MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 99930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021844	CTG	2	6	24110	24115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945544
502	NC_021844	CGT	2	6	24119	24124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945544
503	NC_021844	CTG	2	6	24176	24181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945544
504	NC_021844	TGC	2	6	24187	24192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945544
505	NC_021844	GTGAA	2	10	24231	24240	40 %	20 %	40 %	0 %	525945544
506	NC_021844	ACTG	2	8	24256	24263	25 %	25 %	25 %	25 %	525945544
507	NC_021844	GCAG	2	8	24283	24290	25 %	0 %	50 %	25 %	525945544
508	NC_021844	CGTT	2	8	24303	24310	0 %	50 %	25 %	25 %	525945544
509	NC_021844	A	6	6	24446	24451	100 %	0 %	0 %	0 %	525945544
510	NC_021844	GGT	2	6	24458	24463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945544
511	NC_021844	GGC	2	6	24496	24501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945544
512	NC_021844	TC	3	6	24504	24509	0 %	50 %	0 %	50 %	525945544
513	NC_021844	CTG	2	6	24575	24580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945544
514	NC_021844	AAACAG	2	12	24581	24592	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525945544
515	NC_021844	GCA	2	6	24613	24618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945544
516	NC_021844	GCA	2	6	24635	24640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945544
517	NC_021844	CTG	2	6	24698	24703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945544
518	NC_021844	ACG	2	6	24765	24770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945544
519	NC_021844	GGC	2	6	24835	24840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021844	GAG	2	6	24868	24873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021844	GTA	2	6	24902	24907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945545
522	NC_021844	CGC	2	6	24960	24965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945545
523	NC_021844	GGC	2	6	24996	25001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945545
524	NC_021844	CGAC	2	8	25124	25131	25 %	0 %	25 %	50 %	525945545
525	NC_021844	GCT	2	6	25173	25178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945545
526	NC_021844	GGC	2	6	25267	25272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945545
527	NC_021844	ACG	2	6	25358	25363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945545
528	NC_021844	CAA	2	6	25395	25400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945545
529	NC_021844	TTA	2	6	25403	25408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945545
530	NC_021844	CGA	2	6	25427	25432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945545
531	NC_021844	CTG	2	6	25441	25446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945545
532	NC_021844	AGA	2	6	25461	25466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945545
533	NC_021844	TGA	2	6	25467	25472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945545
534	NC_021844	GCT	2	6	25521	25526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945545
535	NC_021844	CGT	2	6	25540	25545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945545
536	NC_021844	GCC	2	6	25600	25605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945545
537	NC_021844	TGG	2	6	25610	25615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945545
538	NC_021844	GGC	2	6	25639	25644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945545
539	NC_021844	ACA	2	6	25673	25678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945545
540	NC_021844	GCC	2	6	25729	25734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945545
541	NC_021844	CAG	3	9	25899	25907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945546
542	NC_021844	GGC	2	6	25911	25916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945546
543	NC_021844	TCT	2	6	25944	25949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945546
544	NC_021844	GGTA	2	8	26006	26013	25 %	25 %	50 %	0 %	525945546
545	NC_021844	GAA	3	9	26079	26087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945546
546	NC_021844	CTG	2	6	26145	26150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945546
547	NC_021844	GGT	2	6	26217	26222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945546
548	NC_021844	ATG	2	6	26247	26252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945546
549	NC_021844	GCC	2	6	26405	26410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945546
550	NC_021844	CTG	2	6	26484	26489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945546
551	NC_021844	TCG	2	6	26491	26496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945546
552	NC_021844	CTG	2	6	26541	26546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945546
553	NC_021844	CCA	2	6	26623	26628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945546
554	NC_021844	CGG	2	6	26668	26673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945546
555	NC_021844	TGACT	2	10	26675	26684	20 %	40 %	20 %	20 %	525945546
556	NC_021844	CCA	2	6	26698	26703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945546
557	NC_021844	CCA	2	6	26788	26793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945546
558	NC_021844	GTT	2	6	26814	26819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945546
559	NC_021844	CG	3	6	26840	26845	0 %	0 %	50 %	50 %	525945546
560	NC_021844	CAT	2	6	26888	26893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945546
561	NC_021844	GAA	2	6	26922	26927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945546
562	NC_021844	TGG	2	6	26935	26940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945546
563	NC_021844	CG	4	8	26946	26953	0 %	0 %	50 %	50 %	525945546
564	NC_021844	TTC	2	6	26982	26987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945546
565	NC_021844	CAT	2	6	27059	27064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945546
566	NC_021844	CGA	2	6	27119	27124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945546
567	NC_021844	A	6	6	27141	27146	100 %	0 %	0 %	0 %	525945546
568	NC_021844	ACC	2	6	27186	27191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945547
569	NC_021844	GTC	2	6	27197	27202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945547
570	NC_021844	CAA	2	6	27212	27217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945547
571	NC_021844	CGC	2	6	27291	27296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945547
572	NC_021844	AGC	2	6	27336	27341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945547
573	NC_021844	TATC	2	8	27358	27365	25 %	50 %	0 %	25 %	525945547
574	NC_021844	CGG	2	6	27370	27375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945547
575	NC_021844	CGA	2	6	27442	27447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945547
576	NC_021844	GAAGC	2	10	27461	27470	40 %	0 %	40 %	20 %	525945547
577	NC_021844	A	6	6	27578	27583	100 %	0 %	0 %	0 %	525945547
578	NC_021844	T	9	9	27634	27642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021844	CTT	2	6	27736	27741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021844	GAA	2	6	27769	27774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021844	GGA	2	6	27776	27781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021844	ATT	2	6	27813	27818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021844	TAC	2	6	27875	27880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945548
584	NC_021844	TCG	2	6	27887	27892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
585	NC_021844	TCG	2	6	27919	27924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
586	NC_021844	GCG	2	6	27942	27947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945548
587	NC_021844	TGC	2	6	27985	27990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
588	NC_021844	TGG	2	6	27995	28000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945548
589	NC_021844	TGGT	2	8	28011	28018	0 %	50 %	50 %	0 %	525945548
590	NC_021844	TGG	2	6	28039	28044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945548
591	NC_021844	C	6	6	28141	28146	0 %	0 %	0 %	100 %	525945548
592	NC_021844	GGC	2	6	28157	28162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945548
593	NC_021844	GCG	2	6	28188	28193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945548
594	NC_021844	A	7	7	28247	28253	100 %	0 %	0 %	0 %	525945548
595	NC_021844	CTTTT	2	10	28256	28265	0 %	80 %	0 %	20 %	525945548
596	NC_021844	ATT	2	6	28311	28316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945548
597	NC_021844	CTG	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
598	NC_021844	ATT	2	6	28410	28415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945548
599	NC_021844	CTG	2	6	28438	28443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945548
600	NC_021844	A	6	6	28523	28528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021844	TTA	2	6	28592	28597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021844	TCT	2	6	28603	28608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021844	TTAT	2	8	28609	28616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021844	A	7	7	28622	28628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021844	CTT	2	6	28755	28760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021844	A	7	7	28774	28780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021844	GTA	2	6	28782	28787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021844	TGC	2	6	28916	28921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945549
609	NC_021844	GCA	2	6	28947	28952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945549
610	NC_021844	CTA	2	6	28967	28972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945549
611	NC_021844	GTT	2	6	29019	29024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945549
612	NC_021844	GCA	2	6	29097	29102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945549
613	NC_021844	CTT	2	6	29112	29117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945549
614	NC_021844	CGA	2	6	29121	29126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945549
615	NC_021844	GGT	2	6	29209	29214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945549
616	NC_021844	TTA	2	6	29221	29226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945549
617	NC_021844	TGA	2	6	29316	29321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945549
618	NC_021844	GTTG	2	8	29384	29391	0 %	50 %	50 %	0 %	525945549
619	NC_021844	AAT	2	6	29407	29412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945549
620	NC_021844	AGGA	2	8	29459	29466	50 %	0 %	50 %	0 %	525945549
621	NC_021844	CGC	2	6	29475	29480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945549
622	NC_021844	ACGG	2	8	29506	29513	25 %	0 %	50 %	25 %	525945549
623	NC_021844	CTG	2	6	29578	29583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945549
624	NC_021844	ATC	2	6	29674	29679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945549
625	NC_021844	ATT	2	6	29728	29733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945549
626	NC_021844	GTG	2	6	29779	29784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945549
627	NC_021844	TGAAA	2	10	29883	29892	60 %	20 %	20 %	0 %	525945549
628	NC_021844	A	6	6	29890	29895	100 %	0 %	0 %	0 %	525945549
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756	NC_021844	CGC	2	6	36231	36236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945552
757	NC_021844	GGT	2	6	36334	36339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945552
758	NC_021844	CTGGT	2	10	36490	36499	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
759	NC_021844	T	6	6	36516	36521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
760	NC_021844	TCA	2	6	36532	36537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
761	NC_021844	TCA	2	6	36565	36570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
762	NC_021844	AAC	2	6	36603	36608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
763	NC_021844	TGT	2	6	36666	36671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945553
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770	NC_021844	GTG	2	6	36946	36951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945553
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775	NC_021844	ACG	2	6	37241	37246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945553
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786	NC_021844	ATTA	2	8	37673	37680	50 %	50 %	0 %	0 %	525945553
787	NC_021844	CGT	2	6	37779	37784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
788	NC_021844	CCG	2	6	37840	37845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945554
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790	NC_021844	GC	3	6	37871	37876	0 %	0 %	50 %	50 %	525945554
791	NC_021844	TAT	2	6	37920	37925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945554
792	NC_021844	ATC	2	6	37936	37941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945554
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801	NC_021844	CCGGC	2	10	38297	38306	0 %	0 %	40 %	60 %	525945554
802	NC_021844	GGC	2	6	38325	38330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945554
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841	NC_021844	GCG	2	6	39722	39727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949040
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868	NC_021844	TAT	2	6	40758	40763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945556
869	NC_021844	GCGA	2	8	40783	40790	25 %	0 %	50 %	25 %	525945556
870	NC_021844	CAG	2	6	40891	40896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945556
871	NC_021844	GCC	2	6	40931	40936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945556
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873	NC_021844	ACG	2	6	40955	40960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945556
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875	NC_021844	TATC	2	8	41004	41011	25 %	50 %	0 %	25 %	525945556
876	NC_021844	TGA	2	6	41060	41065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945556
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878	NC_021844	TCT	2	6	41174	41179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945556
879	NC_021844	CGG	2	6	41211	41216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945556
880	NC_021844	GCT	2	6	41232	41237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945556
881	NC_021844	GCGCT	2	10	41284	41293	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
882	NC_021844	CG	3	6	41377	41382	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
883	NC_021844	CGT	2	6	41420	41425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945557
884	NC_021844	GATC	2	8	41437	41444	25 %	25 %	25 %	25 %	525945557
885	NC_021844	GC	3	6	41506	41511	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
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891	NC_021844	GC	3	6	41780	41785	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
892	NC_021844	CG	3	6	41792	41797	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
893	NC_021844	GC	3	6	41949	41954	0 %	0 %	50 %	50 %	525945557
894	NC_021844	A	6	6	41996	42001	100 %	0 %	0 %	0 %	525945557
895	NC_021844	A	7	7	42105	42111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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