MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 2357

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021819	CAA	2	6	76509	76514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842647
1502	NC_021819	CGA	2	6	76525	76530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842647
1503	NC_021819	ATCA	2	8	76571	76578	50 %	25 %	0 %	25 %	525842647
1504	NC_021819	CT	3	6	76593	76598	0 %	50 %	0 %	50 %	525842647
1505	NC_021819	GTTTT	2	10	76637	76646	0 %	80 %	20 %	0 %	525842647
1506	NC_021819	A	6	6	76698	76703	100 %	0 %	0 %	0 %	525842647
1507	NC_021819	CTC	2	6	76738	76743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842647
1508	NC_021819	GAT	2	6	76777	76782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842647
1509	NC_021819	TTG	2	6	76790	76795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842647
1510	NC_021819	ATCA	2	8	76835	76842	50 %	25 %	0 %	25 %	525842647
1511	NC_021819	AGA	2	6	76886	76891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842647
1512	NC_021819	GAT	2	6	76897	76902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842647
1513	NC_021819	CCTACC	2	12	77054	77065	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	525842647
1514	NC_021819	A	6	6	77079	77084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021819	CA	3	6	77136	77141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_021819	AGTA	2	8	77145	77152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021819	ACA	2	6	77154	77159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_021819	CGT	2	6	77164	77169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_021819	T	6	6	77169	77174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021819	GCG	2	6	77337	77342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_021819	AAT	2	6	77344	77349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021819	TTC	2	6	77358	77363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021819	TTTC	2	8	77374	77381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_021819	TGAT	2	8	77386	77393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021819	ACG	2	6	77488	77493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_021819	TCTG	2	8	77553	77560	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_021819	TGA	2	6	77604	77609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021819	GA	3	6	77608	77613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021819	ATG	2	6	77624	77629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021819	TAA	2	6	77638	77643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021819	TAGG	2	8	77713	77720	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021819	CAGA	2	8	77750	77757	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_021819	TTA	2	6	77761	77766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021819	ATG	2	6	77768	77773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021819	TCG	2	6	77961	77966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842648
1536	NC_021819	TGA	2	6	77995	78000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842648
1537	NC_021819	GCA	2	6	78056	78061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842648
1538	NC_021819	A	6	6	78066	78071	100 %	0 %	0 %	0 %	525842648
1539	NC_021819	CTGG	2	8	78078	78085	0 %	25 %	50 %	25 %	525842648
1540	NC_021819	GAA	2	6	78160	78165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842648
1541	NC_021819	ATG	2	6	78171	78176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842648
1542	NC_021819	ATC	2	6	78309	78314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842649
1543	NC_021819	AAAC	2	8	78350	78357	75 %	0 %	0 %	25 %	525842649
1544	NC_021819	GAC	2	6	78362	78367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842649
1545	NC_021819	GCA	2	6	78368	78373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842649
1546	NC_021819	GAC	2	6	78395	78400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842649
1547	NC_021819	TCA	2	6	78568	78573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842649
1548	NC_021819	TGG	2	6	78596	78601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842649
1549	NC_021819	CAGTC	2	10	78662	78671	20 %	20 %	20 %	40 %	525842649
1550	NC_021819	ATG	2	6	78675	78680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842649
1551	NC_021819	TGC	2	6	78712	78717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842649
1552	NC_021819	GAA	2	6	78812	78817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842649
1553	NC_021819	TTAA	2	8	78821	78828	50 %	50 %	0 %	0 %	525842649
1554	NC_021819	TTC	2	6	78832	78837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842649
1555	NC_021819	ATG	2	6	78842	78847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842649
1556	NC_021819	ATAC	2	8	78895	78902	50 %	25 %	0 %	25 %	525842649
1557	NC_021819	TCTT	2	8	79000	79007	0 %	75 %	0 %	25 %	525842650
1558	NC_021819	CTGC	2	8	79040	79047	0 %	25 %	25 %	50 %	525842650
1559	NC_021819	GGA	2	6	79111	79116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525842650
1560	NC_021819	ATTGT	2	10	79214	79223	20 %	60 %	20 %	0 %	525842650
1561	NC_021819	A	6	6	79240	79245	100 %	0 %	0 %	0 %	525842650
1562	NC_021819	AGA	2	6	79284	79289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842650
1563	NC_021819	A	7	7	79313	79319	100 %	0 %	0 %	0 %	525842650
1564	NC_021819	A	6	6	79329	79334	100 %	0 %	0 %	0 %	525842650
1565	NC_021819	AAGTC	2	10	79436	79445	40 %	20 %	20 %	20 %	525842650
1566	NC_021819	A	6	6	79461	79466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021819	CTG	2	6	79489	79494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_021819	TCC	2	6	79583	79588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_021819	CG	3	6	79636	79641	0 %	0 %	50 %	50 %	525842651
1570	NC_021819	ATC	2	6	79668	79673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842651
1571	NC_021819	GTT	2	6	79686	79691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842651
1572	NC_021819	T	6	6	79763	79768	0 %	100 %	0 %	0 %	525842651
1573	NC_021819	T	6	6	79775	79780	0 %	100 %	0 %	0 %	525842651
1574	NC_021819	CAA	2	6	79876	79881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842651
1575	NC_021819	ATG	2	6	79886	79891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842651
1576	NC_021819	TCC	2	6	79930	79935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842651
1577	NC_021819	AT	3	6	79936	79941	50 %	50 %	0 %	0 %	525842651
1578	NC_021819	CTTC	2	8	79992	79999	0 %	50 %	0 %	50 %	525842651
1579	NC_021819	TGA	2	6	80001	80006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842651
1580	NC_021819	AAC	2	6	80054	80059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_021819	TAT	2	6	80164	80169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021819	TTG	2	6	80318	80323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842579
1583	NC_021819	CGT	2	6	80329	80334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842579
1584	NC_021819	GAA	2	6	80338	80343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842579
1585	NC_021819	GAA	2	6	80407	80412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842579
1586	NC_021819	GCT	2	6	80433	80438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842579
1587	NC_021819	TGA	2	6	80511	80516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842579
1588	NC_021819	TGGAC	2	10	80536	80545	20 %	20 %	40 %	20 %	525842579
1589	NC_021819	TGA	2	6	80598	80603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842579
1590	NC_021819	CCA	2	6	80623	80628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_021819	GA	3	6	80634	80639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021819	TAC	2	6	80910	80915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842652
1593	NC_021819	GAA	2	6	80959	80964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842652
1594	NC_021819	TTATCG	2	12	81018	81029	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525842652
1595	NC_021819	TGA	2	6	81039	81044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842652
1596	NC_021819	TGT	2	6	81126	81131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842652
1597	NC_021819	GCG	2	6	81215	81220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842652
1598	NC_021819	TCTG	2	8	81226	81233	0 %	50 %	25 %	25 %	525842652
1599	NC_021819	GAA	2	6	81280	81285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842652
1600	NC_021819	TGA	2	6	81351	81356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842652
1601	NC_021819	CAG	2	6	81454	81459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842652
1602	NC_021819	CGTT	2	8	81461	81468	0 %	50 %	25 %	25 %	525842652
1603	NC_021819	CTG	2	6	81535	81540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842652
1604	NC_021819	TGC	2	6	81551	81556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842652
1605	NC_021819	AAC	2	6	81632	81637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842652
1606	NC_021819	TGA	2	6	81813	81818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842652
1607	NC_021819	TGGC	2	8	81820	81827	0 %	25 %	50 %	25 %	525842652
1608	NC_021819	TTA	2	6	81828	81833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842652
1609	NC_021819	TAA	2	6	81834	81839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842652
1610	NC_021819	TGT	2	6	81865	81870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842652
1611	NC_021819	GAA	2	6	81921	81926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842652
1612	NC_021819	ATC	2	6	82021	82026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_021819	T	6	6	82036	82041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021819	TAT	2	6	82060	82065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021819	CTT	2	6	82096	82101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_021819	GAC	2	6	82212	82217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842653
1617	NC_021819	CAA	2	6	82288	82293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842653
1618	NC_021819	CTT	2	6	82324	82329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842653
1619	NC_021819	TC	3	6	82374	82379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_021819	TTTA	2	8	82430	82437	25 %	75 %	0 %	0 %	525842654
1621	NC_021819	GTC	2	6	82513	82518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842654
1622	NC_021819	ATC	3	9	82548	82556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842654
1623	NC_021819	CGTT	2	8	82661	82668	0 %	50 %	25 %	25 %	525842654
1624	NC_021819	CTT	2	6	82682	82687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842654
1625	NC_021819	ACA	2	6	82744	82749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842654
1626	NC_021819	C	6	6	82917	82922	0 %	0 %	0 %	100 %	525842654
1627	NC_021819	CCA	2	6	82955	82960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842654
1628	NC_021819	CGA	2	6	82979	82984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842654
1629	NC_021819	TTA	2	6	82996	83001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842654
1630	NC_021819	CAT	2	6	83039	83044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842654
1631	NC_021819	AC	3	6	83065	83070	50 %	0 %	0 %	50 %	525842654
1632	NC_021819	TCAC	2	8	83137	83144	25 %	25 %	0 %	50 %	525842654
1633	NC_021819	TAA	2	6	83237	83242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842654
1634	NC_021819	TTC	2	6	83251	83256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842654
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1636	NC_021819	TCA	2	6	83362	83367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842655
1637	NC_021819	CGC	2	6	83368	83373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842655
1638	NC_021819	TGC	2	6	83376	83381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842655
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1640	NC_021819	ATG	2	6	83628	83633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1641	NC_021819	CGC	2	6	83673	83678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1642	NC_021819	GA	3	6	83682	83687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1643	NC_021819	CATT	2	8	83741	83748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1644	NC_021819	TTA	2	6	83766	83771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1645	NC_021819	AGT	2	6	83786	83791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1646	NC_021819	CTG	2	6	83803	83808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1647	NC_021819	CCTT	2	8	83812	83819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1648	NC_021819	CGA	2	6	83853	83858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1649	NC_021819	GCGA	2	8	83894	83901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1650	NC_021819	GATGG	2	10	83949	83958	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1651	NC_021819	ATC	2	6	83970	83975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1652	NC_021819	AC	3	6	83994	83999	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1653	NC_021819	TGA	2	6	84275	84280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842656
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1655	NC_021819	TCA	2	6	84321	84326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842656
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1662	NC_021819	TG	3	6	84632	84637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1663	NC_021819	ATA	2	6	84654	84659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1664	NC_021819	CGCCTG	2	12	84666	84677	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1665	NC_021819	CAT	2	6	84835	84840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842657
1666	NC_021819	GCAT	2	8	85018	85025	25 %	25 %	25 %	25 %	525842657
1667	NC_021819	TCA	2	6	85034	85039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842657
1668	NC_021819	TG	3	6	85079	85084	0 %	50 %	50 %	0 %	525842657
1669	NC_021819	GCCAC	2	10	85174	85183	20 %	0 %	20 %	60 %	525842657
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1672	NC_021819	TC	3	6	85498	85503	0 %	50 %	0 %	50 %	525842657
1673	NC_021819	CT	3	6	85644	85649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1674	NC_021819	TCT	2	6	85783	85788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842658
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1679	NC_021819	ATTT	2	8	86074	86081	25 %	75 %	0 %	0 %	525842658
1680	NC_021819	GCC	2	6	86099	86104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1682	NC_021819	TCT	2	6	86220	86225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842659
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1722	NC_021819	ATA	2	6	88248	88253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1725	NC_021819	TGT	2	6	88339	88344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1727	NC_021819	GAG	2	6	88384	88389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1730	NC_021819	TGG	2	6	88432	88437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1731	NC_021819	TGAG	2	8	88601	88608	25 %	25 %	50 %	0 %	525842662
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1745	NC_021819	TCA	3	9	89833	89841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842662
1746	NC_021819	GACT	2	8	89848	89855	25 %	25 %	25 %	25 %	525842662
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1749	NC_021819	CTGA	2	8	90004	90011	25 %	25 %	25 %	25 %	525842663
1750	NC_021819	GGC	2	6	90013	90018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842663
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1752	NC_021819	ACC	3	9	90115	90123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842663
1753	NC_021819	CTG	2	6	90135	90140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842663
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1755	NC_021819	AG	3	6	90195	90200	50 %	0 %	50 %	0 %	525842663
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