MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 3080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021845	GCA	2	6	78697	78702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937700
1502	NC_021845	ACAA	2	8	78720	78727	75 %	0 %	0 %	25 %	525937700
1503	NC_021845	GCCG	2	8	78776	78783	0 %	0 %	50 %	50 %	525937700
1504	NC_021845	GC	3	6	78844	78849	0 %	0 %	50 %	50 %	525937700
1505	NC_021845	CGGTT	2	10	78934	78943	0 %	40 %	40 %	20 %	525937701
1506	NC_021845	GGC	2	6	78949	78954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937701
1507	NC_021845	CGA	2	6	78996	79001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937701
1508	NC_021845	CACCGT	2	12	79032	79043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525937701
1509	NC_021845	GCA	2	6	79046	79051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937701
1510	NC_021845	GCC	2	6	79159	79164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937701
1511	NC_021845	GTG	2	6	79166	79171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937701
1512	NC_021845	GCA	2	6	79197	79202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937701
1513	NC_021845	CCT	2	6	79279	79284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_021845	GCA	2	6	79299	79304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1515	NC_021845	GCT	2	6	79310	79315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1516	NC_021845	CCG	2	6	79430	79435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937702
1517	NC_021845	TGA	2	6	79514	79519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937702
1518	NC_021845	GT	3	6	79526	79531	0 %	50 %	50 %	0 %	525937702
1519	NC_021845	CGT	2	6	79595	79600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1520	NC_021845	CGGC	2	8	79658	79665	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
1521	NC_021845	CGC	2	6	79691	79696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937702
1522	NC_021845	CGC	2	6	79710	79715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937702
1523	NC_021845	GCCG	2	8	79722	79729	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
1524	NC_021845	GCC	2	6	79732	79737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937702
1525	NC_021845	GCCG	2	8	79770	79777	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
1526	NC_021845	CGC	2	6	79851	79856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937702
1527	NC_021845	CCGG	2	8	79887	79894	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
1528	NC_021845	CAG	2	6	79902	79907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1529	NC_021845	GC	3	6	79915	79920	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
1530	NC_021845	CGTG	2	8	79928	79935	0 %	25 %	50 %	25 %	525937702
1531	NC_021845	CTGG	2	8	79971	79978	0 %	25 %	50 %	25 %	525937702
1532	NC_021845	GAA	2	6	80058	80063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937702
1533	NC_021845	GC	3	6	80073	80078	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
1534	NC_021845	TGC	2	6	80093	80098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1535	NC_021845	CCA	2	6	80132	80137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937702
1536	NC_021845	CGA	2	6	80139	80144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1537	NC_021845	TCGC	2	8	80176	80183	0 %	25 %	25 %	50 %	525937702
1538	NC_021845	CGG	2	6	80232	80237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937702
1539	NC_021845	CCG	2	6	80240	80245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937702
1540	NC_021845	ACG	2	6	80284	80289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1541	NC_021845	GTC	2	6	80328	80333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1542	NC_021845	TTC	2	6	80412	80417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937702
1543	NC_021845	CTG	3	9	80427	80435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1544	NC_021845	CAG	2	6	80439	80444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1545	NC_021845	TCG	2	6	80459	80464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1546	NC_021845	GTGG	2	8	80470	80477	0 %	25 %	75 %	0 %	525937702
1547	NC_021845	GCC	2	6	80481	80486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937702
1548	NC_021845	GCG	2	6	80524	80529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937702
1549	NC_021845	CA	3	6	80550	80555	50 %	0 %	0 %	50 %	525937702
1550	NC_021845	GCC	2	6	80574	80579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937702
1551	NC_021845	GC	3	6	80609	80614	0 %	0 %	50 %	50 %	525937702
1552	NC_021845	TGC	2	6	80634	80639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1553	NC_021845	GAC	3	9	80667	80675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937702
1554	NC_021845	CGTT	2	8	80686	80693	0 %	50 %	25 %	25 %	525937702
1555	NC_021845	CGG	2	6	80807	80812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937702
1556	NC_021845	GGT	2	6	80967	80972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937702
1557	NC_021845	TGG	2	6	80993	80998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021845	GTT	2	6	81022	81027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937703
1559	NC_021845	GCG	2	6	81056	81061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937703
1560	NC_021845	AGGCC	2	10	81106	81115	20 %	0 %	40 %	40 %	525937703
1561	NC_021845	GAT	2	6	81223	81228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937703
1562	NC_021845	GCA	2	6	81277	81282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937703
1563	NC_021845	AAG	2	6	81315	81320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937703
1564	NC_021845	GGC	2	6	81365	81370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937703
1565	NC_021845	ACG	2	6	81387	81392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937703
1566	NC_021845	GC	3	6	81400	81405	0 %	0 %	50 %	50 %	525937703
1567	NC_021845	TGA	2	6	81427	81432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937703
1568	NC_021845	TCG	2	6	81540	81545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937704
1569	NC_021845	GAC	2	6	81551	81556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937704
1570	NC_021845	GGC	2	6	81683	81688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937704
1571	NC_021845	CAA	2	6	81700	81705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937704
1572	NC_021845	GCGAGG	2	12	81711	81722	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	525937704
1573	NC_021845	T	6	6	81734	81739	0 %	100 %	0 %	0 %	525937704
1574	NC_021845	ATG	2	6	81741	81746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937704
1575	NC_021845	CGAG	2	8	81790	81797	25 %	0 %	50 %	25 %	525937705
1576	NC_021845	GCC	2	6	81907	81912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937705
1577	NC_021845	GCA	2	6	82034	82039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937705
1578	NC_021845	GGC	2	6	82055	82060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937705
1579	NC_021845	GC	3	6	82078	82083	0 %	0 %	50 %	50 %	525937705
1580	NC_021845	TTTGG	2	10	82186	82195	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021845	AGCTTA	2	12	82198	82209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1582	NC_021845	AATT	2	8	82245	82252	50 %	50 %	0 %	0 %	525937706
1583	NC_021845	GGC	2	6	82284	82289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937706
1584	NC_021845	CTG	2	6	82333	82338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937706
1585	NC_021845	GCA	2	6	82361	82366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937706
1586	NC_021845	CGC	2	6	82369	82374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937706
1587	NC_021845	GGA	2	6	82467	82472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937706
1588	NC_021845	AGA	2	6	82532	82537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937706
1589	NC_021845	GAC	2	6	82720	82725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_021845	CAA	2	6	82762	82767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_021845	AGG	2	6	82877	82882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021845	GAT	2	6	82883	82888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021845	AGA	2	6	82955	82960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021845	TTAA	2	8	82974	82981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021845	TTAA	2	8	83055	83062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021845	ATC	2	6	83127	83132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_021845	AC	3	6	83222	83227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_021845	ACG	2	6	83307	83312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_021845	TAA	2	6	83367	83372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021845	GTT	2	6	83424	83429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021845	ACA	2	6	83474	83479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_021845	ATC	2	6	83488	83493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_021845	ATG	2	6	83549	83554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021845	CAG	2	6	83673	83678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_021845	TGT	2	6	83702	83707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021845	GTC	2	6	83735	83740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_021845	ACCAGT	2	12	83824	83835	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_021845	ACA	2	6	83907	83912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_021845	GAAG	2	8	83954	83961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021845	ACTC	2	8	84014	84021	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_021845	TTC	2	6	84102	84107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_021845	AGG	2	6	84147	84152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021845	TCG	2	6	84207	84212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937707
1614	NC_021845	AGA	2	6	84273	84278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937707
1615	NC_021845	GCC	2	6	84327	84332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937707
1616	NC_021845	GCGTT	2	10	84382	84391	0 %	40 %	40 %	20 %	525937707
1617	NC_021845	GACT	2	8	84570	84577	25 %	25 %	25 %	25 %	525937707
1618	NC_021845	AAT	2	6	84601	84606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937707
1619	NC_021845	ATGT	2	8	84651	84658	25 %	50 %	25 %	0 %	525937707
1620	NC_021845	TGCC	2	8	84664	84671	0 %	25 %	25 %	50 %	525937707
1621	NC_021845	GT	3	6	84844	84849	0 %	50 %	50 %	0 %	525937707
1622	NC_021845	GAA	2	6	84893	84898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937707
1623	NC_021845	GCT	2	6	85105	85110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937707
1624	NC_021845	TTA	2	6	85138	85143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937707
1625	NC_021845	GTT	2	6	85150	85155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937707
1626	NC_021845	TGC	2	6	85210	85215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937707
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1628	NC_021845	TGA	2	6	85394	85399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937707
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