MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 99930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021844	GTT	2	6	163257	163262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945647
3502	NC_021844	GGT	2	6	163267	163272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945647
3503	NC_021844	TCC	2	6	163276	163281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945647
3504	NC_021844	GCT	2	6	163294	163299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945647
3505	NC_021844	TCA	2	6	163330	163335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945647
3506	NC_021844	GAT	2	6	163339	163344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945647
3507	NC_021844	CCTT	2	8	163351	163358	0 %	50 %	0 %	50 %	525945647
3508	NC_021844	CCG	2	6	163363	163368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945647
3509	NC_021844	TGA	2	6	163378	163383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945647
3510	NC_021844	GAC	2	6	163468	163473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945647
3511	NC_021844	GC	3	6	163494	163499	0 %	0 %	50 %	50 %	525945647
3512	NC_021844	GCA	2	6	163549	163554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945647
3513	NC_021844	AAC	2	6	163592	163597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945647
3514	NC_021844	GCA	2	6	163609	163614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945647
3515	NC_021844	GTTT	2	8	163645	163652	0 %	75 %	25 %	0 %	525945647
3516	NC_021844	CTG	2	6	163677	163682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945647
3517	NC_021844	TAC	2	6	163871	163876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945647
3518	NC_021844	ATT	2	6	163931	163936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945648
3519	NC_021844	AGTT	2	8	163994	164001	25 %	50 %	25 %	0 %	525945648
3520	NC_021844	CAT	2	6	164058	164063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945648
3521	NC_021844	T	6	6	164091	164096	0 %	100 %	0 %	0 %	525945648
3522	NC_021844	TGT	2	6	164105	164110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945648
3523	NC_021844	TGCGC	2	10	164162	164171	0 %	20 %	40 %	40 %	525945648
3524	NC_021844	CAT	2	6	164172	164177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945648
3525	NC_021844	GTT	2	6	164199	164204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945648
3526	NC_021844	GC	3	6	164279	164284	0 %	0 %	50 %	50 %	525945648
3527	NC_021844	GTT	2	6	164321	164326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945648
3528	NC_021844	GCC	2	6	164443	164448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945648
3529	NC_021844	GATT	2	8	164480	164487	25 %	50 %	25 %	0 %	525945648
3530	NC_021844	TCG	2	6	164494	164499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945648
3531	NC_021844	GCG	2	6	164521	164526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945648
3532	NC_021844	CTAA	2	8	164527	164534	50 %	25 %	0 %	25 %	525945648
3533	NC_021844	TTCA	2	8	164550	164557	25 %	50 %	0 %	25 %	525945648
3534	NC_021844	GC	3	6	164573	164578	0 %	0 %	50 %	50 %	525945648
3535	NC_021844	GCA	2	6	164597	164602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945648
3536	NC_021844	ACG	2	6	164650	164655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945648
3537	NC_021844	AAGT	2	8	164689	164696	50 %	25 %	25 %	0 %	525945648
3538	NC_021844	GA	3	6	164816	164821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021844	CAG	2	6	164928	164933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945649
3540	NC_021844	GAA	2	6	165050	165055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945649
3541	NC_021844	AGC	2	6	165151	165156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945649
3542	NC_021844	GGC	2	6	165170	165175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945649
3543	NC_021844	CG	3	6	165202	165207	0 %	0 %	50 %	50 %	525945649
3544	NC_021844	TGCG	2	8	165213	165220	0 %	25 %	50 %	25 %	525945649
3545	NC_021844	TGG	2	6	165393	165398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945649
3546	NC_021844	CGG	2	6	165399	165404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945649
3547	NC_021844	CCG	2	6	165462	165467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945649
3548	NC_021844	CGT	2	6	165484	165489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945649
3549	NC_021844	ATT	2	6	165509	165514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945649
3550	NC_021844	GAA	2	6	165554	165559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945649
3551	NC_021844	TTG	2	6	165569	165574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945649
3552	NC_021844	GGC	2	6	165619	165624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945649
3553	NC_021844	T	8	8	165662	165669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021844	ATG	2	6	165687	165692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021844	TTC	2	6	165815	165820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945650
3556	NC_021844	GTT	2	6	165856	165861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945650
3557	NC_021844	TGG	2	6	165885	165890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945650
3558	NC_021844	CTG	2	6	165911	165916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945650
3559	NC_021844	CGA	3	9	165948	165956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945650
3560	NC_021844	CGG	2	6	165957	165962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945650
3561	NC_021844	TGG	2	6	166047	166052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945650
3562	NC_021844	GC	3	6	166056	166061	0 %	0 %	50 %	50 %	525945650
3563	NC_021844	TGG	2	6	166080	166085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945650
3564	NC_021844	ATT	2	6	166130	166135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945650
3565	NC_021844	CTGG	2	8	166154	166161	0 %	25 %	50 %	25 %	525945650
3566	NC_021844	CAT	2	6	166255	166260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945650
3567	NC_021844	GAA	2	6	166289	166294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945650
3568	NC_021844	GGC	2	6	166318	166323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945650
3569	NC_021844	GAA	2	6	166340	166345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945650
3570	NC_021844	CAG	2	6	166558	166563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945651
3571	NC_021844	CGT	2	6	166573	166578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945651
3572	NC_021844	GCCTTC	2	12	166582	166593	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525945651
3573	NC_021844	T	6	6	166602	166607	0 %	100 %	0 %	0 %	525945651
3574	NC_021844	T	7	7	166784	166790	0 %	100 %	0 %	0 %	525945651
3575	NC_021844	CCGA	2	8	166907	166914	25 %	0 %	25 %	50 %	525945651
3576	NC_021844	GCC	2	6	166916	166921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945651
3577	NC_021844	CGT	2	6	166930	166935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945651
3578	NC_021844	CGA	2	6	166997	167002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945651
3579	NC_021844	GTTT	2	8	167015	167022	0 %	75 %	25 %	0 %	525945651
3580	NC_021844	TAT	2	6	167110	167115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021844	TTAC	2	8	167139	167146	25 %	50 %	0 %	25 %	525945652
3582	NC_021844	GCC	2	6	167163	167168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945652
3583	NC_021844	CCA	2	6	167198	167203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945652
3584	NC_021844	AACA	2	8	167229	167236	75 %	0 %	0 %	25 %	525945652
3585	NC_021844	AATC	2	8	167327	167334	50 %	25 %	0 %	25 %	525945652
3586	NC_021844	GCC	2	6	167401	167406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945652
3587	NC_021844	GGTA	2	8	167439	167446	25 %	25 %	50 %	0 %	525945652
3588	NC_021844	CGT	2	6	167451	167456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945652
3589	NC_021844	CGT	2	6	167480	167485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945652
3590	NC_021844	GC	3	6	167494	167499	0 %	0 %	50 %	50 %	525945652
3591	NC_021844	CTG	2	6	167547	167552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945652
3592	NC_021844	T	7	7	167585	167591	0 %	100 %	0 %	0 %	525945652
3593	NC_021844	CAT	2	6	167592	167597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945652
3594	NC_021844	TCG	2	6	167612	167617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945653
3595	NC_021844	TAA	2	6	167620	167625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945653
3596	NC_021844	CAT	2	6	167733	167738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945653
3597	NC_021844	TTC	2	6	167788	167793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945653
3598	NC_021844	ATT	2	6	167797	167802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945653
3599	NC_021844	CAA	2	6	167820	167825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945653
3600	NC_021844	TTA	2	6	167889	167894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945653
3601	NC_021844	TCA	2	6	167900	167905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945653
3602	NC_021844	GCC	2	6	167912	167917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945653
3603	NC_021844	T	6	6	167920	167925	0 %	100 %	0 %	0 %	525945653
3604	NC_021844	T	6	6	167928	167933	0 %	100 %	0 %	0 %	525945653
3605	NC_021844	CGG	2	6	167967	167972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945653
3606	NC_021844	TGC	2	6	167990	167995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945653
3607	NC_021844	CGG	2	6	168003	168008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945653
3608	NC_021844	GGC	2	6	168065	168070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945653
3609	NC_021844	CG	3	6	168119	168124	0 %	0 %	50 %	50 %	525945653
3610	NC_021844	GCC	2	6	168128	168133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945653
3611	NC_021844	CG	3	6	168198	168203	0 %	0 %	50 %	50 %	525945653
3612	NC_021844	GCG	2	6	168263	168268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945653
3613	NC_021844	CGC	2	6	168318	168323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945653
3614	NC_021844	GGC	2	6	168397	168402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945653
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3616	NC_021844	TGG	2	6	168468	168473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945653
3617	NC_021844	CGG	2	6	168519	168524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945653
3618	NC_021844	CGG	2	6	168588	168593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945653
3619	NC_021844	G	6	6	168648	168653	0 %	0 %	100 %	0 %	525945653
3620	NC_021844	TAA	2	6	168654	168659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945653
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3622	NC_021844	CCG	2	6	168752	168757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945653
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3624	NC_021844	TCA	2	6	168792	168797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945653
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3733	NC_021844	CGC	2	6	174394	174399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945659
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3735	NC_021844	TGC	2	6	174411	174416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945659
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3737	NC_021844	TA	3	6	174473	174478	50 %	50 %	0 %	0 %	525945660
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3743	NC_021844	TGC	2	6	174825	174830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945660
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3989	NC_021844	CAT	3	9	186020	186028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949066
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3992	NC_021844	T	6	6	186235	186240	0 %	100 %	0 %	0 %	525945669
3993	NC_021844	GCGTC	2	10	186252	186261	0 %	20 %	40 %	40 %	525945669
3994	NC_021844	CG	3	6	186283	186288	0 %	0 %	50 %	50 %	525945669
3995	NC_021844	CGG	2	6	186345	186350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945669
3996	NC_021844	GTT	2	6	186421	186426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945669
3997	NC_021844	TGC	2	6	186462	186467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945669
3998	NC_021844	TCA	2	6	186557	186562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945669
3999	NC_021844	CG	3	6	186609	186614	0 %	0 %	50 %	50 %	525945669
4000	NC_021844	GGC	2	6	186649	186654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945669

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