MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 4291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021815	TCC	2	6	78014	78019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832462
1502	NC_021815	GCT	2	6	78029	78034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832462
1503	NC_021815	CTT	2	6	78097	78102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832462
1504	NC_021815	GGT	2	6	78116	78121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832462
1505	NC_021815	CTG	2	6	78174	78179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832462
1506	NC_021815	GAC	2	6	78197	78202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832462
1507	NC_021815	TG	3	6	78232	78237	0 %	50 %	50 %	0 %	525832462
1508	NC_021815	GAC	2	6	78251	78256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832462
1509	NC_021815	AGA	2	6	78283	78288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832462
1510	NC_021815	GGT	2	6	78349	78354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832462
1511	NC_021815	GTT	2	6	78445	78450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832462
1512	NC_021815	TTG	2	6	78522	78527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832462
1513	NC_021815	GAA	2	6	78593	78598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832462
1514	NC_021815	TGA	2	6	78646	78651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832462
1515	NC_021815	CGG	2	6	78678	78683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832462
1516	NC_021815	AAG	2	6	78749	78754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832462
1517	NC_021815	GCCT	2	8	78777	78784	0 %	25 %	25 %	50 %	525832462
1518	NC_021815	TTC	2	6	78815	78820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832462
1519	NC_021815	CTG	2	6	78855	78860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832462
1520	NC_021815	ACC	2	6	78914	78919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832462
1521	NC_021815	GTAT	2	8	78985	78992	25 %	50 %	25 %	0 %	525832462
1522	NC_021815	GAA	2	6	79018	79023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832462
1523	NC_021815	CGA	2	6	79041	79046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832462
1524	NC_021815	ACA	2	6	79188	79193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832462
1525	NC_021815	GGC	2	6	79352	79357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832462
1526	NC_021815	TAC	2	6	79424	79429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832462
1527	NC_021815	GA	3	6	79563	79568	50 %	0 %	50 %	0 %	525832462
1528	NC_021815	TC	3	6	79716	79721	0 %	50 %	0 %	50 %	525832462
1529	NC_021815	T	8	8	79810	79817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021815	ATT	2	6	79962	79967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832463
1531	NC_021815	GCG	2	6	80016	80021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832463
1532	NC_021815	CT	3	6	80094	80099	0 %	50 %	0 %	50 %	525832463
1533	NC_021815	AAG	2	6	80148	80153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832463
1534	NC_021815	GCATGG	2	12	80209	80220	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525832463
1535	NC_021815	GTG	2	6	80254	80259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832463
1536	NC_021815	GGT	3	9	80267	80275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832463
1537	NC_021815	TTG	2	6	80278	80283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832463
1538	NC_021815	TGG	2	6	80332	80337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832463
1539	NC_021815	A	6	6	80399	80404	100 %	0 %	0 %	0 %	525832463
1540	NC_021815	TGA	2	6	80446	80451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832463
1541	NC_021815	ACA	2	6	80452	80457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832463
1542	NC_021815	CTTC	2	8	80469	80476	0 %	50 %	0 %	50 %	525832463
1543	NC_021815	GCT	2	6	80513	80518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832463
1544	NC_021815	TCATT	2	10	80525	80534	20 %	60 %	0 %	20 %	525832463
1545	NC_021815	CGTTC	2	10	80546	80555	0 %	40 %	20 %	40 %	525832463
1546	NC_021815	GTT	2	6	80556	80561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832463
1547	NC_021815	GAA	2	6	80594	80599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832463
1548	NC_021815	GAA	2	6	80654	80659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832464
1549	NC_021815	ATT	2	6	80693	80698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832464
1550	NC_021815	GAT	2	6	80741	80746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832464
1551	NC_021815	TG	3	6	80769	80774	0 %	50 %	50 %	0 %	525832464
1552	NC_021815	TG	3	6	80781	80786	0 %	50 %	50 %	0 %	525832464
1553	NC_021815	ATCA	2	8	80885	80892	50 %	25 %	0 %	25 %	525832464
1554	NC_021815	GAT	2	6	80905	80910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832464
1555	NC_021815	GCT	2	6	80938	80943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832464
1556	NC_021815	TCC	2	6	80973	80978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525832464
1557	NC_021815	CAC	2	6	80981	80986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832464
1558	NC_021815	CAA	2	6	81013	81018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832464
1559	NC_021815	CAG	2	6	81113	81118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832464
1560	NC_021815	ATC	2	6	81145	81150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832464
1561	NC_021815	CGG	2	6	81186	81191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832464
1562	NC_021815	GCG	2	6	81435	81440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832464
1563	NC_021815	T	7	7	81483	81489	0 %	100 %	0 %	0 %	525832464
1564	NC_021815	AAG	2	6	81593	81598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832464
1565	NC_021815	CT	3	6	81612	81617	0 %	50 %	0 %	50 %	525832464
1566	NC_021815	GGT	2	6	81664	81669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832464
1567	NC_021815	CCAA	2	8	81680	81687	50 %	0 %	0 %	50 %	525832464
1568	NC_021815	GCG	3	9	81701	81709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832464
1569	NC_021815	GGA	2	6	81754	81759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832464
1570	NC_021815	CTGC	2	8	81790	81797	0 %	25 %	25 %	50 %	525832464
1571	NC_021815	ACCG	2	8	81806	81813	25 %	0 %	25 %	50 %	525832464
1572	NC_021815	GCT	2	6	81863	81868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832464
1573	NC_021815	GGGACC	2	12	81899	81910	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525832464
1574	NC_021815	GTCT	2	8	81951	81958	0 %	50 %	25 %	25 %	525832464
1575	NC_021815	CAA	2	6	81976	81981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832464
1576	NC_021815	T	6	6	82041	82046	0 %	100 %	0 %	0 %	525832464
1577	NC_021815	GAA	2	6	82142	82147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832464
1578	NC_021815	GAA	2	6	82199	82204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832464
1579	NC_021815	GAC	2	6	82331	82336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832464
1580	NC_021815	GAA	3	9	82355	82363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832464
1581	NC_021815	CAG	2	6	82391	82396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832464
1582	NC_021815	TC	3	6	82437	82442	0 %	50 %	0 %	50 %	525832464
1583	NC_021815	AAC	2	6	82448	82453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832464
1584	NC_021815	TAC	2	6	82527	82532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832464
1585	NC_021815	AAG	2	6	82557	82562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832464
1586	NC_021815	GTC	2	6	82592	82597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832464
1587	NC_021815	GAA	2	6	82790	82795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832464
1588	NC_021815	GTC	2	6	82821	82826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832464
1589	NC_021815	AC	3	6	82867	82872	50 %	0 %	0 %	50 %	525832464
1590	NC_021815	GTCG	2	8	82925	82932	0 %	25 %	50 %	25 %	525832464
1591	NC_021815	CAATCG	2	12	83102	83113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525832465
1592	NC_021815	TGG	2	6	83133	83138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832465
1593	NC_021815	CGG	2	6	83142	83147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832465
1594	NC_021815	CTA	2	6	83151	83156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832465
1595	NC_021815	TGA	2	6	83159	83164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832465
1596	NC_021815	CATC	2	8	83181	83188	25 %	25 %	0 %	50 %	525832465
1597	NC_021815	AGG	2	6	83267	83272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832465
1598	NC_021815	GTC	2	6	83356	83361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832465
1599	NC_021815	TGA	2	6	83388	83393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832465
1600	NC_021815	AAG	2	6	83418	83423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832466
1601	NC_021815	GCT	2	6	83493	83498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832466
1602	NC_021815	TGCC	2	8	83553	83560	0 %	25 %	25 %	50 %	525832466
1603	NC_021815	CTT	2	6	83570	83575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832466
1604	NC_021815	CCAAG	2	10	83627	83636	40 %	0 %	20 %	40 %	525832466
1605	NC_021815	GTC	2	6	83748	83753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832466
1606	NC_021815	AG	3	6	83792	83797	50 %	0 %	50 %	0 %	525832466
1607	NC_021815	AAC	2	6	83829	83834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832466
1608	NC_021815	GATCA	2	10	83898	83907	40 %	20 %	20 %	20 %	525832466
1609	NC_021815	TGG	2	6	83942	83947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021815	TGGC	2	8	83963	83970	0 %	25 %	50 %	25 %	525832467
1611	NC_021815	AGA	2	6	84053	84058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832467
1612	NC_021815	AGC	2	6	84128	84133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832467
1613	NC_021815	ACT	2	6	84139	84144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832467
1614	NC_021815	CGG	2	6	84263	84268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832467
1615	NC_021815	GGAA	2	8	84312	84319	50 %	0 %	50 %	0 %	525832467
1616	NC_021815	A	6	6	84364	84369	100 %	0 %	0 %	0 %	525832467
1617	NC_021815	CAT	3	9	84384	84392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832467
1618	NC_021815	GTT	2	6	84402	84407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832467
1619	NC_021815	ACA	2	6	84416	84421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832467
1620	NC_021815	GGA	2	6	84450	84455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832467
1621	NC_021815	AAC	2	6	84473	84478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832467
1622	NC_021815	CGT	2	6	84483	84488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832467
1623	NC_021815	GAAGA	2	10	84643	84652	60 %	0 %	40 %	0 %	525832467
1624	NC_021815	GAAG	2	8	84828	84835	50 %	0 %	50 %	0 %	525832467
1625	NC_021815	ACT	2	6	84909	84914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832467
1626	NC_021815	AAG	2	6	84919	84924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832467
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1755	NC_021815	TGA	2	6	91910	91915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1880	NC_021815	G	7	7	99008	99014	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1881	NC_021815	CCT	2	6	99038	99043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1882	NC_021815	GA	3	6	99052	99057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1883	NC_021815	GGC	2	6	99109	99114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832480
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1985	NC_021815	GTT	3	9	104676	104684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832485
1986	NC_021815	ATC	2	6	104757	104762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832485
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1994	NC_021815	TGG	2	6	104909	104914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832485
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1997	NC_021815	CAG	2	6	105081	105086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832485
1998	NC_021815	TGCCGG	2	12	105095	105106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525832485
1999	NC_021815	GTG	2	6	105115	105120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832485
2000	NC_021815	ATG	2	6	105127	105132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832485

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