MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021820	GC	3	6	72980	72985	0 %	0 %	50 %	50 %	526218078
1502	NC_021820	T	6	6	73010	73015	0 %	100 %	0 %	0 %	526218078
1503	NC_021820	GCA	2	6	73043	73048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1504	NC_021820	GGC	2	6	73072	73077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218078
1505	NC_021820	CCGT	2	8	73139	73146	0 %	25 %	25 %	50 %	526218078
1506	NC_021820	ACC	2	6	73174	73179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218078
1507	NC_021820	TCC	2	6	73193	73198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218078
1508	NC_021820	GAT	2	6	73236	73241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218078
1509	NC_021820	CTC	2	6	73242	73247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218078
1510	NC_021820	CAG	2	6	73294	73299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1511	NC_021820	TCA	2	6	73373	73378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218078
1512	NC_021820	GATT	2	8	73398	73405	25 %	50 %	25 %	0 %	526218078
1513	NC_021820	GTA	2	6	73418	73423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218078
1514	NC_021820	CTG	2	6	73441	73446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1515	NC_021820	ACA	2	6	73484	73489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218078
1516	NC_021820	GC	3	6	73509	73514	0 %	0 %	50 %	50 %	526218078
1517	NC_021820	GCG	2	6	73568	73573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218078
1518	NC_021820	GGTTC	2	10	73588	73597	0 %	40 %	40 %	20 %	526218078
1519	NC_021820	GC	3	6	73640	73645	0 %	0 %	50 %	50 %	526218078
1520	NC_021820	CGC	2	6	73656	73661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218078
1521	NC_021820	GCC	2	6	73697	73702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218078
1522	NC_021820	GTT	2	6	73704	73709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218078
1523	NC_021820	CTG	2	6	73753	73758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1524	NC_021820	GCA	2	6	73776	73781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1525	NC_021820	GCA	2	6	73832	73837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1526	NC_021820	AGG	2	6	73841	73846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218078
1527	NC_021820	CTG	3	9	73870	73878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1528	NC_021820	GCCGCT	2	12	73883	73894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526218078
1529	NC_021820	GC	3	6	73924	73929	0 %	0 %	50 %	50 %	526218078
1530	NC_021820	CCA	2	6	74003	74008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218078
1531	NC_021820	GC	3	6	74017	74022	0 %	0 %	50 %	50 %	526218078
1532	NC_021820	TCA	2	6	74063	74068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218078
1533	NC_021820	AACA	2	8	74083	74090	75 %	0 %	0 %	25 %	526218078
1534	NC_021820	CGC	2	6	74091	74096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218078
1535	NC_021820	CGC	2	6	74134	74139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218078
1536	NC_021820	GAA	2	6	74149	74154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218078
1537	NC_021820	CGC	2	6	74175	74180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218078
1538	NC_021820	CCG	2	6	74183	74188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218078
1539	NC_021820	CTG	2	6	74203	74208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1540	NC_021820	TGAACT	2	12	74214	74225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526218078
1541	NC_021820	GC	3	6	74288	74293	0 %	0 %	50 %	50 %	526218079
1542	NC_021820	CAC	2	6	74314	74319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218079
1543	NC_021820	CAGC	2	8	74337	74344	25 %	0 %	25 %	50 %	526218079
1544	NC_021820	ATCT	2	8	74350	74357	25 %	50 %	0 %	25 %	526218079
1545	NC_021820	TGC	2	6	74364	74369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218079
1546	NC_021820	GAA	2	6	74393	74398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218079
1547	NC_021820	CGCGA	2	10	74426	74435	20 %	0 %	40 %	40 %	526218079
1548	NC_021820	TGG	2	6	74442	74447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218079
1549	NC_021820	AAG	2	6	74448	74453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218079
1550	NC_021820	CCG	2	6	74505	74510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218079
1551	NC_021820	A	6	6	74537	74542	100 %	0 %	0 %	0 %	526218079
1552	NC_021820	CCG	2	6	74565	74570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218079
1553	NC_021820	CTG	2	6	74591	74596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218079
1554	NC_021820	GCG	2	6	74597	74602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218079
1555	NC_021820	GGCG	2	8	74605	74612	0 %	0 %	75 %	25 %	526218079
1556	NC_021820	GCG	2	6	74655	74660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218079
1557	NC_021820	GGC	2	6	74728	74733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218079
1558	NC_021820	CGC	2	6	74745	74750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218079
1559	NC_021820	CCTT	2	8	74794	74801	0 %	50 %	0 %	50 %	526218079
1560	NC_021820	CAA	2	6	74813	74818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218079
1561	NC_021820	GA	3	6	74903	74908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021820	ATT	2	6	74923	74928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218080
1563	NC_021820	CG	3	6	74967	74972	0 %	0 %	50 %	50 %	526218080
1564	NC_021820	ATT	2	6	74981	74986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218080
1565	NC_021820	AAC	2	6	75001	75006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218080
1566	NC_021820	GGC	2	6	75106	75111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218080
1567	NC_021820	GC	3	6	75141	75146	0 %	0 %	50 %	50 %	526218080
1568	NC_021820	A	6	6	75155	75160	100 %	0 %	0 %	0 %	526218080
1569	NC_021820	CGG	3	9	75186	75194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218080
1570	NC_021820	TTAT	2	8	75299	75306	25 %	75 %	0 %	0 %	526218080
1571	NC_021820	CTG	3	9	75334	75342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218080
1572	NC_021820	GGCG	2	8	75384	75391	0 %	0 %	75 %	25 %	526218080
1573	NC_021820	CTG	2	6	75403	75408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218080
1574	NC_021820	GC	4	8	75448	75455	0 %	0 %	50 %	50 %	526218080
1575	NC_021820	GCG	2	6	75467	75472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218080
1576	NC_021820	CCA	2	6	75473	75478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218080
1577	NC_021820	GGCG	2	8	75483	75490	0 %	0 %	75 %	25 %	526218080
1578	NC_021820	CGCTGG	2	12	75509	75520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218080
1579	NC_021820	GCTAT	2	10	75525	75534	20 %	40 %	20 %	20 %	526218080
1580	NC_021820	GAA	2	6	75547	75552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218080
1581	NC_021820	GCC	2	6	75571	75576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218080
1582	NC_021820	CGT	2	6	75585	75590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218080
1583	NC_021820	ACCT	2	8	75625	75632	25 %	25 %	0 %	50 %	526218080
1584	NC_021820	GCG	2	6	75653	75658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218080
1585	NC_021820	CAC	2	6	75712	75717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218080
1586	NC_021820	TAT	2	6	75718	75723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218080
1587	NC_021820	GAA	2	6	75784	75789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218080
1588	NC_021820	GCG	2	6	75802	75807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218080
1589	NC_021820	CCT	2	6	75896	75901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218080
1590	NC_021820	GGC	2	6	75934	75939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218080
1591	NC_021820	CGC	2	6	75960	75965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218080
1592	NC_021820	GCT	2	6	75966	75971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218080
1593	NC_021820	CTT	2	6	75996	76001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218080
1594	NC_021820	ATC	2	6	76126	76131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_021820	AAGCG	2	10	76142	76151	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1596	NC_021820	CAT	2	6	76153	76158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_021820	T	6	6	76206	76211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021820	TC	3	6	76224	76229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1599	NC_021820	AC	3	6	76254	76259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_021820	GAA	2	6	76269	76274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021820	TGC	2	6	76308	76313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218081
1602	NC_021820	T	7	7	76314	76320	0 %	100 %	0 %	0 %	526218081
1603	NC_021820	TC	3	6	76331	76336	0 %	50 %	0 %	50 %	526218081
1604	NC_021820	TGC	2	6	76389	76394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218081
1605	NC_021820	ATG	2	6	76439	76444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218081
1606	NC_021820	GTC	2	6	76510	76515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218081
1607	NC_021820	CG	3	6	76519	76524	0 %	0 %	50 %	50 %	526218081
1608	NC_021820	CAG	2	6	76534	76539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218081
1609	NC_021820	CGC	2	6	76639	76644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218081
1610	NC_021820	AGG	2	6	76838	76843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218081
1611	NC_021820	TAT	2	6	76850	76855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218081
1612	NC_021820	AGC	2	6	76928	76933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_021820	ATT	2	6	76956	76961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218082
1614	NC_021820	TCA	2	6	76983	76988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218082
1615	NC_021820	CGA	2	6	77004	77009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218082
1616	NC_021820	GC	4	8	77061	77068	0 %	0 %	50 %	50 %	526218082
1617	NC_021820	CGT	2	6	77163	77168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218082
1618	NC_021820	CAG	2	6	77197	77202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218082
1619	NC_021820	GAA	2	6	77209	77214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218082
1620	NC_021820	CTG	2	6	77335	77340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218082
1621	NC_021820	ATCA	2	8	77347	77354	50 %	25 %	0 %	25 %	526218082
1622	NC_021820	GTC	2	6	77366	77371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218082
1623	NC_021820	AGC	2	6	77423	77428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218082
1624	NC_021820	CCCGG	2	10	77469	77478	0 %	0 %	40 %	60 %	526218082
1625	NC_021820	GCA	2	6	77507	77512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218082
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1627	NC_021820	CGCC	2	8	77538	77545	0 %	0 %	25 %	75 %	526218082
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1755	NC_021820	AAT	2	6	83968	83973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221724
1756	NC_021820	CTA	2	6	84005	84010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221724
1757	NC_021820	A	6	6	84020	84025	100 %	0 %	0 %	0 %	526221724
1758	NC_021820	TCA	2	6	84059	84064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221724
1759	NC_021820	GTC	2	6	84095	84100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221724
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1762	NC_021820	TTC	2	6	84143	84148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221724
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1781	NC_021820	A	6	6	85041	85046	100 %	0 %	0 %	0 %	526218086
1782	NC_021820	TAT	2	6	85059	85064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218086
1783	NC_021820	ATC	2	6	85073	85078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218086
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1785	NC_021820	TCT	2	6	85194	85199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218086
1786	NC_021820	GGAT	2	8	85253	85260	25 %	25 %	50 %	0 %	526218086
1787	NC_021820	TGA	2	6	85361	85366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1788	NC_021820	TTA	2	6	85409	85414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218087
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1793	NC_021820	TTCA	2	8	85685	85692	25 %	50 %	0 %	25 %	526218087
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1811	NC_021820	CG	3	6	86385	86390	0 %	0 %	50 %	50 %	526218087
1812	NC_021820	GCA	2	6	86536	86541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218087
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1867	NC_021820	ACG	2	6	88493	88498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218088
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1870	NC_021820	TACCAG	2	12	88579	88590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526218088
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1873	NC_021820	GCC	2	6	88699	88704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218088
1874	NC_021820	GCG	2	6	88716	88721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218088
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1997	NC_021820	CCG	2	6	94438	94443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218092
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