MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021820	GAC	2	6	49449	49454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218060
1002	NC_021820	TCA	2	6	49469	49474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218060
1003	NC_021820	GC	3	6	49477	49482	0 %	0 %	50 %	50 %	526218060
1004	NC_021820	CGC	3	9	49480	49488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218060
1005	NC_021820	TGT	2	6	49511	49516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218060
1006	NC_021820	CGCC	2	8	49608	49615	0 %	0 %	25 %	75 %	526218060
1007	NC_021820	TCATC	2	10	49671	49680	20 %	40 %	0 %	40 %	526218060
1008	NC_021820	ATCA	2	8	49828	49835	50 %	25 %	0 %	25 %	526218060
1009	NC_021820	GCG	2	6	49836	49841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218060
1010	NC_021820	CGT	2	6	49860	49865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218060
1011	NC_021820	CACG	2	8	49893	49900	25 %	0 %	25 %	50 %	526218060
1012	NC_021820	CG	3	6	50151	50156	0 %	0 %	50 %	50 %	526218060
1013	NC_021820	CGC	2	6	50175	50180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218060
1014	NC_021820	AT	3	6	50222	50227	50 %	50 %	0 %	0 %	526218060
1015	NC_021820	CGG	2	6	50268	50273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218060
1016	NC_021820	ACGC	2	8	50299	50306	25 %	0 %	25 %	50 %	526218060
1017	NC_021820	TCAA	2	8	50309	50316	50 %	25 %	0 %	25 %	526218060
1018	NC_021820	GGA	2	6	50356	50361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218060
1019	NC_021820	GCC	2	6	50374	50379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218060
1020	NC_021820	CAT	2	6	50418	50423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218060
1021	NC_021820	GCT	2	6	50499	50504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218060
1022	NC_021820	CAG	2	6	50587	50592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218060
1023	NC_021820	T	6	6	50599	50604	0 %	100 %	0 %	0 %	526218060
1024	NC_021820	AAG	2	6	50630	50635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021820	GAT	2	6	50664	50669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021820	ATG	2	6	50741	50746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021820	CCG	2	6	50752	50757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_021820	ATC	2	6	50913	50918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021820	TAT	2	6	50966	50971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021820	GC	3	6	51041	51046	0 %	0 %	50 %	50 %	526218061
1031	NC_021820	ATG	2	6	51056	51061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218061
1032	NC_021820	TCGC	2	8	51094	51101	0 %	25 %	25 %	50 %	526218061
1033	NC_021820	GTCA	2	8	51104	51111	25 %	25 %	25 %	25 %	526218061
1034	NC_021820	TGCG	2	8	51120	51127	0 %	25 %	50 %	25 %	526218061
1035	NC_021820	CAG	2	6	51179	51184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218061
1036	NC_021820	CGG	2	6	51216	51221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218061
1037	NC_021820	GAT	2	6	51253	51258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218061
1038	NC_021820	AAG	2	6	51359	51364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218061
1039	NC_021820	GCC	2	6	51386	51391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218061
1040	NC_021820	CG	3	6	51413	51418	0 %	0 %	50 %	50 %	526218061
1041	NC_021820	ACTAAA	2	12	51452	51463	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526218061
1042	NC_021820	TGA	2	6	51487	51492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218061
1043	NC_021820	GAT	2	6	51517	51522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218061
1044	NC_021820	CGC	2	6	51559	51564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218061
1045	NC_021820	CGGCAA	2	12	51640	51651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218061
1046	NC_021820	GC	3	6	51668	51673	0 %	0 %	50 %	50 %	526218061
1047	NC_021820	CCGT	2	8	51710	51717	0 %	25 %	25 %	50 %	526218061
1048	NC_021820	ATT	2	6	51767	51772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218061
1049	NC_021820	GGC	2	6	51778	51783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218061
1050	NC_021820	CCG	2	6	51881	51886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218061
1051	NC_021820	A	6	6	51912	51917	100 %	0 %	0 %	0 %	526218061
1052	NC_021820	CAT	2	6	52046	52051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218061
1053	NC_021820	CCG	2	6	52202	52207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218062
1054	NC_021820	GAA	2	6	52209	52214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218062
1055	NC_021820	GCAC	2	8	52240	52247	25 %	0 %	25 %	50 %	526218062
1056	NC_021820	GCG	2	6	52285	52290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218062
1057	NC_021820	ATG	2	6	52515	52520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218063
1058	NC_021820	CG	4	8	52695	52702	0 %	0 %	50 %	50 %	526218063
1059	NC_021820	CGG	2	6	52769	52774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218063
1060	NC_021820	CGC	2	6	52782	52787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218063
1061	NC_021820	GTT	2	6	52833	52838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218063
1062	NC_021820	GCC	2	6	52884	52889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218063
1063	NC_021820	GCA	2	6	52928	52933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218063
1064	NC_021820	CCA	2	6	52949	52954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218063
1065	NC_021820	ACG	2	6	52997	53002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218063
1066	NC_021820	CCA	2	6	53090	53095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218063
1067	NC_021820	T	6	6	53108	53113	0 %	100 %	0 %	0 %	526218063
1068	NC_021820	TTG	2	6	53118	53123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218063
1069	NC_021820	ACAG	2	8	53229	53236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_021820	A	6	6	53255	53260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021820	ATC	2	6	53297	53302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_021820	TTTAT	2	10	53306	53315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021820	ATG	2	6	53359	53364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218064
1074	NC_021820	GTC	2	6	53367	53372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218064
1075	NC_021820	CGG	2	6	53387	53392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218064
1076	NC_021820	GGC	2	6	53463	53468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218064
1077	NC_021820	CCATC	2	10	53488	53497	20 %	20 %	0 %	60 %	526218064
1078	NC_021820	ATT	2	6	53526	53531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218064
1079	NC_021820	TTC	2	6	53579	53584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218064
1080	NC_021820	CAA	2	6	53625	53630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218064
1081	NC_021820	ATG	2	6	53800	53805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218064
1082	NC_021820	CCA	2	6	53855	53860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218064
1083	NC_021820	TTA	2	6	53875	53880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218064
1084	NC_021820	CTG	2	6	53970	53975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218064
1085	NC_021820	CT	5	10	54002	54011	0 %	50 %	0 %	50 %	526218064
1086	NC_021820	GCG	2	6	54028	54033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218064
1087	NC_021820	GAT	2	6	54078	54083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218064
1088	NC_021820	TCA	2	6	54088	54093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218064
1089	NC_021820	A	6	6	54111	54116	100 %	0 %	0 %	0 %	526218064
1090	NC_021820	CTGC	2	8	54128	54135	0 %	25 %	25 %	50 %	526218064
1091	NC_021820	CGCTGG	2	12	54169	54180	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	526218064
1092	NC_021820	ACAG	2	8	54198	54205	50 %	0 %	25 %	25 %	526218064
1093	NC_021820	CCG	2	6	54298	54303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218064
1094	NC_021820	AGC	2	6	54427	54432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218064
1095	NC_021820	CG	3	6	54468	54473	0 %	0 %	50 %	50 %	526218064
1096	NC_021820	TCG	2	6	54502	54507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218064
1097	NC_021820	CGC	2	6	54587	54592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218064
1098	NC_021820	ATT	2	6	54597	54602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218064
1099	NC_021820	ACC	2	6	54666	54671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218064
1100	NC_021820	GCG	2	6	54708	54713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218064
1101	NC_021820	CCAT	2	8	54757	54764	25 %	25 %	0 %	50 %	526218065
1102	NC_021820	GCG	2	6	54809	54814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218065
1103	NC_021820	ACG	2	6	54843	54848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218065
1104	NC_021820	AGT	2	6	54922	54927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218065
1105	NC_021820	CGC	2	6	54942	54947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218065
1106	NC_021820	CGCC	2	8	55076	55083	0 %	0 %	25 %	75 %	526218065
1107	NC_021820	CGCGAT	2	12	55100	55111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526218065
1108	NC_021820	GAT	2	6	55121	55126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218065
1109	NC_021820	CAT	2	6	55143	55148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218065
1110	NC_021820	TCA	2	6	55153	55158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218065
1111	NC_021820	CT	3	6	55186	55191	0 %	50 %	0 %	50 %	526218065
1112	NC_021820	AAC	2	6	55243	55248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218065
1113	NC_021820	GCA	2	6	55322	55327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218065
1114	NC_021820	TTG	2	6	55340	55345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218065
1115	NC_021820	TTG	2	6	55386	55391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218065
1116	NC_021820	GTACG	2	10	55427	55436	20 %	20 %	40 %	20 %	526218065
1117	NC_021820	CCA	2	6	55445	55450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218065
1118	NC_021820	CAG	2	6	55497	55502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218065
1119	NC_021820	TGGC	2	8	55551	55558	0 %	25 %	50 %	25 %	526218065
1120	NC_021820	CCG	2	6	55574	55579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218065
1121	NC_021820	CCA	2	6	55610	55615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218065
1122	NC_021820	ATT	2	6	55639	55644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218065
1123	NC_021820	TCC	2	6	55647	55652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_021820	TAGCA	2	10	55680	55689	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_021820	TAA	2	6	55721	55726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021820	TC	3	6	55789	55794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_021820	T	9	9	55846	55854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_021820	CCG	2	6	61955	61960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218070
1254	NC_021820	GAACT	2	10	62112	62121	40 %	20 %	20 %	20 %	526218070
1255	NC_021820	GCT	2	6	62132	62137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218070
1256	NC_021820	GATC	2	8	62215	62222	25 %	25 %	25 %	25 %	526218070
1257	NC_021820	GCC	2	6	62223	62228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218070
1258	NC_021820	GCTG	2	8	62264	62271	0 %	25 %	50 %	25 %	526218070
1259	NC_021820	CTG	3	9	62277	62285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218070
1260	NC_021820	CGC	2	6	62320	62325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218070
1261	NC_021820	CGA	2	6	62357	62362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218070
1262	NC_021820	TGA	2	6	62365	62370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218070
1263	NC_021820	GTT	2	6	62375	62380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218070
1264	NC_021820	CGG	2	6	62558	62563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218070
1265	NC_021820	GGC	2	6	62577	62582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218070
1266	NC_021820	GC	3	6	62581	62586	0 %	0 %	50 %	50 %	526218070
1267	NC_021820	GCT	2	6	62600	62605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218070
1268	NC_021820	GAT	2	6	62660	62665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218070
1269	NC_021820	CAG	2	6	62699	62704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218070
1270	NC_021820	CTG	2	6	62742	62747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218070
1271	NC_021820	CCG	3	9	62748	62756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218070
1272	NC_021820	TCCGC	2	10	62860	62869	0 %	20 %	20 %	60 %	526218070
1273	NC_021820	CGT	2	6	62922	62927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218070
1274	NC_021820	GGC	2	6	62934	62939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218070
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1276	NC_021820	TGC	2	6	62995	63000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218070
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1278	NC_021820	GTG	2	6	63036	63041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218070
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1281	NC_021820	TGG	2	6	63172	63177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218070
1282	NC_021820	GAA	2	6	63222	63227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218070
1283	NC_021820	GTG	2	6	63237	63242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218070
1284	NC_021820	CTGA	2	8	63369	63376	25 %	25 %	25 %	25 %	526218070
1285	NC_021820	AG	3	6	63475	63480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1286	NC_021820	GGC	2	6	63504	63509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1287	NC_021820	CTG	2	6	63518	63523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1288	NC_021820	T	6	6	63536	63541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1289	NC_021820	AT	3	6	63544	63549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1290	NC_021820	TCTG	2	8	63551	63558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1291	NC_021820	TCTT	2	8	63578	63585	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1292	NC_021820	CTGGG	2	10	63726	63735	0 %	20 %	60 %	20 %	526218071
1293	NC_021820	CCT	2	6	63764	63769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218071
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1326	NC_021820	CAG	2	6	65222	65227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218071
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1328	NC_021820	TGAT	2	8	65362	65369	25 %	50 %	25 %	0 %	526218071
1329	NC_021820	TAACGC	2	12	65428	65439	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1330	NC_021820	TC	3	6	65459	65464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1331	NC_021820	AAT	2	6	65503	65508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1332	NC_021820	ACG	2	6	65579	65584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218072
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1334	NC_021820	TCA	2	6	65606	65611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218072
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1341	NC_021820	CAG	2	6	65881	65886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218072
1342	NC_021820	GC	3	6	65914	65919	0 %	0 %	50 %	50 %	526218072
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1346	NC_021820	CTA	2	6	66016	66021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218072
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1351	NC_021820	TGAAAG	2	12	66275	66286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	526218072
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1357	NC_021820	CGCC	2	8	66541	66548	0 %	0 %	25 %	75 %	526218073
1358	NC_021820	CGG	2	6	66585	66590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218073
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1364	NC_021820	TGCT	2	8	66792	66799	0 %	50 %	25 %	25 %	526218074
1365	NC_021820	TCA	2	6	66854	66859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218074
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1370	NC_021820	CG	3	6	67088	67093	0 %	0 %	50 %	50 %	526218074
1371	NC_021820	TCA	2	6	67132	67137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218074
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1377	NC_021820	GTC	2	6	67311	67316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218074
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1379	NC_021820	ATTT	2	8	67427	67434	25 %	75 %	0 %	0 %	526218074
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1492	NC_021820	ATCT	2	8	72528	72535	25 %	50 %	0 %	25 %	526218078
1493	NC_021820	CTG	2	6	72598	72603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218078
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1497	NC_021820	CAG	2	6	72781	72786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1498	NC_021820	CAG	2	6	72817	72822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218078
1499	NC_021820	GC	3	6	72844	72849	0 %	0 %	50 %	50 %	526218078
1500	NC_021820	CGC	2	6	72876	72881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218078

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