MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 2357

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021819	CAT	2	6	51668	51673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842628
1002	NC_021819	CAT	2	6	51750	51755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842628
1003	NC_021819	A	6	6	51777	51782	100 %	0 %	0 %	0 %	525842628
1004	NC_021819	CCG	2	6	51850	51855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842628
1005	NC_021819	TCC	2	6	51904	51909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842628
1006	NC_021819	ACC	2	6	51967	51972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842628
1007	NC_021819	CATT	2	8	52054	52061	25 %	50 %	0 %	25 %	525842628
1008	NC_021819	CGA	2	6	52068	52073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842628
1009	NC_021819	AT	3	6	52121	52126	50 %	50 %	0 %	0 %	525842628
1010	NC_021819	CGT	2	6	52128	52133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842628
1011	NC_021819	ACC	2	6	52157	52162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842628
1012	NC_021819	GTC	2	6	52221	52226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842628
1013	NC_021819	TCT	2	6	52231	52236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842628
1014	NC_021819	AGC	2	6	52351	52356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842628
1015	NC_021819	CAG	2	6	52392	52397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842628
1016	NC_021819	AAGG	2	8	52529	52536	50 %	0 %	50 %	0 %	525842628
1017	NC_021819	T	6	6	52610	52615	0 %	100 %	0 %	0 %	525842628
1018	NC_021819	TCC	2	6	52688	52693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842629
1019	NC_021819	AATTT	2	10	52707	52716	40 %	60 %	0 %	0 %	525842629
1020	NC_021819	AT	3	6	52717	52722	50 %	50 %	0 %	0 %	525842629
1021	NC_021819	TTC	2	6	52723	52728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842629
1022	NC_021819	CT	3	6	52739	52744	0 %	50 %	0 %	50 %	525842629
1023	NC_021819	GAA	2	6	52745	52750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842629
1024	NC_021819	GAG	2	6	52760	52765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525842629
1025	NC_021819	ATT	2	6	52966	52971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842629
1026	NC_021819	AGT	2	6	52989	52994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021819	AG	3	6	53080	53085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021819	GCA	2	6	53112	53117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021819	GA	3	6	53141	53146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021819	AAT	2	6	53153	53158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021819	AG	3	6	53188	53193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021819	ATC	2	6	53207	53212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021819	TGT	2	6	53244	53249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021819	CT	3	6	53275	53280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_021819	GAG	2	6	53289	53294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021819	AG	4	8	53297	53304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021819	AGC	2	6	53331	53336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_021819	TGG	2	6	53337	53342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021819	TGAG	2	8	53506	53513	25 %	25 %	50 %	0 %	525842630
1040	NC_021819	CAT	2	6	53630	53635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842630
1041	NC_021819	CAC	2	6	53717	53722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842630
1042	NC_021819	ACAT	2	8	53802	53809	50 %	25 %	0 %	25 %	525842630
1043	NC_021819	TTTG	2	8	53818	53825	0 %	75 %	25 %	0 %	525842630
1044	NC_021819	ACC	2	6	54036	54041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842630
1045	NC_021819	AAT	2	6	54077	54082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842630
1046	NC_021819	TCC	2	6	54225	54230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842630
1047	NC_021819	ACA	2	6	54444	54449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842630
1048	NC_021819	TA	4	8	54517	54524	50 %	50 %	0 %	0 %	525842630
1049	NC_021819	GAT	2	6	54577	54582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842630
1050	NC_021819	TCA	2	6	54609	54614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842630
1051	NC_021819	CT	3	6	54657	54662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_021819	TCA	3	9	54738	54746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021819	GC	3	6	54853	54858	0 %	0 %	50 %	50 %	525842574
1054	NC_021819	TGT	2	6	54867	54872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842574
1055	NC_021819	TGA	2	6	54883	54888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842574
1056	NC_021819	ATG	2	6	54981	54986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842574
1057	NC_021819	GTG	3	9	54990	54998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842574
1058	NC_021819	TGA	2	6	55015	55020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842574
1059	NC_021819	TGG	2	6	55021	55026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842574
1060	NC_021819	CGC	2	6	55085	55090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842574
1061	NC_021819	AT	3	6	55098	55103	50 %	50 %	0 %	0 %	525842574
1062	NC_021819	A	6	6	55154	55159	100 %	0 %	0 %	0 %	525842574
1063	NC_021819	AC	3	6	55189	55194	50 %	0 %	0 %	50 %	525842575
1064	NC_021819	ATC	2	6	55309	55314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842575
1065	NC_021819	TGA	2	6	55427	55432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842575
1066	NC_021819	ATA	2	6	55435	55440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842575
1067	NC_021819	TCA	2	6	55469	55474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842575
1068	NC_021819	GCA	2	6	55501	55506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842575
1069	NC_021819	TACG	2	8	55569	55576	25 %	25 %	25 %	25 %	525842575
1070	NC_021819	TCA	2	6	55610	55615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842575
1071	NC_021819	TGGC	2	8	55641	55648	0 %	25 %	50 %	25 %	525842575
1072	NC_021819	TCG	2	6	55657	55662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842575
1073	NC_021819	AGG	2	6	55787	55792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525842575
1074	NC_021819	GTGG	2	8	55935	55942	0 %	25 %	75 %	0 %	525842575
1075	NC_021819	CAA	2	6	55950	55955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842575
1076	NC_021819	CCG	2	6	55987	55992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842575
1077	NC_021819	TTA	2	6	56010	56015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842575
1078	NC_021819	AAT	2	6	56029	56034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842575
1079	NC_021819	A	7	7	56072	56078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021819	CTT	2	6	56101	56106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021819	TA	3	6	56195	56200	50 %	50 %	0 %	0 %	525842576
1082	NC_021819	CTT	2	6	56370	56375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842576
1083	NC_021819	TCA	2	6	56535	56540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842577
1084	NC_021819	T	6	6	56629	56634	0 %	100 %	0 %	0 %	525842577
1085	NC_021819	GCG	2	6	56640	56645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842577
1086	NC_021819	ACA	2	6	56742	56747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_021819	AAGT	2	8	56766	56773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021819	AGT	2	6	56779	56784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021819	CAA	2	6	56849	56854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021819	TTAGT	2	10	56953	56962	20 %	60 %	20 %	0 %	525842631
1091	NC_021819	GTG	2	6	57025	57030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842631
1092	NC_021819	GTGCG	2	10	57047	57056	0 %	20 %	60 %	20 %	525842631
1093	NC_021819	CGCC	3	12	57141	57152	0 %	0 %	25 %	75 %	525842631
1094	NC_021819	CAG	2	6	57207	57212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842631
1095	NC_021819	T	7	7	57221	57227	0 %	100 %	0 %	0 %	525842631
1096	NC_021819	TTC	2	6	57231	57236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842631
1097	NC_021819	GATCG	2	10	57330	57339	20 %	20 %	40 %	20 %	525842631
1098	NC_021819	ACCG	2	8	57387	57394	25 %	0 %	25 %	50 %	525842631
1099	NC_021819	CAG	2	6	57411	57416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842631
1100	NC_021819	TGA	2	6	57418	57423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842631
1101	NC_021819	TGC	2	6	57451	57456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842631
1102	NC_021819	GCC	2	6	57595	57600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842631
1103	NC_021819	GACC	2	8	57761	57768	25 %	0 %	25 %	50 %	525842631
1104	NC_021819	ATT	2	6	57880	57885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842631
1105	NC_021819	GAC	2	6	57901	57906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_021819	GATA	2	8	57927	57934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021819	T	6	6	57961	57966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021819	TTA	2	6	57972	57977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021819	TTAA	2	8	57981	57988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021819	TCT	2	6	58013	58018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021819	ATTTT	2	10	58029	58038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021819	TTC	2	6	58046	58051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021819	ACA	2	6	58073	58078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_021819	AGT	2	6	58177	58182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842632
1115	NC_021819	CAA	2	6	58237	58242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842632
1116	NC_021819	ATA	2	6	58405	58410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842632
1117	NC_021819	ATA	2	6	58445	58450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842632
1118	NC_021819	AAT	2	6	58459	58464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842632
1119	NC_021819	AAT	2	6	58480	58485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842632
1120	NC_021819	TAA	2	6	58554	58559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842632
1121	NC_021819	ATA	2	6	58566	58571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842632
1122	NC_021819	ATG	2	6	58586	58591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842632
1123	NC_021819	GAA	2	6	58593	58598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842632
1124	NC_021819	A	7	7	58603	58609	100 %	0 %	0 %	0 %	525842632
1125	NC_021819	GAT	2	6	58678	58683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842632
1126	NC_021819	ATT	2	6	58701	58706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021819	GCA	2	6	58731	58736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021819	TTA	2	6	58788	58793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021819	CTG	2	6	58859	58864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021819	TAAAT	2	10	58936	58945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_021819	A	6	6	65003	65008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1382	NC_021819	AT	4	8	70888	70895	50 %	50 %	0 %	0 %	525842644
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1384	NC_021819	AGA	2	6	71021	71026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842644
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1387	NC_021819	ACA	2	6	71206	71211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1388	NC_021819	ATG	3	9	71219	71227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1389	NC_021819	TC	4	8	71236	71243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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