MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921 plasmid unnamed

Total Repeats: 4291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021815	GTCT	2	8	26369	26376	0 %	50 %	25 %	25 %	525832397
502	NC_021815	TGG	2	6	26399	26404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832397
503	NC_021815	AAGG	2	8	26467	26474	50 %	0 %	50 %	0 %	525832397
504	NC_021815	CCA	2	6	26482	26487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832397
505	NC_021815	TCAAAG	2	12	26552	26563	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525832397
506	NC_021815	GTG	2	6	26571	26576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832397
507	NC_021815	GAAG	2	8	26578	26585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021815	AG	3	6	26584	26589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021815	T	6	6	26614	26619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021815	GCC	2	6	26622	26627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_021815	ACTC	2	8	26701	26708	25 %	25 %	0 %	50 %	525832398
512	NC_021815	GAA	2	6	26736	26741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832398
513	NC_021815	A	6	6	26745	26750	100 %	0 %	0 %	0 %	525832398
514	NC_021815	GGAT	2	8	26753	26760	25 %	25 %	50 %	0 %	525832398
515	NC_021815	TC	3	6	26767	26772	0 %	50 %	0 %	50 %	525832398
516	NC_021815	CTG	2	6	26781	26786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832398
517	NC_021815	GAA	2	6	26790	26795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832398
518	NC_021815	ACT	2	6	26827	26832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832398
519	NC_021815	CCG	2	6	26901	26906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832398
520	NC_021815	ATC	2	6	26907	26912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832398
521	NC_021815	TCGCCG	2	12	26954	26965	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525832398
522	NC_021815	TGCT	2	8	26974	26981	0 %	50 %	25 %	25 %	525832398
523	NC_021815	CCA	2	6	27061	27066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832398
524	NC_021815	GAGC	2	8	27096	27103	25 %	0 %	50 %	25 %	525832398
525	NC_021815	GAT	2	6	27146	27151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832398
526	NC_021815	GAT	2	6	27230	27235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832398
527	NC_021815	GAA	2	6	27324	27329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832398
528	NC_021815	AAG	2	6	27351	27356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832398
529	NC_021815	A	6	6	27363	27368	100 %	0 %	0 %	0 %	525832398
530	NC_021815	GGT	2	6	27413	27418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832398
531	NC_021815	GTC	2	6	27454	27459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832398
532	NC_021815	ACA	2	6	27463	27468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832398
533	NC_021815	TTG	2	6	27678	27683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832399
534	NC_021815	TGG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832399
535	NC_021815	ACAGT	2	10	27752	27761	40 %	20 %	20 %	20 %	525832399
536	NC_021815	CAGTGT	2	12	27781	27792	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525832399
537	NC_021815	GAT	2	6	27809	27814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832399
538	NC_021815	TA	3	6	27908	27913	50 %	50 %	0 %	0 %	525832400
539	NC_021815	TTGT	2	8	27954	27961	0 %	75 %	25 %	0 %	525832400
540	NC_021815	GT	3	6	27973	27978	0 %	50 %	50 %	0 %	525832400
541	NC_021815	TTC	2	6	28011	28016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832400
542	NC_021815	TG	3	6	28017	28022	0 %	50 %	50 %	0 %	525832400
543	NC_021815	GA	3	6	28031	28036	50 %	0 %	50 %	0 %	525832400
544	NC_021815	GCT	2	6	28148	28153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832401
545	NC_021815	TGG	2	6	28190	28195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832401
546	NC_021815	GGC	2	6	28225	28230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525832401
547	NC_021815	T	6	6	28251	28256	0 %	100 %	0 %	0 %	525832401
548	NC_021815	AGGA	2	8	28293	28300	50 %	0 %	50 %	0 %	525832401
549	NC_021815	TTC	2	6	28357	28362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832402
550	NC_021815	TCCT	2	8	28514	28521	0 %	50 %	0 %	50 %	525832402
551	NC_021815	GCT	2	6	28541	28546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832402
552	NC_021815	TGG	2	6	28573	28578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525832402
553	NC_021815	ATG	2	6	28595	28600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832402
554	NC_021815	ATG	2	6	28658	28663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832402
555	NC_021815	GAG	2	6	28730	28735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832403
556	NC_021815	TGAA	2	8	28782	28789	50 %	25 %	25 %	0 %	525832403
557	NC_021815	GGCAA	2	10	28802	28811	40 %	0 %	40 %	20 %	525832403
558	NC_021815	AAG	2	6	28931	28936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832403
559	NC_021815	CAA	2	6	28980	28985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832403
560	NC_021815	ACA	2	6	29010	29015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832403
561	NC_021815	TG	4	8	29052	29059	0 %	50 %	50 %	0 %	525832403
562	NC_021815	CCG	2	6	29066	29071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525832403
563	NC_021815	TGA	2	6	29107	29112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832403
564	NC_021815	AGG	2	6	29173	29178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832403
565	NC_021815	TC	3	6	29234	29239	0 %	50 %	0 %	50 %	525832403
566	NC_021815	CT	4	8	29282	29289	0 %	50 %	0 %	50 %	525832403
567	NC_021815	ACC	2	6	29323	29328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525832403
568	NC_021815	TG	3	6	29348	29353	0 %	50 %	50 %	0 %	525832403
569	NC_021815	TG	3	6	29367	29372	0 %	50 %	50 %	0 %	525832403
570	NC_021815	ACA	2	6	29427	29432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832403
571	NC_021815	TTG	3	9	29721	29729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525832403
572	NC_021815	CAT	2	6	29800	29805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832403
573	NC_021815	AGC	2	6	29875	29880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832403
574	NC_021815	TAT	2	6	29930	29935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832404
575	NC_021815	ATT	2	6	29961	29966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832404
576	NC_021815	CTT	2	6	29982	29987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832404
577	NC_021815	AT	3	6	29996	30001	50 %	50 %	0 %	0 %	525832404
578	NC_021815	CTA	2	6	30002	30007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832404
579	NC_021815	ACA	2	6	30017	30022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525832404
580	NC_021815	CAG	2	6	30024	30029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832404
581	NC_021815	GCA	2	6	30030	30035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832404
582	NC_021815	ATTG	2	8	30084	30091	25 %	50 %	25 %	0 %	525832404
583	NC_021815	G	6	6	30123	30128	0 %	0 %	100 %	0 %	525832404
584	NC_021815	ATT	2	6	30132	30137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832404
585	NC_021815	GT	3	6	30156	30161	0 %	50 %	50 %	0 %	525832404
586	NC_021815	GAA	2	6	30318	30323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525832404
587	NC_021815	A	6	6	30328	30333	100 %	0 %	0 %	0 %	525832404
588	NC_021815	AG	3	6	30408	30413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021815	TA	3	6	30414	30419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021815	GTGA	3	12	30443	30454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021815	TTTCA	2	10	30482	30491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
592	NC_021815	T	6	6	30523	30528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021815	CGG	2	6	30546	30551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_021815	CAA	2	6	30614	30619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021815	GA	3	6	30625	30630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021815	CGC	2	6	30693	30698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_021815	CAGTT	2	10	30715	30724	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
598	NC_021815	CTT	2	6	30743	30748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021815	ACC	2	6	30768	30773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_021815	CAC	2	6	30814	30819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_021815	TCG	2	6	30842	30847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_021815	T	6	6	30986	30991	0 %	100 %	0 %	0 %	525832405
603	NC_021815	CTG	2	6	31003	31008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832405
604	NC_021815	GTCAAA	2	12	31015	31026	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525832405
605	NC_021815	TTGTG	2	10	31099	31108	0 %	60 %	40 %	0 %	525832405
606	NC_021815	TG	3	6	31149	31154	0 %	50 %	50 %	0 %	525832405
607	NC_021815	ATGAG	2	10	31245	31254	40 %	20 %	40 %	0 %	525832405
608	NC_021815	AG	3	6	31309	31314	50 %	0 %	50 %	0 %	525832405
609	NC_021815	CTT	2	6	31350	31355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832405
610	NC_021815	T	6	6	31354	31359	0 %	100 %	0 %	0 %	525832405
611	NC_021815	ACAGA	2	10	31525	31534	60 %	0 %	20 %	20 %	525832405
612	NC_021815	GGA	2	6	31538	31543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832405
613	NC_021815	TAA	2	6	31555	31560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832405
614	NC_021815	A	6	6	31581	31586	100 %	0 %	0 %	0 %	525832405
615	NC_021815	GTA	2	6	31669	31674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832405
616	NC_021815	ACAA	2	8	31675	31682	75 %	0 %	0 %	25 %	525832405
617	NC_021815	A	6	6	31681	31686	100 %	0 %	0 %	0 %	525832405
618	NC_021815	TAT	2	6	31727	31732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832406
619	NC_021815	CCTT	2	8	31767	31774	0 %	50 %	0 %	50 %	525832406
620	NC_021815	TCA	2	6	31808	31813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832406
621	NC_021815	GAC	2	6	31882	31887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832406
622	NC_021815	TGA	2	6	31920	31925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832406
623	NC_021815	TAC	2	6	32049	32054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021815	CTG	2	6	32118	32123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021815	TGG	2	6	32128	32133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021815	GTG	2	6	32173	32178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021815	GCA	2	6	32199	32204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021815	GTA	2	6	32222	32227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832407
629	NC_021815	TAA	2	6	32276	32281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832407
630	NC_021815	AAT	2	6	32385	32390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525832407
631	NC_021815	TG	3	6	32467	32472	0 %	50 %	50 %	0 %	525832407
632	NC_021815	TGA	2	6	32523	32528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525832407
633	NC_021815	CAT	2	6	32603	32608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525832407
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635	NC_021815	TTA	2	6	32695	32700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525832407
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650	NC_021815	GTC	2	6	34094	34099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_021815	TCT	2	6	34282	34287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525832408
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662	NC_021815	CTG	2	6	34764	34769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832409
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761	NC_021815	CGA	2	6	39357	39362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832417
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765	NC_021815	TCG	2	6	39521	39526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525832417
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872	NC_021815	GAC	2	6	44805	44810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525832423
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885	NC_021815	AGG	2	6	45331	45336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525832423
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