MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Spiroplasma taiwanense CT-1

Total Repeats: 965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021846	AAAATT	2	12	841	852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525938957
2	NC_021846	TTCAAT	2	12	1597	1608	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525938958
3	NC_021846	ATTTAA	2	12	2532	2543	50 %	50 %	0 %	0 %	525938958
4	NC_021846	GATTTT	2	12	3185	3196	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525938959
5	NC_021846	CTGATG	2	12	4125	4136	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525938959
6	NC_021846	TAATTT	2	12	5806	5817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525938960
7	NC_021846	AAATGA	2	12	7358	7369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525938961
8	NC_021846	TTATTT	2	12	9345	9356	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525938963
9	NC_021846	TTAAGT	2	12	10112	10123	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525938963
10	NC_021846	GCAAAT	2	12	10238	10249	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525938963
11	NC_021846	GAAAAA	2	12	11919	11930	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525938966
12	NC_021846	GCAAAA	2	12	13750	13761	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525938968
13	NC_021846	AGAGAA	2	12	15568	15579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525938969
14	NC_021846	TGAAAA	2	12	17484	17495	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525938971
15	NC_021846	ATATTT	2	12	18513	18524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525938972
16	NC_021846	AGATTT	2	12	20124	20135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525938974
17	NC_021846	TGTAGA	2	12	20262	20273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525938974
18	NC_021846	AGAAGC	2	12	21117	21128	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525938974
19	NC_021846	ATAGGA	2	12	21205	21216	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525938974
20	NC_021846	TTTTAA	2	12	22413	22424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525938976
21	NC_021846	TTAATT	2	12	22871	22882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525938976
22	NC_021846	AAGTTC	2	12	23866	23877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525938978
23	NC_021846	ATTTTG	2	12	23949	23960	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525938978
24	NC_021846	TGCAAT	2	12	25663	25674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525938981
25	NC_021846	TAAATA	2	12	30834	30845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525938986
26	NC_021846	AAGTAA	2	12	32384	32395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525938987
27	NC_021846	ATTTTA	2	12	32627	32638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525938987
28	NC_021846	AAAATT	2	12	33642	33653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525938989
29	NC_021846	ATATGA	2	12	34253	34264	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525938990
30	NC_021846	GAATTT	2	12	34603	34614	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525938990
31	NC_021846	GAAACA	2	12	35136	35147	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525938991
32	NC_021846	AGTTTT	2	12	35969	35980	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525938993
33	NC_021846	AACAAA	2	12	35981	35992	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525938993
34	NC_021846	TACAGT	2	12	36176	36187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525938993
35	NC_021846	ATTAAA	2	12	37547	37558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021846	TTGCAA	2	12	38120	38131	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525938997
37	NC_021846	TGGAGA	2	12	38664	38675	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525938997
38	NC_021846	TGGAGA	2	12	39470	39481	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021846	AATTAC	2	12	40886	40897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021846	TTAAAA	2	12	41315	41326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525938999
41	NC_021846	AGTAAA	2	12	42675	42686	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525939002
42	NC_021846	AAAGAA	2	12	45308	45319	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525939003
43	NC_021846	TATTTT	2	12	52123	52134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021846	TAAAAA	2	12	52230	52241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021846	AATTTC	2	12	53071	53082	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525939007
46	NC_021846	AAATAA	2	12	53990	54001	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525939009
47	NC_021846	TGCAAT	2	12	55392	55403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525939011
48	NC_021846	TCTGCT	2	12	55537	55548	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525939011
49	NC_021846	AATTAG	2	12	56012	56023	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525939011
50	NC_021846	TTCAAG	2	12	58336	58347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525939013
51	NC_021846	TATTTA	2	12	60608	60619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021846	AAAAAC	2	12	60778	60789	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	525939017
53	NC_021846	TAGCAA	2	12	63420	63431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525939017
54	NC_021846	TAAAAT	2	12	63562	63573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525939017
55	NC_021846	TTTAAA	2	12	63631	63642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021846	TTTATC	2	12	66611	66622	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525939019
57	NC_021846	CAATTC	2	12	67516	67527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525939019
58	NC_021846	TTTTTA	2	12	71284	71295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021846	ATTTAG	2	12	72306	72317	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525939024
60	NC_021846	AATTAA	2	12	72750	72761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525939024
61	NC_021846	AAAAGA	2	12	73623	73634	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021846	GGTAAA	2	12	74715	74726	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525939025
63	NC_021846	AGGAAT	2	12	75269	75280	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525939025
64	NC_021846	TTAAAA	2	12	77640	77651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525939027
65	NC_021846	AGTAAT	2	12	79442	79453	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525939029
66	NC_021846	AACTTT	2	12	79817	79828	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525939029
67	NC_021846	AAGACA	2	12	80303	80314	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525939030
68	NC_021846	TTAAAA	2	12	80690	80701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525939031
69	NC_021846	GGATTT	2	12	81554	81565	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525939033
70	NC_021846	TTAATA	2	12	83952	83963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021846	AAAATA	2	12	85774	85785	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525939035
72	NC_021846	TTTTAA	2	12	86153	86164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525939035
73	NC_021846	GGAAAA	2	12	88162	88173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525939037
74	NC_021846	GGAATT	2	12	88278	88289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525939037
75	NC_021846	TGATAA	2	12	88488	88499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525939037
76	NC_021846	TTTTGT	2	12	89097	89108	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525939038
77	NC_021846	TAATTA	2	12	89234	89245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021846	TAAATT	2	12	93247	93258	50 %	50 %	0 %	0 %	525939041
79	NC_021846	TGCAAT	2	12	93433	93444	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525939041
80	NC_021846	GAAAAA	2	12	93888	93899	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525939041
81	NC_021846	TGGTTT	2	12	95024	95035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525939042
82	NC_021846	TACAAT	2	12	95745	95756	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021846	AGTTCA	2	12	100022	100033	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525939047
84	NC_021846	TATGAT	2	12	100320	100331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525939047
85	NC_021846	ATGCCA	2	12	103049	103060	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021846	TAAAAT	2	12	107455	107466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525939051
87	NC_021846	GTTTTA	2	12	107893	107904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525939052
88	NC_021846	AAATGA	2	12	108306	108317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525939052
89	NC_021846	GAAAAA	2	12	109219	109230	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525939053
90	NC_021846	ATTGAA	2	12	111745	111756	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021846	TAACAG	2	12	113196	113207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021846	AGAATT	2	12	113964	113975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021846	TGAAAT	2	12	114030	114041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021846	TAGTTT	2	12	114341	114352	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021846	TATAAT	2	12	114807	114818	50 %	50 %	0 %	0 %	525939055
96	NC_021846	AAAAGT	2	12	115480	115491	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525939057
97	NC_021846	TTATTT	2	12	116026	116037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021846	TAAAAA	2	12	117068	117079	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525939061
99	NC_021846	TTGTAA	2	12	120692	120703	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525939065
100	NC_021846	CGGAGG	2	12	120714	120725	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	525939065
101	NC_021846	ATGCAT	2	12	121311	121322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525939066
102	NC_021846	TAAATT	2	12	124085	124096	50 %	50 %	0 %	0 %	525939068
103	NC_021846	TACAAT	2	12	125005	125016	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525939068
104	NC_021846	ATTAAA	2	12	125836	125847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525939068
105	NC_021846	TTAAAA	2	12	126116	126127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525939069
106	NC_021846	TGAAAA	2	12	126249	126260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525939069
107	NC_021846	ATGTTG	2	12	126530	126541	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525939069
108	NC_021846	TTTTAA	2	12	128283	128294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525939070
109	NC_021846	TCAAAC	2	12	128992	129003	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525939071
110	NC_021846	AAAAGA	2	12	129642	129653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525939071
111	NC_021846	ATTGAT	2	12	131261	131272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021846	AAAAAT	2	12	131345	131356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525939073
113	NC_021846	AGTTTA	2	12	131409	131420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525939073
114	NC_021846	ATTTAA	2	12	131821	131832	50 %	50 %	0 %	0 %	525939073
115	NC_021846	TAATTT	2	12	131877	131888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525939073
116	NC_021846	AGAAAA	2	12	132696	132707	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525939074
117	NC_021846	AATAAA	2	12	132814	132825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525939074
118	NC_021846	AAATTT	2	12	132855	132866	50 %	50 %	0 %	0 %	525939074
119	NC_021846	AGAAAA	2	12	136191	136202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525939078
120	NC_021846	AAATAA	2	12	138302	138313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525939082
121	NC_021846	AAAATA	2	12	138576	138587	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525939082
122	NC_021846	AATTGT	2	12	140674	140685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525939087
123	NC_021846	GAAAAT	2	12	140863	140874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525939088
124	NC_021846	AAATTT	2	12	141119	141130	50 %	50 %	0 %	0 %	525939089
125	NC_021846	TTAATT	2	12	142132	142143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_021846	AAATTA	2	12	279086	279097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525939204
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243	NC_021846	CTGAAA	2	12	284148	284159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
244	NC_021846	CAGATA	2	12	284701	284712	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525939209
245	NC_021846	AAGAAA	2	12	284738	284749	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	525939209
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352	NC_021846	TTTTGA	2	12	412648	412659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525939324
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358	NC_021846	AGAACC	2	12	417040	417051	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525939327
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360	NC_021846	TAGTGG	2	12	420708	420719	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
361	NC_021846	ATTGCA	2	12	421387	421398	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
362	NC_021846	AAATTA	2	12	422397	422408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525939330
363	NC_021846	ACATTA	2	12	422681	422692	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525939331
364	NC_021846	TTATGA	2	12	423921	423932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525939332
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475	NC_021846	AGAAGC	2	12	541550	541561	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525939442
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