MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021817	TAAA	2	8	209	216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021817	GCTT	2	8	767	774	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021817	TGAT	2	8	1329	1336	25 %	50 %	25 %	0 %	525833510
4	NC_021817	TCAA	2	8	1778	1785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021817	TTAT	3	12	3023	3034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021817	TCGG	2	8	3775	3782	0 %	25 %	50 %	25 %	525833513
7	NC_021817	GGTA	2	8	3818	3825	25 %	25 %	50 %	0 %	525833513
8	NC_021817	CGAA	3	12	4047	4058	50 %	0 %	25 %	25 %	525833513
9	NC_021817	GTCA	2	8	4212	4219	25 %	25 %	25 %	25 %	525833513
10	NC_021817	CTGC	2	8	4223	4230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021817	GCCA	2	8	4454	4461	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021817	CTTT	2	8	4628	4635	0 %	75 %	0 %	25 %	525833514
13	NC_021817	ACTT	2	8	4852	4859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021817	ACTG	2	8	5086	5093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021817	ACCA	2	8	5113	5120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021817	GCCA	2	8	6105	6112	25 %	0 %	25 %	50 %	525833515
17	NC_021817	TGCC	2	8	6178	6185	0 %	25 %	25 %	50 %	525833515
18	NC_021817	ACGA	2	8	6794	6801	50 %	0 %	25 %	25 %	525833516
19	NC_021817	GCCT	2	8	6890	6897	0 %	25 %	25 %	50 %	525833516
20	NC_021817	TCAG	2	8	7625	7632	25 %	25 %	25 %	25 %	525833517
21	NC_021817	CCAG	3	12	7897	7908	25 %	0 %	25 %	50 %	525833517
22	NC_021817	CGGT	2	8	8198	8205	0 %	25 %	50 %	25 %	525833517
23	NC_021817	CTGA	2	8	8236	8243	25 %	25 %	25 %	25 %	525833517
24	NC_021817	CCGT	2	8	9333	9340	0 %	25 %	25 %	50 %	525833517
25	NC_021817	CCTG	2	8	9537	9544	0 %	25 %	25 %	50 %	525833517
26	NC_021817	CAGC	2	8	9564	9571	25 %	0 %	25 %	50 %	525833517
27	NC_021817	GACA	2	8	9766	9773	50 %	0 %	25 %	25 %	525833517
28	NC_021817	TTTC	2	8	10692	10699	0 %	75 %	0 %	25 %	525833517
29	NC_021817	GTTC	2	8	11073	11080	0 %	50 %	25 %	25 %	525833517
30	NC_021817	TCCC	2	8	12283	12290	0 %	25 %	0 %	75 %	525833518
31	NC_021817	CAGC	2	8	13362	13369	25 %	0 %	25 %	50 %	525833518
32	NC_021817	CGAT	2	8	13435	13442	25 %	25 %	25 %	25 %	525833518
33	NC_021817	CCTG	2	8	14228	14235	0 %	25 %	25 %	50 %	525833518
34	NC_021817	CTGA	2	8	14283	14290	25 %	25 %	25 %	25 %	525833518
35	NC_021817	AATA	2	8	14330	14337	75 %	25 %	0 %	0 %	525833518
36	NC_021817	TTAT	2	8	14431	14438	25 %	75 %	0 %	0 %	525833518
37	NC_021817	GTCT	2	8	14556	14563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021817	AATT	2	8	15789	15796	50 %	50 %	0 %	0 %	525833520
39	NC_021817	GCCA	2	8	17758	17765	25 %	0 %	25 %	50 %	525833521
40	NC_021817	CACC	2	8	18533	18540	25 %	0 %	0 %	75 %	525833521
41	NC_021817	GATA	2	8	18767	18774	50 %	25 %	25 %	0 %	525833521
42	NC_021817	AGAT	2	8	19301	19308	50 %	25 %	25 %	0 %	525833522
43	NC_021817	GAGC	2	8	19720	19727	25 %	0 %	50 %	25 %	525833522
44	NC_021817	TCAG	2	8	21400	21407	25 %	25 %	25 %	25 %	525833524
45	NC_021817	TGCA	2	8	21765	21772	25 %	25 %	25 %	25 %	525833524
46	NC_021817	CAGA	2	8	23621	23628	50 %	0 %	25 %	25 %	525833525
47	NC_021817	TATT	2	8	24785	24792	25 %	75 %	0 %	0 %	525833528
48	NC_021817	CGTC	2	8	25365	25372	0 %	25 %	25 %	50 %	525833528
49	NC_021817	AAAT	2	8	25777	25784	75 %	25 %	0 %	0 %	525833529
50	NC_021817	CGCC	2	8	26344	26351	0 %	0 %	25 %	75 %	525833530
51	NC_021817	GACC	2	8	27219	27226	25 %	0 %	25 %	50 %	525833531
52	NC_021817	CAGC	2	8	27672	27679	25 %	0 %	25 %	50 %	525833531
53	NC_021817	ATGA	2	8	28099	28106	50 %	25 %	25 %	0 %	525833531
54	NC_021817	TTCC	2	8	28300	28307	0 %	50 %	0 %	50 %	525833531
55	NC_021817	GCTT	2	8	29079	29086	0 %	50 %	25 %	25 %	525833531
56	NC_021817	CCGG	2	8	29399	29406	0 %	0 %	50 %	50 %	525833532
57	NC_021817	CCGC	2	8	29781	29788	0 %	0 %	25 %	75 %	525833532
58	NC_021817	CTGC	2	8	29928	29935	0 %	25 %	25 %	50 %	525833532
59	NC_021817	CTGG	2	8	29993	30000	0 %	25 %	50 %	25 %	525833533
60	NC_021817	CATC	2	8	30084	30091	25 %	25 %	0 %	50 %	525833533
61	NC_021817	GGAT	2	8	30225	30232	25 %	25 %	50 %	0 %	525833533
62	NC_021817	ACGC	2	8	30490	30497	25 %	0 %	25 %	50 %	525833503
63	NC_021817	ACTA	2	8	30721	30728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021817	CCTG	2	8	31081	31088	0 %	25 %	25 %	50 %	525833534
65	NC_021817	ACGA	2	8	31326	31333	50 %	0 %	25 %	25 %	525833534
66	NC_021817	TCTG	2	8	31876	31883	0 %	50 %	25 %	25 %	525833534
67	NC_021817	GCGG	2	8	31999	32006	0 %	0 %	75 %	25 %	525833534
68	NC_021817	GCAC	2	8	32216	32223	25 %	0 %	25 %	50 %	525833535
69	NC_021817	CGCC	2	8	32310	32317	0 %	0 %	25 %	75 %	525833535
70	NC_021817	CGTG	2	8	32596	32603	0 %	25 %	50 %	25 %	525833535
71	NC_021817	AGGA	2	8	33177	33184	50 %	0 %	50 %	0 %	525833536
72	NC_021817	CAGC	2	8	33304	33311	25 %	0 %	25 %	50 %	525833536
73	NC_021817	ATTT	2	8	33427	33434	25 %	75 %	0 %	0 %	525833537
74	NC_021817	TAGA	2	8	34481	34488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021817	ATTT	2	8	34521	34528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021817	TTAT	2	8	34874	34881	25 %	75 %	0 %	0 %	525833540
77	NC_021817	CATA	2	8	35067	35074	50 %	25 %	0 %	25 %	525833540
78	NC_021817	TTAT	2	8	35178	35185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021817	ATTT	2	8	35840	35847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021817	CTGC	2	8	36837	36844	0 %	25 %	25 %	50 %	525833543
81	NC_021817	AATA	2	8	37321	37328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021817	TATT	2	8	37358	37365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021817	AATA	2	8	37702	37709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021817	AATA	2	8	37757	37764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021817	TTAC	2	8	37885	37892	25 %	50 %	0 %	25 %	525833544
86	NC_021817	AGTG	2	8	38015	38022	25 %	25 %	50 %	0 %	525833544
87	NC_021817	AGGA	2	8	38128	38135	50 %	0 %	50 %	0 %	525833544
88	NC_021817	TTCC	2	8	38209	38216	0 %	50 %	0 %	50 %	525833544
89	NC_021817	TCAG	2	8	39329	39336	25 %	25 %	25 %	25 %	525833546
90	NC_021817	CCTT	2	8	39592	39599	0 %	50 %	0 %	50 %	525833547
91	NC_021817	GCGG	2	8	39959	39966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021817	TCAT	2	8	40979	40986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021817	CATG	2	8	41615	41622	25 %	25 %	25 %	25 %	525833549
94	NC_021817	CCAT	2	8	41649	41656	25 %	25 %	0 %	50 %	525833550
95	NC_021817	CTTT	2	8	41684	41691	0 %	75 %	0 %	25 %	525833550
96	NC_021817	GCCA	2	8	42033	42040	25 %	0 %	25 %	50 %	525833550
97	NC_021817	GGCG	2	8	42404	42411	0 %	0 %	75 %	25 %	525833551
98	NC_021817	TCAG	2	8	44444	44451	25 %	25 %	25 %	25 %	525833552
99	NC_021817	CTGA	2	8	44766	44773	25 %	25 %	25 %	25 %	525833552
100	NC_021817	GTTT	2	8	45783	45790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021817	TGCC	2	8	46445	46452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021817	TCCC	2	8	46782	46789	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_021817	CAGC	2	8	46942	46949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021817	CATC	2	8	47337	47344	25 %	25 %	0 %	50 %	525833556
105	NC_021817	TAAA	2	8	48188	48195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021817	ATCC	2	8	48490	48497	25 %	25 %	0 %	50 %	525833558
107	NC_021817	CCAG	2	8	48660	48667	25 %	0 %	25 %	50 %	525833558
108	NC_021817	ATCC	2	8	49058	49065	25 %	25 %	0 %	50 %	525833558
109	NC_021817	CCAT	2	8	49111	49118	25 %	25 %	0 %	50 %	525833558
110	NC_021817	GCTG	2	8	50682	50689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021817	CGGT	2	8	50930	50937	0 %	25 %	50 %	25 %	525833505
112	NC_021817	CGGC	2	8	51166	51173	0 %	0 %	50 %	50 %	525833505
113	NC_021817	ACGG	2	8	51202	51209	25 %	0 %	50 %	25 %	525833505
114	NC_021817	AAAC	2	8	52267	52274	75 %	0 %	0 %	25 %	525833506
115	NC_021817	CGGC	2	8	52555	52562	0 %	0 %	50 %	50 %	525833506
116	NC_021817	CGTT	2	8	52576	52583	0 %	50 %	25 %	25 %	525833506
117	NC_021817	GACC	2	8	52617	52624	25 %	0 %	25 %	50 %	525833506
118	NC_021817	AACG	2	8	52710	52717	50 %	0 %	25 %	25 %	525833506
119	NC_021817	AGGC	2	8	53226	53233	25 %	0 %	50 %	25 %	525833506
120	NC_021817	TTTG	2	8	53278	53285	0 %	75 %	25 %	0 %	525833506
121	NC_021817	GAGC	2	8	53308	53315	25 %	0 %	50 %	25 %	525833506
122	NC_021817	ATGG	2	8	53330	53337	25 %	25 %	50 %	0 %	525833506
123	NC_021817	TTGA	2	8	54041	54048	25 %	50 %	25 %	0 %	525833507
124	NC_021817	GTCA	2	8	54458	54465	25 %	25 %	25 %	25 %	525833507
125	NC_021817	TCGA	2	8	54839	54846	25 %	25 %	25 %	25 %	525833562
126	NC_021817	GGCT	2	8	54864	54871	0 %	25 %	50 %	25 %	525833562
127	NC_021817	TACA	2	8	55392	55399	50 %	25 %	0 %	25 %	525833562
128	NC_021817	AAAT	2	8	55789	55796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021817	GAAA	2	8	56718	56725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021817	CTTT	2	8	56841	56848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021817	GCAA	2	8	57167	57174	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021817	GCTG	2	8	57714	57721	0 %	25 %	50 %	25 %	525833508
133	NC_021817	GGCA	2	8	57745	57752	25 %	0 %	50 %	25 %	525833508
134	NC_021817	GCAG	2	8	57961	57968	25 %	0 %	50 %	25 %	525833508
135	NC_021817	CGGT	2	8	58683	58690	0 %	25 %	50 %	25 %	525833565
136	NC_021817	GCTG	2	8	58825	58832	0 %	25 %	50 %	25 %	525833565
137	NC_021817	CCGC	2	8	58870	58877	0 %	0 %	25 %	75 %	525833565
138	NC_021817	ACTC	2	8	60236	60243	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021817	GAAG	2	8	60379	60386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021817	TGTA	2	8	60588	60595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021817	GAAA	2	8	60775	60782	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021817	ATAA	2	8	61232	61239	75 %	25 %	0 %	0 %	525833569
143	NC_021817	ATGA	2	8	61408	61415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021817	AAGC	2	8	61540	61547	50 %	0 %	25 %	25 %	525833570
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.