MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 1992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021845	CAT	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021845	TTA	2	6	277	282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021845	CTT	2	6	286	291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021845	GAT	2	6	313	318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021845	CTT	2	6	335	340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021845	CAG	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021845	CAT	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021845	CAA	2	6	523	528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021845	TAA	2	6	574	579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021845	AAT	2	6	587	592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021845	TAT	2	6	658	663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021845	ATG	2	6	812	817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937633
13	NC_021845	GCC	2	6	948	953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937633
14	NC_021845	TGC	2	6	1032	1037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937633
15	NC_021845	TTA	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937633
16	NC_021845	CTC	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937633
17	NC_021845	TTA	2	6	1144	1149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937633
18	NC_021845	TCC	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937633
19	NC_021845	TTC	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937633
20	NC_021845	GTT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937633
21	NC_021845	GAT	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937633
22	NC_021845	GTC	2	6	1673	1678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937634
23	NC_021845	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937634
24	NC_021845	CAC	2	6	1864	1869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937634
25	NC_021845	ATA	2	6	1925	1930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937634
26	NC_021845	CAA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937634
27	NC_021845	ACA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937634
28	NC_021845	GCA	2	6	2056	2061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937634
29	NC_021845	CAG	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937634
30	NC_021845	TTA	2	6	2115	2120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937634
31	NC_021845	ACG	2	6	2168	2173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021845	AGT	2	6	2254	2259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021845	GTT	2	6	2411	2416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937635
34	NC_021845	AGC	2	6	2610	2615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937635
35	NC_021845	CGG	2	6	2694	2699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937635
36	NC_021845	ACA	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937635
37	NC_021845	AAC	2	6	2860	2865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937635
38	NC_021845	AGG	2	6	2892	2897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937635
39	NC_021845	TCA	3	9	2900	2908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937635
40	NC_021845	TAG	2	6	3049	3054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937635
41	NC_021845	TTA	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937635
42	NC_021845	CTG	2	6	3236	3241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937635
43	NC_021845	CGT	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937635
44	NC_021845	ATA	2	6	3351	3356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937635
45	NC_021845	TAA	2	6	3587	3592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937635
46	NC_021845	ACG	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937635
47	NC_021845	ATG	2	6	3646	3651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937635
48	NC_021845	AGA	2	6	3699	3704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021845	ATT	2	6	3782	3787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937636
50	NC_021845	CTG	2	6	3827	3832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937636
51	NC_021845	GGA	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937636
52	NC_021845	TTA	2	6	4052	4057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937637
53	NC_021845	TGA	2	6	4068	4073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937637
54	NC_021845	ATC	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
55	NC_021845	ATT	2	6	4146	4151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937637
56	NC_021845	TCA	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
57	NC_021845	ATT	2	6	4266	4271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937637
58	NC_021845	TAA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937637
59	NC_021845	CTG	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937637
60	NC_021845	ATC	3	9	4889	4897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
61	NC_021845	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937637
62	NC_021845	AAT	2	6	5036	5041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937637
63	NC_021845	ATT	2	6	5075	5080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937637
64	NC_021845	ATC	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
65	NC_021845	TCT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937637
66	NC_021845	TCA	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
67	NC_021845	CCT	2	6	5257	5262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937637
68	NC_021845	CTC	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937637
69	NC_021845	CTG	3	9	5279	5287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937637
70	NC_021845	CAT	2	6	5380	5385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
71	NC_021845	GCC	2	6	5605	5610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937637
72	NC_021845	CAT	2	6	5656	5661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
73	NC_021845	TCA	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937637
74	NC_021845	GTC	2	6	5954	5959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937637
75	NC_021845	TGA	2	6	6032	6037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937637
76	NC_021845	TAA	2	6	6118	6123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021845	TTG	2	6	6282	6287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937638
78	NC_021845	ATA	2	6	6404	6409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937638
79	NC_021845	CTG	2	6	6448	6453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937638
80	NC_021845	ATT	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937638
81	NC_021845	GCC	2	6	6536	6541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937638
82	NC_021845	CTT	2	6	6654	6659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937638
83	NC_021845	TAG	2	6	6689	6694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937638
84	NC_021845	TCA	2	6	6704	6709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937638
85	NC_021845	ATC	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937638
86	NC_021845	AAG	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937638
87	NC_021845	CTG	2	6	7001	7006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937638
88	NC_021845	ATC	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937638
89	NC_021845	CAT	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937638
90	NC_021845	CAT	3	9	7374	7382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937639
91	NC_021845	CAT	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937639
92	NC_021845	GTA	2	6	7538	7543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021845	GAA	2	6	7703	7708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
94	NC_021845	AAG	2	6	7764	7769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
95	NC_021845	CTA	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937640
96	NC_021845	TCT	2	6	7837	7842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937640
97	NC_021845	GAA	2	6	8008	8013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
98	NC_021845	CAC	2	6	8093	8098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937640
99	NC_021845	TGC	2	6	8148	8153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937640
100	NC_021845	AGA	2	6	8185	8190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
101	NC_021845	ACC	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937640
102	NC_021845	TCA	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937640
103	NC_021845	TCA	2	6	8327	8332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937640
104	NC_021845	AGA	2	6	8620	8625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
105	NC_021845	AGA	2	6	8649	8654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937640
106	NC_021845	GAT	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937641
107	NC_021845	AAC	2	6	8938	8943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937641
108	NC_021845	AAT	2	6	9029	9034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937641
109	NC_021845	AGA	2	6	9044	9049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937641
110	NC_021845	TCA	3	9	9091	9099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937641
111	NC_021845	ATA	2	6	9150	9155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937641
112	NC_021845	ACC	2	6	9239	9244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937641
113	NC_021845	GAA	2	6	9297	9302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937641
114	NC_021845	ACA	2	6	9367	9372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937641
115	NC_021845	ACC	2	6	9405	9410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937641
116	NC_021845	TTC	2	6	9426	9431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937641
117	NC_021845	CTG	2	6	9455	9460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937641
118	NC_021845	GGT	2	6	9515	9520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937641
119	NC_021845	ATT	2	6	9600	9605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937641
120	NC_021845	TAC	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937641
121	NC_021845	ATA	2	6	9898	9903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937642
122	NC_021845	ACA	2	6	9910	9915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937642
123	NC_021845	TCA	2	6	9937	9942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937642
124	NC_021845	TTA	2	6	10061	10066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937642
125	NC_021845	CTC	2	6	10167	10172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_021845	TTG	2	6	10295	10300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937643
127	NC_021845	CAT	2	6	10373	10378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937643
128	NC_021845	TCT	2	6	10489	10494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937643
129	NC_021845	ATG	2	6	10615	10620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937643
130	NC_021845	TTA	2	6	10634	10639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937643
131	NC_021845	CTC	2	6	10728	10733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937643
132	NC_021845	AAG	2	6	10794	10799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937643
133	NC_021845	ATA	2	6	10857	10862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937643
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139	NC_021845	GAA	2	6	11118	11123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_021845	AGG	2	6	11234	11239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021845	TGT	2	6	13377	13382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021845	AAT	2	6	13404	13409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_021845	GAA	2	6	20785	20790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_021845	TAT	2	6	20828	20833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_021845	GCA	2	6	20947	20952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_021845	ATT	2	6	20988	20993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021845	TGC	2	6	21117	21122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937651
258	NC_021845	ATC	2	6	21140	21145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937651
259	NC_021845	TAC	2	6	21205	21210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937651
260	NC_021845	TGA	2	6	21235	21240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937651
261	NC_021845	ATC	2	6	21272	21277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937651
262	NC_021845	AAC	2	6	21398	21403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937651
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