MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021814	ATG	2	6	187325	187330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021814	TTG	2	6	187354	187359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021814	A	6	6	187429	187434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021814	ATCATT	2	12	187459	187470	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4005	NC_021814	AT	3	6	187487	187492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021814	A	6	6	187512	187517	100 %	0 %	0 %	0 %	525836938
4007	NC_021814	GAC	2	6	187519	187524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836938
4008	NC_021814	ATC	2	6	187525	187530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836938
4009	NC_021814	GGC	2	6	187631	187636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836938
4010	NC_021814	T	7	7	187686	187692	0 %	100 %	0 %	0 %	525836938
4011	NC_021814	G	6	6	187749	187754	0 %	0 %	100 %	0 %	525836938
4012	NC_021814	CGC	2	6	187785	187790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836938
4013	NC_021814	GGC	2	6	187841	187846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836938
4014	NC_021814	AGCC	2	8	187849	187856	25 %	0 %	25 %	50 %	525836938
4015	NC_021814	CGG	2	6	187897	187902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836938
4016	NC_021814	CG	3	6	187905	187910	0 %	0 %	50 %	50 %	525836938
4017	NC_021814	TGG	2	6	187917	187922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836938
4018	NC_021814	CGT	3	9	187982	187990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836938
4019	NC_021814	TGT	2	6	188104	188109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836938
4020	NC_021814	GGC	2	6	188111	188116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836938
4021	NC_021814	TGG	2	6	188364	188369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021814	CTG	2	6	188373	188378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_021814	TAA	2	6	188560	188565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836939
4024	NC_021814	T	6	6	188602	188607	0 %	100 %	0 %	0 %	525836939
4025	NC_021814	CTC	2	6	188627	188632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525836939
4026	NC_021814	TCG	2	6	188770	188775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836939
4027	NC_021814	ACCG	2	8	188776	188783	25 %	0 %	25 %	50 %	525836939
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4030	NC_021814	CAGC	2	8	188912	188919	25 %	0 %	25 %	50 %	525836939
4031	NC_021814	CGA	2	6	188959	188964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836939
4032	NC_021814	A	7	7	189151	189157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021814	CGC	2	6	189158	189163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_021814	GCG	3	9	189167	189175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_021814	GCG	2	6	189187	189192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_021814	TCG	2	6	189199	189204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836940
4037	NC_021814	GCA	2	6	189215	189220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836940
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4039	NC_021814	CTT	2	6	189311	189316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836940
4040	NC_021814	GCA	2	6	189359	189364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836940
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4042	NC_021814	CGT	2	6	189398	189403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836940
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4045	NC_021814	TCG	2	6	189496	189501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836940
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4047	NC_021814	GCA	2	6	189623	189628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836940
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4051	NC_021814	TCA	2	6	189797	189802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836940
4052	NC_021814	TCTT	2	8	189904	189911	0 %	75 %	0 %	25 %	525836940
4053	NC_021814	CGG	2	6	189916	189921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836940
4054	NC_021814	TCT	2	6	189988	189993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836940
4055	NC_021814	GCAG	2	8	190013	190020	25 %	0 %	50 %	25 %	525836940
4056	NC_021814	CTT	2	6	190028	190033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836940
4057	NC_021814	TTC	3	9	190135	190143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836940
4058	NC_021814	ACGC	2	8	190194	190201	25 %	0 %	25 %	50 %	525836940
4059	NC_021814	CAT	2	6	190206	190211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836940
4060	NC_021814	GCA	2	6	190306	190311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836940
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4062	NC_021814	ACG	2	6	190348	190353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836940
4063	NC_021814	GC	4	8	190358	190365	0 %	0 %	50 %	50 %	525836940
4064	NC_021814	TGT	2	6	190406	190411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836940
4065	NC_021814	CGG	2	6	190418	190423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836940
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4070	NC_021814	TCT	2	6	190519	190524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836940
4071	NC_021814	CAG	2	6	190602	190607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836940
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4074	NC_021814	TGG	2	6	190826	190831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836940
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4081	NC_021814	CGAT	2	8	191161	191168	25 %	25 %	25 %	25 %	525836940
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4087	NC_021814	GCA	2	6	191397	191402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836941
4088	NC_021814	GTA	2	6	191439	191444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836941
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4090	NC_021814	CGGG	2	8	191612	191619	0 %	0 %	75 %	25 %	525836941
4091	NC_021814	CGC	2	6	191623	191628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836941
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4095	NC_021814	AG	3	6	191831	191836	50 %	0 %	50 %	0 %	525836941
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4101	NC_021814	CATATG	2	12	192050	192061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525836941
4102	NC_021814	AGCGA	2	10	192084	192093	40 %	0 %	40 %	20 %	525836941
4103	NC_021814	CGA	2	6	192124	192129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836941
4104	NC_021814	CAAG	2	8	192151	192158	50 %	0 %	25 %	25 %	525836941
4105	NC_021814	GGC	2	6	192208	192213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836941
4106	NC_021814	TGC	2	6	192352	192357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836941
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4110	NC_021814	AAT	2	6	192479	192484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836941
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4115	NC_021814	GC	3	6	192739	192744	0 %	0 %	50 %	50 %	525836941
4116	NC_021814	AAG	2	6	192790	192795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836941
4117	NC_021814	ATGGA	2	10	192809	192818	40 %	20 %	40 %	0 %	525836941
4118	NC_021814	CGA	2	6	192877	192882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836941
4119	NC_021814	CAG	2	6	192896	192901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836941
4120	NC_021814	TTC	2	6	192959	192964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_021814	CT	3	6	193032	193037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_021814	GCC	2	6	193039	193044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_021814	GCA	2	6	193050	193055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_021814	TACAAC	2	12	193126	193137	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_021814	AGC	2	6	193153	193158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_021814	GCGT	2	8	193191	193198	0 %	25 %	50 %	25 %	525836942
4127	NC_021814	TTC	2	6	193213	193218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836942
4128	NC_021814	GC	3	6	193246	193251	0 %	0 %	50 %	50 %	525836942
4129	NC_021814	GTC	2	6	193261	193266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836942
4130	NC_021814	ACG	3	9	193284	193292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836942
4131	NC_021814	TGC	3	9	193472	193480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_021814	T	6	6	193500	193505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021814	GGGA	2	8	193524	193531	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_021814	ACG	2	6	193668	193673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836943
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4136	NC_021814	CGG	2	6	193732	193737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836943
4137	NC_021814	GGC	2	6	193795	193800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836943
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4139	NC_021814	GCGA	2	8	193823	193830	25 %	0 %	50 %	25 %	525836943
4140	NC_021814	GC	3	6	193872	193877	0 %	0 %	50 %	50 %	525836943
4141	NC_021814	CTG	2	6	193961	193966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836943
4142	NC_021814	CGG	2	6	194023	194028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836943
4143	NC_021814	CTG	2	6	194072	194077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836943
4144	NC_021814	GCC	2	6	194096	194101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836943
4145	NC_021814	TTG	2	6	194129	194134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836943
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4147	NC_021814	CGG	2	6	194187	194192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836943
4148	NC_021814	GTA	2	6	194283	194288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836943
4149	NC_021814	GGC	2	6	194291	194296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836943
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4151	NC_021814	TGA	2	6	194355	194360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836943
4152	NC_021814	GC	4	8	194371	194378	0 %	0 %	50 %	50 %	525836943
4153	NC_021814	GGCG	2	8	194410	194417	0 %	0 %	75 %	25 %	525836943
4154	NC_021814	GC	3	6	194440	194445	0 %	0 %	50 %	50 %	525836943
4155	NC_021814	ATG	2	6	194459	194464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836943
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4157	NC_021814	GAT	2	6	194524	194529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836943
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4159	NC_021814	CGG	2	6	194568	194573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836943
4160	NC_021814	CGG	2	6	194619	194624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836943
4161	NC_021814	CAT	2	6	194649	194654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840484
4162	NC_021814	GCC	2	6	194655	194660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840484
4163	NC_021814	ACG	2	6	194680	194685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840484
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4167	NC_021814	CAGCTC	2	12	194870	194881	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525836944
4168	NC_021814	TGT	2	6	194951	194956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836944
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4172	NC_021814	CAG	2	6	195096	195101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836944
4173	NC_021814	TGCC	2	8	195107	195114	0 %	25 %	25 %	50 %	525836944
4174	NC_021814	A	6	6	195192	195197	100 %	0 %	0 %	0 %	525836944
4175	NC_021814	GGC	2	6	195222	195227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836944
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4179	NC_021814	ATA	2	6	195538	195543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4180	NC_021814	GCAG	2	8	195584	195591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4181	NC_021814	CAC	2	6	195633	195638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836945
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4184	NC_021814	CTG	2	6	195841	195846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836945
4185	NC_021814	CG	5	10	195903	195912	0 %	0 %	50 %	50 %	525836945
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4188	NC_021814	AAATAA	2	12	195952	195963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525836945
4189	NC_021814	T	6	6	195975	195980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4190	NC_021814	TA	3	6	195993	195998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4191	NC_021814	TGA	2	6	196053	196058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836946
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4194	NC_021814	CTG	2	6	196163	196168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836946
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4204	NC_021814	CG	4	8	196485	196492	0 %	0 %	50 %	50 %	525836946
4205	NC_021814	GAT	2	6	196502	196507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836946
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4209	NC_021814	TGG	2	6	196842	196847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836946
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4211	NC_021814	GAT	2	6	196875	196880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836946
4212	NC_021814	AGCGC	2	10	196941	196950	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4213	NC_021814	TCG	2	6	197035	197040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836947
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4217	NC_021814	CAGC	2	8	197134	197141	25 %	0 %	25 %	50 %	525836947
4218	NC_021814	GATCA	2	10	197299	197308	40 %	20 %	20 %	20 %	525836947
4219	NC_021814	CGCC	2	8	197391	197398	0 %	0 %	25 %	75 %	525836947
4220	NC_021814	ATG	2	6	197410	197415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836947
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4222	NC_021814	TCA	2	6	197520	197525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836947
4223	NC_021814	GGT	2	6	197662	197667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836947
4224	NC_021814	GCA	2	6	197795	197800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836947
4225	NC_021814	GA	3	6	197847	197852	50 %	0 %	50 %	0 %	525836947
4226	NC_021814	TCG	2	6	197918	197923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836947
4227	NC_021814	CG	3	6	197922	197927	0 %	0 %	50 %	50 %	525836947
4228	NC_021814	TTC	2	6	198052	198057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836947
4229	NC_021814	CTG	2	6	198100	198105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836947
4230	NC_021814	GCG	2	6	198129	198134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836947
4231	NC_021814	ATCTTT	2	12	198154	198165	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525836947
4232	NC_021814	AAC	2	6	198179	198184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836947
4233	NC_021814	CAC	2	6	198198	198203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836947
4234	NC_021814	ATC	2	6	198244	198249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4235	NC_021814	GCA	2	6	198332	198337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836948
4236	NC_021814	CGC	3	9	198368	198376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836948
4237	NC_021814	CATA	2	8	198377	198384	50 %	25 %	0 %	25 %	525836948
4238	NC_021814	ATA	2	6	198394	198399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836948
4239	NC_021814	T	6	6	198444	198449	0 %	100 %	0 %	0 %	525836948
4240	NC_021814	TCT	2	6	198487	198492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836948
4241	NC_021814	TGA	2	6	198503	198508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836948
4242	NC_021814	CTG	2	6	198531	198536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836948
4243	NC_021814	CGG	2	6	198542	198547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836948
4244	NC_021814	TTG	2	6	198574	198579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836948
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4352	NC_021814	CAC	2	6	203296	203301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836950
4353	NC_021814	GC	4	8	203355	203362	0 %	0 %	50 %	50 %	525836950
4354	NC_021814	TAT	2	6	203411	203416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4355	NC_021814	CG	3	6	203417	203422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4356	NC_021814	TC	3	6	203434	203439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4357	NC_021814	GCG	2	6	203602	203607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836951
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4360	NC_021814	GC	5	10	203685	203694	0 %	0 %	50 %	50 %	525836951
4361	NC_021814	CGA	2	6	203755	203760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836951
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4363	NC_021814	GAA	2	6	203814	203819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836951
4364	NC_021814	GATC	2	8	203875	203882	25 %	25 %	25 %	25 %	525836951
4365	NC_021814	GC	3	6	203884	203889	0 %	0 %	50 %	50 %	525836951
4366	NC_021814	GC	3	6	203949	203954	0 %	0 %	50 %	50 %	525836951
4367	NC_021814	GGCG	2	8	203957	203964	0 %	0 %	75 %	25 %	525836951
4368	NC_021814	GCT	2	6	204020	204025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836951
4369	NC_021814	GCT	2	6	204164	204169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836951
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4374	NC_021814	GCG	3	9	204315	204323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836951
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4392	NC_021814	TAAAG	2	10	204992	205001	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_021814	TC	3	6	205021	205026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4394	NC_021814	C	7	7	205026	205032	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4398	NC_021814	TTG	2	6	205175	205180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_021814	CCG	2	6	205213	205218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4400	NC_021814	CTG	2	6	205253	205258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4402	NC_021814	A	7	7	205296	205302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4403	NC_021814	G	6	6	205338	205343	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4474	NC_021814	ATA	2	6	208914	208919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4475	NC_021814	T	7	7	208929	208935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4476	NC_021814	TGA	3	9	209034	209042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836954
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4485	NC_021814	GGCG	2	8	209367	209374	0 %	0 %	75 %	25 %	525836954
4486	NC_021814	CG	3	6	209384	209389	0 %	0 %	50 %	50 %	525836954
4487	NC_021814	TGA	2	6	209417	209422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836954
4488	NC_021814	ACG	2	6	209468	209473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836954
4489	NC_021814	GC	5	10	209485	209494	0 %	0 %	50 %	50 %	525836954
4490	NC_021814	ATA	2	6	209522	209527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836954
4491	NC_021814	TGG	2	6	209552	209557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836954
4492	NC_021814	A	6	6	209611	209616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4493	NC_021814	T	6	6	209637	209642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4494	NC_021814	ACG	2	6	209679	209684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4495	NC_021814	ATT	2	6	209703	209708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4496	NC_021814	TCA	2	6	209801	209806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836955
4497	NC_021814	CAG	3	9	209808	209816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836955
4498	NC_021814	ACAT	2	8	209840	209847	50 %	25 %	0 %	25 %	525836955
4499	NC_021814	CTG	2	6	209901	209906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836955
4500	NC_021814	CTG	2	6	209925	209930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836955

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