MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 99930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_021844	GTG	2	6	115007	115012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945612
2503	NC_021844	TC	3	6	115020	115025	0 %	50 %	0 %	50 %	525945612
2504	NC_021844	GAA	2	6	115048	115053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945612
2505	NC_021844	ACT	2	6	115124	115129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945612
2506	NC_021844	GAAA	2	8	115138	115145	75 %	0 %	25 %	0 %	525945612
2507	NC_021844	CTG	2	6	115152	115157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945612
2508	NC_021844	GTT	2	6	115176	115181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945612
2509	NC_021844	TGC	2	6	115272	115277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945612
2510	NC_021844	GGAT	2	8	115339	115346	25 %	25 %	50 %	0 %	525945612
2511	NC_021844	AG	3	6	115360	115365	50 %	0 %	50 %	0 %	525945612
2512	NC_021844	TC	3	6	115376	115381	0 %	50 %	0 %	50 %	525945612
2513	NC_021844	CTG	2	6	115492	115497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945612
2514	NC_021844	GTT	2	6	115550	115555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945612
2515	NC_021844	CGG	2	6	115599	115604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945612
2516	NC_021844	A	7	7	115624	115630	100 %	0 %	0 %	0 %	525945612
2517	NC_021844	TATT	2	8	115724	115731	25 %	75 %	0 %	0 %	525945612
2518	NC_021844	TCC	2	6	115809	115814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945612
2519	NC_021844	CGG	2	6	115889	115894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945612
2520	NC_021844	TCC	2	6	115961	115966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945612
2521	NC_021844	TGA	2	6	115992	115997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945612
2522	NC_021844	TTG	2	6	116017	116022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945612
2523	NC_021844	TGT	2	6	116037	116042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945612
2524	NC_021844	C	6	6	116043	116048	0 %	0 %	0 %	100 %	525945612
2525	NC_021844	GTTC	2	8	116086	116093	0 %	50 %	25 %	25 %	525945612
2526	NC_021844	AT	3	6	116107	116112	50 %	50 %	0 %	0 %	525945612
2527	NC_021844	CAG	2	6	116113	116118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945612
2528	NC_021844	AAG	2	6	116153	116158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945612
2529	NC_021844	TTAC	2	8	116205	116212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2530	NC_021844	CATA	2	8	116221	116228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_021844	ACA	2	6	116328	116333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945613
2532	NC_021844	CTA	2	6	116392	116397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945613
2533	NC_021844	TGAT	2	8	116545	116552	25 %	50 %	25 %	0 %	525945613
2534	NC_021844	GGCGC	2	10	116553	116562	0 %	0 %	60 %	40 %	525945613
2535	NC_021844	GAA	2	6	116571	116576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945613
2536	NC_021844	GAT	2	6	116667	116672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945613
2537	NC_021844	GAG	2	6	116727	116732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945613
2538	NC_021844	TTC	2	6	116881	116886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945613
2539	NC_021844	TAC	2	6	116951	116956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945613
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2541	NC_021844	GAT	2	6	117036	117041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945613
2542	NC_021844	GAT	2	6	117059	117064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945613
2543	NC_021844	AT	3	6	117107	117112	50 %	50 %	0 %	0 %	525945614
2544	NC_021844	A	6	6	117189	117194	100 %	0 %	0 %	0 %	525945614
2545	NC_021844	TAA	2	6	117218	117223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945614
2546	NC_021844	ATG	2	6	117249	117254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945614
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2548	NC_021844	ACA	2	6	117502	117507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949057
2549	NC_021844	AGT	2	6	117511	117516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949057
2550	NC_021844	GGCT	2	8	117604	117611	0 %	25 %	50 %	25 %	525949057
2551	NC_021844	TTC	2	6	117621	117626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949057
2552	NC_021844	TGC	2	6	117665	117670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949057
2553	NC_021844	AAT	2	6	117727	117732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949057
2554	NC_021844	TTA	2	6	117818	117823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945615
2555	NC_021844	TTGA	2	8	117991	117998	25 %	50 %	25 %	0 %	525945615
2556	NC_021844	T	6	6	118003	118008	0 %	100 %	0 %	0 %	525945615
2557	NC_021844	CCG	3	9	118016	118024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945615
2558	NC_021844	GCTTC	2	10	118095	118104	0 %	40 %	20 %	40 %	525945615
2559	NC_021844	ACC	2	6	118113	118118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945615
2560	NC_021844	GA	3	6	118213	118218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_021844	CAA	2	6	118260	118265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_021844	ACG	2	6	118335	118340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_021844	AATG	2	8	118352	118359	50 %	25 %	25 %	0 %	525949058
2564	NC_021844	GCCT	2	8	118440	118447	0 %	25 %	25 %	50 %	525949058
2565	NC_021844	ATT	2	6	118584	118589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949058
2566	NC_021844	CGAC	2	8	118594	118601	25 %	0 %	25 %	50 %	525949058
2567	NC_021844	CTT	2	6	118642	118647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949058
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2570	NC_021844	CGC	2	6	118829	118834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949058
2571	NC_021844	T	6	6	118847	118852	0 %	100 %	0 %	0 %	525949058
2572	NC_021844	TAT	2	6	118859	118864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949058
2573	NC_021844	TGGC	2	8	118865	118872	0 %	25 %	50 %	25 %	525949058
2574	NC_021844	CGC	2	6	118886	118891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949058
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2581	NC_021844	TG	3	6	119249	119254	0 %	50 %	50 %	0 %	525949058
2582	NC_021844	GGC	3	9	119273	119281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949058
2583	NC_021844	TCCA	2	8	119379	119386	25 %	25 %	0 %	50 %	525949058
2584	NC_021844	GCG	2	6	119421	119426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949058
2585	NC_021844	GCT	2	6	119456	119461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949058
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2589	NC_021844	TGC	2	6	119550	119555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_021844	ACG	2	6	119572	119577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_021844	GTC	2	6	119581	119586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_021844	AAT	2	6	119594	119599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_021844	GGC	2	6	119633	119638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945616
2594	NC_021844	T	7	7	119653	119659	0 %	100 %	0 %	0 %	525945616
2595	NC_021844	ATC	2	6	119837	119842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945616
2596	NC_021844	GCT	2	6	119869	119874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945616
2597	NC_021844	TGA	2	6	119944	119949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945616
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2599	NC_021844	CGCGG	2	10	120085	120094	0 %	0 %	60 %	40 %	525945616
2600	NC_021844	ATA	2	6	120098	120103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945616
2601	NC_021844	CAGG	2	8	120162	120169	25 %	0 %	50 %	25 %	525945616
2602	NC_021844	CAG	2	6	120188	120193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945616
2603	NC_021844	CCA	2	6	120196	120201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945616
2604	NC_021844	CCG	2	6	120205	120210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945616
2605	NC_021844	ATG	2	6	120266	120271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945616
2606	NC_021844	CGG	2	6	120286	120291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945616
2607	NC_021844	TGC	2	6	120294	120299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945616
2608	NC_021844	CGT	2	6	120346	120351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945616
2609	NC_021844	GC	3	6	120360	120365	0 %	0 %	50 %	50 %	525945616
2610	NC_021844	GC	3	6	120369	120374	0 %	0 %	50 %	50 %	525945616
2611	NC_021844	CGG	2	6	120376	120381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945616
2612	NC_021844	CCA	2	6	120433	120438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945616
2613	NC_021844	GCC	2	6	120467	120472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945616
2614	NC_021844	ACG	2	6	120570	120575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945616
2615	NC_021844	GCC	2	6	120590	120595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945616
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2618	NC_021844	TGA	2	6	120849	120854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945616
2619	NC_021844	CA	3	6	120879	120884	50 %	0 %	0 %	50 %	525945616
2620	NC_021844	CCA	2	6	120956	120961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945616
2621	NC_021844	A	6	6	121075	121080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_021844	AGT	2	6	121132	121137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945617
2623	NC_021844	TTG	2	6	121146	121151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945617
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2984	NC_021844	CAA	2	6	137285	137290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2989	NC_021844	ATA	2	6	137452	137457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2992	NC_021844	TGC	2	6	137553	137558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2993	NC_021844	T	6	6	137559	137564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_021844	AT	3	6	137635	137640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2995	NC_021844	GTG	2	6	137912	137917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945631
2996	NC_021844	ATA	2	6	137986	137991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945631
2997	NC_021844	ATT	2	6	138048	138053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945631
2998	NC_021844	CGCC	2	8	138061	138068	0 %	0 %	25 %	75 %	525945631
2999	NC_021844	GCT	2	6	138073	138078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945631
3000	NC_021844	CTG	2	6	138087	138092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945631

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