MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 3080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021845	AATG	2	8	134902	134909	50 %	25 %	25 %	0 %	525937774
2502	NC_021845	CGTG	2	8	134917	134924	0 %	25 %	50 %	25 %	525937774
2503	NC_021845	CGA	2	6	134931	134936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937774
2504	NC_021845	AAC	2	6	134952	134957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937774
2505	NC_021845	T	6	6	134975	134980	0 %	100 %	0 %	0 %	525937774
2506	NC_021845	GAAA	2	8	135010	135017	75 %	0 %	25 %	0 %	525937774
2507	NC_021845	TGG	2	6	135054	135059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937774
2508	NC_021845	ATG	2	6	135235	135240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937774
2509	NC_021845	T	7	7	135248	135254	0 %	100 %	0 %	0 %	525937774
2510	NC_021845	TTAG	2	8	135260	135267	25 %	50 %	25 %	0 %	525937774
2511	NC_021845	CGAG	2	8	135330	135337	25 %	0 %	50 %	25 %	525937774
2512	NC_021845	T	6	6	135393	135398	0 %	100 %	0 %	0 %	525937774
2513	NC_021845	TTA	2	6	135427	135432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937775
2514	NC_021845	CTT	2	6	135477	135482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937775
2515	NC_021845	CAGCAA	2	12	135527	135538	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525937775
2516	NC_021845	CT	3	6	135628	135633	0 %	50 %	0 %	50 %	525937775
2517	NC_021845	CTTT	2	8	135648	135655	0 %	75 %	0 %	25 %	525937775
2518	NC_021845	TTA	2	6	135676	135681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937775
2519	NC_021845	ACA	2	6	135757	135762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937775
2520	NC_021845	TA	3	6	135798	135803	50 %	50 %	0 %	0 %	525937775
2521	NC_021845	TTG	2	6	135805	135810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937775
2522	NC_021845	GCA	2	6	135850	135855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937775
2523	NC_021845	GTT	2	6	135936	135941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937775
2524	NC_021845	TCA	2	6	135958	135963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937775
2525	NC_021845	AGG	2	6	136031	136036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937775
2526	NC_021845	ATT	2	6	136048	136053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937775
2527	NC_021845	AGC	2	6	136065	136070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937775
2528	NC_021845	TGA	2	6	136158	136163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937775
2529	NC_021845	ATA	2	6	136231	136236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937775
2530	NC_021845	ATA	2	6	136437	136442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937775
2531	NC_021845	GCTG	2	8	136699	136706	0 %	25 %	50 %	25 %	525937775
2532	NC_021845	ACA	4	12	136798	136809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937775
2533	NC_021845	ACCAA	2	10	136893	136902	60 %	0 %	0 %	40 %	525937775
2534	NC_021845	ATTGC	2	10	136948	136957	20 %	40 %	20 %	20 %	525937775
2535	NC_021845	GCC	2	6	136959	136964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937775
2536	NC_021845	TTATTT	2	12	137134	137145	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525937775
2537	NC_021845	GCT	2	6	137281	137286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937775
2538	NC_021845	A	7	7	137311	137317	100 %	0 %	0 %	0 %	525937775
2539	NC_021845	GAA	2	6	137365	137370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937775
2540	NC_021845	CTTT	2	8	137741	137748	0 %	75 %	0 %	25 %	525937776
2541	NC_021845	GAT	2	6	137943	137948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937776
2542	NC_021845	GAT	2	6	138025	138030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937776
2543	NC_021845	TTC	2	6	138068	138073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937776
2544	NC_021845	AGG	2	6	138080	138085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937776
2545	NC_021845	GCT	2	6	138123	138128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937776
2546	NC_021845	TGG	3	9	138155	138163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937776
2547	NC_021845	GTTCT	2	10	138248	138257	0 %	60 %	20 %	20 %	525937776
2548	NC_021845	TTG	2	6	138319	138324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937776
2549	NC_021845	TG	3	6	138360	138365	0 %	50 %	50 %	0 %	525937776
2550	NC_021845	TCT	2	6	138399	138404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937776
2551	NC_021845	TTC	2	6	138509	138514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937776
2552	NC_021845	AGA	2	6	138581	138586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937776
2553	NC_021845	TCA	2	6	138588	138593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937776
2554	NC_021845	GTT	2	6	138642	138647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937776
2555	NC_021845	CTT	2	6	138651	138656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937776
2556	NC_021845	GA	3	6	138749	138754	50 %	0 %	50 %	0 %	525937776
2557	NC_021845	GCA	2	6	138817	138822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937776
2558	NC_021845	AC	4	8	138864	138871	50 %	0 %	0 %	50 %	525937776
2559	NC_021845	TA	3	6	138872	138877	50 %	50 %	0 %	0 %	525937776
2560	NC_021845	GTTG	2	8	138916	138923	0 %	50 %	50 %	0 %	525937776
2561	NC_021845	TCT	2	6	138969	138974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937776
2562	NC_021845	GCT	2	6	138996	139001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937776
2563	NC_021845	TCT	2	6	139063	139068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937776
2564	NC_021845	TCG	2	6	139074	139079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937776
2565	NC_021845	TCT	2	6	139214	139219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937776
2566	NC_021845	T	6	6	139234	139239	0 %	100 %	0 %	0 %	525937776
2567	NC_021845	TAAA	2	8	139251	139258	75 %	25 %	0 %	0 %	525937776
2568	NC_021845	AAG	2	6	139346	139351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937776
2569	NC_021845	AGT	2	6	139429	139434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937776
2570	NC_021845	TCA	3	9	139446	139454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937776
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2572	NC_021845	TTG	2	6	139635	139640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937776
2573	NC_021845	TGC	3	9	139685	139693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937776
2574	NC_021845	TAGAA	2	10	139750	139759	60 %	20 %	20 %	0 %	525937776
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2578	NC_021845	CAT	2	6	140074	140079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937776
2579	NC_021845	GCA	2	6	140100	140105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937776
2580	NC_021845	ACT	2	6	140127	140132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937776
2581	NC_021845	T	6	6	140178	140183	0 %	100 %	0 %	0 %	525937776
2582	NC_021845	AG	3	6	140186	140191	50 %	0 %	50 %	0 %	525937776
2583	NC_021845	CCA	2	6	140223	140228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937776
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2587	NC_021845	GA	3	6	140527	140532	50 %	0 %	50 %	0 %	525937776
2588	NC_021845	AT	3	6	140539	140544	50 %	50 %	0 %	0 %	525937776
2589	NC_021845	CAT	2	6	140566	140571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937776
2590	NC_021845	TGAGA	2	10	140577	140586	40 %	20 %	40 %	0 %	525937776
2591	NC_021845	TCA	3	9	140632	140640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937776
2592	NC_021845	TGA	2	6	140713	140718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937777
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2594	NC_021845	TGT	2	6	140809	140814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937777
2595	NC_021845	AGTTG	2	10	140938	140947	20 %	40 %	40 %	0 %	525937777
2596	NC_021845	TGA	2	6	140981	140986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937777
2597	NC_021845	ATGA	2	8	140988	140995	50 %	25 %	25 %	0 %	525937777
2598	NC_021845	CAA	2	6	141031	141036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937777
2599	NC_021845	TTTC	2	8	141040	141047	0 %	75 %	0 %	25 %	525937777
2600	NC_021845	TTC	2	6	141059	141064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937777
2601	NC_021845	AG	4	8	141136	141143	50 %	0 %	50 %	0 %	525937777
2602	NC_021845	CAT	2	6	141160	141165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937777
2603	NC_021845	TGA	2	6	141175	141180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937777
2604	NC_021845	TAA	3	9	141232	141240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937777
2605	NC_021845	AT	3	6	141431	141436	50 %	50 %	0 %	0 %	525937778
2606	NC_021845	TGG	2	6	141731	141736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937778
2607	NC_021845	TTCC	2	8	141742	141749	0 %	50 %	0 %	50 %	525937778
2608	NC_021845	CCT	2	6	141869	141874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2609	NC_021845	GGA	2	6	141894	141899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_021845	T	8	8	141908	141915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_021845	AGA	2	6	141923	141928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_021845	TGA	2	6	141944	141949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_021845	ATT	2	6	142082	142087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_021845	AT	3	6	142125	142130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_021845	A	8	8	142147	142154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_021845	GAC	2	6	142207	142212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_021845	TGA	2	6	142308	142313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_021845	CGT	2	6	142351	142356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_021845	T	9	9	142393	142401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_021845	A	6	6	142569	142574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_021845	TCT	2	6	142735	142740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937779
2622	NC_021845	CTC	2	6	142757	142762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937779
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2995	NC_021845	GCA	2	6	161778	161783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937794
2996	NC_021845	ACCG	2	8	161810	161817	25 %	0 %	25 %	50 %	525937794
2997	NC_021845	AGC	2	6	161823	161828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937794
2998	NC_021845	TGA	2	6	162102	162107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937794
2999	NC_021845	ATG	2	6	162315	162320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937794
3000	NC_021845	GGA	2	6	162358	162363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937794

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