MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bareilly str. CFSAN000189 plasmid unnamed

Total Repeats: 1606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021817	GCA	2	6	49011	49016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833558
1002	NC_021817	ATCC	2	8	49058	49065	25 %	25 %	0 %	50 %	525833558
1003	NC_021817	CCAT	2	8	49111	49118	25 %	25 %	0 %	50 %	525833558
1004	NC_021817	CG	3	6	49134	49139	0 %	0 %	50 %	50 %	525833558
1005	NC_021817	CGC	2	6	49213	49218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_021817	GCG	2	6	49223	49228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021817	T	6	6	49240	49245	0 %	100 %	0 %	0 %	525833559
1008	NC_021817	CGC	2	6	49264	49269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833559
1009	NC_021817	GAT	2	6	49305	49310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525833559
1010	NC_021817	CAG	2	6	49363	49368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833559
1011	NC_021817	CCG	2	6	49383	49388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833559
1012	NC_021817	AC	3	6	49452	49457	50 %	0 %	0 %	50 %	525833559
1013	NC_021817	GTT	2	6	49470	49475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525833559
1014	NC_021817	ATTCC	2	10	49536	49545	20 %	40 %	0 %	40 %	525833559
1015	NC_021817	CCG	2	6	49566	49571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833559
1016	NC_021817	CAA	2	6	49621	49626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525833559
1017	NC_021817	GCC	2	6	49710	49715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833560
1018	NC_021817	GCC	2	6	49812	49817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833560
1019	NC_021817	CA	3	6	49825	49830	50 %	0 %	0 %	50 %	525833560
1020	NC_021817	TCG	2	6	49907	49912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833561
1021	NC_021817	CGG	2	6	49944	49949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833561
1022	NC_021817	ACG	2	6	50005	50010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833561
1023	NC_021817	GGC	2	6	50023	50028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833561
1024	NC_021817	TG	3	6	50081	50086	0 %	50 %	50 %	0 %	525833561
1025	NC_021817	GTG	2	6	50134	50139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833561
1026	NC_021817	CCAGC	2	10	50158	50167	20 %	0 %	20 %	60 %	525833561
1027	NC_021817	T	6	6	50374	50379	0 %	100 %	0 %	0 %	525833561
1028	NC_021817	CGA	2	6	50469	50474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833561
1029	NC_021817	GCG	2	6	50587	50592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_021817	GCTG	2	8	50682	50689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_021817	ACG	2	6	50721	50726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_021817	CGG	2	6	50827	50832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021817	CTGAA	2	10	50870	50879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_021817	CGGT	2	8	50930	50937	0 %	25 %	50 %	25 %	525833505
1035	NC_021817	GAG	2	6	50958	50963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833505
1036	NC_021817	GAA	2	6	50982	50987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833505
1037	NC_021817	CGG	2	6	51020	51025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833505
1038	NC_021817	TGC	2	6	51058	51063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833505
1039	NC_021817	CGC	2	6	51072	51077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833505
1040	NC_021817	GTG	2	6	51122	51127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525833505
1041	NC_021817	TCA	2	6	51142	51147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833505
1042	NC_021817	CGGC	2	8	51166	51173	0 %	0 %	50 %	50 %	525833505
1043	NC_021817	ACGG	2	8	51202	51209	25 %	0 %	50 %	25 %	525833505
1044	NC_021817	CGT	2	6	51254	51259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833505
1045	NC_021817	ACC	2	6	51323	51328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833505
1046	NC_021817	CTG	2	6	51390	51395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833505
1047	NC_021817	CGG	2	6	51408	51413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833505
1048	NC_021817	CCG	2	6	51508	51513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525833505
1049	NC_021817	TTC	2	6	51706	51711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_021817	ATA	2	6	51735	51740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021817	TA	3	6	51744	51749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021817	CGG	2	6	51846	51851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021817	GCC	2	6	51866	51871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_021817	GGA	2	6	51880	51885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021817	TTC	2	6	51934	51939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021817	TGG	2	6	51994	51999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021817	CTG	2	6	52098	52103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021817	CT	3	6	52126	52131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_021817	GTG	2	6	52158	52163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021817	AAAC	2	8	52267	52274	75 %	0 %	0 %	25 %	525833506
1061	NC_021817	CGT	3	9	52276	52284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833506
1062	NC_021817	TC	3	6	52285	52290	0 %	50 %	0 %	50 %	525833506
1063	NC_021817	GAAGC	2	10	52325	52334	40 %	0 %	40 %	20 %	525833506
1064	NC_021817	CG	3	6	52476	52481	0 %	0 %	50 %	50 %	525833506
1065	NC_021817	CGA	2	6	52498	52503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833506
1066	NC_021817	CGGC	2	8	52555	52562	0 %	0 %	50 %	50 %	525833506
1067	NC_021817	CGTT	2	8	52576	52583	0 %	50 %	25 %	25 %	525833506
1068	NC_021817	GACC	2	8	52617	52624	25 %	0 %	25 %	50 %	525833506
1069	NC_021817	GC	3	6	52641	52646	0 %	0 %	50 %	50 %	525833506
1070	NC_021817	AACG	2	8	52710	52717	50 %	0 %	25 %	25 %	525833506
1071	NC_021817	CTG	2	6	52724	52729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833506
1072	NC_021817	GGA	2	6	52744	52749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833506
1073	NC_021817	AAG	2	6	52778	52783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833506
1074	NC_021817	CAC	2	6	52801	52806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525833506
1075	NC_021817	TCA	2	6	52839	52844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833506
1076	NC_021817	GA	3	6	52868	52873	50 %	0 %	50 %	0 %	525833506
1077	NC_021817	GGA	2	6	52912	52917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833506
1078	NC_021817	CAG	2	6	52934	52939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833506
1079	NC_021817	GCA	2	6	52947	52952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525833506
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1081	NC_021817	CTA	2	6	53107	53112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833506
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1084	NC_021817	TTTG	2	8	53278	53285	0 %	75 %	25 %	0 %	525833506
1085	NC_021817	GAGC	2	8	53308	53315	25 %	0 %	50 %	25 %	525833506
1086	NC_021817	ATGG	2	8	53330	53337	25 %	25 %	50 %	0 %	525833506
1087	NC_021817	ACT	2	6	53413	53418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833506
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1089	NC_021817	TC	3	6	53570	53575	0 %	50 %	0 %	50 %	525833507
1090	NC_021817	GC	3	6	53669	53674	0 %	0 %	50 %	50 %	525833507
1091	NC_021817	TTC	2	6	53687	53692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833507
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1093	NC_021817	TCG	2	6	53793	53798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833507
1094	NC_021817	CAT	2	6	53827	53832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833507
1095	NC_021817	CTG	2	6	53974	53979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833507
1096	NC_021817	TTGA	2	8	54041	54048	25 %	50 %	25 %	0 %	525833507
1097	NC_021817	TCA	2	6	54141	54146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833507
1098	NC_021817	GAA	2	6	54269	54274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833507
1099	NC_021817	CTG	2	6	54275	54280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525833507
1100	NC_021817	ATA	2	6	54297	54302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833507
1101	NC_021817	CTT	2	6	54447	54452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833507
1102	NC_021817	GTCA	2	8	54458	54465	25 %	25 %	25 %	25 %	525833507
1103	NC_021817	TCT	2	6	54512	54517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833507
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1105	NC_021817	CAT	2	6	54630	54635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833562
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1107	NC_021817	GT	3	6	54824	54829	0 %	50 %	50 %	0 %	525833562
1108	NC_021817	TCGA	2	8	54839	54846	25 %	25 %	25 %	25 %	525833562
1109	NC_021817	GGCT	2	8	54864	54871	0 %	25 %	50 %	25 %	525833562
1110	NC_021817	GAA	2	6	54884	54889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525833562
1111	NC_021817	GGA	2	6	54908	54913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525833562
1112	NC_021817	ATA	2	6	55022	55027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525833562
1113	NC_021817	CA	3	6	55074	55079	50 %	0 %	0 %	50 %	525833562
1114	NC_021817	TTC	2	6	55177	55182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525833562
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1117	NC_021817	TA	3	6	55593	55598	50 %	50 %	0 %	0 %	525833562
1118	NC_021817	GGC	2	6	55600	55605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525833562
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1120	NC_021817	T	6	6	55751	55756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021817	AAAT	2	8	55789	55796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021817	ATA	2	6	55798	55803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021817	AGG	2	6	55822	55827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021817	TTG	2	6	55873	55878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021817	GTA	2	6	55987	55992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021817	ACA	2	6	55996	56001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_021817	TAT	2	6	56048	56053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525833563
1128	NC_021817	ATC	2	6	56131	56136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525833563
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1130	NC_021817	GT	3	6	56209	56214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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