MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 2357

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021819	CGA	2	6	103489	103494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842680
2002	NC_021819	ATG	2	6	103574	103579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842680
2003	NC_021819	CGG	2	6	103632	103637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842680
2004	NC_021819	TGA	2	6	103647	103652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842680
2005	NC_021819	CCGA	2	8	103718	103725	25 %	0 %	25 %	50 %	525842680
2006	NC_021819	TAA	2	6	103750	103755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842680
2007	NC_021819	GCT	2	6	103804	103809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842680
2008	NC_021819	ATC	2	6	103872	103877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842680
2009	NC_021819	AGA	2	6	104066	104071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842681
2010	NC_021819	TCAG	2	8	104078	104085	25 %	25 %	25 %	25 %	525842681
2011	NC_021819	GAA	2	6	104087	104092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842681
2012	NC_021819	ATT	2	6	104095	104100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842681
2013	NC_021819	TCAG	2	8	104110	104117	25 %	25 %	25 %	25 %	525842681
2014	NC_021819	AG	3	6	104177	104182	50 %	0 %	50 %	0 %	525842681
2015	NC_021819	CA	3	6	104198	104203	50 %	0 %	0 %	50 %	525842681
2016	NC_021819	TGA	2	6	104234	104239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842681
2017	NC_021819	TGC	2	6	104290	104295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842681
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2019	NC_021819	GCT	2	6	104536	104541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842681
2020	NC_021819	TGA	3	9	104558	104566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842681
2021	NC_021819	CAT	2	6	104585	104590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842681
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2023	NC_021819	GAC	2	6	104928	104933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842681
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2028	NC_021819	TGA	2	6	105045	105050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842681
2029	NC_021819	CT	3	6	105154	105159	0 %	50 %	0 %	50 %	525842682
2030	NC_021819	GGA	2	6	105172	105177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525842682
2031	NC_021819	CTG	2	6	105227	105232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842682
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2040	NC_021819	TTG	2	6	105744	105749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842682
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2042	NC_021819	CA	3	6	105892	105897	50 %	0 %	0 %	50 %	525842682
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2097	NC_021819	AAAG	2	8	108933	108940	75 %	0 %	25 %	0 %	525842687
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2116	NC_021819	TGC	2	6	110124	110129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2117	NC_021819	GCA	2	6	110137	110142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2118	NC_021819	CTG	2	6	110165	110170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_021819	T	6	6	110215	110220	0 %	100 %	0 %	0 %	525842689
2120	NC_021819	A	7	7	110260	110266	100 %	0 %	0 %	0 %	525842689
2121	NC_021819	TCG	2	6	110288	110293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842689
2122	NC_021819	GGC	2	6	110422	110427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842689
2123	NC_021819	CGT	2	6	110523	110528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842689
2124	NC_021819	CCT	2	6	110532	110537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842689
2125	NC_021819	GACG	2	8	110542	110549	25 %	0 %	50 %	25 %	525842689
2126	NC_021819	GAC	2	6	110557	110562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842689
2127	NC_021819	TCA	2	6	110720	110725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842689
2128	NC_021819	GAC	2	6	110770	110775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842689
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2132	NC_021819	CGT	2	6	110887	110892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842689
2133	NC_021819	TGA	2	6	110900	110905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842689
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2139	NC_021819	TCTG	2	8	111281	111288	0 %	50 %	25 %	25 %	525842690
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2148	NC_021819	CAG	2	6	111792	111797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842690
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2152	NC_021819	AATC	2	8	111959	111966	50 %	25 %	0 %	25 %	525842690
2153	NC_021819	GGT	2	6	111989	111994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842690
2154	NC_021819	CCA	2	6	111999	112004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842690
2155	NC_021819	CCCTA	2	10	112014	112023	20 %	20 %	0 %	60 %	525842690
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2187	NC_021819	CAT	2	6	113832	113837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842691
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2201	NC_021819	ACTG	2	8	114495	114502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2202	NC_021819	CCT	2	6	114525	114530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2221	NC_021819	GGA	3	9	115695	115703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2222	NC_021819	T	6	6	115732	115737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2223	NC_021819	GA	4	8	115790	115797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2224	NC_021819	GGCTT	2	10	115866	115875	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2225	NC_021819	TAA	2	6	115900	115905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2226	NC_021819	A	6	6	115904	115909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2227	NC_021819	TGT	2	6	115988	115993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2228	NC_021819	AAT	2	6	116003	116008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842580
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2230	NC_021819	GAT	2	6	116082	116087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842580
2231	NC_021819	AG	3	6	116108	116113	50 %	0 %	50 %	0 %	525842580
2232	NC_021819	T	7	7	116126	116132	0 %	100 %	0 %	0 %	525842580
2233	NC_021819	CGAA	2	8	116166	116173	50 %	0 %	25 %	25 %	525842580
2234	NC_021819	CTT	2	6	116228	116233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2235	NC_021819	GTT	2	6	116310	116315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2236	NC_021819	TAAA	2	8	116360	116367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2237	NC_021819	GAA	2	6	116393	116398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842693
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2240	NC_021819	GAAT	2	8	116552	116559	50 %	25 %	25 %	0 %	525842693
2241	NC_021819	TGCA	2	8	116581	116588	25 %	25 %	25 %	25 %	525842693
2242	NC_021819	AGC	2	6	116670	116675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842693
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2348	NC_021819	A	8	8	122284	122291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2349	NC_021819	A	6	6	122324	122329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2355	NC_021819	TTA	2	6	122578	122583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2356	NC_021819	TTG	2	6	122592	122597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2357	NC_021819	TTA	2	6	122821	122826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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