MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
101001	NC_021820	AGCC	2	8	4779213	4779220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101002	NC_021820	GACA	2	8	4779230	4779237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101003	NC_021820	TAC	2	6	4779249	4779254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101004	NC_021820	CAT	2	6	4779259	4779264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101005	NC_021820	A	7	7	4779348	4779354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101006	NC_021820	GCG	3	9	4779455	4779463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221690
101007	NC_021820	GATA	2	8	4779488	4779495	50 %	25 %	25 %	0 %	526221690
101008	NC_021820	ATC	2	6	4779537	4779542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221690
101009	NC_021820	CGG	2	6	4779548	4779553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221690
101010	NC_021820	ACG	2	6	4779573	4779578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221690
101011	NC_021820	TGA	2	6	4779640	4779645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221690
101012	NC_021820	ATC	2	6	4779652	4779657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221690
101013	NC_021820	TCA	2	6	4779701	4779706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221690
101014	NC_021820	GCAG	2	8	4779730	4779737	25 %	0 %	50 %	25 %	526221690
101015	NC_021820	GTC	2	6	4779766	4779771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221690
101016	NC_021820	AAAC	2	8	4779791	4779798	75 %	0 %	0 %	25 %	526221690
101017	NC_021820	AGC	2	6	4779805	4779810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221690
101018	NC_021820	CAG	2	6	4779846	4779851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221690
101019	NC_021820	AAT	2	6	4779945	4779950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221690
101020	NC_021820	AAC	2	6	4780045	4780050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221690
101021	NC_021820	TGC	2	6	4780060	4780065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221690
101022	NC_021820	AAT	2	6	4780074	4780079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221690
101023	NC_021820	CGC	2	6	4780110	4780115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221690
101024	NC_021820	ATAA	2	8	4780125	4780132	75 %	25 %	0 %	0 %	526221690
101025	NC_021820	CAC	2	6	4780182	4780187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221690
101026	NC_021820	ATC	2	6	4780192	4780197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221690
101027	NC_021820	AAT	2	6	4780240	4780245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221690
101028	NC_021820	GTG	2	6	4780267	4780272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221690
101029	NC_021820	TCT	2	6	4780345	4780350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221690
101030	NC_021820	CGC	2	6	4780382	4780387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221690
101031	NC_021820	ATAG	2	8	4780397	4780404	50 %	25 %	25 %	0 %	526221690
101032	NC_021820	CGC	2	6	4780474	4780479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221690
101033	NC_021820	CTGT	2	8	4780491	4780498	0 %	50 %	25 %	25 %	526221690
101034	NC_021820	ATAAG	2	10	4780579	4780588	60 %	20 %	20 %	0 %	526221690
101035	NC_021820	GGC	2	6	4780640	4780645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221690
101036	NC_021820	GCC	2	6	4780705	4780710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221690
101037	NC_021820	CTT	2	6	4780745	4780750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221690
101038	NC_021820	CCT	2	6	4780826	4780831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526221690
101039	NC_021820	ATCG	2	8	4780837	4780844	25 %	25 %	25 %	25 %	526221690
101040	NC_021820	GCG	2	6	4780922	4780927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221690
101041	NC_021820	AGC	2	6	4780930	4780935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221690
101042	NC_021820	ATC	2	6	4781065	4781070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221690
101043	NC_021820	GC	3	6	4781078	4781083	0 %	0 %	50 %	50 %	526221690
101044	NC_021820	ATA	2	6	4781095	4781100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221690
101045	NC_021820	GCG	2	6	4781110	4781115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221690
101046	NC_021820	ATA	2	6	4781137	4781142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221690
101047	NC_021820	CCG	2	6	4781185	4781190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221690
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101049	NC_021820	CGG	2	6	4781222	4781227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221690
101050	NC_021820	ATAA	2	8	4781272	4781279	75 %	25 %	0 %	0 %	526221690
101051	NC_021820	GAA	2	6	4781393	4781398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526221691
101052	NC_021820	ACG	2	6	4781439	4781444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221691
101053	NC_021820	CGT	2	6	4781450	4781455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221691
101054	NC_021820	CTG	2	6	4781477	4781482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221691
101055	NC_021820	TCG	2	6	4781484	4781489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221691
101056	NC_021820	TCG	2	6	4781548	4781553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221691
101057	NC_021820	CTG	2	6	4781577	4781582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221691
101058	NC_021820	GCC	2	6	4781598	4781603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221691
101059	NC_021820	TGC	2	6	4781635	4781640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221691
101060	NC_021820	GCG	2	6	4781644	4781649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221691
101061	NC_021820	ACGC	2	8	4781672	4781679	25 %	0 %	25 %	50 %	526221691
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101063	NC_021820	CAG	2	6	4781806	4781811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221691
101064	NC_021820	GC	3	6	4781812	4781817	0 %	0 %	50 %	50 %	526221691
101065	NC_021820	CG	3	6	4781854	4781859	0 %	0 %	50 %	50 %	526221691
101066	NC_021820	GTT	2	6	4781903	4781908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526221691
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101068	NC_021820	ATA	2	6	4781999	4782004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221691
101069	NC_021820	GCTTCC	2	12	4782015	4782026	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	526221691
101070	NC_021820	CGA	2	6	4782145	4782150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221691
101071	NC_021820	CG	3	6	4782165	4782170	0 %	0 %	50 %	50 %	526221691
101072	NC_021820	CG	3	6	4782172	4782177	0 %	0 %	50 %	50 %	526221691
101073	NC_021820	TAAA	2	8	4782318	4782325	75 %	25 %	0 %	0 %	526221692
101074	NC_021820	ACA	2	6	4782330	4782335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526221692
101075	NC_021820	A	6	6	4782416	4782421	100 %	0 %	0 %	0 %	526221692
101076	NC_021820	GGAA	2	8	4782458	4782465	50 %	0 %	50 %	0 %	526221692
101077	NC_021820	GA	4	8	4782517	4782524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101078	NC_021820	CGC	2	6	4782551	4782556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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101080	NC_021820	TAT	2	6	4782643	4782648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101081	NC_021820	AAT	2	6	4782678	4782683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221693
101082	NC_021820	CCG	2	6	4782740	4782745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221693
101083	NC_021820	GCA	2	6	4782833	4782838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221693
101084	NC_021820	GCA	2	6	4782842	4782847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221693
101085	NC_021820	TAT	2	6	4782874	4782879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221693
101086	NC_021820	GTC	2	6	4782887	4782892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221693
101087	NC_021820	TGC	2	6	4782896	4782901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221693
101088	NC_021820	AGC	2	6	4782923	4782928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221693
101089	NC_021820	TAA	2	6	4782939	4782944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526221693
101090	NC_021820	TTC	2	6	4782975	4782980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221693
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101093	NC_021820	GC	3	6	4783118	4783123	0 %	0 %	50 %	50 %	526221693
101094	NC_021820	TG	3	6	4783173	4783178	0 %	50 %	50 %	0 %	526221693
101095	NC_021820	CGC	2	6	4783179	4783184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221693
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101099	NC_021820	GCTG	2	8	4783364	4783371	0 %	25 %	50 %	25 %	526221693
101100	NC_021820	CCG	2	6	4783373	4783378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221693
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101102	NC_021820	GAAA	2	8	4783599	4783606	75 %	0 %	25 %	0 %	526221693
101103	NC_021820	GCGCT	2	10	4783678	4783687	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101104	NC_021820	CA	3	6	4783704	4783709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101105	NC_021820	GCC	2	6	4783743	4783748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221694
101106	NC_021820	GCCTAC	2	12	4783782	4783793	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526221694
101107	NC_021820	CGT	2	6	4783920	4783925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221694
101108	NC_021820	CCG	2	6	4783999	4784004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221694
101109	NC_021820	GCG	2	6	4784054	4784059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221694
101110	NC_021820	GC	3	6	4784160	4784165	0 %	0 %	50 %	50 %	526221694
101111	NC_021820	TCAA	2	8	4784206	4784213	50 %	25 %	0 %	25 %	526221694
101112	NC_021820	CTGGC	2	10	4784223	4784232	0 %	20 %	40 %	40 %	526221694
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101114	NC_021820	TCA	2	6	4784270	4784275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221694
101115	NC_021820	ACG	2	6	4784352	4784357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221694
101116	NC_021820	GCA	2	6	4784396	4784401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221694
101117	NC_021820	ACC	2	6	4784428	4784433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526221694
101118	NC_021820	GA	3	6	4784464	4784469	50 %	0 %	50 %	0 %	526221694
101119	NC_021820	CTT	2	6	4784492	4784497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221694
101120	NC_021820	CCG	4	12	4784563	4784574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221694
101121	NC_021820	TCT	2	6	4784599	4784604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221694
101122	NC_021820	GGAC	2	8	4784638	4784645	25 %	0 %	50 %	25 %	526221694
101123	NC_021820	CCG	2	6	4784648	4784653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221694
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101127	NC_021820	CGG	2	6	4784840	4784845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221694
101128	NC_021820	CTGC	2	8	4784894	4784901	0 %	25 %	25 %	50 %	526221694
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101182	NC_021820	CTTTG	2	10	4787700	4787709	0 %	60 %	20 %	20 %	526221695
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101212	NC_021820	TC	3	6	4789128	4789133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101213	NC_021820	A	6	6	4789144	4789149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101215	NC_021820	CAT	2	6	4789234	4789239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526221696
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101218	NC_021820	TGA	2	6	4789403	4789408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221696
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101222	NC_021820	GCA	2	6	4789617	4789622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526221696
101223	NC_021820	CGG	2	6	4789625	4789630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221696
101224	NC_021820	GAT	2	6	4789632	4789637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221696
101225	NC_021820	ATT	2	6	4789642	4789647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221696
101226	NC_021820	GATAAT	2	12	4789663	4789674	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	526221696
101227	NC_021820	GCC	2	6	4789675	4789680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221696
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101229	NC_021820	CGT	2	6	4789795	4789800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221696
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101241	NC_021820	TCG	2	6	4790450	4790455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221696
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101258	NC_021820	CTG	2	6	4791155	4791160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221697
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101324	NC_021820	T	6	6	4794275	4794280	0 %	100 %	0 %	0 %	526221701
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101339	NC_021820	C	6	6	4795056	4795061	0 %	0 %	0 %	100 %	526221701
101340	NC_021820	GGC	2	6	4795067	4795072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221701
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101461	NC_021820	GCT	2	6	4801502	4801507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221707
101462	NC_021820	CGC	2	6	4801575	4801580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221707
101463	NC_021820	TGCTG	2	10	4801593	4801602	0 %	40 %	40 %	20 %	526221707
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101465	NC_021820	CCG	2	6	4801732	4801737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221708
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101485	NC_021820	GCC	2	6	4802597	4802602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221708
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101492	NC_021820	GC	3	6	4802782	4802787	0 %	0 %	50 %	50 %	526221708
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101499	NC_021820	TGCCA	2	10	4803109	4803118	20 %	20 %	20 %	40 %	526221709
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