MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189

Total Repeats: 99930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021844	ATA	2	6	234289	234294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945702
5002	NC_021844	TAAT	2	8	234303	234310	50 %	50 %	0 %	0 %	525945703
5003	NC_021844	AATAAA	2	12	234341	234352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525945703
5004	NC_021844	CAG	2	6	234359	234364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
5005	NC_021844	TCA	2	6	234408	234413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945703
5006	NC_021844	TAA	2	6	234490	234495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
5007	NC_021844	AAAT	2	8	234510	234517	75 %	25 %	0 %	0 %	525945703
5008	NC_021844	CTT	2	6	234532	234537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945703
5009	NC_021844	AAT	2	6	234549	234554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
5010	NC_021844	CGA	2	6	234601	234606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
5011	NC_021844	ATAA	2	8	234630	234637	75 %	25 %	0 %	0 %	525945703
5012	NC_021844	GCA	2	6	234664	234669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
5013	NC_021844	CAT	2	6	234680	234685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945703
5014	NC_021844	CCA	2	6	234733	234738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945703
5015	NC_021844	GAC	2	6	234746	234751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
5016	NC_021844	CGT	2	6	234755	234760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945703
5017	NC_021844	GGC	2	6	234764	234769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945703
5018	NC_021844	GATA	2	8	234811	234818	50 %	25 %	25 %	0 %	525945703
5019	NC_021844	GGC	2	6	234845	234850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945703
5020	NC_021844	CGGAA	2	10	234883	234892	40 %	0 %	40 %	20 %	525945703
5021	NC_021844	GCC	2	6	234893	234898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945703
5022	NC_021844	ATA	2	6	234900	234905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
5023	NC_021844	CCA	3	9	235007	235015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945703
5024	NC_021844	GCGCC	2	10	235027	235036	0 %	0 %	40 %	60 %	525945703
5025	NC_021844	CAT	2	6	235037	235042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945703
5026	NC_021844	ATA	2	6	235107	235112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
5027	NC_021844	G	6	6	235124	235129	0 %	0 %	100 %	0 %	525945703
5028	NC_021844	AAT	2	6	235130	235135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945703
5029	NC_021844	CCG	2	6	235149	235154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945703
5030	NC_021844	CAT	2	6	235202	235207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945703
5031	NC_021844	CAG	2	6	235214	235219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
5032	NC_021844	GCC	2	6	235304	235309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945703
5033	NC_021844	GCC	2	6	235361	235366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945703
5034	NC_021844	CAAAA	2	10	235388	235397	80 %	0 %	0 %	20 %	525945703
5035	NC_021844	A	6	6	235394	235399	100 %	0 %	0 %	0 %	525945703
5036	NC_021844	CAG	2	6	235409	235414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
5037	NC_021844	AGC	2	6	235490	235495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
5038	NC_021844	AGC	3	9	235503	235511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945703
5039	NC_021844	GCAG	2	8	235549	235556	25 %	0 %	50 %	25 %	525945703
5040	NC_021844	CAC	2	6	235568	235573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945703
5041	NC_021844	GTT	2	6	235599	235604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945704
5042	NC_021844	TTA	2	6	235623	235628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945704
5043	NC_021844	CAG	2	6	235807	235812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945704
5044	NC_021844	GA	3	6	235814	235819	50 %	0 %	50 %	0 %	525945704
5045	NC_021844	CCA	2	6	235848	235853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525945704
5046	NC_021844	CGTAA	2	10	235971	235980	40 %	20 %	20 %	20 %	525945704
5047	NC_021844	TAA	2	6	235989	235994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945704
5048	NC_021844	TTTC	2	8	236084	236091	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_021844	TGA	2	6	236175	236180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021844	GCG	2	6	236197	236202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945705
5051	NC_021844	AT	3	6	236238	236243	50 %	50 %	0 %	0 %	525945705
5052	NC_021844	CAA	2	6	236281	236286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945705
5053	NC_021844	GCG	2	6	236321	236326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945705
5054	NC_021844	TCA	2	6	236355	236360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945705
5055	NC_021844	TCCA	2	8	236419	236426	25 %	25 %	0 %	50 %	525945705
5056	NC_021844	CTG	2	6	236476	236481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945705
5057	NC_021844	AG	3	6	236498	236503	50 %	0 %	50 %	0 %	525945705
5058	NC_021844	GC	3	6	236527	236532	0 %	0 %	50 %	50 %	525945705
5059	NC_021844	GC	3	6	236689	236694	0 %	0 %	50 %	50 %	525945705
5060	NC_021844	C	6	6	236729	236734	0 %	0 %	0 %	100 %	525945705
5061	NC_021844	GGC	2	6	236740	236745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945705
5062	NC_021844	TTTA	2	8	236791	236798	25 %	75 %	0 %	0 %	525945705
5063	NC_021844	TCT	2	6	236799	236804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525945705
5064	NC_021844	GTA	2	6	236818	236823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945705
5065	NC_021844	CCG	2	6	236873	236878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945705
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5067	NC_021844	TCG	2	6	236960	236965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945705
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5069	NC_021844	AG	3	6	237025	237030	50 %	0 %	50 %	0 %	525945705
5070	NC_021844	GCC	2	6	237033	237038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525945705
5071	NC_021844	ATA	2	6	237101	237106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945705
5072	NC_021844	TAT	2	6	237114	237119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945705
5073	NC_021844	TTA	2	6	237208	237213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945706
5074	NC_021844	AATG	2	8	237273	237280	50 %	25 %	25 %	0 %	525945706
5075	NC_021844	A	6	6	237302	237307	100 %	0 %	0 %	0 %	525945706
5076	NC_021844	TAA	2	6	237324	237329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525945706
5077	NC_021844	TGATT	2	10	237338	237347	20 %	60 %	20 %	0 %	525945706
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5082	NC_021844	GTC	2	6	237656	237661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949073
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5084	NC_021844	GTC	2	6	237737	237742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949073
5085	NC_021844	CAG	2	6	237751	237756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949073
5086	NC_021844	TGA	2	6	237760	237765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949073
5087	NC_021844	GAA	2	6	237891	237896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949073
5088	NC_021844	GCG	2	6	237974	237979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949073
5089	NC_021844	TCG	2	6	238023	238028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949073
5090	NC_021844	ACATCG	2	12	238093	238104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525949073
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5092	NC_021844	C	6	6	238180	238185	0 %	0 %	0 %	100 %	525949073
5093	NC_021844	GGC	2	6	238188	238193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949073
5094	NC_021844	CCG	2	6	238240	238245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949073
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5099	NC_021844	AAT	2	6	238439	238444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949073
5100	NC_021844	GGT	2	6	238514	238519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949073
5101	NC_021844	GCGA	2	8	238520	238527	25 %	0 %	50 %	25 %	525949073
5102	NC_021844	TCG	2	6	238542	238547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949073
5103	NC_021844	T	7	7	238663	238669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021844	AT	3	6	238705	238710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021844	ATC	2	6	238763	238768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_021844	T	6	6	238777	238782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021844	AC	3	6	238804	238809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_021844	GA	3	6	238840	238845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021844	TGA	2	6	238852	238857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945707
5110	NC_021844	AAC	2	6	238863	238868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525945707
5111	NC_021844	TTG	2	6	239007	239012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525945707
5112	NC_021844	CGG	2	6	239050	239055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525945707
5113	NC_021844	GAC	2	6	239072	239077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525945707
5114	NC_021844	ATC	2	6	239121	239126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525945707
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5118	NC_021844	TGC	2	6	239245	239250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525945707
5119	NC_021844	AGATC	2	10	239363	239372	40 %	20 %	20 %	20 %	525945707
5120	NC_021844	GAA	2	6	239463	239468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525945707
5121	NC_021844	GCG	2	6	239718	239723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_021844	CT	3	6	239732	239737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_021844	TAT	2	6	239782	239787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525945708
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5229	NC_021844	A	7	7	244275	244281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5230	NC_021844	CG	4	8	244393	244400	0 %	0 %	50 %	50 %	525949075
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5241	NC_021844	TG	3	6	244876	244881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_021844	ACA	2	6	244935	244940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949076
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5247	NC_021844	GCG	2	6	245287	245292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949076
5248	NC_021844	CGG	2	6	245308	245313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949076
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5275	NC_021844	T	7	7	246338	246344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5362	NC_021844	A	8	8	250699	250706	100 %	0 %	0 %	0 %	525945713
5363	NC_021844	A	6	6	250723	250728	100 %	0 %	0 %	0 %	525945713
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5365	NC_021844	GTA	2	6	250823	250828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525945713
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5367	NC_021844	TAA	3	9	251023	251031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_021844	TAA	2	6	251054	251059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_021844	TCTGT	2	10	251078	251087	0 %	60 %	20 %	20 %	525949078
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5377	NC_021844	TTCC	2	8	251463	251470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5378	NC_021844	ATA	2	6	251498	251503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949079
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5441	NC_021844	T	8	8	254532	254539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5442	NC_021844	TAA	2	6	254568	254573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5443	NC_021844	ATTG	2	8	254603	254610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5444	NC_021844	CAGA	2	8	254714	254721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5455	NC_021844	TGA	2	6	255188	255193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5469	NC_021844	TGA	2	6	255895	255900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949081
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5492	NC_021844	GAA	2	6	256928	256933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_021844	ACG	2	6	256935	256940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5494	NC_021844	TGA	2	6	256951	256956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5495	NC_021844	A	6	6	257038	257043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5496	NC_021844	TTG	2	6	257182	257187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5497	NC_021844	T	7	7	257227	257233	0 %	100 %	0 %	0 %	525945716
5498	NC_021844	TGG	2	6	257276	257281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525945716
5499	NC_021844	CTGT	2	8	257413	257420	0 %	50 %	25 %	25 %	525945716
5500	NC_021844	GT	3	6	257490	257495	0 %	50 %	50 %	0 %	525945716

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