MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 4291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021815	GCC	2	6	182203	182208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3502	NC_021815	AG	3	6	182258	182263	50 %	0 %	50 %	0 %	525832545
3503	NC_021815	ACA	2	6	182281	182286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832545
3504	NC_021815	GCC	2	6	182316	182321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3505	NC_021815	T	6	6	182324	182329	0 %	100 %	0 %	0 %	525832545
3506	NC_021815	GC	3	6	182356	182361	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545
3507	NC_021815	CCT	2	6	182392	182397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832545
3508	NC_021815	AGC	2	6	182404	182409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3509	NC_021815	GGA	2	6	182430	182435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832545
3510	NC_021815	ATC	2	6	182438	182443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832545
3511	NC_021815	TGCC	2	8	182450	182457	0 %	25 %	25 %	50 %	525832545
3512	NC_021815	GTT	2	6	182497	182502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832545
3513	NC_021815	GCG	2	6	182530	182535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3514	NC_021815	CTG	2	6	182543	182548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3515	NC_021815	GGTAGC	2	12	182551	182562	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525832545
3516	NC_021815	CAG	2	6	182579	182584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3517	NC_021815	GGCG	2	8	182635	182642	0 %	0 %	75 %	25 %	525832545
3518	NC_021815	CG	3	6	182722	182727	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545
3519	NC_021815	GT	3	6	182757	182762	0 %	50 %	50 %	0 %	525832545
3520	NC_021815	CACG	2	8	182812	182819	25 %	0 %	25 %	50 %	525832545
3521	NC_021815	GGCG	2	8	182839	182846	0 %	0 %	75 %	25 %	525832545
3522	NC_021815	CAA	2	6	182905	182910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832545
3523	NC_021815	CGC	2	6	182926	182931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3524	NC_021815	CCA	2	6	182956	182961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832545
3525	NC_021815	CTG	2	6	182969	182974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3526	NC_021815	GTT	2	6	183028	183033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832545
3527	NC_021815	GGC	2	6	183062	183067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3528	NC_021815	GAT	2	6	183085	183090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832545
3529	NC_021815	CCTG	2	8	183120	183127	0 %	25 %	25 %	50 %	525832545
3530	NC_021815	CAG	2	6	183155	183160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3531	NC_021815	CGC	2	6	183166	183171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3532	NC_021815	GAA	2	6	183179	183184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832545
3533	NC_021815	TGC	2	6	183222	183227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3534	NC_021815	GGC	2	6	183233	183238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3535	NC_021815	GAC	2	6	183304	183309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3536	NC_021815	GGC	2	6	183413	183418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3537	NC_021815	GGC	2	6	183515	183520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3538	NC_021815	CGC	2	6	183533	183538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3539	NC_021815	GCA	2	6	183556	183561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3540	NC_021815	AGC	2	6	183642	183647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3541	NC_021815	GC	3	6	183646	183651	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545
3542	NC_021815	TGT	2	6	183666	183671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832545
3543	NC_021815	GCA	2	6	183700	183705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3544	NC_021815	CCG	2	6	183739	183744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3545	NC_021815	GCG	2	6	183903	183908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3546	NC_021815	AT	3	6	183996	184001	50 %	50 %	0 %	0 %	525832545
3547	NC_021815	CGT	2	6	184051	184056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3548	NC_021815	TCG	2	6	184071	184076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3549	NC_021815	GAA	2	6	184087	184092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832545
3550	NC_021815	TTC	2	6	184145	184150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832545
3551	NC_021815	CAG	2	6	184174	184179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3552	NC_021815	CCA	2	6	184225	184230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832545
3553	NC_021815	GAGT	2	8	184256	184263	25 %	25 %	50 %	0 %	525832545
3554	NC_021815	TCA	2	6	184264	184269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832545
3555	NC_021815	GAT	2	6	184429	184434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832545
3556	NC_021815	GCC	2	6	184473	184478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3557	NC_021815	T	6	6	184483	184488	0 %	100 %	0 %	0 %	525832545
3558	NC_021815	TCC	2	6	184577	184582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832545
3559	NC_021815	CGA	2	6	184602	184607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3560	NC_021815	AGC	2	6	184639	184644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3561	NC_021815	TGC	2	6	184692	184697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3562	NC_021815	GCC	2	6	184742	184747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3563	NC_021815	CCA	2	6	184798	184803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832545
3564	NC_021815	GTTG	2	8	184813	184820	0 %	50 %	50 %	0 %	525832545
3565	NC_021815	CGT	2	6	184864	184869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3566	NC_021815	GCC	2	6	184910	184915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3567	NC_021815	CGGG	2	8	184956	184963	0 %	0 %	75 %	25 %	525832545
3568	NC_021815	GGCGT	2	10	185016	185025	0 %	20 %	60 %	20 %	525832545
3569	NC_021815	CAG	2	6	185048	185053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3570	NC_021815	CATG	2	8	185118	185125	25 %	25 %	25 %	25 %	525832545
3571	NC_021815	CCATCA	2	12	185146	185157	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	525832545
3572	NC_021815	CGC	2	6	185164	185169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3573	NC_021815	CG	3	6	185171	185176	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545
3574	NC_021815	ACC	2	6	185310	185315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832545
3575	NC_021815	ACC	2	6	185379	185384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832545
3576	NC_021815	CTG	2	6	185414	185419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3577	NC_021815	CGT	2	6	185458	185463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3578	NC_021815	CAG	2	6	185564	185569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3579	NC_021815	CAA	2	6	185584	185589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832545
3580	NC_021815	CGG	2	6	185670	185675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3581	NC_021815	ATA	2	6	185693	185698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832545
3582	NC_021815	GCA	2	6	185773	185778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3583	NC_021815	GC	3	6	185826	185831	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545
3584	NC_021815	GGCG	2	8	185833	185840	0 %	0 %	75 %	25 %	525832545
3585	NC_021815	CAT	2	6	185843	185848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832545
3586	NC_021815	AAC	2	6	185919	185924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832545
3587	NC_021815	CGT	2	6	185953	185958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3588	NC_021815	GAT	2	6	186004	186009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832545
3589	NC_021815	GCG	2	6	186022	186027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3590	NC_021815	GCT	2	6	186074	186079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3591	NC_021815	ACC	2	6	186111	186116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832545
3592	NC_021815	GCT	2	6	186136	186141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3593	NC_021815	TCC	2	6	186195	186200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832545
3594	NC_021815	CAG	2	6	186263	186268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3595	NC_021815	AGC	2	6	186345	186350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3596	NC_021815	GCC	2	6	186362	186367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3597	NC_021815	GCG	2	6	186479	186484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3598	NC_021815	G	6	6	186545	186550	0 %	0 %	100 %	0 %	525832545
3599	NC_021815	GCCA	2	8	186567	186574	25 %	0 %	25 %	50 %	525832545
3600	NC_021815	GCGT	2	8	186581	186588	0 %	25 %	50 %	25 %	525832545
3601	NC_021815	TC	3	6	186591	186596	0 %	50 %	0 %	50 %	525832545
3602	NC_021815	TTGA	2	8	186602	186609	25 %	50 %	25 %	0 %	525832545
3603	NC_021815	TCT	2	6	186610	186615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832545
3604	NC_021815	GCA	2	6	186622	186627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3605	NC_021815	CAG	2	6	186680	186685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3606	NC_021815	GAA	2	6	186701	186706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832545
3607	NC_021815	CAG	2	6	186734	186739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3608	NC_021815	GGC	2	6	186868	186873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3609	NC_021815	CGT	2	6	186880	186885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3610	NC_021815	CTG	2	6	186941	186946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3611	NC_021815	GCA	2	6	186970	186975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3612	NC_021815	GCA	2	6	186988	186993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3613	NC_021815	CGC	2	6	187069	187074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3614	NC_021815	GAT	2	6	187164	187169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832545
3615	NC_021815	TCG	2	6	187170	187175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
3616	NC_021815	GGC	2	6	187176	187181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3617	NC_021815	TCT	2	6	187185	187190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832545
3618	NC_021815	GCC	2	6	187233	187238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832545
3619	NC_021815	GGC	2	6	187247	187252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832545
3620	NC_021815	TCA	2	6	187309	187314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832545
3621	NC_021815	GGCC	2	8	187330	187337	0 %	0 %	50 %	50 %	525832545
3622	NC_021815	CT	3	6	187350	187355	0 %	50 %	0 %	50 %	525832545
3623	NC_021815	CTG	2	6	187364	187369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832545
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3730	NC_021815	GCTG	2	8	192192	192199	0 %	25 %	50 %	25 %	525832548
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3735	NC_021815	CGAT	2	8	192351	192358	25 %	25 %	25 %	25 %	525832548
3736	NC_021815	ATC	2	6	192386	192391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832548
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3740	NC_021815	CGA	2	6	192544	192549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832548
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3994	NC_021815	A	6	6	205028	205033	100 %	0 %	0 %	0 %	525832560
3995	NC_021815	GGA	2	6	205264	205269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832560
3996	NC_021815	CAGA	2	8	205292	205299	50 %	0 %	25 %	25 %	525832560
3997	NC_021815	A	6	6	205323	205328	100 %	0 %	0 %	0 %	525832560
3998	NC_021815	AGC	2	6	205341	205346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832560
3999	NC_021815	ATG	2	6	205520	205525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832560
4000	NC_021815	CAG	2	6	205550	205555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832560

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