MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 3080

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021845	AATG	2	8	52986	52993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021845	AT	3	6	53002	53007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021845	TAA	2	6	53107	53112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021845	TACT	2	8	53134	53141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_021845	ACT	2	6	53151	53156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937677
1006	NC_021845	A	6	6	53180	53185	100 %	0 %	0 %	0 %	525937677
1007	NC_021845	TCAG	2	8	53266	53273	25 %	25 %	25 %	25 %	525937677
1008	NC_021845	TTCA	2	8	53295	53302	25 %	50 %	0 %	25 %	525937677
1009	NC_021845	ACG	2	6	53330	53335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937677
1010	NC_021845	GGA	2	6	53396	53401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937677
1011	NC_021845	TAA	2	6	53405	53410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525937677
1012	NC_021845	TCATT	2	10	53479	53488	20 %	60 %	0 %	20 %	525937677
1013	NC_021845	AGA	2	6	53522	53527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937677
1014	NC_021845	CAG	2	6	53764	53769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937678
1015	NC_021845	TTCT	2	8	54040	54047	0 %	75 %	0 %	25 %	525937678
1016	NC_021845	TTG	2	6	54138	54143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937678
1017	NC_021845	CTCAT	2	10	54153	54162	20 %	40 %	0 %	40 %	525937678
1018	NC_021845	AGT	2	6	54163	54168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937678
1019	NC_021845	AGTT	2	8	54217	54224	25 %	50 %	25 %	0 %	525937678
1020	NC_021845	GCAA	2	8	54276	54283	50 %	0 %	25 %	25 %	525937678
1021	NC_021845	CAC	2	6	54316	54321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937678
1022	NC_021845	TGA	2	6	54376	54381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937678
1023	NC_021845	CCA	2	6	54402	54407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937678
1024	NC_021845	GA	4	8	54463	54470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021845	TAA	2	6	54511	54516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021845	A	8	8	54527	54534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021845	T	7	7	54677	54683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021845	A	6	6	54686	54691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021845	T	6	6	54715	54720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021845	T	9	9	54736	54744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021845	GTA	2	6	54747	54752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021845	AGT	2	6	54872	54877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937679
1033	NC_021845	AAGT	2	8	54946	54953	50 %	25 %	25 %	0 %	525937679
1034	NC_021845	AATGGG	2	12	55019	55030	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525937679
1035	NC_021845	GAA	2	6	55059	55064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937679
1036	NC_021845	ACA	2	6	55072	55077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937679
1037	NC_021845	ATG	2	6	55182	55187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937679
1038	NC_021845	TGA	2	6	55193	55198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937679
1039	NC_021845	AGA	2	6	55235	55240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937679
1040	NC_021845	TCG	2	6	55319	55324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937679
1041	NC_021845	GCTG	2	8	55338	55345	0 %	25 %	50 %	25 %	525937679
1042	NC_021845	CGAA	2	8	55352	55359	50 %	0 %	25 %	25 %	525937679
1043	NC_021845	CGA	2	6	55384	55389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937679
1044	NC_021845	TGT	2	6	55424	55429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937679
1045	NC_021845	AAG	2	6	55524	55529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937679
1046	NC_021845	A	7	7	55575	55581	100 %	0 %	0 %	0 %	525937679
1047	NC_021845	CCG	2	6	55635	55640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937679
1048	NC_021845	TCA	2	6	55675	55680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937679
1049	NC_021845	CCA	2	6	55681	55686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937679
1050	NC_021845	TTA	2	6	55689	55694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937679
1051	NC_021845	GAA	2	6	55746	55751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937679
1052	NC_021845	AGC	2	6	55828	55833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937679
1053	NC_021845	A	8	8	55893	55900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021845	AAG	2	6	55905	55910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021845	AAT	2	6	55957	55962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021845	T	6	6	56024	56029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021845	T	9	9	56069	56077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021845	CTT	2	6	56079	56084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_021845	T	7	7	56107	56113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021845	A	6	6	56123	56128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021845	T	6	6	56187	56192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021845	AAC	2	6	56268	56273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937680
1063	NC_021845	TTC	2	6	56306	56311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937680
1064	NC_021845	TTG	2	6	56348	56353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937680
1065	NC_021845	ATG	2	6	56363	56368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937680
1066	NC_021845	TTG	2	6	56377	56382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937680
1067	NC_021845	TC	3	6	56436	56441	0 %	50 %	0 %	50 %	525937680
1068	NC_021845	CACT	2	8	56525	56532	25 %	25 %	0 %	50 %	525937680
1069	NC_021845	TAT	2	6	56601	56606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937680
1070	NC_021845	GCC	2	6	56607	56612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525937680
1071	NC_021845	GTA	2	6	56644	56649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937680
1072	NC_021845	TTGCT	2	10	56660	56669	0 %	60 %	20 %	20 %	525937680
1073	NC_021845	CAAT	2	8	56679	56686	50 %	25 %	0 %	25 %	525937680
1074	NC_021845	TTA	2	6	56687	56692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937680
1075	NC_021845	ACG	2	6	56705	56710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937680
1076	NC_021845	ACAA	2	8	56740	56747	75 %	0 %	0 %	25 %	525937680
1077	NC_021845	CAC	2	6	56849	56854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937680
1078	NC_021845	GAGC	2	8	56856	56863	25 %	0 %	50 %	25 %	525937680
1079	NC_021845	TTC	2	6	56881	56886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937680
1080	NC_021845	TC	3	6	57244	57249	0 %	50 %	0 %	50 %	525937680
1081	NC_021845	AGGGGA	2	12	57456	57467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937680
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1084	NC_021845	GTCTAA	2	12	57618	57629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525937680
1085	NC_021845	AGA	2	6	57635	57640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937680
1086	NC_021845	TGA	2	6	57656	57661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937680
1087	NC_021845	CATCT	2	10	57710	57719	20 %	40 %	0 %	40 %	525937680
1088	NC_021845	AGC	2	6	57738	57743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937680
1089	NC_021845	TTC	2	6	57746	57751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937680
1090	NC_021845	GAA	2	6	57787	57792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937680
1091	NC_021845	CGGA	2	8	57796	57803	25 %	0 %	50 %	25 %	525937680
1092	NC_021845	ATGG	2	8	57804	57811	25 %	25 %	50 %	0 %	525937680
1093	NC_021845	CAA	2	6	57877	57882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937680
1094	NC_021845	CAAC	2	8	57899	57906	50 %	0 %	0 %	50 %	525937681
1095	NC_021845	CCA	2	6	57907	57912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525937681
1096	NC_021845	AGA	3	9	57920	57928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937681
1097	NC_021845	GAA	2	6	58056	58061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937681
1098	NC_021845	ATTA	2	8	58066	58073	50 %	50 %	0 %	0 %	525937681
1099	NC_021845	CGA	2	6	58152	58157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937682
1100	NC_021845	TG	3	6	58196	58201	0 %	50 %	50 %	0 %	525937682
1101	NC_021845	AGA	2	6	58409	58414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937682
1102	NC_021845	GTT	2	6	58609	58614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525937683
1103	NC_021845	TG	3	6	58642	58647	0 %	50 %	50 %	0 %	525937683
1104	NC_021845	ATT	2	6	58749	58754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937683
1105	NC_021845	A	6	6	58819	58824	100 %	0 %	0 %	0 %	525937683
1106	NC_021845	TGG	2	6	58855	58860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021845	AG	3	6	58885	58890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021845	T	6	6	58892	58897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021845	ATT	2	6	58899	58904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937684
1110	NC_021845	T	6	6	58903	58908	0 %	100 %	0 %	0 %	525937684
1111	NC_021845	AAC	2	6	58945	58950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937684
1112	NC_021845	CTGG	2	8	58960	58967	0 %	25 %	50 %	25 %	525937684
1113	NC_021845	A	6	6	58994	58999	100 %	0 %	0 %	0 %	525937684
1114	NC_021845	GAA	2	6	59006	59011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525937684
1115	NC_021845	CAAT	2	8	59096	59103	50 %	25 %	0 %	25 %	525937684
1116	NC_021845	CTT	2	6	59233	59238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937684
1117	NC_021845	AATG	2	8	59371	59378	50 %	25 %	25 %	0 %	525937684
1118	NC_021845	CTT	2	6	59605	59610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021845	TACA	2	8	59617	59624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_021845	AGC	2	6	59652	59657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021845	AGA	2	6	59715	59720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021845	GTT	2	6	59783	59788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021845	TTG	2	6	59800	59805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021845	CAT	2	6	59892	59897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_021845	CAG	2	6	60019	60024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525937685
1126	NC_021845	CTG	2	6	60043	60048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937685
1127	NC_021845	CGAG	2	8	60089	60096	25 %	0 %	50 %	25 %	525937685
1128	NC_021845	TCC	2	6	60135	60140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937685
1129	NC_021845	ATCGT	2	10	60166	60175	20 %	40 %	20 %	20 %	525937685
1130	NC_021845	TGC	2	6	60176	60181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937685
1131	NC_021845	CTC	2	6	60319	60324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525937685
1132	NC_021845	TTA	2	6	60478	60483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525937685
1133	NC_021845	TGA	2	6	60605	60610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937685
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1135	NC_021845	T	6	6	60677	60682	0 %	100 %	0 %	0 %	525937685
1136	NC_021845	TTC	2	6	60761	60766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525937685
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1139	NC_021845	TGGA	2	8	60961	60968	25 %	25 %	50 %	0 %	525937685
1140	NC_021845	ACT	2	6	60970	60975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937685
1141	NC_021845	GGA	2	6	61005	61010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525937685
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1143	NC_021845	A	6	6	61210	61215	100 %	0 %	0 %	0 %	525937685
1144	NC_021845	TCA	2	6	61251	61256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937685
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1151	NC_021845	GTG	2	6	61632	61637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525937685
1152	NC_021845	CAA	2	6	61658	61663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937685
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1155	NC_021845	AAC	2	6	61887	61892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525937685
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1158	NC_021845	AAAG	2	8	61989	61996	75 %	0 %	25 %	0 %	525937685
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1165	NC_021845	CAC	2	6	62497	62502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1166	NC_021845	TCT	2	6	62506	62511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1167	NC_021845	TTG	2	6	62523	62528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1168	NC_021845	CTC	2	6	62542	62547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1171	NC_021845	ACA	2	6	62722	62727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1172	NC_021845	ATT	2	6	62873	62878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1174	NC_021845	TTTA	2	8	63023	63030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_021845	AAT	2	6	63056	63061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1176	NC_021845	ACA	2	6	63146	63151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1177	NC_021845	ATT	2	6	63158	63163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1178	NC_021845	ATT	2	6	63179	63184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1179	NC_021845	T	6	6	63202	63207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1180	NC_021845	TAG	2	6	63234	63239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1181	NC_021845	TTA	2	6	63247	63252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1182	NC_021845	TGATC	2	10	63266	63275	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1183	NC_021845	GTT	2	6	63277	63282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1184	NC_021845	T	7	7	63344	63350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1192	NC_021845	CAT	2	6	63779	63784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937686
1193	NC_021845	ATC	2	6	63799	63804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525937686
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1250	NC_021845	GTA	2	6	66969	66974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937687
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1252	NC_021845	TGA	2	6	67025	67030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525937687
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1254	NC_021845	TGC	2	6	67079	67084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937687
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1257	NC_021845	GCG	2	6	67167	67172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937687
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1259	NC_021845	GCTT	2	8	67312	67319	0 %	50 %	25 %	25 %	525937687
1260	NC_021845	CTG	3	9	67395	67403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937687
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1273	NC_021845	CGT	2	6	67802	67807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937687
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1280	NC_021845	CGG	2	6	68305	68310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525937687
1281	NC_021845	CTT	3	9	68324	68332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1282	NC_021845	ATTCT	2	10	68420	68429	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1360	NC_021845	T	6	6	71816	71821	0 %	100 %	0 %	0 %	525937695
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1371	NC_021845	AACA	2	8	72183	72190	75 %	0 %	0 %	25 %	525937695
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1380	NC_021845	CG	3	6	72598	72603	0 %	0 %	50 %	50 %	525937695
1381	NC_021845	TGC	3	9	72611	72619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525937695
1382	NC_021845	GCATCT	2	12	72622	72633	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525937695
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