MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 4291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021815	ATT	2	6	134927	134932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021815	AC	3	6	134955	134960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2503	NC_021815	TGG	2	6	135093	135098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_021815	CGG	2	6	135122	135127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_021815	CTG	2	6	135194	135199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_021815	GGC	2	6	135269	135274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_021815	CAG	2	6	135294	135299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_021815	ATT	2	6	135336	135341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_021815	TAT	2	6	135383	135388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_021815	GCA	2	6	135410	135415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_021815	AG	3	6	135452	135457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_021815	CT	3	6	135466	135471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2513	NC_021815	CGA	2	6	135487	135492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_021815	AGG	2	6	135519	135524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_021815	AAAAC	2	10	135611	135620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2516	NC_021815	T	6	6	135752	135757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_021815	TA	3	6	135786	135791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021815	A	6	6	135791	135796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_021815	ATG	2	6	135815	135820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_021815	CAA	2	6	135875	135880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_021815	TTA	2	6	135896	135901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_021815	AATA	2	8	135922	135929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_021815	TCTT	2	8	135958	135965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_021815	ATT	2	6	136009	136014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_021815	ATTTT	2	10	136019	136028	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_021815	T	7	7	136025	136031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_021815	T	6	6	136049	136054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_021815	TTG	2	6	136091	136096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_021815	ATG	2	6	136102	136107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_021815	G	12	12	136109	136120	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_021815	AAT	2	6	136189	136194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_021815	ATT	2	6	136213	136218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_021815	CTAC	2	8	136232	136239	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2534	NC_021815	A	6	6	136249	136254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_021815	AAG	2	6	136299	136304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_021815	ATT	2	6	136314	136319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_021815	TGG	2	6	136321	136326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_021815	ACA	2	6	136361	136366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_021815	AGT	2	6	136397	136402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_021815	GAT	2	6	136463	136468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_021815	ATT	2	6	136476	136481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_021815	GCT	2	6	136495	136500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_021815	T	6	6	136555	136560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021815	A	6	6	136638	136643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_021815	ATG	2	6	136658	136663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_021815	CGG	2	6	136705	136710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832518
2547	NC_021815	TAG	2	6	136716	136721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832518
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2549	NC_021815	A	6	6	136772	136777	100 %	0 %	0 %	0 %	525832518
2550	NC_021815	GGAG	2	8	136848	136855	25 %	0 %	75 %	0 %	525832518
2551	NC_021815	TAAA	2	8	136856	136863	75 %	25 %	0 %	0 %	525832518
2552	NC_021815	TAT	2	6	136908	136913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832518
2553	NC_021815	T	9	9	136921	136929	0 %	100 %	0 %	0 %	525832518
2554	NC_021815	AAG	2	6	136957	136962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832518
2555	NC_021815	TGC	2	6	136983	136988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832518
2556	NC_021815	TAT	2	6	136997	137002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832518
2557	NC_021815	GGA	2	6	137010	137015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832518
2558	NC_021815	ATA	2	6	137031	137036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832518
2559	NC_021815	TTA	2	6	137042	137047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_021815	TATT	2	8	137051	137058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_021815	ATT	2	6	137068	137073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_021815	ATG	2	6	137127	137132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_021815	TAA	2	6	137140	137145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_021815	A	7	7	137173	137179	100 %	0 %	0 %	0 %	525832519
2565	NC_021815	AAT	2	6	137190	137195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832519
2566	NC_021815	AT	4	8	137247	137254	50 %	50 %	0 %	0 %	525832519
2567	NC_021815	GAAA	2	8	137331	137338	75 %	0 %	25 %	0 %	525832519
2568	NC_021815	CCT	2	6	137341	137346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832519
2569	NC_021815	A	7	7	137366	137372	100 %	0 %	0 %	0 %	525832519
2570	NC_021815	CA	3	6	137374	137379	50 %	0 %	0 %	50 %	525832519
2571	NC_021815	GAG	2	6	137477	137482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832519
2572	NC_021815	CGG	2	6	137514	137519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832519
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2576	NC_021815	GTC	2	6	137654	137659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2578	NC_021815	T	7	7	137771	137777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_021815	TGA	2	6	137796	137801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_021815	AAC	2	6	137859	137864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_021815	T	6	6	137876	137881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_021815	A	6	6	137910	137915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_021815	AAT	2	6	137918	137923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_021815	TTG	2	6	137925	137930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_021815	TGTTT	2	10	138023	138032	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_021815	A	6	6	138050	138055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_021815	ATTA	2	8	138073	138080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_021815	ATTT	2	8	138303	138310	25 %	75 %	0 %	0 %	525832520
2590	NC_021815	TGT	2	6	138323	138328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832520
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2595	NC_021815	TCA	2	6	138527	138532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832520
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2597	NC_021815	TGAGT	2	10	138570	138579	20 %	40 %	40 %	0 %	525832520
2598	NC_021815	AT	3	6	138592	138597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_021815	TTA	2	6	138652	138657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_021815	A	6	6	138660	138665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_021815	A	6	6	138672	138677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_021815	AT	3	6	138680	138685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_021815	T	7	7	138685	138691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_021815	TTC	2	6	138737	138742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_021815	TCAACA	2	12	138789	138800	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_021815	CAGG	2	8	138804	138811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2607	NC_021815	ACT	2	6	138813	138818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_021815	GGAG	2	8	138837	138844	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_021815	ACA	2	6	138902	138907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832521
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2611	NC_021815	G	6	6	138945	138950	0 %	0 %	100 %	0 %	525832521
2612	NC_021815	GGA	2	6	138966	138971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832521
2613	NC_021815	AC	3	6	138976	138981	50 %	0 %	0 %	50 %	525832521
2614	NC_021815	GGA	2	6	139008	139013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832521
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2619	NC_021815	TGG	2	6	139088	139093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832521
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2623	NC_021815	G	7	7	139172	139178	0 %	0 %	100 %	0 %	525832522
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2626	NC_021815	TGG	2	6	139295	139300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_021815	GGT	2	6	139359	139364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_021815	GGA	2	6	139368	139373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832523
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2631	NC_021815	GGC	2	6	139464	139469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832523
2632	NC_021815	TGG	2	6	139472	139477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832523
2633	NC_021815	TGG	2	6	139481	139486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832523
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2746	NC_021815	GCTGA	2	10	144771	144780	20 %	20 %	40 %	20 %	525832348
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2750	NC_021815	GCAGA	2	10	144910	144919	40 %	0 %	40 %	20 %	525832526
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2752	NC_021815	GGGA	2	8	145035	145042	25 %	0 %	75 %	0 %	525832526
2753	NC_021815	GCA	2	6	145130	145135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832526
2754	NC_021815	CAG	2	6	145142	145147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832526
2755	NC_021815	GCG	2	6	145216	145221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832526
2756	NC_021815	AAT	2	6	145312	145317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832526
2757	NC_021815	TTAT	2	8	145514	145521	25 %	75 %	0 %	0 %	525832527
2758	NC_021815	ACA	2	6	145654	145659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832527
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2763	NC_021815	GAC	2	6	145834	145839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832527
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2766	NC_021815	CTT	2	6	145996	146001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832527
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2768	NC_021815	CGC	2	6	146083	146088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832527
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2770	NC_021815	TGC	2	6	146166	146171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832527
2771	NC_021815	TGA	2	6	146187	146192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832527
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2779	NC_021815	GCA	2	6	146393	146398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832527
2780	NC_021815	GGACG	2	10	146550	146559	20 %	0 %	60 %	20 %	525832527
2781	NC_021815	T	7	7	146600	146606	0 %	100 %	0 %	0 %	525832527
2782	NC_021815	GCT	2	6	146636	146641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832527
2783	NC_021815	CCAGTT	2	12	146644	146655	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525832527
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2787	NC_021815	CTGTT	2	10	146835	146844	0 %	60 %	20 %	20 %	525832527
2788	NC_021815	CGT	2	6	146847	146852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832527
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2809	NC_021815	CGG	2	6	147989	147994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2810	NC_021815	ACA	2	6	148278	148283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832530
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2843	NC_021815	TAT	2	6	150237	150242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832532
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2845	NC_021815	GCA	2	6	150297	150302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832532
2846	NC_021815	CA	3	6	150379	150384	50 %	0 %	0 %	50 %	525832532
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2852	NC_021815	ATG	2	6	150743	150748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2853	NC_021815	ATT	2	6	150752	150757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2854	NC_021815	GGA	2	6	150769	150774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2855	NC_021815	CAGAC	2	10	150777	150786	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2856	NC_021815	GA	3	6	150824	150829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2857	NC_021815	TCA	2	6	150836	150841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2858	NC_021815	ATGAC	2	10	150846	150855	40 %	20 %	20 %	20 %	525832533
2859	NC_021815	G	6	6	150970	150975	0 %	0 %	100 %	0 %	525832533
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2865	NC_021815	CGTTC	2	10	151303	151312	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2866	NC_021815	ATG	2	6	151363	151368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2869	NC_021815	CTG	2	6	151616	151621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2870	NC_021815	CAG	2	6	151628	151633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2871	NC_021815	ACT	2	6	151644	151649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2872	NC_021815	TAC	2	6	151650	151655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2873	NC_021815	AC	3	6	151654	151659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2874	NC_021815	AAC	2	6	151679	151684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2875	NC_021815	CAC	2	6	151694	151699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2997	NC_021815	TCG	2	6	158353	158358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2999	NC_021815	AAT	2	6	158406	158411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_021815	A	6	6	158514	158519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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