MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021814	CGC	2	6	70240	70245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836845
1502	NC_021814	GGAGTT	2	12	70253	70264	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525836845
1503	NC_021814	GCC	2	6	70265	70270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836845
1504	NC_021814	TCG	2	6	70380	70385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1505	NC_021814	CAG	2	6	70418	70423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1506	NC_021814	CGC	2	6	70489	70494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836845
1507	NC_021814	CGC	2	6	70549	70554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836845
1508	NC_021814	CAG	2	6	70568	70573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1509	NC_021814	GCC	2	6	70574	70579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836845
1510	NC_021814	GC	3	6	70595	70600	0 %	0 %	50 %	50 %	525836845
1511	NC_021814	GA	3	6	70617	70622	50 %	0 %	50 %	0 %	525836845
1512	NC_021814	CAG	2	6	70625	70630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1513	NC_021814	CTG	2	6	70634	70639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1514	NC_021814	TCA	2	6	70644	70649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836845
1515	NC_021814	CGC	2	6	70657	70662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836845
1516	NC_021814	CAT	2	6	70702	70707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836845
1517	NC_021814	AGC	2	6	70738	70743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1518	NC_021814	TTG	2	6	70797	70802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836845
1519	NC_021814	ACGGT	2	10	70827	70836	20 %	20 %	40 %	20 %	525836845
1520	NC_021814	ATCA	2	8	70859	70866	50 %	25 %	0 %	25 %	525836845
1521	NC_021814	GATA	2	8	70897	70904	50 %	25 %	25 %	0 %	525836845
1522	NC_021814	GAT	2	6	70970	70975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836845
1523	NC_021814	CGCAG	2	10	70984	70993	20 %	0 %	40 %	40 %	525836845
1524	NC_021814	CAG	2	6	71087	71092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1525	NC_021814	CTC	2	6	71207	71212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525836845
1526	NC_021814	TGG	2	6	71218	71223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836845
1527	NC_021814	CAG	2	6	71246	71251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1528	NC_021814	AGA	2	6	71299	71304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836845
1529	NC_021814	TGG	2	6	71326	71331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836845
1530	NC_021814	CTG	2	6	71393	71398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1531	NC_021814	AGT	2	6	71404	71409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836845
1532	NC_021814	ATA	2	6	71415	71420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836845
1533	NC_021814	GGCT	2	8	71424	71431	0 %	25 %	50 %	25 %	525836845
1534	NC_021814	TCG	2	6	71454	71459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1535	NC_021814	CTT	2	6	71590	71595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836845
1536	NC_021814	GGC	2	6	71623	71628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836845
1537	NC_021814	TCCA	2	8	71640	71647	25 %	25 %	0 %	50 %	525836845
1538	NC_021814	ATGG	2	8	71656	71663	25 %	25 %	50 %	0 %	525836845
1539	NC_021814	GTC	2	6	71675	71680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1540	NC_021814	CCG	2	6	71709	71714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836845
1541	NC_021814	GGC	2	6	71876	71881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836845
1542	NC_021814	TGCC	2	8	71905	71912	0 %	25 %	25 %	50 %	525836845
1543	NC_021814	GC	3	6	71958	71963	0 %	0 %	50 %	50 %	525836845
1544	NC_021814	GTT	2	6	71984	71989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836845
1545	NC_021814	GGCG	2	8	71996	72003	0 %	0 %	75 %	25 %	525836845
1546	NC_021814	GAT	2	6	72026	72031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836845
1547	NC_021814	CAG	3	9	72047	72055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1548	NC_021814	TGT	2	6	72064	72069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836845
1549	NC_021814	GCG	2	6	72136	72141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836845
1550	NC_021814	GC	4	8	72162	72169	0 %	0 %	50 %	50 %	525836845
1551	NC_021814	TGG	2	6	72273	72278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836845
1552	NC_021814	CCG	2	6	72340	72345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836845
1553	NC_021814	CATA	2	8	72347	72354	50 %	25 %	0 %	25 %	525836845
1554	NC_021814	GTC	2	6	72407	72412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1555	NC_021814	CGG	2	6	72435	72440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836845
1556	NC_021814	CCG	2	6	72481	72486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836845
1557	NC_021814	GAG	2	6	72522	72527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525836845
1558	NC_021814	TTGG	2	8	72555	72562	0 %	50 %	50 %	0 %	525836845
1559	NC_021814	CTG	2	6	72596	72601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1560	NC_021814	TTC	3	9	72605	72613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836845
1561	NC_021814	CGG	2	6	72631	72636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836845
1562	NC_021814	ATC	2	6	72663	72668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836845
1563	NC_021814	GAAA	2	8	72721	72728	75 %	0 %	25 %	0 %	525836845
1564	NC_021814	TGC	2	6	72798	72803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836845
1565	NC_021814	ACA	2	6	72913	72918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836845
1566	NC_021814	GC	3	6	72966	72971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_021814	CAT	2	6	73005	73010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_021814	ATG	2	6	73094	73099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021814	T	6	6	73237	73242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021814	GCT	2	6	73251	73256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_021814	A	6	6	73416	73421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021814	ATC	2	6	73441	73446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_021814	ATGA	2	8	73456	73463	50 %	25 %	25 %	0 %	525840461
1574	NC_021814	TGG	2	6	73620	73625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836846
1575	NC_021814	GCA	3	9	73761	73769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836846
1576	NC_021814	AGC	2	6	73784	73789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836846
1577	NC_021814	TGC	2	6	73877	73882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836846
1578	NC_021814	GCCAG	2	10	73907	73916	20 %	0 %	40 %	40 %	525836846
1579	NC_021814	TCG	2	6	73919	73924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836846
1580	NC_021814	GCAG	2	8	73959	73966	25 %	0 %	50 %	25 %	525836846
1581	NC_021814	TAG	2	6	73967	73972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836846
1582	NC_021814	TG	3	6	73979	73984	0 %	50 %	50 %	0 %	525836846
1583	NC_021814	ACC	2	6	74095	74100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836846
1584	NC_021814	GT	3	6	74128	74133	0 %	50 %	50 %	0 %	525836846
1585	NC_021814	GCAG	2	8	74166	74173	25 %	0 %	50 %	25 %	525836846
1586	NC_021814	GTG	2	6	74197	74202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836846
1587	NC_021814	GGC	2	6	74282	74287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836846
1588	NC_021814	GAC	2	6	74305	74310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836846
1589	NC_021814	GAT	2	6	74331	74336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836846
1590	NC_021814	CGC	2	6	74345	74350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836846
1591	NC_021814	CAGC	2	8	74375	74382	25 %	0 %	25 %	50 %	525836846
1592	NC_021814	GCT	2	6	74397	74402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836846
1593	NC_021814	ACC	2	6	74505	74510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836846
1594	NC_021814	GTAGC	2	10	74512	74521	20 %	20 %	40 %	20 %	525836846
1595	NC_021814	TGA	2	6	74523	74528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021814	TAT	2	6	74580	74585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021814	TGA	3	9	74654	74662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840462
1598	NC_021814	TGG	2	6	74705	74710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840462
1599	NC_021814	TGC	2	6	74747	74752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840462
1600	NC_021814	T	6	6	74791	74796	0 %	100 %	0 %	0 %	525840462
1601	NC_021814	GTT	3	9	74836	74844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525840462
1602	NC_021814	AAC	2	6	74846	74851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525840462
1603	NC_021814	GGA	2	6	74895	74900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525840462
1604	NC_021814	GCGCGA	2	12	74904	74915	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525840462
1605	NC_021814	AGCGGA	2	12	74985	74996	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525840462
1606	NC_021814	GAA	2	6	75043	75048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525840462
1607	NC_021814	T	6	6	75116	75121	0 %	100 %	0 %	0 %	525840462
1608	NC_021814	GCG	2	6	75235	75240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840462
1609	NC_021814	CGA	2	6	75258	75263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840462
1610	NC_021814	CGGA	2	8	75317	75324	25 %	0 %	50 %	25 %	525840462
1611	NC_021814	TTA	2	6	75357	75362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840462
1612	NC_021814	GC	3	6	75444	75449	0 %	0 %	50 %	50 %	525840462
1613	NC_021814	TCG	2	6	75515	75520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840462
1614	NC_021814	CTG	2	6	75535	75540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840462
1615	NC_021814	CCG	2	6	75554	75559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840462
1616	NC_021814	CCG	2	6	75593	75598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525840462
1617	NC_021814	GCG	2	6	75648	75653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840462
1618	NC_021814	AACC	2	8	75670	75677	50 %	0 %	0 %	50 %	525840462
1619	NC_021814	GCA	2	6	75732	75737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840462
1620	NC_021814	CAG	2	6	75856	75861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525840462
1621	NC_021814	GC	3	6	75880	75885	0 %	0 %	50 %	50 %	525840462
1622	NC_021814	ATG	2	6	75887	75892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840462
1623	NC_021814	TGC	2	6	75902	75907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525840462
1624	NC_021814	TAT	2	6	75973	75978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525840462
1625	NC_021814	CGG	2	6	75996	76001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840462
1626	NC_021814	GCG	2	6	76064	76069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525840462
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1628	NC_021814	TGA	2	6	76161	76166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840462
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1647	NC_021814	TTA	2	6	77015	77020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1651	NC_021814	ATT	2	6	77136	77141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1751	NC_021814	TGG	2	6	81892	81897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836853
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