MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021817	AT	4	8	248	255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021817	AT	3	6	381	386	50 %	50 %	0 %	0 %	525833509
3	NC_021817	TA	4	8	924	931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021817	AT	3	6	941	946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021817	TA	3	6	2419	2424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021817	TG	3	6	2549	2554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021817	AG	3	6	3036	3041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021817	GA	3	6	3241	3246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021817	GC	3	6	7717	7722	0 %	0 %	50 %	50 %	525833517
10	NC_021817	GA	3	6	8298	8303	50 %	0 %	50 %	0 %	525833517
11	NC_021817	TG	3	6	9269	9274	0 %	50 %	50 %	0 %	525833517
12	NC_021817	CG	3	6	9637	9642	0 %	0 %	50 %	50 %	525833517
13	NC_021817	TC	3	6	10708	10713	0 %	50 %	0 %	50 %	525833517
14	NC_021817	GC	3	6	10914	10919	0 %	0 %	50 %	50 %	525833517
15	NC_021817	AC	3	6	12015	12020	50 %	0 %	0 %	50 %	525833517
16	NC_021817	AG	3	6	15336	15341	50 %	0 %	50 %	0 %	525833519
17	NC_021817	CA	3	6	15469	15474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021817	TG	3	6	15480	15485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021817	AT	3	6	15638	15643	50 %	50 %	0 %	0 %	525833520
20	NC_021817	TC	3	6	15799	15804	0 %	50 %	0 %	50 %	525833520
21	NC_021817	TG	3	6	17653	17658	0 %	50 %	50 %	0 %	525833521
22	NC_021817	GC	3	6	18623	18628	0 %	0 %	50 %	50 %	525833521
23	NC_021817	CG	3	6	19196	19201	0 %	0 %	50 %	50 %	525833522
24	NC_021817	GA	3	6	19385	19390	50 %	0 %	50 %	0 %	525833522
25	NC_021817	GC	3	6	20218	20223	0 %	0 %	50 %	50 %	525833522
26	NC_021817	AC	3	6	22097	22102	50 %	0 %	0 %	50 %	525833525
27	NC_021817	CA	3	6	22682	22687	50 %	0 %	0 %	50 %	525833525
28	NC_021817	CT	3	6	23876	23881	0 %	50 %	0 %	50 %	525833526
29	NC_021817	AC	3	6	24847	24852	50 %	0 %	0 %	50 %	525833528
30	NC_021817	GC	3	6	28934	28939	0 %	0 %	50 %	50 %	525833531
31	NC_021817	TG	4	8	30146	30153	0 %	50 %	50 %	0 %	525833533
32	NC_021817	TG	3	6	30772	30777	0 %	50 %	50 %	0 %	525833534
33	NC_021817	CG	4	8	30921	30928	0 %	0 %	50 %	50 %	525833534
34	NC_021817	AG	3	6	31041	31046	50 %	0 %	50 %	0 %	525833534
35	NC_021817	GA	3	6	31740	31745	50 %	0 %	50 %	0 %	525833534
36	NC_021817	GA	3	6	34254	34259	50 %	0 %	50 %	0 %	525833539
37	NC_021817	TC	3	6	34445	34450	0 %	50 %	0 %	50 %	525833539
38	NC_021817	GA	3	6	34690	34695	50 %	0 %	50 %	0 %	525833540
39	NC_021817	TA	3	6	34745	34750	50 %	50 %	0 %	0 %	525833540
40	NC_021817	AT	4	8	34759	34766	50 %	50 %	0 %	0 %	525833540
41	NC_021817	CT	3	6	34854	34859	0 %	50 %	0 %	50 %	525833540
42	NC_021817	CT	3	6	35439	35444	0 %	50 %	0 %	50 %	525833541
43	NC_021817	TC	3	6	35611	35616	0 %	50 %	0 %	50 %	525833541
44	NC_021817	AC	3	6	36064	36069	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021817	AT	3	6	36965	36970	50 %	50 %	0 %	0 %	525833543
46	NC_021817	TG	3	6	37234	37239	0 %	50 %	50 %	0 %	525833543
47	NC_021817	GC	3	6	37334	37339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021817	TA	3	6	37346	37351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021817	AT	3	6	37414	37419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021817	GC	3	6	38252	38257	0 %	0 %	50 %	50 %	525833544
51	NC_021817	CA	3	6	38368	38373	50 %	0 %	0 %	50 %	525833544
52	NC_021817	CT	4	8	38667	38674	0 %	50 %	0 %	50 %	525833544
53	NC_021817	GT	3	6	38957	38962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021817	CG	3	6	39466	39471	0 %	0 %	50 %	50 %	525833547
55	NC_021817	TG	3	6	39799	39804	0 %	50 %	50 %	0 %	525833547
56	NC_021817	GA	3	6	42153	42158	50 %	0 %	50 %	0 %	525833550
57	NC_021817	GC	3	6	42920	42925	0 %	0 %	50 %	50 %	525833552
58	NC_021817	GC	3	6	43697	43702	0 %	0 %	50 %	50 %	525833552
59	NC_021817	CT	3	6	45558	45563	0 %	50 %	0 %	50 %	525833504
60	NC_021817	TC	3	6	45623	45628	0 %	50 %	0 %	50 %	525833504
61	NC_021817	GC	3	6	46857	46862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021817	TC	4	8	47176	47183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021817	CG	3	6	47210	47215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021817	CG	3	6	48735	48740	0 %	0 %	50 %	50 %	525833558
65	NC_021817	GC	3	6	48763	48768	0 %	0 %	50 %	50 %	525833558
66	NC_021817	CG	3	6	49134	49139	0 %	0 %	50 %	50 %	525833558
67	NC_021817	AC	3	6	49452	49457	50 %	0 %	0 %	50 %	525833559
68	NC_021817	CA	3	6	49825	49830	50 %	0 %	0 %	50 %	525833560
69	NC_021817	TG	3	6	50081	50086	0 %	50 %	50 %	0 %	525833561
70	NC_021817	TA	3	6	51744	51749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021817	CT	3	6	52126	52131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021817	TC	3	6	52285	52290	0 %	50 %	0 %	50 %	525833506
73	NC_021817	CG	3	6	52476	52481	0 %	0 %	50 %	50 %	525833506
74	NC_021817	GC	3	6	52641	52646	0 %	0 %	50 %	50 %	525833506
75	NC_021817	GA	3	6	52868	52873	50 %	0 %	50 %	0 %	525833506
76	NC_021817	TC	3	6	53570	53575	0 %	50 %	0 %	50 %	525833507
77	NC_021817	GC	3	6	53669	53674	0 %	0 %	50 %	50 %	525833507
78	NC_021817	GT	3	6	54824	54829	0 %	50 %	50 %	0 %	525833562
79	NC_021817	CA	3	6	55074	55079	50 %	0 %	0 %	50 %	525833562
80	NC_021817	TA	3	6	55593	55598	50 %	50 %	0 %	0 %	525833562
81	NC_021817	TC	3	6	56140	56145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021817	GT	3	6	56209	56214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021817	TG	3	6	56376	56381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021817	AT	3	6	57535	57540	50 %	50 %	0 %	0 %	525833508
85	NC_021817	TA	3	6	57953	57958	50 %	50 %	0 %	0 %	525833508
86	NC_021817	AG	3	6	58978	58983	50 %	0 %	50 %	0 %	525833565
87	NC_021817	TA	3	6	59152	59157	50 %	50 %	0 %	0 %	525833565
88	NC_021817	CG	3	6	60492	60497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021817	AG	3	6	60559	60564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021817	GC	3	6	60716	60721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021817	CA	3	6	61511	61516	50 %	0 %	0 %	50 %	525833570
92	NC_021817	AT	3	6	61528	61533	50 %	50 %	0 %	0 %	525833570
93	NC_021817	TA	3	6	61620	61625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021817	AT	3	6	61934	61939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021817	CT	3	6	62092	62097	0 %	50 %	0 %	50 %	525833571
96	NC_021817	TA	3	6	62249	62254	50 %	50 %	0 %	0 %	525833571
97	NC_021817	AC	3	6	62366	62371	50 %	0 %	0 %	50 %	525833571
98	NC_021817	TC	3	6	62521	62526	0 %	50 %	0 %	50 %	525833571
99	NC_021817	AT	4	8	64944	64951	50 %	50 %	0 %	0 %	525833573
100	NC_021817	TC	3	6	66858	66863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021817	AT	4	8	67541	67548	50 %	50 %	0 %	0 %	525833574
102	NC_021817	TC	3	6	69319	69324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021817	AT	3	6	69735	69740	50 %	50 %	0 %	0 %	525833576
104	NC_021817	AC	3	6	70141	70146	50 %	0 %	0 %	50 %	525833576
105	NC_021817	AT	4	8	70505	70512	50 %	50 %	0 %	0 %	525833577
106	NC_021817	AT	3	6	71615	71620	50 %	50 %	0 %	0 %	525833577
107	NC_021817	AT	3	6	71714	71719	50 %	50 %	0 %	0 %	525833577
108	NC_021817	AT	3	6	71803	71808	50 %	50 %	0 %	0 %	525833577
109	NC_021817	AT	3	6	72926	72931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021817	AC	3	6	73954	73959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021817	CT	3	6	75151	75156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021817	TA	3	6	75394	75399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021817	TG	3	6	75444	75449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021817	AT	3	6	76681	76686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021817	AT	3	6	76904	76909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021817	AG	3	6	76982	76987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021817	GA	3	6	77028	77033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021817	AT	3	6	77225	77230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021817	AT	3	6	77492	77497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021817	GA	3	6	77505	77510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021817	AT	3	6	77684	77689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021817	TA	3	6	77726	77731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021817	AG	3	6	78017	78022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021817	AG	3	6	78049	78054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.