MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 08-1736

Total Repeats: 101851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_021820	TTA	2	6	419501	419506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526218341
9002	NC_021820	TTGA	2	8	419674	419681	25 %	50 %	25 %	0 %	526218341
9003	NC_021820	T	6	6	419686	419691	0 %	100 %	0 %	0 %	526218341
9004	NC_021820	CGC	2	6	419700	419705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218341
9005	NC_021820	GCTTC	2	10	419778	419787	0 %	40 %	20 %	40 %	526218341
9006	NC_021820	ACC	2	6	419796	419801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218341
9007	NC_021820	GA	3	6	419896	419901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_021820	CAA	2	6	419943	419948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_021820	ACG	2	6	420018	420023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_021820	AATG	2	8	420035	420042	50 %	25 %	25 %	0 %	526221784
9011	NC_021820	GCCT	2	8	420123	420130	0 %	25 %	25 %	50 %	526221784
9012	NC_021820	ATT	2	6	420267	420272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221784
9013	NC_021820	CGAC	2	8	420277	420284	25 %	0 %	25 %	50 %	526221784
9014	NC_021820	CTT	2	6	420325	420330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221784
9015	NC_021820	GCT	2	6	420362	420367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221784
9016	NC_021820	CG	3	6	420449	420454	0 %	0 %	50 %	50 %	526221784
9017	NC_021820	CGC	2	6	420512	420517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221784
9018	NC_021820	TAT	2	6	420542	420547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526221784
9019	NC_021820	TGGC	2	8	420548	420555	0 %	25 %	50 %	25 %	526221784
9020	NC_021820	CGC	2	6	420569	420574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221784
9021	NC_021820	GTG	2	6	420606	420611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526221784
9022	NC_021820	GAT	2	6	420698	420703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526221784
9023	NC_021820	CTTT	2	8	420736	420743	0 %	75 %	0 %	25 %	526221784
9024	NC_021820	CTT	2	6	420841	420846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526221784
9025	NC_021820	GCT	2	6	420899	420904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221784
9026	NC_021820	GC	3	6	420916	420921	0 %	0 %	50 %	50 %	526221784
9027	NC_021820	TG	3	6	420932	420937	0 %	50 %	50 %	0 %	526221784
9028	NC_021820	GGC	3	9	420956	420964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221784
9029	NC_021820	TCCA	2	8	421062	421069	25 %	25 %	0 %	50 %	526221784
9030	NC_021820	GCG	2	6	421104	421109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221784
9031	NC_021820	GCT	2	6	421139	421144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526221784
9032	NC_021820	CGC	2	6	421147	421152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526221784
9033	NC_021820	CGG	2	6	421163	421168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221784
9034	NC_021820	GGC	2	6	421196	421201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526221784
9035	NC_021820	TGC	2	6	421233	421238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_021820	ACG	2	6	421255	421260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_021820	GTC	2	6	421264	421269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_021820	AAT	2	6	421277	421282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_021820	GGC	2	6	421316	421321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218342
9040	NC_021820	T	7	7	421336	421342	0 %	100 %	0 %	0 %	526218342
9041	NC_021820	ATC	2	6	421520	421525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218342
9042	NC_021820	GCT	2	6	421552	421557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218342
9043	NC_021820	TGA	2	6	421627	421632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218342
9044	NC_021820	CCG	2	6	421747	421752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218342
9045	NC_021820	CGCGG	2	10	421768	421777	0 %	0 %	60 %	40 %	526218342
9046	NC_021820	ATA	2	6	421781	421786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218342
9047	NC_021820	CAGG	2	8	421845	421852	25 %	0 %	50 %	25 %	526218342
9048	NC_021820	CAG	2	6	421871	421876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218342
9049	NC_021820	CCA	2	6	421879	421884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218342
9050	NC_021820	CCG	2	6	421888	421893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218342
9051	NC_021820	CGG	2	6	421969	421974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218342
9052	NC_021820	TGC	2	6	421977	421982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218342
9053	NC_021820	CGT	2	6	422029	422034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218342
9054	NC_021820	GC	3	6	422043	422048	0 %	0 %	50 %	50 %	526218342
9055	NC_021820	GC	3	6	422052	422057	0 %	0 %	50 %	50 %	526218342
9056	NC_021820	CGG	2	6	422059	422064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218342
9057	NC_021820	GCC	2	6	422100	422105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218342
9058	NC_021820	CCA	2	6	422116	422121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218342
9059	NC_021820	GCC	2	6	422150	422155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218342
9060	NC_021820	ACG	2	6	422253	422258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218342
9061	NC_021820	GCC	2	6	422273	422278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218342
9062	NC_021820	TAA	2	6	422320	422325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526218342
9063	NC_021820	TCG	2	6	422352	422357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218342
9064	NC_021820	CA	3	6	422562	422567	50 %	0 %	0 %	50 %	526218342
9065	NC_021820	CCA	2	6	422639	422644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218342
9066	NC_021820	AGT	2	6	422815	422820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526218343
9067	NC_021820	TTG	2	6	422829	422834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218343
9068	NC_021820	ATC	2	6	422847	422852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218343
9069	NC_021820	TGC	2	6	422865	422870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218343
9070	NC_021820	CTCG	2	8	422879	422886	0 %	25 %	25 %	50 %	526218343
9071	NC_021820	T	7	7	422893	422899	0 %	100 %	0 %	0 %	526218343
9072	NC_021820	GC	3	6	422920	422925	0 %	0 %	50 %	50 %	526218343
9073	NC_021820	T	7	7	422967	422973	0 %	100 %	0 %	0 %	526218343
9074	NC_021820	ACT	2	6	423236	423241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9076	NC_021820	CGG	2	6	423355	423360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218344
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9080	NC_021820	TGC	2	6	423550	423555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218344
9081	NC_021820	CGA	2	6	423578	423583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218344
9082	NC_021820	GCG	2	6	423645	423650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218344
9083	NC_021820	T	6	6	423711	423716	0 %	100 %	0 %	0 %	526218344
9084	NC_021820	GCG	2	6	423754	423759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218344
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9088	NC_021820	CTG	2	6	423909	423914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218344
9089	NC_021820	GTCT	2	8	423931	423938	0 %	50 %	25 %	25 %	526218344
9090	NC_021820	AGC	2	6	424002	424007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218344
9091	NC_021820	GGTCG	2	10	424055	424064	0 %	20 %	60 %	20 %	526218344
9092	NC_021820	GCG	2	6	424085	424090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218344
9093	NC_021820	GAA	2	6	424137	424142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526218344
9094	NC_021820	GTT	2	6	424217	424222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526218344
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9096	NC_021820	CG	3	6	424439	424444	0 %	0 %	50 %	50 %	526218344
9097	NC_021820	AG	3	6	424493	424498	50 %	0 %	50 %	0 %	526218344
9098	NC_021820	CG	3	6	424522	424527	0 %	0 %	50 %	50 %	526218344
9099	NC_021820	C	6	6	424556	424561	0 %	0 %	0 %	100 %	526218344
9100	NC_021820	CCG	2	6	424644	424649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218344
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9106	NC_021820	CCA	2	6	425020	425025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526218344
9107	NC_021820	CGG	2	6	425151	425156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218344
9108	NC_021820	TGG	2	6	425167	425172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526218344
9109	NC_021820	AGAT	2	8	425221	425228	50 %	25 %	25 %	0 %	526218344
9110	NC_021820	CTG	2	6	425262	425267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218344
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9113	NC_021820	CGG	2	6	425419	425424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526218344
9114	NC_021820	A	6	6	425425	425430	100 %	0 %	0 %	0 %	526218344
9115	NC_021820	GGA	2	6	425444	425449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526218344
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9117	NC_021820	AGCG	2	8	425547	425554	25 %	0 %	50 %	25 %	526218344
9118	NC_021820	AGCGC	2	10	425704	425713	20 %	0 %	40 %	40 %	526218344
9119	NC_021820	GC	3	6	425728	425733	0 %	0 %	50 %	50 %	526218344
9120	NC_021820	ATC	2	6	425748	425753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526218344
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9123	NC_021820	CG	5	10	425954	425963	0 %	0 %	50 %	50 %	526218344
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9240	NC_021820	CTGT	2	8	430977	430984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9241	NC_021820	A	7	7	431039	431045	100 %	0 %	0 %	0 %	526218351
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9494	NC_021820	GTCAG	2	10	442535	442544	20 %	20 %	40 %	20 %	526218359
9495	NC_021820	GCT	2	6	442555	442560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218359
9496	NC_021820	CCG	2	6	442611	442616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526218359
9497	NC_021820	ACG	2	6	442632	442637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218359
9498	NC_021820	CTG	2	6	442687	442692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526218359
9499	NC_021820	CAG	2	6	442722	442727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526218359
9500	NC_021820	CCT	2	6	442757	442762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526218359

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