MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 11348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021814	CGCC	2	8	959	966	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2	NC_021814	TTAC	2	8	1187	1194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021814	CTGT	2	8	1330	1337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021814	TAAC	2	8	2199	2206	50 %	25 %	0 %	25 %	525836787
5	NC_021814	TCAA	2	8	2285	2292	50 %	25 %	0 %	25 %	525836787
6	NC_021814	TGAG	2	8	2526	2533	25 %	25 %	50 %	0 %	525836787
7	NC_021814	CGAT	2	8	2876	2883	25 %	25 %	25 %	25 %	525836787
8	NC_021814	ATCA	2	8	3112	3119	50 %	25 %	0 %	25 %	525836787
9	NC_021814	AGGA	2	8	3479	3486	50 %	0 %	50 %	0 %	525836787
10	NC_021814	TAGA	2	8	3532	3539	50 %	25 %	25 %	0 %	525836787
11	NC_021814	ACCA	2	8	3835	3842	50 %	0 %	0 %	50 %	525836787
12	NC_021814	CAAC	2	8	3948	3955	50 %	0 %	0 %	50 %	525836787
13	NC_021814	GATA	2	8	4156	4163	50 %	25 %	25 %	0 %	525836787
14	NC_021814	TATT	2	8	4580	4587	25 %	75 %	0 %	0 %	525836787
15	NC_021814	CCAG	2	8	4602	4609	25 %	0 %	25 %	50 %	525836787
16	NC_021814	ATTT	2	8	4836	4843	25 %	75 %	0 %	0 %	525836787
17	NC_021814	GCCA	2	8	5098	5105	25 %	0 %	25 %	50 %	525836787
18	NC_021814	AACA	2	8	5460	5467	75 %	0 %	0 %	25 %	525836788
19	NC_021814	GGCG	2	8	5885	5892	0 %	0 %	75 %	25 %	525836788
20	NC_021814	GATC	2	8	6047	6054	25 %	25 %	25 %	25 %	525836788
21	NC_021814	ACGT	2	8	6158	6165	25 %	25 %	25 %	25 %	525836788
22	NC_021814	ATTT	2	8	6598	6605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021814	TTGA	2	8	6794	6801	25 %	50 %	25 %	0 %	525836789
24	NC_021814	ATTA	2	8	7234	7241	50 %	50 %	0 %	0 %	525836789
25	NC_021814	GCCT	2	8	7648	7655	0 %	25 %	25 %	50 %	525836790
26	NC_021814	GCCA	2	8	8189	8196	25 %	0 %	25 %	50 %	525836790
27	NC_021814	TCAT	2	8	8201	8208	25 %	50 %	0 %	25 %	525836790
28	NC_021814	GAAA	2	8	8250	8257	75 %	0 %	25 %	0 %	525836790
29	NC_021814	CGTT	2	8	8324	8331	0 %	50 %	25 %	25 %	525836790
30	NC_021814	GGTT	2	8	8528	8535	0 %	50 %	50 %	0 %	525836790
31	NC_021814	CAGC	2	8	8868	8875	25 %	0 %	25 %	50 %	525836790
32	NC_021814	ATGC	2	8	8947	8954	25 %	25 %	25 %	25 %	525836790
33	NC_021814	ATAA	2	8	9632	9639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021814	CATC	2	8	10225	10232	25 %	25 %	0 %	50 %	525836792
35	NC_021814	CATA	2	8	10414	10421	50 %	25 %	0 %	25 %	525836792
36	NC_021814	AAGC	2	8	11392	11399	50 %	0 %	25 %	25 %	525836794
37	NC_021814	AACA	2	8	11639	11646	75 %	0 %	0 %	25 %	525836794
38	NC_021814	ATGG	2	8	11662	11669	25 %	25 %	50 %	0 %	525836794
39	NC_021814	GCCA	2	8	12112	12119	25 %	0 %	25 %	50 %	525836794
40	NC_021814	AAAT	2	8	12294	12301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021814	TTAT	2	8	12326	12333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021814	AATG	2	8	12443	12450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021814	CATT	2	8	12733	12740	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021814	CTGG	2	8	12925	12932	0 %	25 %	50 %	25 %	525836795
45	NC_021814	CTGG	2	8	13053	13060	0 %	25 %	50 %	25 %	525836795
46	NC_021814	ATCC	2	8	13408	13415	25 %	25 %	0 %	50 %	525836795
47	NC_021814	TTTA	2	8	13721	13728	25 %	75 %	0 %	0 %	525836796
48	NC_021814	CCGC	2	8	14548	14555	0 %	0 %	25 %	75 %	525836796
49	NC_021814	GTAA	2	8	15309	15316	50 %	25 %	25 %	0 %	525836797
50	NC_021814	TCAT	2	8	15584	15591	25 %	50 %	0 %	25 %	525836798
51	NC_021814	AACG	2	8	15765	15772	50 %	0 %	25 %	25 %	525836798
52	NC_021814	ACGC	2	8	16070	16077	25 %	0 %	25 %	50 %	525836798
53	NC_021814	AGAT	2	8	16190	16197	50 %	25 %	25 %	0 %	525836798
54	NC_021814	ACGG	2	8	16694	16701	25 %	0 %	50 %	25 %	525836798
55	NC_021814	ACCA	2	8	17078	17085	50 %	0 %	0 %	50 %	525836799
56	NC_021814	CGAA	2	8	17576	17583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021814	CCAG	2	8	17958	17965	25 %	0 %	25 %	50 %	525836800
58	NC_021814	GATA	2	8	18915	18922	50 %	25 %	25 %	0 %	525836801
59	NC_021814	TTAA	2	8	19422	19429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021814	GAAT	2	8	19660	19667	50 %	25 %	25 %	0 %	525836802
61	NC_021814	GCAG	2	8	20088	20095	25 %	0 %	50 %	25 %	525836802
62	NC_021814	CCAG	2	8	20101	20108	25 %	0 %	25 %	50 %	525836802
63	NC_021814	CAGT	2	8	20170	20177	25 %	25 %	25 %	25 %	525836802
64	NC_021814	AGAT	2	8	20525	20532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021814	TCAC	2	8	21024	21031	25 %	25 %	0 %	50 %	525836803
66	NC_021814	GCTG	2	8	21098	21105	0 %	25 %	50 %	25 %	525836803
67	NC_021814	ATTG	2	8	21834	21841	25 %	50 %	25 %	0 %	525836803
68	NC_021814	TGGC	2	8	22487	22494	0 %	25 %	50 %	25 %	525836803
69	NC_021814	TGGT	2	8	22821	22828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021814	TCCG	2	8	23097	23104	0 %	25 %	25 %	50 %	525836804
71	NC_021814	GGCG	2	8	26362	26369	0 %	0 %	75 %	25 %	525836808
72	NC_021814	TAAG	2	8	27225	27232	50 %	25 %	25 %	0 %	525836808
73	NC_021814	GGAT	2	8	28294	28301	25 %	25 %	50 %	0 %	525836809
74	NC_021814	TGTC	2	8	28531	28538	0 %	50 %	25 %	25 %	525836809
75	NC_021814	GTTG	2	8	29062	29069	0 %	50 %	50 %	0 %	525836809
76	NC_021814	TAAA	2	8	30112	30119	75 %	25 %	0 %	0 %	525836809
77	NC_021814	TGGC	2	8	30345	30352	0 %	25 %	50 %	25 %	525836809
78	NC_021814	TGGC	2	8	30558	30565	0 %	25 %	50 %	25 %	525836809
79	NC_021814	ACGC	2	8	30606	30613	25 %	0 %	25 %	50 %	525836809
80	NC_021814	TGGC	2	8	30668	30675	0 %	25 %	50 %	25 %	525836809
81	NC_021814	GAAC	2	8	30846	30853	50 %	0 %	25 %	25 %	525836809
82	NC_021814	ACGC	2	8	31013	31020	25 %	0 %	25 %	50 %	525836809
83	NC_021814	AAAG	2	8	31482	31489	75 %	0 %	25 %	0 %	525836809
84	NC_021814	GCAG	2	8	31922	31929	25 %	0 %	50 %	25 %	525836810
85	NC_021814	GTCC	2	8	32178	32185	0 %	25 %	25 %	50 %	525836810
86	NC_021814	ATTG	2	8	32609	32616	25 %	50 %	25 %	0 %	525836810
87	NC_021814	TTTC	2	8	33217	33224	0 %	75 %	0 %	25 %	525836811
88	NC_021814	CAGC	2	8	33452	33459	25 %	0 %	25 %	50 %	525836811
89	NC_021814	TTCC	2	8	33520	33527	0 %	50 %	0 %	50 %	525836811
90	NC_021814	CCAG	2	8	33571	33578	25 %	0 %	25 %	50 %	525836811
91	NC_021814	TTCC	2	8	34358	34365	0 %	50 %	0 %	50 %	525836812
92	NC_021814	TTTA	2	8	34498	34505	25 %	75 %	0 %	0 %	525836812
93	NC_021814	GATC	2	8	34902	34909	25 %	25 %	25 %	25 %	525836813
94	NC_021814	GCGT	2	8	35144	35151	0 %	25 %	50 %	25 %	525836813
95	NC_021814	CTAT	2	8	36419	36426	25 %	50 %	0 %	25 %	525836814
96	NC_021814	TTTA	2	8	36690	36697	25 %	75 %	0 %	0 %	525836814
97	NC_021814	GTTT	2	8	37025	37032	0 %	75 %	25 %	0 %	525836814
98	NC_021814	CTGC	2	8	37086	37093	0 %	25 %	25 %	50 %	525836814
99	NC_021814	TGTC	2	8	37586	37593	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021814	GTTC	2	8	37772	37779	0 %	50 %	25 %	25 %	525836815
101	NC_021814	CCTG	2	8	37781	37788	0 %	25 %	25 %	50 %	525836815
102	NC_021814	CTGA	2	8	38449	38456	25 %	25 %	25 %	25 %	525836817
103	NC_021814	ATTA	2	8	38659	38666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021814	TCAT	2	8	38825	38832	25 %	50 %	0 %	25 %	525840457
105	NC_021814	TGAT	2	8	39284	39291	25 %	50 %	25 %	0 %	525836818
106	NC_021814	AATT	2	8	39586	39593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021814	GCGT	2	8	40158	40165	0 %	25 %	50 %	25 %	525836819
108	NC_021814	AAAC	2	8	40244	40251	75 %	0 %	0 %	25 %	525836819
109	NC_021814	GCTG	2	8	41215	41222	0 %	25 %	50 %	25 %	525840458
110	NC_021814	ATTG	2	8	42354	42361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021814	CAAA	2	8	42598	42605	75 %	0 %	0 %	25 %	525836820
112	NC_021814	GGCA	2	8	43262	43269	25 %	0 %	50 %	25 %	525836820
113	NC_021814	TGCC	2	8	43507	43514	0 %	25 %	25 %	50 %	525836820
114	NC_021814	AAGA	2	8	43787	43794	75 %	0 %	25 %	0 %	525840460
115	NC_021814	GGCG	2	8	44116	44123	0 %	0 %	75 %	25 %	525840460
116	NC_021814	AATT	2	8	44876	44883	50 %	50 %	0 %	0 %	525836821
117	NC_021814	GCAG	2	8	46001	46008	25 %	0 %	50 %	25 %	525836823
118	NC_021814	CTGG	2	8	46079	46086	0 %	25 %	50 %	25 %	525836823
119	NC_021814	GGCG	2	8	46274	46281	0 %	0 %	75 %	25 %	525836823
120	NC_021814	CGGC	2	8	46708	46715	0 %	0 %	50 %	50 %	525836823
121	NC_021814	GCTG	2	8	46832	46839	0 %	25 %	50 %	25 %	525836823
122	NC_021814	CAGC	2	8	47111	47118	25 %	0 %	25 %	50 %	525836823
123	NC_021814	TGGC	2	8	47502	47509	0 %	25 %	50 %	25 %	525836824
124	NC_021814	CTGG	2	8	50429	50436	0 %	25 %	50 %	25 %	525836826
125	NC_021814	GGAA	2	8	51282	51289	50 %	0 %	50 %	0 %	525836827
126	NC_021814	ACCG	2	8	51510	51517	25 %	0 %	25 %	50 %	525836827
127	NC_021814	CGTC	2	8	51652	51659	0 %	25 %	25 %	50 %	525836827
128	NC_021814	GCAG	2	8	51871	51878	25 %	0 %	50 %	25 %	525836827
129	NC_021814	TGAA	2	8	52045	52052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021814	GCGA	2	8	53062	53069	25 %	0 %	50 %	25 %	525836829
131	NC_021814	GATC	2	8	53138	53145	25 %	25 %	25 %	25 %	525836829
132	NC_021814	GACG	2	8	53180	53187	25 %	0 %	50 %	25 %	525836829
133	NC_021814	TGGC	2	8	53490	53497	0 %	25 %	50 %	25 %	525836829
134	NC_021814	ATCA	2	8	53538	53545	50 %	25 %	0 %	25 %	525836829
135	NC_021814	CAGC	2	8	53621	53628	25 %	0 %	25 %	50 %	525836829
136	NC_021814	CTGT	2	8	53834	53841	0 %	50 %	25 %	25 %	525836829
137	NC_021814	TTAT	2	8	54177	54184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021814	CAAC	2	8	54733	54740	50 %	0 %	0 %	50 %	525836831
139	NC_021814	AAGA	2	8	55221	55228	75 %	0 %	25 %	0 %	525836832
140	NC_021814	CTGG	2	8	55469	55476	0 %	25 %	50 %	25 %	525836832
141	NC_021814	GAAT	2	8	55831	55838	50 %	25 %	25 %	0 %	525836832
142	NC_021814	CTGG	2	8	56192	56199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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