MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 99930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_021844	GCG	2	6	257624	257629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945716
5503	NC_021844	TAA	2	6	257748	257753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945716
5504	NC_021844	ATG	2	6	257756	257761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945716
5505	NC_021844	CTA	2	6	257803	257808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_021844	A	7	7	257893	257899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_021844	CAGG	2	8	257910	257917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_021844	TCA	2	6	258083	258088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945717
5509	NC_021844	TAA	2	6	258093	258098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945717
5510	NC_021844	A	6	6	258172	258177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_021844	T	6	6	258215	258220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_021844	GGCG	2	8	258342	258349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5513	NC_021844	TTTTA	2	10	258357	258366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_021844	CGGG	2	8	258390	258397	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_021844	CTTA	2	8	258459	258466	25 %	50 %	0 %	25 %	525945718
5516	NC_021844	CTG	2	6	258506	258511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945718
5517	NC_021844	GCT	2	6	258696	258701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945718
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5519	NC_021844	CA	3	6	258752	258757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_021844	G	6	6	258813	258818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_021844	CGC	2	6	258824	258829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_021844	AAT	2	6	258924	258929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_021844	A	7	7	258940	258946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_021844	T	6	6	258982	258987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_021844	AATAA	2	10	259014	259023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5543	NC_021844	CAT	2	6	260014	260019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945720
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5546	NC_021844	AT	3	6	260140	260145	50 %	50 %	0 %	0 %	525945720
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5555	NC_021844	CGG	2	6	260558	260563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945720
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5558	NC_021844	CAG	2	6	260725	260730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945720
5559	NC_021844	CG	3	6	260731	260736	0 %	0 %	50 %	50 %	525945720
5560	NC_021844	GC	3	6	260769	260774	0 %	0 %	50 %	50 %	525945720
5561	NC_021844	CG	3	6	260795	260800	0 %	0 %	50 %	50 %	525945720
5562	NC_021844	GCA	2	6	260859	260864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945720
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5566	NC_021844	CAT	2	6	260981	260986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5569	NC_021844	AAT	2	6	261079	261084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_021844	GCC	2	6	261103	261108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_021844	CGGTA	2	10	261114	261123	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5590	NC_021844	T	6	6	261805	261810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5592	NC_021844	GTAA	2	8	261888	261895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_021844	ATAA	2	8	261910	261917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5598	NC_021844	TGG	2	6	262416	262421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945722
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5604	NC_021844	TGG	2	6	262710	262715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945722
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5615	NC_021844	CGG	2	6	263035	263040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945722
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5620	NC_021844	CAT	2	6	263240	263245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945722
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5622	NC_021844	GCC	2	6	263318	263323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945722
5623	NC_021844	CTGC	2	8	263345	263352	0 %	25 %	25 %	50 %	525945722
5624	NC_021844	ACC	2	6	263354	263359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945722
5625	NC_021844	CGG	2	6	263500	263505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945722
5626	NC_021844	GCC	2	6	263567	263572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945722
5627	NC_021844	GCCA	2	8	263582	263589	25 %	0 %	25 %	50 %	525945722
5628	NC_021844	GCC	2	6	263602	263607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945722
5629	NC_021844	CGC	2	6	263693	263698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945722
5630	NC_021844	GC	3	6	263753	263758	0 %	0 %	50 %	50 %	525945722
5631	NC_021844	CG	3	6	263970	263975	0 %	0 %	50 %	50 %	525945722
5632	NC_021844	TCG	2	6	263979	263984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945722
5633	NC_021844	ATC	2	6	264009	264014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945722
5634	NC_021844	GGCG	2	8	264028	264035	0 %	0 %	75 %	25 %	525945722
5635	NC_021844	GGC	2	6	264113	264118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945722
5636	NC_021844	CTGGT	2	10	264203	264212	0 %	40 %	40 %	20 %	525945722
5637	NC_021844	CCGGC	2	10	264225	264234	0 %	0 %	40 %	60 %	525945722
5638	NC_021844	GGTGG	2	10	264279	264288	0 %	20 %	80 %	0 %	525949083
5639	NC_021844	TCC	2	6	264295	264300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525949083
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5641	NC_021844	CAG	2	6	264384	264389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949083
5642	NC_021844	TCC	2	6	264520	264525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525949083
5643	NC_021844	GCG	2	6	264541	264546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949083
5644	NC_021844	TTC	2	6	264594	264599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949083
5645	NC_021844	T	6	6	264790	264795	0 %	100 %	0 %	0 %	525945723
5646	NC_021844	GCC	2	6	264854	264859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945723
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5649	NC_021844	TCC	3	9	265019	265027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525945723
5650	NC_021844	TGA	2	6	265058	265063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945723
5651	NC_021844	G	6	6	265209	265214	0 %	0 %	100 %	0 %	525945723
5652	NC_021844	TTCA	2	8	265345	265352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5653	NC_021844	AAT	2	6	265358	265363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_021844	TGA	2	6	265397	265402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945724
5655	NC_021844	T	6	6	265465	265470	0 %	100 %	0 %	0 %	525945724
5656	NC_021844	CAA	2	6	265492	265497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945724
5657	NC_021844	AT	3	6	265500	265505	50 %	50 %	0 %	0 %	525945724
5658	NC_021844	ACG	2	6	265528	265533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945724
5659	NC_021844	ACG	2	6	265736	265741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945724
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5663	NC_021844	CTGG	2	8	265968	265975	0 %	25 %	50 %	25 %	525945724
5664	NC_021844	GGC	2	6	266016	266021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945724
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5667	NC_021844	GTT	2	6	266183	266188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5668	NC_021844	ATC	2	6	266190	266195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5670	NC_021844	GC	3	6	266284	266289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5671	NC_021844	T	8	8	266303	266310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5672	NC_021844	A	7	7	266342	266348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5673	NC_021844	TAA	2	6	266353	266358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5674	NC_021844	TTAT	2	8	266377	266384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5675	NC_021844	GAA	2	6	266391	266396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5676	NC_021844	ATA	2	6	266397	266402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5677	NC_021844	ATTA	2	8	266404	266411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5678	NC_021844	TAA	2	6	266426	266431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5679	NC_021844	A	6	6	266430	266435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5680	NC_021844	TAAC	2	8	266490	266497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5681	NC_021844	ATT	2	6	266499	266504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5682	NC_021844	TA	4	8	266507	266514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5683	NC_021844	GTT	2	6	266630	266635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945725
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5685	NC_021844	CGT	2	6	266737	266742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945725
5686	NC_021844	TCT	3	9	266819	266827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945725
5687	NC_021844	TTG	2	6	266997	267002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945725
5688	NC_021844	CCA	2	6	267021	267026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945725
5689	NC_021844	GCT	2	6	267035	267040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945725
5690	NC_021844	TAC	2	6	267056	267061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945725
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5693	NC_021844	T	6	6	267199	267204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5694	NC_021844	AGC	2	6	267314	267319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945726
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5696	NC_021844	GTA	2	6	267339	267344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945726
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5704	NC_021844	CGG	2	6	267648	267653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945726
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5707	NC_021844	CCGGCA	2	12	267840	267851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525945726
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5710	NC_021844	TAAC	2	8	267922	267929	50 %	25 %	0 %	25 %	525945726
5711	NC_021844	ATT	2	6	267942	267947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5712	NC_021844	TGCGCT	2	12	268004	268015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945727
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5716	NC_021844	A	9	9	268174	268182	100 %	0 %	0 %	0 %	525945727
5717	NC_021844	GC	3	6	268226	268231	0 %	0 %	50 %	50 %	525945727
5718	NC_021844	GCGT	2	8	268288	268295	0 %	25 %	50 %	25 %	525945727
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5723	NC_021844	GC	3	6	268440	268445	0 %	0 %	50 %	50 %	525945727
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5745	NC_021844	GCA	2	6	269480	269485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945727
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5749	NC_021844	GCA	2	6	269809	269814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945727
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5995	NC_021844	TGA	2	6	280839	280844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945733
5996	NC_021844	CCTG	2	8	280932	280939	0 %	25 %	25 %	50 %	525945733
5997	NC_021844	TCG	2	6	280990	280995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945733
5998	NC_021844	GGA	2	6	281013	281018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525945733
5999	NC_021844	TGC	2	6	281093	281098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945733
6000	NC_021844	GTC	2	6	281101	281106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945733

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