MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella bongori N268-08

Total Repeats: 96123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021870	GGCT	2	8	170059	170066	0 %	25 %	50 %	25 %	526226114
3502	NC_021870	GGT	2	6	170229	170234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226114
3503	NC_021870	GGT	2	6	170238	170243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226114
3504	NC_021870	TACA	2	8	170328	170335	50 %	25 %	0 %	25 %	526226114
3505	NC_021870	TC	3	6	170413	170418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_021870	TGCC	2	8	170448	170455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_021870	TGA	2	6	170536	170541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021870	T	6	6	170625	170630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021870	T	6	6	170638	170643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021870	CTA	2	6	170661	170666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021870	CTA	2	6	170709	170714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_021870	CTG	2	6	170716	170721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_021870	GAG	2	6	170787	170792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021870	CGT	2	6	170796	170801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3515	NC_021870	AGA	2	6	170805	170810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526226115
3516	NC_021870	GCC	2	6	170836	170841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226115
3517	NC_021870	TCG	2	6	170888	170893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3518	NC_021870	GCT	2	6	170895	170900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3519	NC_021870	A	6	6	170901	170906	100 %	0 %	0 %	0 %	526226115
3520	NC_021870	CCCG	2	8	170907	170914	0 %	0 %	25 %	75 %	526226115
3521	NC_021870	GAA	2	6	170920	170925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526226115
3522	NC_021870	GCC	2	6	170977	170982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226115
3523	NC_021870	GCC	2	6	171004	171009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226115
3524	NC_021870	G	6	6	171081	171086	0 %	0 %	100 %	0 %	526226115
3525	NC_021870	ATCC	2	8	171094	171101	25 %	25 %	0 %	50 %	526226115
3526	NC_021870	TGAT	2	8	171104	171111	25 %	50 %	25 %	0 %	526226115
3527	NC_021870	GAC	2	6	171118	171123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3528	NC_021870	GCT	2	6	171165	171170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3529	NC_021870	ATG	2	6	171188	171193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226115
3530	NC_021870	GAA	2	6	171196	171201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526226115
3531	NC_021870	AAAGCC	2	12	171202	171213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	526226115
3532	NC_021870	CCA	2	6	171277	171282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526226115
3533	NC_021870	TCACCG	2	12	171296	171307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526226115
3534	NC_021870	GAT	2	6	171337	171342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226115
3535	NC_021870	CT	3	6	171343	171348	0 %	50 %	0 %	50 %	526226115
3536	NC_021870	TTG	2	6	171446	171451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526226115
3537	NC_021870	TGG	2	6	171515	171520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226115
3538	NC_021870	TTC	2	6	171528	171533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526226115
3539	NC_021870	CCA	2	6	171545	171550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526226115
3540	NC_021870	CGG	3	9	171603	171611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226115
3541	NC_021870	CGG	2	6	171621	171626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226115
3542	NC_021870	TCT	2	6	171641	171646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526226115
3543	NC_021870	TC	4	8	171692	171699	0 %	50 %	0 %	50 %	526226115
3544	NC_021870	CGC	2	6	171748	171753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226115
3545	NC_021870	TGAT	2	8	171803	171810	25 %	50 %	25 %	0 %	526226115
3546	NC_021870	TGG	2	6	171822	171827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226115
3547	NC_021870	CAC	2	6	171858	171863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526226115
3548	NC_021870	GCC	2	6	171932	171937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226115
3549	NC_021870	GGTC	2	8	171963	171970	0 %	25 %	50 %	25 %	526226115
3550	NC_021870	GTCC	2	8	171991	171998	0 %	25 %	25 %	50 %	526226115
3551	NC_021870	ACC	2	6	172045	172050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526226115
3552	NC_021870	TGA	2	6	172065	172070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226115
3553	NC_021870	CAT	2	6	172168	172173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526226115
3554	NC_021870	GGC	2	6	172201	172206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226115
3555	NC_021870	TGC	3	9	172256	172264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3556	NC_021870	GGT	2	6	172282	172287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226115
3557	NC_021870	CGG	2	6	172325	172330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226115
3558	NC_021870	GCC	2	6	172351	172356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226115
3559	NC_021870	CTG	2	6	172483	172488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3560	NC_021870	GAA	2	6	172497	172502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526226115
3561	NC_021870	GAA	2	6	172506	172511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526226115
3562	NC_021870	TCT	2	6	172517	172522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526226115
3563	NC_021870	CCG	2	6	172595	172600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226115
3564	NC_021870	TTG	2	6	172675	172680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526226115
3565	NC_021870	GAT	2	6	172686	172691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226115
3566	NC_021870	TCG	2	6	172710	172715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3567	NC_021870	CGT	2	6	172726	172731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3568	NC_021870	TGGC	2	8	172750	172757	0 %	25 %	50 %	25 %	526226115
3569	NC_021870	CTG	2	6	172768	172773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3570	NC_021870	GCCGAC	2	12	172777	172788	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	526226115
3571	NC_021870	CGG	2	6	172799	172804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226115
3572	NC_021870	GATCGA	2	12	172806	172817	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526226115
3573	NC_021870	GC	3	6	172847	172852	0 %	0 %	50 %	50 %	526226115
3574	NC_021870	GAC	2	6	172864	172869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3575	NC_021870	CTG	2	6	172876	172881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3576	NC_021870	CGA	2	6	172905	172910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226115
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3578	NC_021870	GCT	2	6	172965	172970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226115
3579	NC_021870	ACTG	2	8	173040	173047	25 %	25 %	25 %	25 %	526226115
3580	NC_021870	AAG	2	6	173048	173053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526226115
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3582	NC_021870	CG	3	6	173082	173087	0 %	0 %	50 %	50 %	526226115
3583	NC_021870	GC	3	6	173128	173133	0 %	0 %	50 %	50 %	526226115
3584	NC_021870	GGT	2	6	173151	173156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226115
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3586	NC_021870	GGC	2	6	173238	173243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226115
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3588	NC_021870	CGG	2	6	173387	173392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226115
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3590	NC_021870	T	7	7	173490	173496	0 %	100 %	0 %	0 %	526226116
3591	NC_021870	CGGG	2	8	173601	173608	0 %	0 %	75 %	25 %	526226116
3592	NC_021870	GAA	2	6	173659	173664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526226116
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3594	NC_021870	TGA	2	6	173688	173693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226116
3595	NC_021870	GCGG	2	8	173742	173749	0 %	0 %	75 %	25 %	526226116
3596	NC_021870	TGGA	2	8	173767	173774	25 %	25 %	50 %	0 %	526226116
3597	NC_021870	GAG	2	6	173779	173784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526226116
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3601	NC_021870	GCG	2	6	173873	173878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226116
3602	NC_021870	GGT	2	6	173895	173900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226116
3603	NC_021870	TCAT	2	8	173945	173952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_021870	T	7	7	173976	173982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021870	AGAT	2	8	174107	174114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021870	TGG	2	6	174154	174159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226117
3607	NC_021870	CGT	2	6	174186	174191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226117
3608	NC_021870	GCGG	2	8	174218	174225	0 %	0 %	75 %	25 %	526226117
3609	NC_021870	GC	3	6	174304	174309	0 %	0 %	50 %	50 %	526226117
3610	NC_021870	GTT	2	6	174426	174431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021870	GAC	2	6	174495	174500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226118
3612	NC_021870	ATT	2	6	174535	174540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526226118
3613	NC_021870	TGC	2	6	174560	174565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226118
3614	NC_021870	CAG	2	6	174573	174578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226118
3615	NC_021870	GC	3	6	174587	174592	0 %	0 %	50 %	50 %	526226118
3616	NC_021870	ATG	2	6	174629	174634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226118
3617	NC_021870	GCC	2	6	174734	174739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_021870	ATA	2	6	174773	174778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526226119
3619	NC_021870	GCG	2	6	174804	174809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226119
3620	NC_021870	TCC	2	6	174840	174845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526226119
3621	NC_021870	AGC	2	6	174888	174893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226119
3622	NC_021870	CCA	2	6	174934	174939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526226119
3623	NC_021870	TCT	2	6	174960	174965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526226119
3624	NC_021870	AATT	2	8	174985	174992	50 %	50 %	0 %	0 %	526226119
3625	NC_021870	TGG	2	6	175080	175085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226119
3626	NC_021870	GGTA	2	8	175186	175193	25 %	25 %	50 %	0 %	526226119
3627	NC_021870	ACC	2	6	175227	175232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526226119
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3632	NC_021870	AAT	2	6	175675	175680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526226120
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3651	NC_021870	TCA	2	6	176523	176528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3652	NC_021870	GT	3	6	176544	176549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3653	NC_021870	CGC	2	6	176609	176614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3654	NC_021870	GGA	2	6	176651	176656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3655	NC_021870	T	6	6	176708	176713	0 %	100 %	0 %	0 %	526226121
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3660	NC_021870	ACA	2	6	176977	176982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526226121
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3662	NC_021870	TAT	2	6	177067	177072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3663	NC_021870	CGC	2	6	177278	177283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226122
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3732	NC_021870	CAG	3	9	181062	181070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226123
3733	NC_021870	GGC	2	6	181071	181076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226123
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3737	NC_021870	CCAG	2	8	181178	181185	25 %	0 %	25 %	50 %	526226123
3738	NC_021870	AAG	2	6	181197	181202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526226123
3739	NC_021870	T	6	6	181307	181312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3740	NC_021870	TG	3	6	181340	181345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3741	NC_021870	GCG	2	6	181428	181433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226124
3742	NC_021870	TTA	2	6	181434	181439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526226124
3743	NC_021870	TGGT	2	8	181598	181605	0 %	50 %	50 %	0 %	526226124
3744	NC_021870	TTTATG	2	12	181621	181632	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	526226124
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3746	NC_021870	GCT	2	6	181866	181871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226124
3747	NC_021870	TGC	2	6	182006	182011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226124
3748	NC_021870	GGC	2	6	182040	182045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3752	NC_021870	TGG	2	6	182167	182172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3863	NC_021870	GAT	2	6	187129	187134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226131
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3865	NC_021870	AT	3	6	187362	187367	50 %	50 %	0 %	0 %	526226131
3866	NC_021870	AGC	2	6	187464	187469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226131
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3868	NC_021870	TGG	2	6	187596	187601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226131
3869	NC_021870	GAT	2	6	187619	187624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226131
3870	NC_021870	GCA	2	6	187633	187638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226131
3871	NC_021870	CGG	2	6	187640	187645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226131
3872	NC_021870	TGC	2	6	187662	187667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226131
3873	NC_021870	GCT	2	6	187699	187704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226131
3874	NC_021870	ACT	2	6	187739	187744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526226131
3875	NC_021870	GAT	2	6	187753	187758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226131
3876	NC_021870	TGC	2	6	187776	187781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226131
3877	NC_021870	ACCA	2	8	187797	187804	50 %	0 %	0 %	50 %	526226131
3878	NC_021870	CGC	2	6	187836	187841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226131
3879	NC_021870	ATG	2	6	187853	187858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226131
3880	NC_021870	GCTG	2	8	187861	187868	0 %	25 %	50 %	25 %	526226131
3881	NC_021870	GGC	2	6	187957	187962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226131
3882	NC_021870	GC	3	6	187961	187966	0 %	0 %	50 %	50 %	526226131
3883	NC_021870	AGC	2	6	188049	188054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226131
3884	NC_021870	GTC	2	6	188087	188092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3885	NC_021870	AGT	2	6	188195	188200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226132
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3887	NC_021870	ATC	2	6	188224	188229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526226132
3888	NC_021870	TA	3	6	188334	188339	50 %	50 %	0 %	0 %	526226132
3889	NC_021870	GTT	2	6	188358	188363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526226132
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3891	NC_021870	GAC	2	6	188580	188585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226132
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3893	NC_021870	GAT	2	6	188680	188685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226132
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3896	NC_021870	CAT	2	6	188844	188849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526226132
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3900	NC_021870	CGT	2	6	189004	189009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3901	NC_021870	GCC	2	6	189023	189028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3904	NC_021870	CAA	2	6	189173	189178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526226133
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3915	NC_021870	ACG	2	6	189653	189658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526226134
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3917	NC_021870	CCA	2	6	189745	189750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526226134
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3920	NC_021870	ATA	2	6	189891	189896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3921	NC_021870	GAAT	2	8	189898	189905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3922	NC_021870	ATC	2	6	190131	190136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526226135
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3932	NC_021870	AGGT	2	8	190469	190476	25 %	25 %	50 %	0 %	526226135
3933	NC_021870	CTT	2	6	190578	190583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526226135
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3953	NC_021870	ACC	2	6	191664	191669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526226136
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3958	NC_021870	GT	3	6	191926	191931	0 %	50 %	50 %	0 %	526226137
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3962	NC_021870	CTG	2	6	192027	192032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526226137
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3971	NC_021870	TGG	2	6	192368	192373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226137
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3973	NC_021870	AGA	2	6	192427	192432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526226137
3974	NC_021870	GC	3	6	192440	192445	0 %	0 %	50 %	50 %	526226137
3975	NC_021870	GAACC	2	10	192450	192459	40 %	0 %	20 %	40 %	526226137
3976	NC_021870	CGG	2	6	192560	192565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226138
3977	NC_021870	A	6	6	192566	192571	100 %	0 %	0 %	0 %	526226138
3978	NC_021870	T	6	6	192618	192623	0 %	100 %	0 %	0 %	526226138
3979	NC_021870	TCA	2	6	192653	192658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526226138
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3984	NC_021870	TGCCGC	2	12	192888	192899	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526226138
3985	NC_021870	CAT	2	6	192928	192933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526226138
3986	NC_021870	GGT	2	6	192940	192945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526226138
3987	NC_021870	TTC	2	6	192946	192951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526226138
3988	NC_021870	GT	3	6	193048	193053	0 %	50 %	50 %	0 %	526226138
3989	NC_021870	TACC	2	8	193117	193124	25 %	25 %	0 %	50 %	526226139
3990	NC_021870	GTT	2	6	193268	193273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526226139
3991	NC_021870	TGA	2	6	193311	193316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526226139
3992	NC_021870	CAC	2	6	193373	193378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526226139
3993	NC_021870	TGCG	2	8	193540	193547	0 %	25 %	50 %	25 %	526226139
3994	NC_021870	CGC	2	6	193621	193626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226139
3995	NC_021870	GCC	2	6	193640	193645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526226139
3996	NC_021870	GCCGAT	2	12	193686	193697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526226139
3997	NC_021870	GCG	2	6	193698	193703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526226139
3998	NC_021870	GA	3	6	193749	193754	50 %	0 %	50 %	0 %	526226139
3999	NC_021870	TGT	2	6	193774	193779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526226139
4000	NC_021870	CGCTGG	2	12	193825	193836	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526226139

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