MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 99930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_021844	GCT	2	6	91805	91810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945594
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2005	NC_021844	T	6	6	91888	91893	0 %	100 %	0 %	0 %	525945594
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2007	NC_021844	TACTG	2	10	91998	92007	20 %	40 %	20 %	20 %	525945594
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2243	NC_021844	TGT	2	6	102115	102120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_021844	ACT	2	6	102171	102176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2245	NC_021844	AATA	2	8	102227	102234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2246	NC_021844	TGG	2	6	102448	102453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945602
2247	NC_021844	ACCA	2	8	102468	102475	50 %	0 %	0 %	50 %	525945602
2248	NC_021844	AAG	2	6	102484	102489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945602
2249	NC_021844	GCG	2	6	102526	102531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945602
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2251	NC_021844	CGA	2	6	102602	102607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945602
2252	NC_021844	ACA	2	6	102619	102624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945602
2253	NC_021844	ACG	2	6	102657	102662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945602
2254	NC_021844	CAG	2	6	102686	102691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945602
2255	NC_021844	ATC	2	6	102741	102746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945602
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2257	NC_021844	ATCG	2	8	102780	102787	25 %	25 %	25 %	25 %	525945602
2258	NC_021844	CG	3	6	102786	102791	0 %	0 %	50 %	50 %	525945602
2259	NC_021844	A	7	7	102803	102809	100 %	0 %	0 %	0 %	525945602
2260	NC_021844	TTA	2	6	102897	102902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945602
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2264	NC_021844	TAC	2	6	103200	103205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945602
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2268	NC_021844	A	7	7	103608	103614	100 %	0 %	0 %	0 %	525945603
2269	NC_021844	CGG	2	6	103759	103764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945603
2270	NC_021844	GAT	2	6	103781	103786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945603
2271	NC_021844	CGGCG	2	10	103844	103853	0 %	0 %	60 %	40 %	525945603
2272	NC_021844	GTG	2	6	104010	104015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945603
2273	NC_021844	CTG	2	6	104028	104033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945603
2274	NC_021844	TACGC	2	10	104096	104105	20 %	20 %	20 %	40 %	525945603
2275	NC_021844	T	6	6	104268	104273	0 %	100 %	0 %	0 %	525945603
2276	NC_021844	TGA	2	6	104299	104304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945603
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2285	NC_021844	GAT	2	6	104866	104871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945604
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2290	NC_021844	TCA	2	6	105130	105135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945604
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2293	NC_021844	TGGC	2	8	105353	105360	0 %	25 %	50 %	25 %	525945604
2294	NC_021844	TCT	2	6	105438	105443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945604
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2302	NC_021844	T	8	8	105760	105767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2312	NC_021844	CGC	2	6	106113	106118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945605
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2326	NC_021844	GCT	2	6	106580	106585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945606
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2354	NC_021844	GTCA	2	8	107556	107563	25 %	25 %	25 %	25 %	525945606
2355	NC_021844	ATGCCA	2	12	107659	107670	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525945606
2356	NC_021844	GCA	2	6	107693	107698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945606
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2358	NC_021844	CAG	2	6	107760	107765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945606
2359	NC_021844	CGG	2	6	107807	107812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945606
2360	NC_021844	AAGG	2	8	107878	107885	50 %	0 %	50 %	0 %	525945606
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2365	NC_021844	CGC	3	9	108038	108046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945607
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2367	NC_021844	CGCT	2	8	108167	108174	0 %	25 %	25 %	50 %	525945607
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2370	NC_021844	CGG	2	6	108383	108388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945607
2371	NC_021844	TGGC	2	8	108431	108438	0 %	25 %	50 %	25 %	525945607
2372	NC_021844	GAT	2	6	108446	108451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945607
2373	NC_021844	TTGC	2	8	108462	108469	0 %	50 %	25 %	25 %	525945607
2374	NC_021844	CTG	2	6	108491	108496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945607
2375	NC_021844	CCG	2	6	108531	108536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945607
2376	NC_021844	GGC	2	6	108547	108552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945607
2377	NC_021844	GCT	2	6	108647	108652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945607
2378	NC_021844	GTG	2	6	108678	108683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945607
2379	NC_021844	CG	3	6	108684	108689	0 %	0 %	50 %	50 %	525945607
2380	NC_021844	G	6	6	108779	108784	0 %	0 %	100 %	0 %	525945607
2381	NC_021844	GC	3	6	108793	108798	0 %	0 %	50 %	50 %	525945607
2382	NC_021844	TGG	2	6	108799	108804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945607
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2385	NC_021844	GGC	2	6	108929	108934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945607
2386	NC_021844	CAC	2	6	108944	108949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945607
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2390	NC_021844	CATCGC	2	12	109133	109144	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525945607
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2392	NC_021844	CACCT	2	10	109220	109229	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2393	NC_021844	TGCC	2	8	109317	109324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2394	NC_021844	CTT	2	6	109368	109373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945608
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2397	NC_021844	CTAC	2	8	109532	109539	25 %	25 %	0 %	50 %	525945608
2398	NC_021844	GAT	2	6	109563	109568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945608
2399	NC_021844	CTA	2	6	109617	109622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945608
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2403	NC_021844	CGT	2	6	109819	109824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945608
2404	NC_021844	CGG	2	6	109869	109874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945608
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2412	NC_021844	GTC	2	6	110330	110335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945608
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2423	NC_021844	A	7	7	110722	110728	100 %	0 %	0 %	0 %	525945608
2424	NC_021844	TG	3	6	110753	110758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2425	NC_021844	T	6	6	110794	110799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2426	NC_021844	TAA	2	6	110857	110862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949054
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2439	NC_021844	GCC	2	6	111507	111512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2440	NC_021844	ACG	2	6	111564	111569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2443	NC_021844	CCT	2	6	111666	111671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2445	NC_021844	CA	3	6	111771	111776	50 %	0 %	0 %	50 %	525949055
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2449	NC_021844	AGA	2	6	112041	112046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949055
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2453	NC_021844	AATT	2	8	112320	112327	50 %	50 %	0 %	0 %	525949055
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2464	NC_021844	TTTG	2	8	112998	113005	0 %	75 %	25 %	0 %	525945610
2465	NC_021844	ATT	2	6	113083	113088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945610
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2469	NC_021844	ATAA	2	8	113272	113279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2470	NC_021844	A	6	6	113278	113283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2471	NC_021844	ATGA	2	8	113343	113350	50 %	25 %	25 %	0 %	525945611
2472	NC_021844	CT	3	6	113362	113367	0 %	50 %	0 %	50 %	525945611
2473	NC_021844	T	7	7	113425	113431	0 %	100 %	0 %	0 %	525945611
2474	NC_021844	TTC	2	6	113442	113447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945611
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2478	NC_021844	CTGG	2	8	113751	113758	0 %	25 %	50 %	25 %	525945611
2479	NC_021844	TAC	2	6	113769	113774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945611
2480	NC_021844	GTTTT	2	10	113785	113794	0 %	80 %	20 %	0 %	525945611
2481	NC_021844	GTC	2	6	113913	113918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945611
2482	NC_021844	GATTG	2	10	113927	113936	20 %	40 %	40 %	0 %	525945611
2483	NC_021844	A	7	7	114006	114012	100 %	0 %	0 %	0 %	525945611
2484	NC_021844	ATG	2	6	114033	114038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945611
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2487	NC_021844	TTC	2	6	114136	114141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945611
2488	NC_021844	TTA	2	6	114171	114176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945611
2489	NC_021844	TGA	2	6	114227	114232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945611
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2491	NC_021844	TTA	2	6	114493	114498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945611
2492	NC_021844	GCT	2	6	114593	114598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945611
2493	NC_021844	ATT	2	6	114618	114623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945611
2494	NC_021844	ATT	2	6	114654	114659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945611
2495	NC_021844	AACT	2	8	114735	114742	50 %	25 %	0 %	25 %	525945612
2496	NC_021844	AAT	2	6	114807	114812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945612
2497	NC_021844	TCG	2	6	114814	114819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945612
2498	NC_021844	GGCA	2	8	114857	114864	25 %	0 %	50 %	25 %	525945612
2499	NC_021844	TGG	2	6	114887	114892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945612
2500	NC_021844	A	6	6	114912	114917	100 %	0 %	0 %	0 %	525945612

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