MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 99930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1503	NC_021844	GGGC	2	8	71891	71898	0 %	0 %	75 %	25 %	525945579
1504	NC_021844	GTC	2	6	71971	71976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945579
1505	NC_021844	CGA	2	6	71994	71999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945579
1506	NC_021844	AAT	2	6	72034	72039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945579
1507	NC_021844	CAG	2	6	72109	72114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945579
1508	NC_021844	ATG	2	6	72140	72145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945579
1509	NC_021844	CGC	2	6	72159	72164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945579
1510	NC_021844	CCT	2	6	72189	72194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945579
1511	NC_021844	CAA	2	6	72240	72245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945579
1512	NC_021844	ATGTG	2	10	72251	72260	20 %	40 %	40 %	0 %	525945579
1513	NC_021844	GC	3	6	72268	72273	0 %	0 %	50 %	50 %	525945579
1514	NC_021844	AT	3	6	72299	72304	50 %	50 %	0 %	0 %	525945579
1515	NC_021844	TAT	2	6	72390	72395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945580
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1517	NC_021844	C	6	6	72639	72644	0 %	0 %	0 %	100 %	525945580
1518	NC_021844	GC	3	6	72775	72780	0 %	0 %	50 %	50 %	525945580
1519	NC_021844	CGATG	2	10	72825	72834	20 %	20 %	40 %	20 %	525945580
1520	NC_021844	GCG	2	6	72859	72864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945580
1521	NC_021844	GAAA	2	8	72885	72892	75 %	0 %	25 %	0 %	525945580
1522	NC_021844	CCA	2	6	72927	72932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945580
1523	NC_021844	AGC	2	6	72946	72951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945580
1524	NC_021844	TGA	2	6	72969	72974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945580
1525	NC_021844	CGC	2	6	73044	73049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945580
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1529	NC_021844	GAA	2	6	73486	73491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945580
1530	NC_021844	TTG	2	6	73498	73503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945580
1531	NC_021844	ACC	2	6	73531	73536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945580
1532	NC_021844	CGC	2	6	73541	73546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945580
1533	NC_021844	TC	3	6	73593	73598	0 %	50 %	0 %	50 %	525945581
1534	NC_021844	GGC	2	6	73622	73627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945581
1535	NC_021844	ACT	2	6	73657	73662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945581
1536	NC_021844	CGA	2	6	73710	73715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945581
1537	NC_021844	G	6	6	73743	73748	0 %	0 %	100 %	0 %	525945581
1538	NC_021844	GGT	2	6	73762	73767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945581
1539	NC_021844	GGC	2	6	73783	73788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945581
1540	NC_021844	TCA	2	6	73906	73911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945581
1541	NC_021844	GCG	2	6	73929	73934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945581
1542	NC_021844	A	6	6	74004	74009	100 %	0 %	0 %	0 %	525945581
1543	NC_021844	GC	3	6	74022	74027	0 %	0 %	50 %	50 %	525945581
1544	NC_021844	GC	4	8	74087	74094	0 %	0 %	50 %	50 %	525945581
1545	NC_021844	CGGCG	2	10	74143	74152	0 %	0 %	60 %	40 %	525945581
1546	NC_021844	CG	3	6	74166	74171	0 %	0 %	50 %	50 %	525945581
1547	NC_021844	TGG	2	6	74172	74177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945581
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1549	NC_021844	CAG	2	6	74273	74278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945581
1550	NC_021844	TGG	2	6	74285	74290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945581
1551	NC_021844	GCG	2	6	74346	74351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945581
1552	NC_021844	TCA	2	6	74361	74366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945581
1553	NC_021844	GTC	2	6	74378	74383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945581
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1555	NC_021844	CTGGCG	2	12	74462	74473	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525945581
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1557	NC_021844	GCC	2	6	74588	74593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945581
1558	NC_021844	CG	3	6	74633	74638	0 %	0 %	50 %	50 %	525945581
1559	NC_021844	GGCG	2	8	74653	74660	0 %	0 %	75 %	25 %	525945581
1560	NC_021844	ATC	2	6	74672	74677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945581
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1562	NC_021844	GTGC	2	8	74686	74693	0 %	25 %	50 %	25 %	525945581
1563	NC_021844	GCA	2	6	74701	74706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945581
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1565	NC_021844	TCG	2	6	74730	74735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945581
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1569	NC_021844	CGA	2	6	74856	74861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945581
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1588	NC_021844	ACG	2	6	75995	76000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945581
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1601	NC_021844	ACG	2	6	76471	76476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945582
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1603	NC_021844	CAA	2	6	76557	76562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945582
1604	NC_021844	GAAT	2	8	76567	76574	50 %	25 %	25 %	0 %	525945582
1605	NC_021844	GTC	2	6	76595	76600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945582
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1608	NC_021844	ATT	2	6	76679	76684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945582
1609	NC_021844	TCGT	2	8	76693	76700	0 %	50 %	25 %	25 %	525945582
1610	NC_021844	TGA	2	6	76703	76708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945582
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1612	NC_021844	AAAT	2	8	76766	76773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021844	ATT	2	6	76821	76826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021844	CAAT	2	8	76832	76839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_021844	ATG	2	6	76844	76849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021844	A	7	7	76883	76889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021844	TAAT	2	8	76897	76904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021844	A	7	7	76938	76944	100 %	0 %	0 %	0 %	525945583
1619	NC_021844	TGTTA	2	10	76981	76990	20 %	60 %	20 %	0 %	525945583
1620	NC_021844	GTAT	2	8	77006	77013	25 %	50 %	25 %	0 %	525945583
1621	NC_021844	A	7	7	77037	77043	100 %	0 %	0 %	0 %	525945583
1622	NC_021844	ATA	2	6	77074	77079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945583
1623	NC_021844	ATT	2	6	77113	77118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945583
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1627	NC_021844	G	6	6	77342	77347	0 %	0 %	100 %	0 %	525945583
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1749	NC_021844	CGG	2	6	81437	81442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1750	NC_021844	TCG	2	6	81446	81451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1751	NC_021844	GCT	2	6	81573	81578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1752	NC_021844	CGC	2	6	81605	81610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
1753	NC_021844	GCCTTC	2	12	81643	81654	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525949045
1754	NC_021844	CGC	2	6	81660	81665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
1755	NC_021844	GCT	2	6	81666	81671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1756	NC_021844	GCCC	2	8	81706	81713	0 %	0 %	25 %	75 %	525949045
1757	NC_021844	GGC	2	6	81723	81728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1758	NC_021844	GCTCG	2	10	81756	81765	0 %	20 %	40 %	40 %	525949045
1759	NC_021844	CTA	2	6	81774	81779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949045
1760	NC_021844	GCTGG	2	10	81783	81792	0 %	20 %	60 %	20 %	525949045
1761	NC_021844	GGC	2	6	81793	81798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1762	NC_021844	TGG	2	6	81799	81804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949045
1763	NC_021844	CCT	2	6	81827	81832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525949045
1764	NC_021844	TGGC	2	8	81841	81848	0 %	25 %	50 %	25 %	525949045
1765	NC_021844	CTG	2	6	81859	81864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1766	NC_021844	GC	3	6	81888	81893	0 %	0 %	50 %	50 %	525949045
1767	NC_021844	GCT	3	9	81912	81920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1768	NC_021844	CTG	2	6	81946	81951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1769	NC_021844	GC	3	6	82012	82017	0 %	0 %	50 %	50 %	525949045
1770	NC_021844	CGG	2	6	82053	82058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1771	NC_021844	GCT	3	9	82062	82070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1772	NC_021844	AAC	2	6	82108	82113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949045
1773	NC_021844	CG	3	6	82124	82129	0 %	0 %	50 %	50 %	525949045
1774	NC_021844	GCT	3	9	82134	82142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1775	NC_021844	CAA	2	6	82146	82151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949045
1776	NC_021844	CTG	2	6	82156	82161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1777	NC_021844	GCC	2	6	82165	82170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
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1779	NC_021844	TGC	2	6	82181	82186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1780	NC_021844	CTG	2	6	82195	82200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1781	NC_021844	GCTGGG	2	12	82218	82229	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525949045
1782	NC_021844	CTG	3	9	82294	82302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1783	NC_021844	GCT	3	9	82356	82364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1784	NC_021844	GCT	2	6	82410	82415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1785	NC_021844	ATC	2	6	82426	82431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949045
1786	NC_021844	CGG	2	6	82439	82444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1787	NC_021844	GATGGC	2	12	82449	82460	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525949045
1788	NC_021844	CTG	2	6	82461	82466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1789	NC_021844	CT	3	6	82524	82529	0 %	50 %	0 %	50 %	525949045
1790	NC_021844	TGG	2	6	82544	82549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949045
1791	NC_021844	GCGG	2	8	82629	82636	0 %	0 %	75 %	25 %	525949045
1792	NC_021844	CGG	2	6	82710	82715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1793	NC_021844	TGC	2	6	82760	82765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1794	NC_021844	ACA	2	6	82784	82789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949045
1795	NC_021844	TGA	2	6	82802	82807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949045
1796	NC_021844	GGC	2	6	82812	82817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1797	NC_021844	CGG	2	6	82824	82829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949045
1798	NC_021844	CGC	2	6	82848	82853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
1799	NC_021844	GAG	2	6	82861	82866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525949045
1800	NC_021844	TAC	2	6	82897	82902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949045
1801	NC_021844	G	6	6	82930	82935	0 %	0 %	100 %	0 %	525949045
1802	NC_021844	CTG	2	6	82936	82941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949045
1803	NC_021844	GGGC	2	8	82950	82957	0 %	0 %	75 %	25 %	525949045
1804	NC_021844	CCG	3	9	82983	82991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949045
1805	NC_021844	TTA	2	6	83031	83036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945587
1806	NC_021844	GCT	2	6	83039	83044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945587
1807	NC_021844	CTG	2	6	83052	83057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945587
1808	NC_021844	GCT	2	6	83069	83074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945587
1809	NC_021844	CGA	2	6	83110	83115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945587
1810	NC_021844	TGC	2	6	83224	83229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945587
1811	NC_021844	GGT	2	6	83309	83314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945587
1812	NC_021844	GAC	2	6	83331	83336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945587
1813	NC_021844	GGC	2	6	83558	83563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945587
1814	NC_021844	TGATGC	2	12	83589	83600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525945588
1815	NC_021844	ACC	2	6	83633	83638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945588
1816	NC_021844	AGC	2	6	83670	83675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1817	NC_021844	AGC	2	6	83694	83699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1818	NC_021844	AAC	2	6	83720	83725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945588
1819	NC_021844	GAT	2	6	83746	83751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945588
1820	NC_021844	AGG	2	6	83790	83795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945588
1821	NC_021844	ATC	2	6	83813	83818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945588
1822	NC_021844	TGG	2	6	83826	83831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945588
1823	NC_021844	CGC	2	6	83862	83867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945588
1824	NC_021844	TGC	2	6	83883	83888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1825	NC_021844	TGC	2	6	83895	83900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1826	NC_021844	GCC	2	6	83906	83911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945588
1827	NC_021844	GGCG	2	8	83917	83924	0 %	0 %	75 %	25 %	525945588
1828	NC_021844	TCG	2	6	83934	83939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1829	NC_021844	CGG	2	6	83951	83956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945588
1830	NC_021844	TGCGCC	2	12	83958	83969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525945588
1831	NC_021844	CGG	2	6	83982	83987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945588
1832	NC_021844	GCG	2	6	84000	84005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945588
1833	NC_021844	CG	4	8	84004	84011	0 %	0 %	50 %	50 %	525945588
1834	NC_021844	GCA	2	6	84109	84114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1835	NC_021844	GCT	2	6	84136	84141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1836	NC_021844	GAG	3	9	84179	84187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945588
1837	NC_021844	ATG	2	6	84228	84233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945588
1838	NC_021844	GGCT	2	8	84248	84255	0 %	25 %	50 %	25 %	525945588
1839	NC_021844	GCG	2	6	84350	84355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945588
1840	NC_021844	GGA	2	6	84394	84399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945588
1841	NC_021844	CCG	2	6	84403	84408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945588
1842	NC_021844	CGG	2	6	84409	84414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945588
1843	NC_021844	GCT	2	6	84418	84423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1844	NC_021844	AGC	3	9	84492	84500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1845	NC_021844	GGC	2	6	84517	84522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945588
1846	NC_021844	GAT	2	6	84529	84534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945588
1847	NC_021844	GCT	2	6	84541	84546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945588
1848	NC_021844	CGG	2	6	84549	84554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945588
1849	NC_021844	CGG	2	6	84563	84568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945588
1850	NC_021844	AAT	2	6	84606	84611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945588
1851	NC_021844	ATG	2	6	84697	84702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1852	NC_021844	CGC	2	6	84751	84756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945589
1853	NC_021844	GC	3	6	84913	84918	0 %	0 %	50 %	50 %	525945589
1854	NC_021844	GTG	2	6	84927	84932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945589
1855	NC_021844	TGA	2	6	84986	84991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945589
1856	NC_021844	CAC	2	6	85011	85016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945589
1857	NC_021844	CGATG	2	10	85058	85067	20 %	20 %	40 %	20 %	525945589
1858	NC_021844	GC	3	6	85093	85098	0 %	0 %	50 %	50 %	525945589
1859	NC_021844	GCG	2	6	85102	85107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945589
1860	NC_021844	CG	3	6	85258	85263	0 %	0 %	50 %	50 %	525945589
1861	NC_021844	ACG	2	6	85302	85307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945589
1862	NC_021844	TGGG	2	8	85359	85366	0 %	25 %	75 %	0 %	525945589
1863	NC_021844	A	6	6	85413	85418	100 %	0 %	0 %	0 %	525945589
1864	NC_021844	CAGG	2	8	85470	85477	25 %	0 %	50 %	25 %	525945589
1865	NC_021844	CGC	2	6	85483	85488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945589
1866	NC_021844	CGC	2	6	85516	85521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945589
1867	NC_021844	GCG	2	6	85538	85543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945589
1868	NC_021844	CCA	2	6	85556	85561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945589
1869	NC_021844	CGC	2	6	85681	85686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945589
1870	NC_021844	CAT	2	6	85713	85718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945589
1871	NC_021844	CTG	2	6	85796	85801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945589
1872	NC_021844	GGA	2	6	85816	85821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945589
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1874	NC_021844	CCG	2	6	85851	85856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945589
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