MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021820	GTG	2	6	515822	515827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11002	NC_021820	GTT	2	6	515842	515847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218413
11003	NC_021820	TGG	2	6	515853	515858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11004	NC_021820	TGG	2	6	515862	515867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11005	NC_021820	GTG	2	6	515876	515881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11006	NC_021820	TGAT	2	8	515885	515892	25 %	50 %	25 %	0 %	526218413
11007	NC_021820	TGG	2	6	515904	515909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11008	NC_021820	AAC	2	6	515951	515956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218413
11009	NC_021820	CGC	2	6	516001	516006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
11010	NC_021820	CAT	2	6	516081	516086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218413
11011	NC_021820	GTG	2	6	516095	516100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11012	NC_021820	TGG	2	6	516126	516131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11013	NC_021820	TGG	2	6	516135	516140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11014	NC_021820	GTG	2	6	516149	516154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11015	NC_021820	TGAT	2	8	516158	516165	25 %	50 %	25 %	0 %	526218413
11016	NC_021820	GGC	2	6	516178	516183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218413
11017	NC_021820	TGC	2	6	516249	516254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218413
11018	NC_021820	TGG	2	6	516261	516266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11019	NC_021820	CAG	2	6	516273	516278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218413
11020	NC_021820	AAC	2	6	516308	516313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218413
11021	NC_021820	CGC	2	6	516358	516363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
11022	NC_021820	CTAC	2	8	516506	516513	25 %	25 %	0 %	50 %	526218413
11023	NC_021820	CCG	2	6	516587	516592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218413
11024	NC_021820	GTCG	2	8	516594	516601	0 %	25 %	50 %	25 %	526218413
11025	NC_021820	TGG	2	6	516654	516659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11026	NC_021820	GTG	2	6	516701	516706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218413
11027	NC_021820	AGC	2	6	516802	516807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218413
11028	NC_021820	GTC	2	6	516811	516816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218413
11029	NC_021820	CCATTG	2	12	516924	516935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526218413
11030	NC_021820	GCG	2	6	517097	517102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218413
11031	NC_021820	TCC	2	6	517168	517173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218413
11032	NC_021820	TGC	2	6	517251	517256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218413
11033	NC_021820	T	8	8	517298	517305	0 %	100 %	0 %	0 %	526218413
11034	NC_021820	ACA	2	6	517334	517339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218413
11035	NC_021820	ATGA	2	8	517385	517392	50 %	25 %	25 %	0 %	526218413
11036	NC_021820	AAT	2	6	517410	517415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_021820	TAT	2	6	517428	517433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218414
11038	NC_021820	T	7	7	517433	517439	0 %	100 %	0 %	0 %	526218414
11039	NC_021820	CTT	2	6	517442	517447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218414
11040	NC_021820	T	6	6	517446	517451	0 %	100 %	0 %	0 %	526218414
11041	NC_021820	ATT	2	6	517523	517528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218414
11042	NC_021820	GTT	2	6	517618	517623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218414
11043	NC_021820	T	6	6	517655	517660	0 %	100 %	0 %	0 %	526218414
11044	NC_021820	ATAG	2	8	517758	517765	50 %	25 %	25 %	0 %	526218414
11045	NC_021820	GTT	2	6	517793	517798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218414
11046	NC_021820	AAT	2	6	517799	517804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218414
11047	NC_021820	GTT	2	6	517852	517857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218414
11048	NC_021820	TTG	2	6	517916	517921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218414
11049	NC_021820	CTT	2	6	517945	517950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218414
11050	NC_021820	TGT	2	6	517959	517964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218414
11051	NC_021820	TGT	2	6	518001	518006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218414
11052	NC_021820	CAA	2	6	518020	518025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218414
11053	NC_021820	TAA	2	6	518129	518134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_021820	TA	3	6	518137	518142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_021820	TTAT	2	8	518161	518168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_021820	TCA	2	6	518178	518183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_021820	TCG	2	6	518235	518240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_021820	GC	3	6	518252	518257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_021820	TTAT	2	8	518270	518277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_021820	TATG	2	8	518322	518329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_021820	T	8	8	518335	518342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_021820	GAT	2	6	518347	518352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_021820	A	7	7	518410	518416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_021820	TA	3	6	518498	518503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_021820	TCC	2	6	518560	518565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_021820	ACA	2	6	518677	518682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218415
11067	NC_021820	CACG	2	8	518690	518697	25 %	0 %	25 %	50 %	526218415
11068	NC_021820	TTC	2	6	518701	518706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218415
11069	NC_021820	T	6	6	518730	518735	0 %	100 %	0 %	0 %	526218415
11070	NC_021820	CG	3	6	518742	518747	0 %	0 %	50 %	50 %	526218415
11071	NC_021820	TCA	2	6	518762	518767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218415
11072	NC_021820	CTT	2	6	518777	518782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218415
11073	NC_021820	TCTTTT	2	12	518839	518850	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	526218415
11074	NC_021820	CGG	2	6	518870	518875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218415
11075	NC_021820	AG	4	8	518884	518891	50 %	0 %	50 %	0 %	526218415
11076	NC_021820	CCTG	2	8	518893	518900	0 %	25 %	25 %	50 %	526218415
11077	NC_021820	TGG	2	6	518902	518907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218415
11078	NC_021820	T	7	7	518947	518953	0 %	100 %	0 %	0 %	526218415
11079	NC_021820	CTT	2	6	518957	518962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218415
11080	NC_021820	GATA	2	8	518990	518997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_021820	GC	3	6	519009	519014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11082	NC_021820	AGTG	2	8	519015	519022	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_021820	TTC	2	6	519024	519029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_021820	ATT	2	6	519079	519084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_021820	GAAA	2	8	519119	519126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_021820	GGA	2	6	519245	519250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_021820	CTT	2	6	519284	519289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218416
11088	NC_021820	CCAG	2	8	519318	519325	25 %	0 %	25 %	50 %	526218416
11089	NC_021820	CGC	3	9	519351	519359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218416
11090	NC_021820	TTCC	2	8	519369	519376	0 %	50 %	0 %	50 %	526218416
11091	NC_021820	GC	3	6	519393	519398	0 %	0 %	50 %	50 %	526218416
11092	NC_021820	ATTT	2	8	519401	519408	25 %	75 %	0 %	0 %	526218416
11093	NC_021820	CGG	2	6	519428	519433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218416
11094	NC_021820	AGA	3	9	519448	519456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218416
11095	NC_021820	T	6	6	519492	519497	0 %	100 %	0 %	0 %	526218417
11096	NC_021820	AG	4	8	519525	519532	50 %	0 %	50 %	0 %	526218417
11097	NC_021820	TCG	2	6	519538	519543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218417
11098	NC_021820	CTG	2	6	519554	519559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218417
11099	NC_021820	GCG	4	12	519610	519621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218417
11100	NC_021820	GCAGT	2	10	519635	519644	20 %	20 %	40 %	20 %	526218417
11101	NC_021820	TCG	2	6	519669	519674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218417
11102	NC_021820	GTC	2	6	519857	519862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218417
11103	NC_021820	CGG	2	6	519916	519921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218417
11104	NC_021820	ATT	2	6	519999	520004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218417
11105	NC_021820	CCA	2	6	520098	520103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218418
11106	NC_021820	GCC	2	6	520172	520177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218418
11107	NC_021820	CCTGCG	2	12	520182	520193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	526218418
11108	NC_021820	TCA	2	6	520199	520204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218418
11109	NC_021820	CGC	3	9	520219	520227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218418
11110	NC_021820	AGC	2	6	520277	520282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218418
11111	NC_021820	GAC	2	6	520326	520331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218418
11112	NC_021820	CGC	2	6	520443	520448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218418
11113	NC_021820	TTC	2	6	520450	520455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526218418
11114	NC_021820	CAC	2	6	520468	520473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218418
11115	NC_021820	CG	3	6	520474	520479	0 %	0 %	50 %	50 %	526218418
11116	NC_021820	TGA	2	6	520514	520519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218418
11117	NC_021820	GGC	2	6	520724	520729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218418
11118	NC_021820	CGG	2	6	520743	520748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218418
11119	NC_021820	GTG	2	6	520829	520834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218418
11120	NC_021820	GAT	2	6	520858	520863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218418
11121	NC_021820	CAC	2	6	520939	520944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218418
11122	NC_021820	GTG	2	6	520958	520963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218418
11123	NC_021820	ACA	2	6	520991	520996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526218418
11124	NC_021820	TGC	2	6	521007	521012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218418
11125	NC_021820	CAGC	2	8	521148	521155	25 %	0 %	25 %	50 %	526218418
11126	NC_021820	CTC	2	6	521334	521339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11127	NC_021820	GCC	2	6	521389	521394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11128	NC_021820	T	6	6	521438	521443	0 %	100 %	0 %	0 %	526221798
11129	NC_021820	CAG	2	6	521450	521455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221798
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11132	NC_021820	TGA	2	6	521536	521541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221798
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11143	NC_021820	GGTCA	2	10	522047	522056	20 %	20 %	40 %	20 %	526221798
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11160	NC_021820	CTG	2	6	522734	522739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221798
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11176	NC_021820	ACC	2	6	523222	523227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221798
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11178	NC_021820	ATA	2	6	523251	523256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221798
11179	NC_021820	CTT	2	6	523359	523364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11180	NC_021820	TGTAG	2	10	523430	523439	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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11182	NC_021820	A	7	7	523565	523571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11183	NC_021820	TTG	2	6	523642	523647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11184	NC_021820	CCT	2	6	523751	523756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11185	NC_021820	CTG	2	6	523875	523880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218419
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11189	NC_021820	CTG	2	6	524037	524042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218419
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11227	NC_021820	GCC	2	6	525749	525754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218420
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11230	NC_021820	TGC	2	6	525819	525824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218420
11231	NC_021820	ATG	2	6	525849	525854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218420
11232	NC_021820	GAT	2	6	525907	525912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218420
11233	NC_021820	ATT	2	6	525922	525927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218420
11234	NC_021820	ACG	2	6	525958	525963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218421
11235	NC_021820	A	6	6	526012	526017	100 %	0 %	0 %	0 %	526218421
11236	NC_021820	CT	3	6	526111	526116	0 %	50 %	0 %	50 %	526218421
11237	NC_021820	GGCG	2	8	526125	526132	0 %	0 %	75 %	25 %	526218421
11238	NC_021820	TGG	2	6	526157	526162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218421
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11241	NC_021820	GGC	2	6	526308	526313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218421
11242	NC_021820	CCG	2	6	526355	526360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218421
11243	NC_021820	CAG	2	6	526402	526407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218421
11244	NC_021820	CGC	2	6	526425	526430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218421
11245	NC_021820	GCA	2	6	526431	526436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218421
11246	NC_021820	TGG	2	6	526487	526492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218421
11247	NC_021820	AGC	2	6	526661	526666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218421
11248	NC_021820	GCT	2	6	526683	526688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218421
11249	NC_021820	TGC	2	6	526785	526790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218421
11250	NC_021820	TGGC	2	8	526861	526868	0 %	25 %	50 %	25 %	526218421
11251	NC_021820	TGC	2	6	526886	526891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218421
11252	NC_021820	GTG	2	6	526930	526935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218421
11253	NC_021820	ATT	2	6	526973	526978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218421
11254	NC_021820	GCC	2	6	526999	527004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218421
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11256	NC_021820	GC	3	6	527156	527161	0 %	0 %	50 %	50 %	526218421
11257	NC_021820	CGC	2	6	527166	527171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218421
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11264	NC_021820	CGGAA	2	10	527469	527478	40 %	0 %	40 %	20 %	526218421
11265	NC_021820	TGC	2	6	527498	527503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218421
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11274	NC_021820	TTAAA	2	10	527775	527784	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11275	NC_021820	ATT	2	6	527804	527809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11276	NC_021820	CTT	2	6	527869	527874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11277	NC_021820	TGC	2	6	528073	528078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218422
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11282	NC_021820	TTCG	2	8	528332	528339	0 %	50 %	25 %	25 %	526218422
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11300	NC_021820	TGG	2	6	529190	529195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218423
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11329	NC_021820	CTG	2	6	530601	530606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218423
11330	NC_021820	GCC	2	6	530741	530746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11331	NC_021820	TGC	2	6	530887	530892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218424
11332	NC_021820	ACTC	2	8	530975	530982	25 %	25 %	0 %	50 %	526218424
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11342	NC_021820	GC	4	8	531623	531630	0 %	0 %	50 %	50 %	526218424
11343	NC_021820	CGG	2	6	531676	531681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218424
11344	NC_021820	CAT	2	6	531687	531692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218424
11345	NC_021820	GCT	2	6	531750	531755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218424
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11348	NC_021820	GCGA	2	8	531870	531877	25 %	0 %	50 %	25 %	526218424
11349	NC_021820	TCA	2	6	531893	531898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218424
11350	NC_021820	CTG	3	9	531933	531941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218424
11351	NC_021820	TCG	2	6	532042	532047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218424
11352	NC_021820	GCT	2	6	532109	532114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218424
11353	NC_021820	ACG	2	6	532231	532236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218424
11354	NC_021820	AGC	2	6	532240	532245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218424
11355	NC_021820	AAG	2	6	532267	532272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218424
11356	NC_021820	GCG	2	6	532396	532401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218424
11357	NC_021820	CCA	2	6	532403	532408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218424
11358	NC_021820	CGG	2	6	532424	532429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218424
11359	NC_021820	CTG	2	6	532536	532541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218424
11360	NC_021820	ATGGC	2	10	532567	532576	20 %	20 %	40 %	20 %	526218424
11361	NC_021820	GTT	2	6	532646	532651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218424
11362	NC_021820	A	7	7	532852	532858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_021820	TAA	2	6	532922	532927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11482	NC_021820	AAT	2	6	538901	538906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218430
11483	NC_021820	CGA	2	6	538953	538958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218430
11484	NC_021820	ATAA	2	8	538982	538989	75 %	25 %	0 %	0 %	526218430
11485	NC_021820	GCA	2	6	539016	539021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218430
11486	NC_021820	CAT	2	6	539032	539037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218430
11487	NC_021820	CCA	2	6	539085	539090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218430
11488	NC_021820	GAC	2	6	539098	539103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218430
11489	NC_021820	CGT	2	6	539107	539112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218430
11490	NC_021820	GGC	2	6	539116	539121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218430
11491	NC_021820	GATA	2	8	539163	539170	50 %	25 %	25 %	0 %	526218430
11492	NC_021820	CGGAA	2	10	539235	539244	40 %	0 %	40 %	20 %	526218430
11493	NC_021820	GCC	2	6	539245	539250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218430
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11497	NC_021820	CAT	2	6	539389	539394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218430
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11499	NC_021820	G	6	6	539476	539481	0 %	0 %	100 %	0 %	526218430
11500	NC_021820	AAT	2	6	539482	539487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218430

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