MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Heidelberg str. CFSAN002069 plasmid pCFSAN002069_02

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021842	A	7	7	969	975	100 %	0 %	0 %	0 %	525933209
2	NC_021842	A	6	6	1234	1239	100 %	0 %	0 %	0 %	525933211
3	NC_021842	T	6	6	1271	1276	0 %	100 %	0 %	0 %	525933211
4	NC_021842	T	6	6	1872	1877	0 %	100 %	0 %	0 %	525933212
5	NC_021842	T	6	6	1957	1962	0 %	100 %	0 %	0 %	525933212
6	NC_021842	T	6	6	2069	2074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021842	T	7	7	2792	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
8	NC_021842	A	6	6	2922	2927	100 %	0 %	0 %	0 %	525933214
9	NC_021842	T	7	7	3034	3040	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
10	NC_021842	C	6	6	3178	3183	0 %	0 %	0 %	100 %	525933214
11	NC_021842	T	6	6	3200	3205	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
12	NC_021842	T	7	7	3406	3412	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
13	NC_021842	T	6	6	4348	4353	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
14	NC_021842	T	6	6	4388	4393	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
15	NC_021842	A	6	6	4427	4432	100 %	0 %	0 %	0 %	525933214
16	NC_021842	A	6	6	4510	4515	100 %	0 %	0 %	0 %	525933214
17	NC_021842	T	6	6	4572	4577	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
18	NC_021842	T	6	6	4646	4651	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
19	NC_021842	A	6	6	4753	4758	100 %	0 %	0 %	0 %	525933214
20	NC_021842	T	6	6	5200	5205	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
21	NC_021842	T	6	6	5288	5293	0 %	100 %	0 %	0 %	525933214
22	NC_021842	T	6	6	5332	5337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021842	A	6	6	5452	5457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021842	A	7	7	5519	5525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021842	T	6	6	5544	5549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021842	T	6	6	6205	6210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021842	A	6	6	6434	6439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021842	T	6	6	6640	6645	0 %	100 %	0 %	0 %	525933217
29	NC_021842	T	7	7	6774	6780	0 %	100 %	0 %	0 %	525933217
30	NC_021842	T	6	6	6958	6963	0 %	100 %	0 %	0 %	525933217
31	NC_021842	T	6	6	7296	7301	0 %	100 %	0 %	0 %	525933217
32	NC_021842	T	6	6	7872	7877	0 %	100 %	0 %	0 %	525933217
33	NC_021842	A	8	8	8353	8360	100 %	0 %	0 %	0 %	525933217
34	NC_021842	T	6	6	8533	8538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021842	T	7	7	8949	8955	0 %	100 %	0 %	0 %	525933218
36	NC_021842	T	6	6	9309	9314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021842	T	6	6	9463	9468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021842	T	6	6	10029	10034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021842	C	6	6	10265	10270	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_021842	A	6	6	10821	10826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021842	T	6	6	10836	10841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021842	A	7	7	10906	10912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021842	A	6	6	10927	10932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021842	A	6	6	11001	11006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021842	T	7	7	11012	11018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021842	A	6	6	11046	11051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021842	A	6	6	11122	11127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021842	A	6	6	11156	11161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021842	A	7	7	11188	11194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021842	T	6	6	11213	11218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021842	C	6	6	14108	14113	0 %	0 %	0 %	100 %	525933225
52	NC_021842	A	6	6	14667	14672	100 %	0 %	0 %	0 %	525933226
53	NC_021842	A	6	6	14917	14922	100 %	0 %	0 %	0 %	525933226
54	NC_021842	T	6	6	15779	15784	0 %	100 %	0 %	0 %	525933228
55	NC_021842	T	7	7	15790	15796	0 %	100 %	0 %	0 %	525933228
56	NC_021842	A	6	6	16854	16859	100 %	0 %	0 %	0 %	525933229
57	NC_021842	A	6	6	16888	16893	100 %	0 %	0 %	0 %	525933229
58	NC_021842	A	7	7	16995	17001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021842	A	6	6	17005	17010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021842	A	6	6	17035	17040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021842	T	6	6	17128	17133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021842	A	6	6	17366	17371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021842	A	8	8	17751	17758	100 %	0 %	0 %	0 %	525933230
64	NC_021842	T	6	6	18717	18722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021842	A	7	7	19180	19186	100 %	0 %	0 %	0 %	525933233
66	NC_021842	A	7	7	19396	19402	100 %	0 %	0 %	0 %	525933234
67	NC_021842	G	6	6	19619	19624	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021842	A	7	7	19800	19806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021842	A	7	7	20021	20027	100 %	0 %	0 %	0 %	525933235
70	NC_021842	A	6	6	20221	20226	100 %	0 %	0 %	0 %	525933236
71	NC_021842	A	6	6	20666	20671	100 %	0 %	0 %	0 %	525933237
72	NC_021842	T	6	6	20828	20833	0 %	100 %	0 %	0 %	525933237
73	NC_021842	A	7	7	21568	21574	100 %	0 %	0 %	0 %	525933238
74	NC_021842	A	6	6	21661	21666	100 %	0 %	0 %	0 %	525933238
75	NC_021842	A	6	6	21778	21783	100 %	0 %	0 %	0 %	525933238
76	NC_021842	G	6	6	22037	22042	0 %	0 %	100 %	0 %	525933238
77	NC_021842	A	6	6	22493	22498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021842	T	6	6	23049	23054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021842	A	6	6	23173	23178	100 %	0 %	0 %	0 %	525933239
80	NC_021842	A	6	6	23254	23259	100 %	0 %	0 %	0 %	525933239
81	NC_021842	A	6	6	23328	23333	100 %	0 %	0 %	0 %	525933239
82	NC_021842	A	6	6	23757	23762	100 %	0 %	0 %	0 %	525933240
83	NC_021842	A	7	7	23912	23918	100 %	0 %	0 %	0 %	525933240
84	NC_021842	T	6	6	24164	24169	0 %	100 %	0 %	0 %	525933241
85	NC_021842	T	6	6	24185	24190	0 %	100 %	0 %	0 %	525933241
86	NC_021842	T	6	6	24549	24554	0 %	100 %	0 %	0 %	525933242
87	NC_021842	A	6	6	24752	24757	100 %	0 %	0 %	0 %	525933242
88	NC_021842	A	6	6	25083	25088	100 %	0 %	0 %	0 %	525933242
89	NC_021842	G	6	6	25867	25872	0 %	0 %	100 %	0 %	525933242
90	NC_021842	A	6	6	26091	26096	100 %	0 %	0 %	0 %	525933242
91	NC_021842	T	7	7	26107	26113	0 %	100 %	0 %	0 %	525933242
92	NC_021842	G	6	6	26153	26158	0 %	0 %	100 %	0 %	525933242
93	NC_021842	T	6	6	27928	27933	0 %	100 %	0 %	0 %	525933244
94	NC_021842	A	6	6	27999	28004	100 %	0 %	0 %	0 %	525933244
95	NC_021842	A	6	6	28119	28124	100 %	0 %	0 %	0 %	525933244
96	NC_021842	A	6	6	28167	28172	100 %	0 %	0 %	0 %	525933244
97	NC_021842	T	7	7	28204	28210	0 %	100 %	0 %	0 %	525933245
98	NC_021842	T	6	6	28735	28740	0 %	100 %	0 %	0 %	525933245
99	NC_021842	A	7	7	29560	29566	100 %	0 %	0 %	0 %	525933246
100	NC_021842	A	6	6	29742	29747	100 %	0 %	0 %	0 %	525933246
101	NC_021842	T	6	6	29822	29827	0 %	100 %	0 %	0 %	525933246
102	NC_021842	A	6	6	29944	29949	100 %	0 %	0 %	0 %	525933246
103	NC_021842	A	7	7	31485	31491	100 %	0 %	0 %	0 %	525933248
104	NC_021842	G	6	6	33083	33088	0 %	0 %	100 %	0 %	525933249
105	NC_021842	A	7	7	35124	35130	100 %	0 %	0 %	0 %	525933250
106	NC_021842	A	6	6	35167	35172	100 %	0 %	0 %	0 %	525933250
107	NC_021842	A	7	7	35213	35219	100 %	0 %	0 %	0 %	525933250
108	NC_021842	A	6	6	35289	35294	100 %	0 %	0 %	0 %	525933251
109	NC_021842	T	6	6	35430	35435	0 %	100 %	0 %	0 %	525933251
110	NC_021842	A	6	6	35515	35520	100 %	0 %	0 %	0 %	525933251
111	NC_021842	T	6	6	35708	35713	0 %	100 %	0 %	0 %	525933252
112	NC_021842	T	7	7	35775	35781	0 %	100 %	0 %	0 %	525933252
113	NC_021842	T	6	6	35844	35849	0 %	100 %	0 %	0 %	525933252
114	NC_021842	A	7	7	36837	36843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021842	A	6	6	36916	36921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021842	A	6	6	37539	37544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021842	A	6	6	37569	37574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.