MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Cubana str. CFSAN002050 plasmid

Total Repeats: 2357

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021819	CAG	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842606
502	NC_021819	AGA	2	6	23864	23869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842606
503	NC_021819	CAA	2	6	23890	23895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842606
504	NC_021819	CTG	2	6	23908	23913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842606
505	NC_021819	ATA	2	6	23936	23941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842606
506	NC_021819	CAGC	2	8	23991	23998	25 %	0 %	25 %	50 %	525842606
507	NC_021819	CTGG	2	8	24099	24106	0 %	25 %	50 %	25 %	525842606
508	NC_021819	CAG	2	6	24126	24131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842606
509	NC_021819	TGG	2	6	24132	24137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842606
510	NC_021819	CGC	2	6	24309	24314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842606
511	NC_021819	CAT	2	6	24338	24343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842606
512	NC_021819	TGA	2	6	24354	24359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842606
513	NC_021819	CAGC	2	8	24374	24381	25 %	0 %	25 %	50 %	525842606
514	NC_021819	TGA	2	6	24422	24427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021819	CG	3	6	24504	24509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_021819	TCA	2	6	24514	24519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021819	TCA	2	6	24540	24545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021819	TC	3	6	24567	24572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_021819	CAGA	2	8	24594	24601	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
520	NC_021819	AAT	2	6	24648	24653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021819	CGG	2	6	24698	24703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021819	CAC	2	6	24718	24723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_021819	CTG	2	6	24726	24731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021819	TTAC	2	8	24803	24810	25 %	50 %	0 %	25 %	525842607
525	NC_021819	A	6	6	24828	24833	100 %	0 %	0 %	0 %	525842607
526	NC_021819	GAA	2	6	25027	25032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021819	TTG	2	6	25104	25109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021819	GGAT	2	8	25178	25185	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_021819	CGG	2	6	25216	25221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021819	GCC	2	6	25254	25259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_021819	CAA	2	6	25350	25355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021819	TTAATA	2	12	25403	25414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021819	GTT	2	6	25439	25444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525842570
534	NC_021819	GAA	2	6	25463	25468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842570
535	NC_021819	GGAC	2	8	25602	25609	25 %	0 %	50 %	25 %	525842570
536	NC_021819	CAT	3	9	25648	25656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842570
537	NC_021819	TCA	2	6	25668	25673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842570
538	NC_021819	GAAA	2	8	25696	25703	75 %	0 %	25 %	0 %	525842570
539	NC_021819	GAA	3	9	25812	25820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842571
540	NC_021819	GCT	2	6	25841	25846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842571
541	NC_021819	ACA	2	6	25936	25941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842571
542	NC_021819	AC	3	6	25960	25965	50 %	0 %	0 %	50 %	525842571
543	NC_021819	AGCC	2	8	26024	26031	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
544	NC_021819	TG	3	6	26201	26206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021819	GCC	2	6	26215	26220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_021819	ATC	2	6	26260	26265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021819	CAT	2	6	26295	26300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842608
548	NC_021819	TGC	2	6	26477	26482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842608
549	NC_021819	TGCA	2	8	26491	26498	25 %	25 %	25 %	25 %	525842608
550	NC_021819	CAC	2	6	26604	26609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842608
551	NC_021819	CAT	2	6	26610	26615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842608
552	NC_021819	AGC	2	6	26636	26641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842608
553	NC_021819	GCTG	2	8	26678	26685	0 %	25 %	50 %	25 %	525842608
554	NC_021819	ATG	2	6	26701	26706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842608
555	NC_021819	TGG	2	6	26720	26725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842608
556	NC_021819	CCA	2	6	26729	26734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842608
557	NC_021819	AGC	2	6	26768	26773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842608
558	NC_021819	CAC	2	6	26880	26885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842608
559	NC_021819	GAG	2	6	26935	26940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525842608
560	NC_021819	GAG	2	6	26986	26991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525842608
561	NC_021819	AGC	2	6	27053	27058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842608
562	NC_021819	CAT	2	6	27138	27143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842608
563	NC_021819	GCT	2	6	27183	27188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842608
564	NC_021819	GA	3	6	27265	27270	50 %	0 %	50 %	0 %	525842608
565	NC_021819	TGG	2	6	27302	27307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021819	A	6	6	27308	27313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021819	A	7	7	27348	27354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021819	GAA	2	6	27397	27402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_021819	T	6	6	27459	27464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021819	CGA	2	6	27496	27501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021819	AAT	2	6	27515	27520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021819	TTTCA	2	10	27521	27530	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
573	NC_021819	AATTC	2	10	27550	27559	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
574	NC_021819	CCG	2	6	27596	27601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_021819	GAAT	2	8	27624	27631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021819	GAA	2	6	27677	27682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021819	C	6	6	27687	27692	0 %	0 %	0 %	100 %	525842609
578	NC_021819	AAG	2	6	27822	27827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842609
579	NC_021819	ACG	2	6	27828	27833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842609
580	NC_021819	GTAAAG	2	12	27898	27909	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525842609
581	NC_021819	GCG	2	6	27927	27932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842609
582	NC_021819	CA	3	6	28011	28016	50 %	0 %	0 %	50 %	525842609
583	NC_021819	ACT	2	6	28041	28046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842609
584	NC_021819	TTAC	2	8	28194	28201	25 %	50 %	0 %	25 %	525842609
585	NC_021819	GCC	2	6	28322	28327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842609
586	NC_021819	TCT	2	6	28584	28589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842610
587	NC_021819	GCC	3	9	28605	28613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842610
588	NC_021819	CCA	2	6	28623	28628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842610
589	NC_021819	GC	3	6	28707	28712	0 %	0 %	50 %	50 %	525842610
590	NC_021819	GAT	2	6	28753	28758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842610
591	NC_021819	TGA	2	6	28858	28863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842610
592	NC_021819	CAA	2	6	28897	28902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842610
593	NC_021819	CCG	2	6	29010	29015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842610
594	NC_021819	CAA	2	6	29038	29043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525842610
595	NC_021819	CGAG	2	8	29065	29072	25 %	0 %	50 %	25 %	525842610
596	NC_021819	TCT	2	6	29150	29155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842610
597	NC_021819	CCG	2	6	29185	29190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842610
598	NC_021819	TGG	2	6	29209	29214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842610
599	NC_021819	CCAGTT	2	12	29251	29262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525842610
600	NC_021819	GCTG	2	8	29271	29278	0 %	25 %	50 %	25 %	525842610
601	NC_021819	AGT	2	6	29287	29292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842610
602	NC_021819	CACT	2	8	29337	29344	25 %	25 %	0 %	50 %	525842610
603	NC_021819	ATCA	2	8	29366	29373	50 %	25 %	0 %	25 %	525842610
604	NC_021819	GCA	2	6	29415	29420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842610
605	NC_021819	TTC	2	6	29493	29498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842610
606	NC_021819	GCT	2	6	29663	29668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525842610
607	NC_021819	AAT	2	6	29720	29725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842610
608	NC_021819	CCA	2	6	29786	29791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842610
609	NC_021819	GA	3	6	29811	29816	50 %	0 %	50 %	0 %	525842610
610	NC_021819	CAGT	2	8	29824	29831	25 %	25 %	25 %	25 %	525842610
611	NC_021819	CCA	2	6	29858	29863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842610
612	NC_021819	CGC	2	6	29908	29913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842610
613	NC_021819	GCA	2	6	29935	29940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842610
614	NC_021819	GCC	2	6	29972	29977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842610
615	NC_021819	GCCC	2	8	30094	30101	0 %	0 %	25 %	75 %	525842610
616	NC_021819	CAGC	2	8	30142	30149	25 %	0 %	25 %	50 %	525842610
617	NC_021819	AT	3	6	30271	30276	50 %	50 %	0 %	0 %	525842610
618	NC_021819	CAT	2	6	30373	30378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842610
619	NC_021819	AGCCAA	2	12	30638	30649	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525842610
620	NC_021819	GA	3	6	30666	30671	50 %	0 %	50 %	0 %	525842610
621	NC_021819	GCAA	2	8	30690	30697	50 %	0 %	25 %	25 %	525842610
622	NC_021819	ATA	2	6	30726	30731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525842610
623	NC_021819	ATT	2	6	30749	30754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525842611
624	NC_021819	GC	3	6	30772	30777	0 %	0 %	50 %	50 %	525842611
625	NC_021819	GGT	2	6	30816	30821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525842611
626	NC_021819	G	6	6	30824	30829	0 %	0 %	100 %	0 %	525842611
627	NC_021819	CAG	2	6	30866	30871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525842611
628	NC_021819	ATC	2	6	30909	30914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842611
629	NC_021819	GTA	2	6	31026	31031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842611
630	NC_021819	TTC	2	6	31039	31044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842611
631	NC_021819	CGG	2	6	31076	31081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842611
632	NC_021819	CGC	2	6	31115	31120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842611
633	NC_021819	GTCAC	2	10	31147	31156	20 %	20 %	20 %	40 %	525842611
634	NC_021819	GGC	2	6	31185	31190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525842611
635	NC_021819	TGA	2	6	31242	31247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_021819	CTC	2	6	31377	31382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525842612
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645	NC_021819	CTG	2	6	31669	31674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_021819	CTT	2	6	31752	31757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842613
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741	NC_021819	A	6	6	37389	37394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
742	NC_021819	TTC	2	6	37427	37432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525842617
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750	NC_021819	GCTG	2	8	38073	38080	0 %	25 %	50 %	25 %	525842617
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759	NC_021819	TGA	2	6	38583	38588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842617
760	NC_021819	TGA	2	6	38598	38603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842617
761	NC_021819	CGC	2	6	38608	38613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525842617
762	NC_021819	GAA	3	9	38671	38679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525842617
763	NC_021819	CCGC	2	8	38697	38704	0 %	0 %	25 %	75 %	525842617
764	NC_021819	G	6	6	38746	38751	0 %	0 %	100 %	0 %	525842617
765	NC_021819	CAT	2	6	38794	38799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525842617
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769	NC_021819	TCAA	2	8	39043	39050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
770	NC_021819	TCGAG	2	10	39064	39073	20 %	20 %	40 %	20 %	525842573
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779	NC_021819	ACC	2	6	39836	39841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525842573
780	NC_021819	ATG	2	6	39910	39915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525842618
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859	NC_021819	TTC	2	6	44705	44710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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