MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 99930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021844	TCT	2	6	281165	281170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945733
6002	NC_021844	GCTG	2	8	281189	281196	0 %	25 %	50 %	25 %	525945733
6003	NC_021844	GCG	2	6	281237	281242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945733
6004	NC_021844	CGA	2	6	281255	281260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945733
6005	NC_021844	ATT	2	6	281263	281268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945733
6006	NC_021844	CTG	2	6	281278	281283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945733
6007	NC_021844	CTG	2	6	281290	281295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945733
6008	NC_021844	GTG	2	6	281302	281307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945733
6009	NC_021844	AAG	2	6	281326	281331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945733
6010	NC_021844	CAT	2	6	281340	281345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945734
6011	NC_021844	AAT	2	6	281362	281367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945734
6012	NC_021844	GTC	2	6	281440	281445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945734
6013	NC_021844	GCT	2	6	281535	281540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945734
6014	NC_021844	GCC	2	6	281544	281549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945734
6015	NC_021844	GGC	2	6	281563	281568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945734
6016	NC_021844	GAT	2	6	281593	281598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945734
6017	NC_021844	GC	3	6	281633	281638	0 %	0 %	50 %	50 %	525945734
6018	NC_021844	CTG	2	6	281647	281652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945734
6019	NC_021844	TGG	2	6	281663	281668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945734
6020	NC_021844	ATT	2	6	281692	281697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945734
6021	NC_021844	CGG	2	6	281721	281726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945734
6022	NC_021844	CAT	3	9	281739	281747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945734
6023	NC_021844	CTG	3	9	281782	281790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945734
6024	NC_021844	GCTGGT	2	12	281793	281804	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525945734
6025	NC_021844	CGCTG	2	10	281832	281841	0 %	20 %	40 %	40 %	525945734
6026	NC_021844	CG	3	6	281884	281889	0 %	0 %	50 %	50 %	525945734
6027	NC_021844	GGCG	2	8	281937	281944	0 %	0 %	75 %	25 %	525945734
6028	NC_021844	GCC	2	6	282046	282051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945734
6029	NC_021844	GC	3	6	282071	282076	0 %	0 %	50 %	50 %	525945734
6030	NC_021844	GCC	2	6	282078	282083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945734
6031	NC_021844	TGG	2	6	282139	282144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945734
6032	NC_021844	CTG	2	6	282172	282177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945734
6033	NC_021844	TTA	2	6	282263	282268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_021844	CGA	2	6	282298	282303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_021844	GGT	2	6	282358	282363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_021844	TGG	2	6	282513	282518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_021844	GAT	2	6	282532	282537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_021844	CGT	2	6	282635	282640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_021844	AGCG	2	8	282642	282649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6040	NC_021844	GGC	2	6	282722	282727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_021844	TGA	2	6	282741	282746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_021844	TGA	2	6	282787	282792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021844	GCT	3	9	282838	282846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_021844	GCA	2	6	282853	282858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_021844	TGG	2	6	282903	282908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021844	GCG	2	6	282914	282919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_021844	GTC	2	6	282950	282955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_021844	CG	3	6	282983	282988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_021844	GTG	2	6	283073	283078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021844	GACC	2	8	283091	283098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6051	NC_021844	GAA	2	6	283154	283159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021844	CAAC	2	8	283168	283175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6053	NC_021844	GTCA	2	8	283188	283195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_021844	GAT	2	6	283214	283219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_021844	A	6	6	283291	283296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_021844	GAA	2	6	283308	283313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_021844	CTG	2	6	283435	283440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_021844	GAT	2	6	283443	283448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_021844	CGG	2	6	283461	283466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_021844	TTA	2	6	283473	283478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_021844	GCG	2	6	283524	283529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_021844	CGT	2	6	283645	283650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_021844	GAT	2	6	283665	283670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_021844	CGG	2	6	283725	283730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_021844	CAGCGT	2	12	283732	283743	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_021844	CGA	2	6	283791	283796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_021844	GC	3	6	283824	283829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6068	NC_021844	TGA	2	6	283844	283849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_021844	GGT	2	6	283905	283910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_021844	CGC	2	6	284102	284107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_021844	ACG	2	6	284183	284188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_021844	TGG	2	6	284195	284200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_021844	GGC	2	6	284269	284274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_021844	TCAA	2	8	284355	284362	50 %	25 %	0 %	25 %	525945735
6075	NC_021844	TAA	2	6	284366	284371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945735
6076	NC_021844	CAA	2	6	284384	284389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945735
6077	NC_021844	A	6	6	284463	284468	100 %	0 %	0 %	0 %	525945735
6078	NC_021844	AAT	2	6	284471	284476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945735
6079	NC_021844	CGAAA	2	10	284535	284544	60 %	0 %	20 %	20 %	525945735
6080	NC_021844	ATA	2	6	284622	284627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945735
6081	NC_021844	TAAA	2	8	284675	284682	75 %	25 %	0 %	0 %	525945735
6082	NC_021844	GAT	2	6	284738	284743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945735
6083	NC_021844	ACGAGA	2	12	284836	284847	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525945735
6084	NC_021844	AAT	2	6	284855	284860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945735
6085	NC_021844	ATGCG	2	10	284883	284892	20 %	20 %	40 %	20 %	525945735
6086	NC_021844	TGAA	2	8	284970	284977	50 %	25 %	25 %	0 %	525945735
6087	NC_021844	AAG	2	6	284988	284993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945735
6088	NC_021844	GAAA	2	8	285022	285029	75 %	0 %	25 %	0 %	525945735
6089	NC_021844	GCG	2	6	285036	285041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945735
6090	NC_021844	ACC	3	9	285117	285125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945735
6091	NC_021844	ATA	2	6	285145	285150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945735
6092	NC_021844	CCG	2	6	285159	285164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945735
6093	NC_021844	CCA	2	6	285175	285180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945735
6094	NC_021844	ATA	2	6	285207	285212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945735
6095	NC_021844	AGG	2	6	285256	285261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945735
6096	NC_021844	ACC	2	6	285273	285278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945735
6097	NC_021844	AATA	2	8	285286	285293	75 %	25 %	0 %	0 %	525945735
6098	NC_021844	ATA	2	6	285369	285374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945735
6099	NC_021844	GAT	2	6	285455	285460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945735
6100	NC_021844	TAA	2	6	285469	285474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945735
6101	NC_021844	GTC	2	6	285638	285643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945735
6102	NC_021844	CT	3	6	285677	285682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_021844	TGC	2	6	285692	285697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_021844	TGC	2	6	285773	285778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_021844	CTG	2	6	285783	285788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_021844	AAT	2	6	285806	285811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_021844	TCG	2	6	285813	285818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_021844	TCG	2	6	285852	285857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_021844	GAG	2	6	285956	285961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_021844	AGT	2	6	286030	286035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_021844	CAG	2	6	286102	286107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_021844	CGG	2	6	286156	286161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_021844	CAA	2	6	286278	286283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_021844	GGC	2	6	286284	286289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_021844	CCG	2	6	286419	286424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_021844	CGC	2	6	286505	286510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949087
6117	NC_021844	CAC	2	6	286548	286553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949087
6118	NC_021844	GCT	2	6	286683	286688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949087
6119	NC_021844	GC	3	6	286709	286714	0 %	0 %	50 %	50 %	525949087
6120	NC_021844	A	6	6	286737	286742	100 %	0 %	0 %	0 %	525949087
6121	NC_021844	CGCC	2	8	286748	286755	0 %	0 %	25 %	75 %	525949087
6122	NC_021844	GC	3	6	286823	286828	0 %	0 %	50 %	50 %	525949087
6123	NC_021844	ACG	2	6	286843	286848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949087
6124	NC_021844	GAA	2	6	286887	286892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949087
6125	NC_021844	GC	3	6	286919	286924	0 %	0 %	50 %	50 %	525949087
6126	NC_021844	CCG	2	6	286937	286942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949087
6127	NC_021844	GCA	2	6	286982	286987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949087
6128	NC_021844	AAAG	2	8	286992	286999	75 %	0 %	25 %	0 %	525949087
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6130	NC_021844	CAG	2	6	287091	287096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949087
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6156	NC_021844	A	6	6	288310	288315	100 %	0 %	0 %	0 %	525949088
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6183	NC_021844	CTG	2	6	289321	289326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949089
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6190	NC_021844	CGC	2	6	289836	289841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949089
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6192	NC_021844	GA	3	6	289885	289890	50 %	0 %	50 %	0 %	525949089
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6232	NC_021844	CGCTT	2	10	291996	292005	0 %	40 %	20 %	40 %	525945737
6233	NC_021844	TGA	2	6	292047	292052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945737
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6236	NC_021844	GAAA	2	8	292248	292255	75 %	0 %	25 %	0 %	525945737
6237	NC_021844	GAT	2	6	292266	292271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945737
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6240	NC_021844	CTTT	2	8	292400	292407	0 %	75 %	0 %	25 %	525945737
6241	NC_021844	GGC	2	6	292548	292553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945737
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6244	NC_021844	TGA	2	6	292793	292798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945737
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6368	NC_021844	GCCA	2	8	298549	298556	25 %	0 %	25 %	50 %	525945739
6369	NC_021844	GCG	2	6	298557	298562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945739
6370	NC_021844	CGA	2	6	298569	298574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945739
6371	NC_021844	GCA	2	6	298608	298613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945739
6372	NC_021844	GCA	2	6	298740	298745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945739
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6374	NC_021844	GCA	2	6	298779	298784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945739
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6377	NC_021844	GAAGCG	2	12	298984	298995	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525945739
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6394	NC_021844	GCG	2	6	299536	299541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945739
6395	NC_021844	CAG	2	6	299554	299559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945739
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6398	NC_021844	CGGATG	2	12	299726	299737	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525945739
6399	NC_021844	ATA	2	6	299747	299752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945739
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6421	NC_021844	CAG	2	6	300568	300573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945739
6422	NC_021844	CTG	3	9	300598	300606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945739
6423	NC_021844	CCG	2	6	300652	300657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945739
6424	NC_021844	CGT	2	6	300717	300722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6425	NC_021844	AGCGC	2	10	300733	300742	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6426	NC_021844	CT	3	6	300795	300800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6427	NC_021844	GGC	2	6	300828	300833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6428	NC_021844	GTTT	2	8	300923	300930	0 %	75 %	25 %	0 %	525949091
6429	NC_021844	TGT	2	6	300949	300954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949091
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6432	NC_021844	CG	3	6	301007	301012	0 %	0 %	50 %	50 %	525949091
6433	NC_021844	TTC	2	6	301031	301036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949091
6434	NC_021844	GTG	2	6	301101	301106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949091
6435	NC_021844	GC	3	6	301321	301326	0 %	0 %	50 %	50 %	525949091
6436	NC_021844	TACT	2	8	301347	301354	25 %	50 %	0 %	25 %	525949091
6437	NC_021844	GCA	2	6	301451	301456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949091
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6439	NC_021844	CAG	2	6	301542	301547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949091
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6460	NC_021844	ATTG	2	8	302711	302718	25 %	50 %	25 %	0 %	525949091
6461	NC_021844	CG	3	6	302745	302750	0 %	0 %	50 %	50 %	525949091
6462	NC_021844	GAA	2	6	302823	302828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949091
6463	NC_021844	A	6	6	302866	302871	100 %	0 %	0 %	0 %	525949091
6464	NC_021844	TGT	2	6	302946	302951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6465	NC_021844	CT	3	6	303033	303038	0 %	50 %	0 %	50 %	525945740
6466	NC_021844	CGTT	2	8	303143	303150	0 %	50 %	25 %	25 %	525945740
6467	NC_021844	GAT	2	6	303162	303167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945740
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6471	NC_021844	GATG	2	8	303423	303430	25 %	25 %	50 %	0 %	525945740
6472	NC_021844	GTT	2	6	303498	303503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945740
6473	NC_021844	GCA	2	6	303527	303532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945740
6474	NC_021844	CAT	2	6	303585	303590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945740
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6476	NC_021844	GAA	2	6	303796	303801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945740
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6481	NC_021844	GCT	2	6	304017	304022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945740
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6483	NC_021844	GGC	2	6	304086	304091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945740
6484	NC_021844	CCG	2	6	304100	304105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945740
6485	NC_021844	GC	5	10	304168	304177	0 %	0 %	50 %	50 %	525945740
6486	NC_021844	TGG	2	6	304187	304192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945740
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6488	NC_021844	TAA	2	6	304266	304271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945740
6489	NC_021844	TCC	2	6	304303	304308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945740
6490	NC_021844	ATG	2	6	304392	304397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6491	NC_021844	ATT	2	6	304405	304410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6492	NC_021844	CTT	2	6	304414	304419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6493	NC_021844	TTA	2	6	304500	304505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6494	NC_021844	TTG	2	6	304512	304517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6495	NC_021844	GCAG	2	8	304596	304603	25 %	0 %	50 %	25 %	525945741
6496	NC_021844	GGT	2	6	304798	304803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945741
6497	NC_021844	GCA	2	6	304833	304838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945741
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