MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021820	CG	5	10	119358	119367	0 %	0 %	50 %	50 %	526218113
2502	NC_021820	GCGCG	3	15	119363	119377	0 %	0 %	60 %	40 %	526218113
2503	NC_021820	CAC	2	6	119479	119484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218113
2504	NC_021820	GGA	2	6	119503	119508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218113
2505	NC_021820	AAT	2	6	119509	119514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218113
2506	NC_021820	CTG	2	6	119635	119640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218113
2507	NC_021820	GAT	2	6	119644	119649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218113
2508	NC_021820	A	6	6	119650	119655	100 %	0 %	0 %	0 %	526218113
2509	NC_021820	CAG	2	6	119723	119728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_021820	CGG	2	6	119834	119839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218114
2511	NC_021820	TGG	2	6	119885	119890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218114
2512	NC_021820	CAGTAT	2	12	119894	119905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526218114
2513	NC_021820	ATA	2	6	119929	119934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218114
2514	NC_021820	ACA	2	6	119955	119960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218114
2515	NC_021820	GCC	2	6	119977	119982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218114
2516	NC_021820	TCAC	2	8	119992	119999	25 %	25 %	0 %	50 %	526218114
2517	NC_021820	AAT	2	6	120015	120020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218114
2518	NC_021820	CCA	2	6	120032	120037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218114
2519	NC_021820	CCG	2	6	120038	120043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218114
2520	NC_021820	CAT	2	6	120117	120122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218114
2521	NC_021820	CAG	2	6	120141	120146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218114
2522	NC_021820	CGG	2	6	120173	120178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218114
2523	NC_021820	AAT	2	6	120180	120185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218114
2524	NC_021820	GCC	3	9	120226	120234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218114
2525	NC_021820	CGC	2	6	120237	120242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218114
2526	NC_021820	TTA	2	6	120265	120270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218114
2527	NC_021820	GC	3	6	120293	120298	0 %	0 %	50 %	50 %	526218114
2528	NC_021820	CGC	2	6	120306	120311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218114
2529	NC_021820	GCA	2	6	120329	120334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218114
2530	NC_021820	CCG	2	6	120335	120340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218114
2531	NC_021820	GGC	2	6	120357	120362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218114
2532	NC_021820	CGTT	2	8	120365	120372	0 %	50 %	25 %	25 %	526218114
2533	NC_021820	TTA	2	6	120388	120393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218114
2534	NC_021820	CGT	2	6	120480	120485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218114
2535	NC_021820	GTA	2	6	120504	120509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218114
2536	NC_021820	CTG	2	6	120525	120530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218114
2537	NC_021820	TCG	2	6	120550	120555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218114
2538	NC_021820	GCA	2	6	120575	120580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218114
2539	NC_021820	ATG	2	6	120589	120594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218114
2540	NC_021820	ATC	2	6	120612	120617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218114
2541	NC_021820	GTC	2	6	120676	120681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218114
2542	NC_021820	GCC	2	6	120687	120692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218114
2543	NC_021820	TGC	2	6	120709	120714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218114
2544	NC_021820	CGG	3	9	120752	120760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218114
2545	NC_021820	CCA	2	6	120764	120769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218114
2546	NC_021820	ATG	2	6	120802	120807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218114
2547	NC_021820	GAAA	2	8	120850	120857	75 %	0 %	25 %	0 %	526218115
2548	NC_021820	GGCATT	2	12	120927	120938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526218115
2549	NC_021820	CAG	2	6	120954	120959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218115
2550	NC_021820	AAC	2	6	120994	120999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218115
2551	NC_021820	CCG	2	6	121003	121008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218115
2552	NC_021820	ACA	2	6	121039	121044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218115
2553	NC_021820	GTG	2	6	121052	121057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218115
2554	NC_021820	CGG	2	6	121079	121084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218115
2555	NC_021820	GC	3	6	121094	121099	0 %	0 %	50 %	50 %	526218115
2556	NC_021820	GTG	2	6	121123	121128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218115
2557	NC_021820	TAA	2	6	121150	121155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218115
2558	NC_021820	GCG	2	6	121231	121236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218115
2559	NC_021820	TCA	2	6	121261	121266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218115
2560	NC_021820	TGC	2	6	121283	121288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218115
2561	NC_021820	CGG	2	6	121419	121424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218115
2562	NC_021820	GCG	2	6	121433	121438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218115
2563	NC_021820	CGGC	2	8	121594	121601	0 %	0 %	50 %	50 %	526218115
2564	NC_021820	CCG	2	6	121681	121686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218115
2565	NC_021820	CTGTT	2	10	121702	121711	0 %	60 %	20 %	20 %	526218115
2566	NC_021820	CCT	2	6	121778	121783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218116
2567	NC_021820	ATA	2	6	121822	121827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218116
2568	NC_021820	ATT	2	6	121831	121836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218116
2569	NC_021820	AGC	2	6	121856	121861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218116
2570	NC_021820	TCA	3	9	121896	121904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218116
2571	NC_021820	CG	3	6	121925	121930	0 %	0 %	50 %	50 %	526218116
2572	NC_021820	CAG	2	6	121966	121971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218116
2573	NC_021820	CCCG	2	8	121984	121991	0 %	0 %	25 %	75 %	526218116
2574	NC_021820	GAA	2	6	122014	122019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218116
2575	NC_021820	GCC	2	6	122026	122031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218116
2576	NC_021820	TTTTC	2	10	122061	122070	0 %	80 %	0 %	20 %	526218116
2577	NC_021820	AGA	2	6	122127	122132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218116
2578	NC_021820	TAA	2	6	122136	122141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218116
2579	NC_021820	GC	3	6	122199	122204	0 %	0 %	50 %	50 %	526218116
2580	NC_021820	TAA	2	6	122217	122222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218116
2581	NC_021820	GGT	2	6	122272	122277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218116
2582	NC_021820	ATC	2	6	122282	122287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218116
2583	NC_021820	ACG	2	6	122303	122308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218116
2584	NC_021820	CGC	2	6	122340	122345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218116
2585	NC_021820	ATA	2	6	122353	122358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218116
2586	NC_021820	TAA	2	6	122366	122371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218116
2587	NC_021820	ATAAC	2	10	122390	122399	60 %	20 %	0 %	20 %	526218116
2588	NC_021820	CAG	3	9	122407	122415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218116
2589	NC_021820	AAC	2	6	122419	122424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218116
2590	NC_021820	AAT	2	6	122431	122436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218116
2591	NC_021820	ACG	2	6	122484	122489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218116
2592	NC_021820	AGA	2	6	122529	122534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218116
2593	NC_021820	TTG	2	6	122594	122599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218116
2594	NC_021820	CCAG	2	8	122607	122614	25 %	0 %	25 %	50 %	526218116
2595	NC_021820	ACG	2	6	122630	122635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218116
2596	NC_021820	TCA	2	6	122664	122669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218116
2597	NC_021820	ATC	2	6	122726	122731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218116
2598	NC_021820	TAA	2	6	122829	122834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218116
2599	NC_021820	CAG	2	6	122875	122880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218116
2600	NC_021820	ATCA	2	8	122953	122960	50 %	25 %	0 %	25 %	526218116
2601	NC_021820	GCG	2	6	122993	122998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218116
2602	NC_021820	GAG	2	6	123031	123036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218116
2603	NC_021820	T	6	6	123093	123098	0 %	100 %	0 %	0 %	526218116
2604	NC_021820	ATG	2	6	123164	123169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_021820	TA	3	6	123195	123200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_021820	CCA	2	6	123207	123212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_021820	AG	3	6	123234	123239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_021820	TAAC	2	8	123242	123249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2609	NC_021820	CCG	2	6	123424	123429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218117
2610	NC_021820	CAG	2	6	123467	123472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218117
2611	NC_021820	GTC	2	6	123482	123487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218117
2612	NC_021820	ACC	2	6	123498	123503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218117
2613	NC_021820	CG	3	6	123529	123534	0 %	0 %	50 %	50 %	526218117
2614	NC_021820	CAT	2	6	123557	123562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218117
2615	NC_021820	GC	3	6	123602	123607	0 %	0 %	50 %	50 %	526218117
2616	NC_021820	GTT	2	6	123682	123687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218117
2617	NC_021820	T	6	6	123800	123805	0 %	100 %	0 %	0 %	526218117
2618	NC_021820	AGCC	2	8	123830	123837	25 %	0 %	25 %	50 %	526218117
2619	NC_021820	AATA	2	8	123909	123916	75 %	25 %	0 %	0 %	526218117
2620	NC_021820	GAC	2	6	123944	123949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218117
2621	NC_021820	GGCA	2	8	124011	124018	25 %	0 %	50 %	25 %	526218117
2622	NC_021820	CGCC	2	8	124078	124085	0 %	0 %	25 %	75 %	526218117
2623	NC_021820	GCG	2	6	124086	124091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218117
2624	NC_021820	T	7	7	124126	124132	0 %	100 %	0 %	0 %	526218117
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2632	NC_021820	GCT	2	6	124402	124407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218118
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2747	NC_021820	A	6	6	129332	129337	100 %	0 %	0 %	0 %	526218123
2748	NC_021820	TGG	2	6	129354	129359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218123
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2750	NC_021820	CTG	2	6	129446	129451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218123
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2752	NC_021820	CGC	2	6	129498	129503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218123
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2768	NC_021820	TGA	2	6	130189	130194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218123
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2774	NC_021820	T	6	6	130374	130379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2775	NC_021820	CGAT	2	8	130484	130491	25 %	25 %	25 %	25 %	526218124
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2784	NC_021820	C	6	6	130823	130828	0 %	0 %	0 %	100 %	526218125
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2859	NC_021820	TAATC	2	10	133492	133501	40 %	40 %	0 %	20 %	526218127
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2868	NC_021820	TC	3	6	133865	133870	0 %	50 %	0 %	50 %	526218128
2869	NC_021820	TTA	2	6	133899	133904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218128
2870	NC_021820	ATC	2	6	133930	133935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218128
2871	NC_021820	GCT	2	6	133944	133949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218128
2872	NC_021820	TGT	2	6	134065	134070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218129
2873	NC_021820	GC	3	6	134085	134090	0 %	0 %	50 %	50 %	526218129
2874	NC_021820	ATG	2	6	134129	134134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218129
2875	NC_021820	A	6	6	134175	134180	100 %	0 %	0 %	0 %	526218129
2876	NC_021820	GCCGT	2	10	134213	134222	0 %	20 %	40 %	40 %	526218129
2877	NC_021820	GCC	2	6	134264	134269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218129
2878	NC_021820	GCTC	2	8	134313	134320	0 %	25 %	25 %	50 %	526218129
2879	NC_021820	ATG	2	6	134345	134350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218129
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2882	NC_021820	GC	4	8	134418	134425	0 %	0 %	50 %	50 %	526218129
2883	NC_021820	CAC	2	6	134497	134502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218129
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2886	NC_021820	TTC	2	6	134645	134650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218129
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2892	NC_021820	CTG	2	6	134885	134890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218129
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2895	NC_021820	CTG	2	6	135071	135076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218129
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2901	NC_021820	ATA	2	6	135393	135398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2902	NC_021820	TCA	2	6	135411	135416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2903	NC_021820	A	8	8	135423	135430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2904	NC_021820	AATA	2	8	135461	135468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2905	NC_021820	TACC	2	8	135557	135564	25 %	25 %	0 %	50 %	526218130
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2917	NC_021820	GTT	2	6	136188	136193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2922	NC_021820	CAA	2	6	136344	136349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2931	NC_021820	A	6	6	136766	136771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2932	NC_021820	GGC	2	6	136832	136837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218131
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2961	NC_021820	TCG	2	6	138165	138170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218132
2962	NC_021820	TCA	2	6	138196	138201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218132
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2970	NC_021820	TCA	2	6	138621	138626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218132
2971	NC_021820	A	7	7	138629	138635	100 %	0 %	0 %	0 %	526218132
2972	NC_021820	T	6	6	138638	138643	0 %	100 %	0 %	0 %	526218132
2973	NC_021820	GCA	2	6	138669	138674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2974	NC_021820	CGC	2	6	138726	138731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2975	NC_021820	GCC	2	6	138752	138757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2976	NC_021820	CGA	2	6	138794	138799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2977	NC_021820	ATCGC	2	10	138830	138839	20 %	20 %	20 %	40 %	526218133
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2979	NC_021820	GCGT	2	8	139047	139054	0 %	25 %	50 %	25 %	526218133
2980	NC_021820	CAG	2	6	139088	139093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218133
2981	NC_021820	CCT	2	6	139095	139100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218133
2982	NC_021820	GCCAT	2	10	139119	139128	20 %	20 %	20 %	40 %	526218133
2983	NC_021820	GTTG	2	8	139131	139138	0 %	50 %	50 %	0 %	526218133
2984	NC_021820	CGT	2	6	139146	139151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218133
2985	NC_021820	GCG	2	6	139180	139185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218133
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2987	NC_021820	AGT	2	6	139196	139201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218133
2988	NC_021820	GC	3	6	139256	139261	0 %	0 %	50 %	50 %	526218133
2989	NC_021820	GACC	2	8	139269	139276	25 %	0 %	25 %	50 %	526218133
2990	NC_021820	CTG	2	6	139288	139293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218133
2991	NC_021820	AC	3	6	139296	139301	50 %	0 %	0 %	50 %	526218133
2992	NC_021820	TCCTGC	2	12	139337	139348	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	526218133
2993	NC_021820	GCA	2	6	139350	139355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218133
2994	NC_021820	AC	3	6	139468	139473	50 %	0 %	0 %	50 %	526218133
2995	NC_021820	CCG	2	6	139478	139483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218133
2996	NC_021820	ATG	3	9	139558	139566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218133
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2998	NC_021820	TCC	2	6	139664	139669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2999	NC_021820	GC	3	6	139735	139740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3000	NC_021820	T	8	8	139751	139758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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