MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021814	GTG	2	6	116970	116975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836882
2502	NC_021814	GTG	2	6	117094	117099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836882
2503	NC_021814	TGA	2	6	117155	117160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836882
2504	NC_021814	CGT	2	6	117252	117257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836882
2505	NC_021814	GTC	2	6	117271	117276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836882
2506	NC_021814	GCG	2	6	117286	117291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836882
2507	NC_021814	GTG	2	6	117339	117344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836882
2508	NC_021814	TTC	3	9	117368	117376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836882
2509	NC_021814	GCG	2	6	117391	117396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836882
2510	NC_021814	GCC	2	6	117435	117440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836882
2511	NC_021814	AAG	2	6	117469	117474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836882
2512	NC_021814	CGA	2	6	117509	117514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836882
2513	NC_021814	CGCGC	2	10	117686	117695	0 %	0 %	40 %	60 %	525836882
2514	NC_021814	CG	3	6	117789	117794	0 %	0 %	50 %	50 %	525836882
2515	NC_021814	CTGA	2	8	117795	117802	25 %	25 %	25 %	25 %	525836882
2516	NC_021814	CAC	2	6	117812	117817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836882
2517	NC_021814	ATCGAA	2	12	117819	117830	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525836882
2518	NC_021814	CGAC	2	8	117856	117863	25 %	0 %	25 %	50 %	525836882
2519	NC_021814	CGT	2	6	117888	117893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836882
2520	NC_021814	TTG	2	6	117973	117978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836882
2521	NC_021814	CGG	3	9	117983	117991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836882
2522	NC_021814	AAG	2	6	117994	117999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836882
2523	NC_021814	TC	3	6	118012	118017	0 %	50 %	0 %	50 %	525836882
2524	NC_021814	AAG	2	6	118129	118134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836882
2525	NC_021814	GCGA	2	8	118176	118183	25 %	0 %	50 %	25 %	525836882
2526	NC_021814	CTGG	2	8	118236	118243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_021814	TTG	2	6	118249	118254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_021814	TTCA	2	8	118275	118282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2529	NC_021814	T	6	6	118314	118319	0 %	100 %	0 %	0 %	525836883
2530	NC_021814	CAG	2	6	118420	118425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836883
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2532	NC_021814	GCAG	2	8	118626	118633	25 %	0 %	50 %	25 %	525836883
2533	NC_021814	TGC	2	6	118644	118649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836883
2534	NC_021814	CGG	2	6	118731	118736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836883
2535	NC_021814	GAT	2	6	118756	118761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836883
2536	NC_021814	CTG	2	6	118762	118767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836883
2537	NC_021814	TTG	2	6	118820	118825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836883
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2539	NC_021814	CTCG	2	8	118986	118993	0 %	25 %	25 %	50 %	525836883
2540	NC_021814	CAA	2	6	119091	119096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836883
2541	NC_021814	TTG	2	6	119108	119113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836883
2542	NC_021814	TTG	2	6	119128	119133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836883
2543	NC_021814	GTT	3	9	119249	119257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021814	ATG	2	6	119318	119323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_021814	GCC	2	6	119338	119343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_021814	TAC	2	6	119363	119368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_021814	CTG	2	6	119486	119491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
2548	NC_021814	GCT	2	6	119557	119562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
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2551	NC_021814	CGG	2	6	119698	119703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836884
2552	NC_021814	CT	3	6	119807	119812	0 %	50 %	0 %	50 %	525836884
2553	NC_021814	CGA	2	6	119842	119847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836884
2554	NC_021814	TGC	2	6	119850	119855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
2555	NC_021814	TAT	2	6	119884	119889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836884
2556	NC_021814	TCA	2	6	119908	119913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836884
2557	NC_021814	CCA	2	6	119931	119936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836884
2558	NC_021814	TCG	2	6	119950	119955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
2559	NC_021814	CGC	2	6	119963	119968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836884
2560	NC_021814	GCG	2	6	120107	120112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836884
2561	NC_021814	ACA	2	6	120177	120182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836884
2562	NC_021814	GTC	2	6	120249	120254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
2563	NC_021814	TGG	2	6	120315	120320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836884
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2565	NC_021814	CTG	2	6	120404	120409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
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2569	NC_021814	CGC	2	6	120529	120534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836884
2570	NC_021814	CAG	2	6	120542	120547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836884
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2588	NC_021814	CGT	2	6	121145	121150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
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2591	NC_021814	GTC	2	6	121170	121175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
2592	NC_021814	GCG	2	6	121182	121187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836884
2593	NC_021814	CGT	2	6	121190	121195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836884
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2598	NC_021814	T	7	7	121325	121331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_021814	GA	3	6	121372	121377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_021814	GA	4	8	121399	121406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_021814	ACC	3	9	121424	121432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836885
2602	NC_021814	GCT	2	6	121447	121452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836885
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2605	NC_021814	CGG	2	6	121471	121476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836885
2606	NC_021814	CAT	2	6	121480	121485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836885
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2611	NC_021814	TGA	2	6	121590	121595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836885
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2613	NC_021814	GCT	2	6	121816	121821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836885
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2619	NC_021814	GGC	2	6	122198	122203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836885
2620	NC_021814	GCG	2	6	122232	122237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836885
2621	NC_021814	CTG	3	9	122261	122269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836885
2622	NC_021814	GTG	2	6	122270	122275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836885
2623	NC_021814	TTCC	2	8	122299	122306	0 %	50 %	0 %	50 %	525836885
2624	NC_021814	TGA	2	6	122356	122361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836885
2625	NC_021814	GCT	2	6	122389	122394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836885
2626	NC_021814	GCC	2	6	122404	122409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836885
2627	NC_021814	GAT	2	6	122410	122415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836885
2628	NC_021814	TGG	2	6	122416	122421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836885
2629	NC_021814	CTG	2	6	122423	122428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836885
2630	NC_021814	GGC	2	6	122485	122490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836885
2631	NC_021814	GAT	2	6	122569	122574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836885
2632	NC_021814	TTG	2	6	122636	122641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836885
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2634	NC_021814	TTC	2	6	122744	122749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836886
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2639	NC_021814	CA	3	6	122939	122944	50 %	0 %	0 %	50 %	525836886
2640	NC_021814	CT	3	6	122973	122978	0 %	50 %	0 %	50 %	525836886
2641	NC_021814	GA	3	6	122979	122984	50 %	0 %	50 %	0 %	525836886
2642	NC_021814	TTA	2	6	123018	123023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836886
2643	NC_021814	TTTCAC	2	12	123052	123063	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525836886
2644	NC_021814	CTC	2	6	123122	123127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525836886
2645	NC_021814	GTC	2	6	123146	123151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836886
2646	NC_021814	TTG	2	6	123166	123171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836886
2647	NC_021814	GAA	2	6	123220	123225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836886
2648	NC_021814	A	6	6	123224	123229	100 %	0 %	0 %	0 %	525836886
2649	NC_021814	ATG	2	6	123246	123251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836886
2650	NC_021814	TAA	2	6	123263	123268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2651	NC_021814	TCATA	2	10	123351	123360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2652	NC_021814	AT	3	6	123366	123371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_021814	ACT	2	6	123420	123425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836887
2654	NC_021814	TAT	2	6	123434	123439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836887
2655	NC_021814	TTTTA	2	10	123456	123465	20 %	80 %	0 %	0 %	525836887
2656	NC_021814	TTAT	2	8	123562	123569	25 %	75 %	0 %	0 %	525836887
2657	NC_021814	TGG	2	6	123666	123671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836887
2658	NC_021814	CCA	2	6	123725	123730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836887
2659	NC_021814	ATC	2	6	123761	123766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836887
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2662	NC_021814	ATGA	2	8	123967	123974	50 %	25 %	25 %	0 %	525836887
2663	NC_021814	A	7	7	124052	124058	100 %	0 %	0 %	0 %	525836887
2664	NC_021814	CAA	2	6	124109	124114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836887
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2667	NC_021814	GGAT	2	8	124216	124223	25 %	25 %	50 %	0 %	525836888
2668	NC_021814	CTG	2	6	124277	124282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836888
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2674	NC_021814	GGTAC	2	10	124490	124499	20 %	20 %	40 %	20 %	525836888
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2689	NC_021814	CAGC	2	8	125002	125009	25 %	0 %	25 %	50 %	525836888
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2692	NC_021814	TGT	2	6	125166	125171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2693	NC_021814	GCGCT	2	10	125219	125228	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2694	NC_021814	GCC	2	6	125276	125281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2695	NC_021814	GC	3	6	125362	125367	0 %	0 %	50 %	50 %	525836889
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2712	NC_021814	TCCA	2	8	126242	126249	25 %	25 %	0 %	50 %	525836890
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2722	NC_021814	GCGG	2	8	126580	126587	0 %	0 %	75 %	25 %	525836890
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2732	NC_021814	GCC	2	6	127124	127129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836890
2733	NC_021814	GGCAG	2	10	127150	127159	20 %	0 %	60 %	20 %	525836890
2734	NC_021814	AGC	2	6	127160	127165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836890
2735	NC_021814	TGC	2	6	127235	127240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2736	NC_021814	AAT	2	6	127285	127290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2737	NC_021814	TTG	2	6	127312	127317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2738	NC_021814	CGC	2	6	127323	127328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2739	NC_021814	TGA	2	6	127433	127438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840473
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2741	NC_021814	CAG	2	6	127630	127635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840473
2742	NC_021814	CGC	2	6	127686	127691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840473
2743	NC_021814	GAA	2	6	127770	127775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840473
2744	NC_021814	TGC	3	9	127826	127834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840473
2745	NC_021814	TTG	2	6	127847	127852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840473
2746	NC_021814	GAAGC	2	10	127983	127992	40 %	0 %	40 %	20 %	525840474
2747	NC_021814	TGG	2	6	128035	128040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840474
2748	NC_021814	GAT	2	6	128046	128051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840474
2749	NC_021814	GGT	2	6	128060	128065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840474
2750	NC_021814	GC	3	6	128169	128174	0 %	0 %	50 %	50 %	525840474
2751	NC_021814	CGG	2	6	128221	128226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840474
2752	NC_021814	TA	3	6	128251	128256	50 %	50 %	0 %	0 %	525840474
2753	NC_021814	TGG	2	6	128374	128379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840474
2754	NC_021814	CAG	2	6	128431	128436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840475
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2756	NC_021814	TGC	2	6	128606	128611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840475
2757	NC_021814	ACG	2	6	128617	128622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840475
2758	NC_021814	GGT	2	6	128632	128637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840475
2759	NC_021814	CAGATA	2	12	128674	128685	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525840475
2760	NC_021814	AC	3	6	128754	128759	50 %	0 %	0 %	50 %	525836891
2761	NC_021814	TGGC	2	8	128777	128784	0 %	25 %	50 %	25 %	525836891
2762	NC_021814	ACA	2	6	128788	128793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836891
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2764	NC_021814	GAT	2	6	128891	128896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836891
2765	NC_021814	GC	3	6	128928	128933	0 %	0 %	50 %	50 %	525836891
2766	NC_021814	GC	3	6	128972	128977	0 %	0 %	50 %	50 %	525836891
2767	NC_021814	CGC	2	6	129034	129039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836891
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2770	NC_021814	AAATT	2	10	129114	129123	60 %	40 %	0 %	0 %	525836891
2771	NC_021814	ACA	2	6	129129	129134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836891
2772	NC_021814	A	6	6	129149	129154	100 %	0 %	0 %	0 %	525836891
2773	NC_021814	CAG	2	6	129182	129187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836891
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2775	NC_021814	CGA	3	9	129256	129264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836892
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2779	NC_021814	CAA	2	6	129362	129367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836892
2780	NC_021814	CGC	2	6	129445	129450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836892
2781	NC_021814	TCG	2	6	129498	129503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836892
2782	NC_021814	TCA	2	6	129513	129518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836892
2783	NC_021814	T	7	7	129551	129557	0 %	100 %	0 %	0 %	525836892
2784	NC_021814	TGA	2	6	129592	129597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836892
2785	NC_021814	GGCC	2	8	129604	129611	0 %	0 %	50 %	50 %	525836892
2786	NC_021814	CTG	2	6	129622	129627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836892
2787	NC_021814	TCC	2	6	129697	129702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2788	NC_021814	GTG	2	6	129706	129711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2789	NC_021814	ATG	2	6	129738	129743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2790	NC_021814	CGG	2	6	129860	129865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840476
2791	NC_021814	CTG	2	6	129870	129875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840476
2792	NC_021814	CGC	2	6	129892	129897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840476
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2816	NC_021814	GC	3	6	130928	130933	0 %	0 %	50 %	50 %	525836893
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2827	NC_021814	TAA	2	6	131850	131855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836895
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2829	NC_021814	GCC	2	6	131884	131889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836895
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2832	NC_021814	CGT	2	6	131937	131942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836895
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2835	NC_021814	CCAG	2	8	132023	132030	25 %	0 %	25 %	50 %	525836895
2836	NC_021814	CG	3	6	132034	132039	0 %	0 %	50 %	50 %	525836895
2837	NC_021814	CA	3	6	132134	132139	50 %	0 %	0 %	50 %	525836896
2838	NC_021814	CTG	2	6	132293	132298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836896
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2849	NC_021814	GCC	3	9	132692	132700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836896
2850	NC_021814	GC	3	6	132748	132753	0 %	0 %	50 %	50 %	525836896
2851	NC_021814	CAG	2	6	132767	132772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836896
2852	NC_021814	ATG	2	6	132800	132805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836896
2853	NC_021814	CGC	2	6	132806	132811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836896
2854	NC_021814	TCT	2	6	132825	132830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836896
2855	NC_021814	GA	3	6	132832	132837	50 %	0 %	50 %	0 %	525836896
2856	NC_021814	GCG	2	6	132904	132909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836896
2857	NC_021814	TCA	2	6	132919	132924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836896
2858	NC_021814	AGCA	2	8	132989	132996	50 %	0 %	25 %	25 %	525836896
2859	NC_021814	CCG	2	6	133051	133056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836896
2860	NC_021814	GC	3	6	133057	133062	0 %	0 %	50 %	50 %	525836896
2861	NC_021814	GC	3	6	133087	133092	0 %	0 %	50 %	50 %	525836896
2862	NC_021814	TCA	2	6	133122	133127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836896
2863	NC_021814	TCC	2	6	133191	133196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525836896
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2865	NC_021814	GCA	3	9	133327	133335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836896
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2988	NC_021814	AGAT	2	8	139105	139112	50 %	25 %	25 %	0 %	525840478
2989	NC_021814	CCA	2	6	139205	139210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525840478
2990	NC_021814	ATT	2	6	139338	139343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840479
2991	NC_021814	GC	3	6	139377	139382	0 %	0 %	50 %	50 %	525840479
2992	NC_021814	AAT	2	6	139403	139408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840479
2993	NC_021814	GCG	2	6	139417	139422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840479
2994	NC_021814	TAAT	2	8	139477	139484	50 %	50 %	0 %	0 %	525840479
2995	NC_021814	GTT	2	6	139502	139507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840479
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2998	NC_021814	TCA	2	6	139665	139670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840479
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3000	NC_021814	GCC	2	6	139896	139901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840479

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