MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021817	A	7	7	157	163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021817	A	7	7	580	586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021817	T	8	8	634	641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021817	T	6	6	685	690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021817	A	6	6	1020	1025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021817	C	7	7	1832	1838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_021817	T	6	6	2325	2330	0 %	100 %	0 %	0 %	525833512
8	NC_021817	T	7	7	2569	2575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021817	T	6	6	4679	4684	0 %	100 %	0 %	0 %	525833514
10	NC_021817	T	6	6	5424	5429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021817	T	6	6	5622	5627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021817	T	6	6	6990	6995	0 %	100 %	0 %	0 %	525833517
13	NC_021817	T	6	6	7696	7701	0 %	100 %	0 %	0 %	525833517
14	NC_021817	C	7	7	11353	11359	0 %	0 %	0 %	100 %	525833517
15	NC_021817	T	7	7	12996	13002	0 %	100 %	0 %	0 %	525833518
16	NC_021817	T	6	6	14016	14021	0 %	100 %	0 %	0 %	525833518
17	NC_021817	T	6	6	14294	14299	0 %	100 %	0 %	0 %	525833518
18	NC_021817	T	6	6	14867	14872	0 %	100 %	0 %	0 %	525833519
19	NC_021817	T	6	6	15217	15222	0 %	100 %	0 %	0 %	525833519
20	NC_021817	A	8	8	15901	15908	100 %	0 %	0 %	0 %	525833520
21	NC_021817	A	7	7	15971	15977	100 %	0 %	0 %	0 %	525833520
22	NC_021817	T	7	7	16163	16169	0 %	100 %	0 %	0 %	525833521
23	NC_021817	T	7	7	16348	16354	0 %	100 %	0 %	0 %	525833521
24	NC_021817	A	6	6	18966	18971	100 %	0 %	0 %	0 %	525833521
25	NC_021817	T	6	6	21182	21187	0 %	100 %	0 %	0 %	525833524
26	NC_021817	T	6	6	21835	21840	0 %	100 %	0 %	0 %	525833525
27	NC_021817	T	6	6	22085	22090	0 %	100 %	0 %	0 %	525833525
28	NC_021817	T	8	8	24625	24632	0 %	100 %	0 %	0 %	525833527
29	NC_021817	C	6	6	26210	26215	0 %	0 %	0 %	100 %	525833529
30	NC_021817	T	6	6	26227	26232	0 %	100 %	0 %	0 %	525833529
31	NC_021817	T	6	6	26274	26279	0 %	100 %	0 %	0 %	525833529
32	NC_021817	T	7	7	26512	26518	0 %	100 %	0 %	0 %	525833530
33	NC_021817	C	6	6	27374	27379	0 %	0 %	0 %	100 %	525833531
34	NC_021817	C	6	6	27986	27991	0 %	0 %	0 %	100 %	525833531
35	NC_021817	T	6	6	28363	28368	0 %	100 %	0 %	0 %	525833531
36	NC_021817	C	6	6	28499	28504	0 %	0 %	0 %	100 %	525833531
37	NC_021817	T	6	6	29326	29331	0 %	100 %	0 %	0 %	525833531
38	NC_021817	C	6	6	29736	29741	0 %	0 %	0 %	100 %	525833532
39	NC_021817	T	7	7	29950	29956	0 %	100 %	0 %	0 %	525833532
40	NC_021817	T	7	7	30446	30452	0 %	100 %	0 %	0 %	525833503
41	NC_021817	C	6	6	31355	31360	0 %	0 %	0 %	100 %	525833534
42	NC_021817	T	6	6	31866	31871	0 %	100 %	0 %	0 %	525833534
43	NC_021817	C	6	6	32259	32264	0 %	0 %	0 %	100 %	525833535
44	NC_021817	G	6	6	32328	32333	0 %	0 %	100 %	0 %	525833535
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47	NC_021817	T	6	6	34049	34054	0 %	100 %	0 %	0 %	525833538
48	NC_021817	T	8	8	34221	34228	0 %	100 %	0 %	0 %	525833539
49	NC_021817	T	7	7	34301	34307	0 %	100 %	0 %	0 %	525833539
50	NC_021817	A	6	6	34536	34541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021817	A	7	7	34608	34614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021817	A	7	7	34655	34661	100 %	0 %	0 %	0 %	525833540
53	NC_021817	A	7	7	34676	34682	100 %	0 %	0 %	0 %	525833540
54	NC_021817	T	6	6	34920	34925	0 %	100 %	0 %	0 %	525833540
55	NC_021817	A	6	6	35113	35118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021817	A	8	8	35343	35350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021817	C	6	6	35605	35610	0 %	0 %	0 %	100 %	525833541
58	NC_021817	T	6	6	36191	36196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021817	A	8	8	36678	36685	100 %	0 %	0 %	0 %	525833542
60	NC_021817	A	6	6	37117	37122	100 %	0 %	0 %	0 %	525833543
61	NC_021817	A	6	6	37712	37717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021817	T	6	6	38996	39001	0 %	100 %	0 %	0 %	525833546
63	NC_021817	T	7	7	39830	39836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021817	A	6	6	40372	40377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021817	A	8	8	40462	40469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021817	A	8	8	40686	40693	100 %	0 %	0 %	0 %	525833548
67	NC_021817	A	6	6	42592	42597	100 %	0 %	0 %	0 %	525833551
68	NC_021817	A	6	6	43255	43260	100 %	0 %	0 %	0 %	525833552
69	NC_021817	T	6	6	44809	44814	0 %	100 %	0 %	0 %	525833552
70	NC_021817	T	6	6	44819	44824	0 %	100 %	0 %	0 %	525833552
71	NC_021817	T	6	6	45312	45317	0 %	100 %	0 %	0 %	525833504
72	NC_021817	A	6	6	46032	46037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021817	A	6	6	47998	48003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021817	A	6	6	48108	48113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021817	T	6	6	49240	49245	0 %	100 %	0 %	0 %	525833559
76	NC_021817	T	6	6	50374	50379	0 %	100 %	0 %	0 %	525833561
77	NC_021817	T	6	6	55751	55756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021817	A	7	7	56265	56271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021817	T	8	8	56289	56296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021817	A	6	6	56678	56683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021817	A	6	6	56939	56944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021817	A	6	6	57185	57190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021817	T	8	8	57257	57264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021817	A	6	6	57644	57649	100 %	0 %	0 %	0 %	525833508
85	NC_021817	T	6	6	60027	60032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_021817	A	6	6	61377	61382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021817	T	7	7	61732	61738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021817	T	8	8	61855	61862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021817	T	6	6	62056	62061	0 %	100 %	0 %	0 %	525833571
91	NC_021817	T	6	6	62162	62167	0 %	100 %	0 %	0 %	525833571
92	NC_021817	A	7	7	62424	62430	100 %	0 %	0 %	0 %	525833571
93	NC_021817	C	6	6	62435	62440	0 %	0 %	0 %	100 %	525833571
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95	NC_021817	T	7	7	62618	62624	0 %	100 %	0 %	0 %	525833571
96	NC_021817	T	8	8	62707	62714	0 %	100 %	0 %	0 %	525833571
97	NC_021817	A	6	6	62865	62870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_021817	T	6	6	64580	64585	0 %	100 %	0 %	0 %	525833573
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106	NC_021817	C	6	6	67162	67167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_021817	A	6	6	67699	67704	100 %	0 %	0 %	0 %	525833574
108	NC_021817	C	7	7	67715	67721	0 %	0 %	0 %	100 %	525833574
109	NC_021817	G	8	8	67889	67896	0 %	0 %	100 %	0 %	525833574
110	NC_021817	T	6	6	68136	68141	0 %	100 %	0 %	0 %	525833575
111	NC_021817	T	6	6	68601	68606	0 %	100 %	0 %	0 %	525833575
112	NC_021817	A	7	7	69563	69569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021817	A	6	6	69604	69609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021817	A	7	7	69638	69644	100 %	0 %	0 %	0 %	525833576
115	NC_021817	A	6	6	69776	69781	100 %	0 %	0 %	0 %	525833576
116	NC_021817	T	6	6	69849	69854	0 %	100 %	0 %	0 %	525833576
117	NC_021817	T	8	8	70364	70371	0 %	100 %	0 %	0 %	525833577
118	NC_021817	A	7	7	70644	70650	100 %	0 %	0 %	0 %	525833577
119	NC_021817	G	6	6	71263	71268	0 %	0 %	100 %	0 %	525833577
120	NC_021817	A	7	7	71307	71313	100 %	0 %	0 %	0 %	525833577
121	NC_021817	C	6	6	71838	71843	0 %	0 %	0 %	100 %	525833577
122	NC_021817	T	6	6	72822	72827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021817	T	6	6	72889	72894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021817	G	6	6	72895	72900	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021817	T	6	6	72950	72955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021817	T	6	6	73207	73212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_021817	A	6	6	75956	75961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021817	A	6	6	76023	76028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021817	A	6	6	76251	76256	100 %	0 %	0 %	0 %	525833580
133	NC_021817	T	7	7	76974	76980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021817	A	8	8	77053	77060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.