	TTTTA	2	10	197347	197356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021870	CCGCG	2	10	201101	201110	0 %	0 %	40 %	60 %	526226145
134	NC_021870	GCCAG	2	10	201404	201413	20 %	0 %	40 %	40 %	526226145
135	NC_021870	CGGGG	2	10	203788	203797	0 %	0 %	80 %	20 %	526226149
136	NC_021870	GCGCA	2	10	204458	204467	20 %	0 %	40 %	40 %	526226149
137	NC_021870	ACGCA	2	10	204626	204635	40 %	0 %	20 %	40 %	526226149
138	NC_021870	GGCGA	2	10	205907	205916	20 %	0 %	60 %	20 %	526226149
139	NC_021870	GCCGT	2	10	207001	207010	0 %	20 %	40 %	40 %	526226150
140	NC_021870	GTACA	2	10	207034	207043	40 %	20 %	20 %	20 %	526226150
141	NC_021870	AACCT	2	10	212431	212440	40 %	20 %	0 %	40 %	526226154
142	NC_021870	GGCGT	2	10	213461	213470	0 %	20 %	60 %	20 %	526226155
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145	NC_021870	TGCTT	2	10	217584	217593	0 %	60 %	20 %	20 %	526226157
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147	NC_021870	ACTGG	2	10	225512	225521	20 %	20 %	40 %	20 %	526226165
148	NC_021870	AGTCC	2	10	226929	226938	20 %	20 %	20 %	40 %	526226165
149	NC_021870	TCGGA	2	10	229925	229934	20 %	20 %	40 %	20 %	526226167
150	NC_021870	CGGCG	2	10	231171	231180	0 %	0 %	60 %	40 %	526226168
151	NC_021870	CTGAA	2	10	235509	235518	40 %	20 %	20 %	20 %	526226171
152	NC_021870	AAGCG	2	10	235573	235582	40 %	0 %	40 %	20 %	526226171
153	NC_021870	TGGTG	2	10	237476	237485	0 %	40 %	60 %	0 %	526226173
154	NC_021870	TGCGC	2	10	237995	238004	0 %	20 %	40 %	40 %	526226173
155	NC_021870	GTCTG	2	10	238157	238166	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_021870	AGCAG	2	10	238555	238564	40 %	0 %	40 %	20 %	526226174
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159	NC_021870	CGGTA	2	10	242203	242212	20 %	20 %	40 %	20 %	526226180
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163	NC_021870	GTGAA	2	10	248267	248276	40 %	20 %	40 %	0 %	526226186
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169	NC_021870	TACGC	2	10	259866	259875	20 %	20 %	20 %	40 %	526226194
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171	NC_021870	ATTTT	2	10	263321	263330	20 %	80 %	0 %	0 %	526226199
172	NC_021870	GACCG	2	10	264222	264231	20 %	0 %	40 %	40 %	526226200
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174	NC_021870	ACCGC	2	10	266594	266603	20 %	0 %	20 %	60 %	526226203
175	NC_021870	GTGTT	2	10	267420	267429	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021870	TGGCG	2	10	267699	267708	0 %	20 %	60 %	20 %	526226204
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195	NC_021870	ATTTA	2	10	302901	302910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_021870	GAACG	2	10	303767	303776	40 %	0 %	40 %	20 %	526226234
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210	NC_021870	AAGAG	2	10	314299	314308	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
211	NC_021870	CTTTC	2	10	314707	314716	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
212	NC_021870	TAATA	2	10	316155	316164	60 %	40 %	0 %	0 %	526226248
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215	NC_021870	ATCAA	2	10	318875	318884	60 %	20 %	0 %	20 %	526226249
216	NC_021870	CTACA	2	10	319680	319689	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
217	NC_021870	TAATA	2	10	321624	321633	60 %	40 %	0 %	0 %	526226252
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241	NC_021870	GAATG	2	10	354008	354017	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
242	NC_021870	ATTTA	2	10	359137	359146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_021870	GGCTG	2	10	360450	360459	0 %	20 %	60 %	20 %	526226283
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247	NC_021870	AACGT	2	10	364375	364384	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
248	NC_021870	GTACG	2	10	366446	366455	20 %	20 %	40 %	20 %	526226287
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250	NC_021870	CGTGT	2	10	371948	371957	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
251	NC_021870	ACTTT	2	10	372003	372012	20 %	60 %	0 %	20 %	526226294
252	NC_021870	TGGTC	2	10	372014	372023	0 %	40 %	40 %	20 %	526226294
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254	NC_021870	CATTA	2	10	375551	375560	40 %	40 %	0 %	20 %	526226298
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257	NC_021870	GCGCG	2	10	379108	379117	0 %	0 %	60 %	40 %	526226303
258	NC_021870	CTACT	2	10	380497	380506	20 %	40 %	0 %	40 %	526226305
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265	NC_021870	CGGCG	2	10	388301	388310	0 %	0 %	60 %	40 %	526226313
266	NC_021870	CGTTG	2	10	390660	390669	0 %	40 %	40 %	20 %	526226315
267	NC_021870	ACTGG	2	10	391320	391329	20 %	20 %	40 %	20 %	526226315
268	NC_021870	ACAGG	2	10	392197	392206	40 %	0 %	40 %	20 %	526226315
269	NC_021870	AACGC	2	10	392977	392986	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_021870	GCCAT	2	10	393285	393294	20 %	20 %	20 %	40 %	526226317
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278	NC_021870	GGCGC	2	10	405459	405468	0 %	0 %	60 %	40 %	526226331
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