MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella bongori N268-08

Total Repeats: 96123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021870	AAAT	2	8	59	66	75 %	25 %	0 %	0 %	526225954
2	NC_021870	CAG	2	6	74	79	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225954
3	NC_021870	A	6	6	112	117	100 %	0 %	0 %	0 %	526225954
4	NC_021870	AGAC	2	8	163	170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021870	ACA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021870	CAC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021870	ACC	3	9	227	235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021870	ACC	2	6	242	247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021870	A	6	6	299	304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021870	T	8	8	328	335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021870	AAC	2	6	355	360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021870	CGG	2	6	379	384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225955
13	NC_021870	ACCA	2	8	491	498	50 %	0 %	0 %	50 %	526225955
14	NC_021870	TGG	2	6	501	506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526225955
15	NC_021870	GAT	2	6	508	513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225955
16	NC_021870	A	6	6	516	521	100 %	0 %	0 %	0 %	526225955
17	NC_021870	CGG	2	6	526	531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225955
18	NC_021870	CGT	2	6	637	642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225955
19	NC_021870	CTG	2	6	689	694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225955
20	NC_021870	CGC	2	6	718	723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225955
21	NC_021870	GTG	2	6	735	740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526225955
22	NC_021870	A	6	6	741	746	100 %	0 %	0 %	0 %	526225955
23	NC_021870	CAT	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526225955
24	NC_021870	GATC	2	8	802	809	25 %	25 %	25 %	25 %	526225955
25	NC_021870	CCG	2	6	874	879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225955
26	NC_021870	CGC	2	6	883	888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225955
27	NC_021870	CGA	2	6	901	906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225955
28	NC_021870	CCTGAT	2	12	910	921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526225955
29	NC_021870	CTG	2	6	933	938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225955
30	NC_021870	TGG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526225955
31	NC_021870	GCC	2	6	1004	1009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225955
32	NC_021870	GGAC	2	8	1038	1045	25 %	0 %	50 %	25 %	526225955
33	NC_021870	GT	3	6	1053	1058	0 %	50 %	50 %	0 %	526225955
34	NC_021870	A	6	6	1207	1212	100 %	0 %	0 %	0 %	526225955
35	NC_021870	AAT	2	6	1298	1303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526225955
36	NC_021870	TCCGG	2	10	1322	1331	0 %	20 %	40 %	40 %	526225955
37	NC_021870	GGC	2	6	1354	1359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225955
38	NC_021870	GC	3	6	1358	1363	0 %	0 %	50 %	50 %	526225955
39	NC_021870	CCA	2	6	1371	1376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526225955
40	NC_021870	CG	3	6	1466	1471	0 %	0 %	50 %	50 %	526225955
41	NC_021870	AAG	2	6	1509	1514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526225955
42	NC_021870	GGT	2	6	1561	1566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526225955
43	NC_021870	TTC	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526225955
44	NC_021870	ACG	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225955
45	NC_021870	CCA	2	6	1726	1731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526225955
46	NC_021870	CGG	2	6	1780	1785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225955
47	NC_021870	CGG	2	6	1789	1794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225955
48	NC_021870	AGC	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225955
49	NC_021870	CAA	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526225955
50	NC_021870	GAA	2	6	1834	1839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526225955
51	NC_021870	GT	3	6	1857	1862	0 %	50 %	50 %	0 %	526225955
52	NC_021870	GCG	2	6	1863	1868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225955
53	NC_021870	GTT	2	6	1885	1890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526225955
54	NC_021870	GCAA	2	8	1939	1946	50 %	0 %	25 %	25 %	526225955
55	NC_021870	ATC	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526225955
56	NC_021870	TCG	2	6	2013	2018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225955
57	NC_021870	CCAG	2	8	2028	2035	25 %	0 %	25 %	50 %	526225955
58	NC_021870	TGT	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526225955
59	NC_021870	TCG	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225955
60	NC_021870	ATT	2	6	2121	2126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526225955
61	NC_021870	CGC	2	6	2143	2148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225955
62	NC_021870	ACG	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225955
63	NC_021870	CTG	2	6	2225	2230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225955
64	NC_021870	TC	3	6	2266	2271	0 %	50 %	0 %	50 %	526225955
65	NC_021870	CT	3	6	2279	2284	0 %	50 %	0 %	50 %	526225955
66	NC_021870	GC	3	6	2339	2344	0 %	0 %	50 %	50 %	526225955
67	NC_021870	CG	3	6	2370	2375	0 %	0 %	50 %	50 %	526225955
68	NC_021870	GCC	2	6	2549	2554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225955
69	NC_021870	TGA	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225955
70	NC_021870	AGGTA	2	10	2578	2587	40 %	20 %	40 %	0 %	526225955
71	NC_021870	GT	3	6	2621	2626	0 %	50 %	50 %	0 %	526225955
72	NC_021870	TAT	2	6	2711	2716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526225955
73	NC_021870	CGG	2	6	2766	2771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225955
74	NC_021870	GT	3	6	2775	2780	0 %	50 %	50 %	0 %	526225955
75	NC_021870	CTG	2	6	2789	2794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225955
76	NC_021870	CGT	2	6	3131	3136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225956
77	NC_021870	ATGA	2	8	3153	3160	50 %	25 %	25 %	0 %	526225956
78	NC_021870	GAT	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225956
79	NC_021870	GCA	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225956
80	NC_021870	TGA	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225956
81	NC_021870	GAA	2	6	3291	3296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526225956
82	NC_021870	CAGC	2	8	3308	3315	25 %	0 %	25 %	50 %	526225956
83	NC_021870	GC	4	8	3384	3391	0 %	0 %	50 %	50 %	526225956
84	NC_021870	CCG	2	6	3410	3415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225956
85	NC_021870	ATTGC	2	10	3421	3430	20 %	40 %	20 %	20 %	526225956
86	NC_021870	GCC	2	6	3489	3494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225956
87	NC_021870	TGA	2	6	3499	3504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225956
88	NC_021870	CG	4	8	3528	3535	0 %	0 %	50 %	50 %	526225956
89	NC_021870	CTGG	2	8	3668	3675	0 %	25 %	50 %	25 %	526225956
90	NC_021870	CGG	2	6	3730	3735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225956
91	NC_021870	CAG	2	6	3834	3839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225957
92	NC_021870	T	8	8	3844	3851	0 %	100 %	0 %	0 %	526225957
93	NC_021870	GGA	2	6	3974	3979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526225957
94	NC_021870	CG	3	6	3987	3992	0 %	0 %	50 %	50 %	526225957
95	NC_021870	GTT	2	6	4049	4054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526225957
96	NC_021870	CGG	2	6	4085	4090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225957
97	NC_021870	GCG	2	6	4123	4128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225957
98	NC_021870	CGGCG	2	10	4169	4178	0 %	0 %	60 %	40 %	526225957
99	NC_021870	GTC	2	6	4215	4220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225957
100	NC_021870	GGC	2	6	4278	4283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225957
101	NC_021870	GAC	3	9	4350	4358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225957
102	NC_021870	GCC	2	6	4408	4413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225957
103	NC_021870	CTA	2	6	4430	4435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526225957
104	NC_021870	CG	3	6	4466	4471	0 %	0 %	50 %	50 %	526225957
105	NC_021870	TGG	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526225957
106	NC_021870	CGC	2	6	4568	4573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225957
107	NC_021870	GATG	2	8	4658	4665	25 %	25 %	50 %	0 %	526225957
108	NC_021870	TCAG	2	8	4666	4673	25 %	25 %	25 %	25 %	526225957
109	NC_021870	CG	3	6	4687	4692	0 %	0 %	50 %	50 %	526225957
110	NC_021870	CCG	2	6	4706	4711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225957
111	NC_021870	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225957
112	NC_021870	CCA	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526225957
113	NC_021870	AG	3	6	4907	4912	50 %	0 %	50 %	0 %	526225957
114	NC_021870	CAT	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526225957
115	NC_021870	CTGC	2	8	4995	5002	0 %	25 %	25 %	50 %	526225957
116	NC_021870	TGA	3	9	5026	5034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225957
117	NC_021870	GCC	2	6	5116	5121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_021870	CTT	2	6	5180	5185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526225958
119	NC_021870	GTT	2	6	5222	5227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526225958
120	NC_021870	ATG	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225958
121	NC_021870	TCA	2	6	5264	5269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526225958
122	NC_021870	CG	3	6	5273	5278	0 %	0 %	50 %	50 %	526225958
123	NC_021870	ACC	2	6	5299	5304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526225958
124	NC_021870	TTC	2	6	5362	5367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526225958
125	NC_021870	ACC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526225958
126	NC_021870	AG	3	6	5574	5579	50 %	0 %	50 %	0 %	526225958
127	NC_021870	GCG	2	6	5777	5782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225958
128	NC_021870	TGAGA	2	10	5892	5901	40 %	20 %	40 %	0 %	526225958
129	NC_021870	A	7	7	5946	5952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021870	ACC	2	6	6118	6123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526225959
131	NC_021870	CGA	2	6	6224	6229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225959
132	NC_021870	TAA	2	6	6252	6257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526225959
133	NC_021870	A	6	6	6288	6293	100 %	0 %	0 %	0 %	526225959
134	NC_021870	CAG	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225959
135	NC_021870	ATC	2	6	6469	6474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526225959
136	NC_021870	TGA	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225959
137	NC_021870	GCC	2	6	6562	6567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225959
138	NC_021870	CCAA	2	8	6687	6694	50 %	0 %	0 %	50 %	526225959
139	NC_021870	TGC	2	6	6761	6766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225959
140	NC_021870	AGC	2	6	6778	6783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225959
141	NC_021870	CG	3	6	7013	7018	0 %	0 %	50 %	50 %	526225959
142	NC_021870	GGCCG	2	10	7029	7038	0 %	0 %	60 %	40 %	526225959
143	NC_021870	AGG	2	6	7100	7105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526225959
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145	NC_021870	GCC	2	6	7155	7160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526225959
146	NC_021870	GCCA	2	8	7182	7189	25 %	0 %	25 %	50 %	526225959
147	NC_021870	CCGCG	2	10	7206	7215	0 %	0 %	40 %	60 %	526225959
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151	NC_021870	TAA	2	6	7394	7399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526225959
152	NC_021870	TTG	2	6	7430	7435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526225959
153	NC_021870	GC	3	6	7466	7471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021870	CAAT	2	8	7569	7576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_021870	CGG	2	6	7601	7606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_021870	CGT	2	6	7621	7626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_021870	ATC	2	6	7630	7635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_021870	CAC	2	6	7719	7724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526225960
159	NC_021870	TC	3	6	7795	7800	0 %	50 %	0 %	50 %	526225960
160	NC_021870	AGC	2	6	7873	7878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225960
161	NC_021870	CAG	2	6	7888	7893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225960
162	NC_021870	ACGC	2	8	7979	7986	25 %	0 %	25 %	50 %	526225960
163	NC_021870	TAT	2	6	8028	8033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526225960
164	NC_021870	ATG	2	6	8045	8050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526225960
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167	NC_021870	GGCG	2	8	8193	8200	0 %	0 %	75 %	25 %	526225960
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173	NC_021870	GCA	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225960
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177	NC_021870	AGC	2	6	8662	8667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_021870	T	7	7	8693	8699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021870	T	6	6	8773	8778	0 %	100 %	0 %	0 %	526225961
180	NC_021870	TTG	2	6	8833	8838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526225961
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183	NC_021870	TGT	2	6	8981	8986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526225961
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186	NC_021870	GCG	2	6	9182	9187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225962
187	NC_021870	CTGG	2	8	9222	9229	0 %	25 %	50 %	25 %	526225962
188	NC_021870	TG	3	6	9305	9310	0 %	50 %	50 %	0 %	526225962
189	NC_021870	TGG	2	6	9314	9319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526225962
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192	NC_021870	CGTGA	2	10	9373	9382	20 %	20 %	40 %	20 %	526225962
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209	NC_021870	ATA	2	6	10486	10491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_021870	TGA	2	6	10520	10525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
211	NC_021870	GAAAA	2	10	10530	10539	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_021870	AATAA	2	10	11284	11293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_021870	TCG	2	6	11304	11309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526225965
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238	NC_021870	TTA	2	6	11792	11797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_021870	A	6	6	11883	11888	100 %	0 %	0 %	0 %	526225966
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247	NC_021870	A	8	8	11958	11965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021870	ATG	2	6	12021	12026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_021870	ATT	2	6	12062	12067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526225967
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267	NC_021870	A	6	6	12690	12695	100 %	0 %	0 %	0 %	526225967
268	NC_021870	GTG	2	6	12735	12740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526225967
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270	NC_021870	GCG	2	6	12845	12850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526225967
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400	NC_021870	T	6	6	18261	18266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_021870	T	6	6	18310	18315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_021870	GCA	2	6	18388	18393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526225973
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452	NC_021870	CCA	2	6	20532	20537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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499	NC_021870	CGGG	2	8	23241	23248	0 %	0 %	75 %	25 %	526225974
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