MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021814	AAT	2	6	139916	139921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840479
3002	NC_021814	CTT	2	6	139981	139986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840479
3003	NC_021814	GCA	2	6	140034	140039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840479
3004	NC_021814	TTC	2	6	140138	140143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525840479
3005	NC_021814	CTG	2	6	140158	140163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840479
3006	NC_021814	CGG	2	6	140176	140181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840479
3007	NC_021814	GTC	2	6	140219	140224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840479
3008	NC_021814	GCG	2	6	140268	140273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840479
3009	NC_021814	TTA	2	6	140284	140289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840479
3010	NC_021814	GCC	2	6	140310	140315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840479
3011	NC_021814	GTTC	2	8	140323	140330	0 %	50 %	25 %	25 %	525840479
3012	NC_021814	CAG	2	6	140334	140339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840479
3013	NC_021814	CCA	2	6	140358	140363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840479
3014	NC_021814	TCAA	2	8	140484	140491	50 %	25 %	0 %	25 %	525840479
3015	NC_021814	TTG	2	6	140496	140501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840479
3016	NC_021814	ATT	2	6	140601	140606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840479
3017	NC_021814	TCT	2	6	140640	140645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_021814	TGT	2	6	140672	140677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021814	GT	3	6	140736	140741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021814	CCG	2	6	140779	140784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_021814	GGA	2	6	140795	140800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021814	TGG	3	9	140860	140868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840480
3023	NC_021814	ATC	2	6	140885	140890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840480
3024	NC_021814	CTG	2	6	140935	140940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840480
3025	NC_021814	AAC	2	6	140963	140968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840480
3026	NC_021814	CCT	2	6	141159	141164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525840480
3027	NC_021814	GCT	2	6	141176	141181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840480
3028	NC_021814	GTC	2	6	141191	141196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840480
3029	NC_021814	CAGT	2	8	141201	141208	25 %	25 %	25 %	25 %	525840480
3030	NC_021814	GC	3	6	141316	141321	0 %	0 %	50 %	50 %	525840480
3031	NC_021814	AGTC	2	8	141507	141514	25 %	25 %	25 %	25 %	525840480
3032	NC_021814	CCA	2	6	141543	141548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840480
3033	NC_021814	CAC	2	6	141703	141708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836901
3034	NC_021814	AAG	2	6	141771	141776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836901
3035	NC_021814	CCG	2	6	141777	141782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836901
3036	NC_021814	GAG	2	6	141784	141789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525836901
3037	NC_021814	ATC	4	12	141843	141854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836901
3038	NC_021814	TG	3	6	141907	141912	0 %	50 %	50 %	0 %	525836901
3039	NC_021814	TTC	2	6	141950	141955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836901
3040	NC_021814	GGT	2	6	141980	141985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836901
3041	NC_021814	GTG	2	6	142003	142008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836901
3042	NC_021814	AC	3	6	142027	142032	50 %	0 %	0 %	50 %	525836901
3043	NC_021814	GCC	2	6	142103	142108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836901
3044	NC_021814	CACC	2	8	142129	142136	25 %	0 %	0 %	75 %	525836901
3045	NC_021814	GCCA	2	8	142176	142183	25 %	0 %	25 %	50 %	525836901
3046	NC_021814	TCA	2	6	142186	142191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836901
3047	NC_021814	TAT	2	6	142195	142200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836901
3048	NC_021814	AGC	2	6	142224	142229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836901
3049	NC_021814	ATA	2	6	142269	142274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836901
3050	NC_021814	CGG	2	6	142348	142353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836901
3051	NC_021814	CCA	2	6	142371	142376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836901
3052	NC_021814	GCC	2	6	142409	142414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836901
3053	NC_021814	CCA	2	6	142426	142431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836901
3054	NC_021814	GCG	2	6	142524	142529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836901
3055	NC_021814	TCA	2	6	142642	142647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836901
3056	NC_021814	TGG	2	6	142699	142704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836901
3057	NC_021814	TAA	2	6	142738	142743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836901
3058	NC_021814	GAT	2	6	142765	142770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836901
3059	NC_021814	CTT	2	6	142777	142782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836901
3060	NC_021814	CCG	2	6	142840	142845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836901
3061	NC_021814	AAT	2	6	142847	142852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836901
3062	NC_021814	CAG	2	6	142876	142881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836901
3063	NC_021814	T	6	6	142943	142948	0 %	100 %	0 %	0 %	525836901
3064	NC_021814	T	6	6	142956	142961	0 %	100 %	0 %	0 %	525836901
3065	NC_021814	CTT	2	6	142966	142971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836901
3066	NC_021814	GGC	2	6	143209	143214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836902
3067	NC_021814	GCA	2	6	143219	143224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836902
3068	NC_021814	GC	3	6	143262	143267	0 %	0 %	50 %	50 %	525836902
3069	NC_021814	AATC	2	8	143280	143287	50 %	25 %	0 %	25 %	525836902
3070	NC_021814	CAT	2	6	143376	143381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836902
3071	NC_021814	GTC	2	6	143383	143388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836902
3072	NC_021814	TCA	2	6	143423	143428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836902
3073	NC_021814	TAAT	2	8	143436	143443	50 %	50 %	0 %	0 %	525836902
3074	NC_021814	T	7	7	143507	143513	0 %	100 %	0 %	0 %	525836902
3075	NC_021814	AAT	2	6	143611	143616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836902
3076	NC_021814	TGT	2	6	143627	143632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836902
3077	NC_021814	AT	3	6	143648	143653	50 %	50 %	0 %	0 %	525836902
3078	NC_021814	ATGA	2	8	143692	143699	50 %	25 %	25 %	0 %	525836902
3079	NC_021814	TTC	2	6	143719	143724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836902
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3081	NC_021814	AT	3	6	143808	143813	50 %	50 %	0 %	0 %	525836902
3082	NC_021814	GTG	2	6	143884	143889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836902
3083	NC_021814	AT	3	6	143928	143933	50 %	50 %	0 %	0 %	525836902
3084	NC_021814	ACC	2	6	144027	144032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836903
3085	NC_021814	CCA	2	6	144235	144240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836903
3086	NC_021814	GTGCC	2	10	144301	144310	0 %	20 %	40 %	40 %	525836903
3087	NC_021814	GC	3	6	144341	144346	0 %	0 %	50 %	50 %	525836903
3088	NC_021814	TGCT	2	8	144359	144366	0 %	50 %	25 %	25 %	525836903
3089	NC_021814	ATC	2	6	144407	144412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836903
3090	NC_021814	GGC	2	6	144427	144432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836903
3091	NC_021814	ATG	2	6	144587	144592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836903
3092	NC_021814	GCG	2	6	144723	144728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836903
3093	NC_021814	ACC	3	9	144735	144743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836903
3094	NC_021814	AAT	2	6	144827	144832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836903
3095	NC_021814	TAAAA	2	10	144874	144883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021814	CA	3	6	144921	144926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_021814	ATC	2	6	144935	144940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_021814	GAAA	2	8	144971	144978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021814	TTTTG	2	10	144994	145003	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021814	GTG	2	6	145079	145084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021814	CGA	2	6	145145	145150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_021814	A	7	7	145156	145162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021814	TGT	2	6	145168	145173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836904
3104	NC_021814	AGC	2	6	145317	145322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836904
3105	NC_021814	AGC	2	6	145378	145383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836904
3106	NC_021814	GTG	2	6	145397	145402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836904
3107	NC_021814	GTCTG	2	10	145458	145467	0 %	40 %	40 %	20 %	525836904
3108	NC_021814	CGA	3	9	145468	145476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836904
3109	NC_021814	TTCCT	2	10	145518	145527	0 %	60 %	0 %	40 %	525836904
3110	NC_021814	ATC	2	6	145553	145558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836904
3111	NC_021814	TGT	2	6	145611	145616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836904
3112	NC_021814	G	6	6	145651	145656	0 %	0 %	100 %	0 %	525836904
3113	NC_021814	CAA	2	6	145679	145684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836904
3114	NC_021814	TGT	2	6	145697	145702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836904
3115	NC_021814	TGG	2	6	145710	145715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836904
3116	NC_021814	GCT	2	6	145763	145768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836904
3117	NC_021814	GTG	2	6	145811	145816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836904
3118	NC_021814	ATG	2	6	145833	145838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836904
3119	NC_021814	ATT	2	6	145880	145885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836904
3120	NC_021814	CGC	2	6	145900	145905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836904
3121	NC_021814	TCG	2	6	146050	146055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836905
3122	NC_021814	A	7	7	146066	146072	100 %	0 %	0 %	0 %	525836905
3123	NC_021814	TTG	2	6	146175	146180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836905
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3132	NC_021814	AT	3	6	146567	146572	50 %	50 %	0 %	0 %	525836905
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3242	NC_021814	CAT	2	6	152087	152092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836909
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3244	NC_021814	TGC	2	6	152194	152199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836909
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3378	NC_021814	AG	3	6	158701	158706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3379	NC_021814	ATT	2	6	158707	158712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3459	NC_021814	T	6	6	162526	162531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3482	NC_021814	TTTA	2	8	163764	163771	25 %	75 %	0 %	0 %	525836916
3483	NC_021814	TGA	2	6	163800	163805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836916
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3488	NC_021814	ATT	3	9	164039	164047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836916
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3490	NC_021814	GTT	3	9	164109	164117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_021814	AAAT	2	8	164131	164138	75 %	25 %	0 %	0 %	525836917
3492	NC_021814	GAA	2	6	164172	164177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836917
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3494	NC_021814	GCG	4	12	164229	164240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836917
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3496	NC_021814	CGC	2	6	164351	164356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836917
3497	NC_021814	GCG	2	6	164524	164529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836917
3498	NC_021814	TCG	2	6	164551	164556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836917
3499	NC_021814	GAA	3	9	164628	164636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836917
3500	NC_021814	A	6	6	164635	164640	100 %	0 %	0 %	0 %	525836917

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