MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_021814	ATC	2	6	453615	453620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837143
9502	NC_021814	GTC	2	6	453679	453684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837143
9503	NC_021814	GTC	2	6	453703	453708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837143
9504	NC_021814	TGGC	2	8	453794	453801	0 %	25 %	50 %	25 %	525837143
9505	NC_021814	CGG	2	6	453838	453843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837143
9506	NC_021814	CTG	2	6	453939	453944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837144
9507	NC_021814	GAA	2	6	453951	453956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837144
9508	NC_021814	GCA	2	6	454025	454030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837144
9509	NC_021814	CGA	2	6	454063	454068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837144
9510	NC_021814	AGC	2	6	454176	454181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837144
9511	NC_021814	GGC	2	6	454200	454205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837144
9512	NC_021814	GC	3	6	454237	454242	0 %	0 %	50 %	50 %	525837144
9513	NC_021814	CCGGAG	2	12	454284	454295	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525837144
9514	NC_021814	ACTTT	2	10	454329	454338	20 %	60 %	0 %	20 %	525837144
9515	NC_021814	TCCC	2	8	454350	454357	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9516	NC_021814	C	6	6	454355	454360	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9517	NC_021814	TTGC	2	8	454382	454389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9518	NC_021814	AGC	2	6	454469	454474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9519	NC_021814	T	6	6	454477	454482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_021814	TTC	2	6	454520	454525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9521	NC_021814	CTC	2	6	454534	454539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9522	NC_021814	CGACGC	2	12	454546	454557	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9523	NC_021814	ATTTC	2	10	454564	454573	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9524	NC_021814	TGT	2	6	454640	454645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9525	NC_021814	GT	4	8	454656	454663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9526	NC_021814	GC	3	6	454665	454670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9527	NC_021814	GCAAA	2	10	454712	454721	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9528	NC_021814	TAA	2	6	454727	454732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_021814	CAA	2	6	454739	454744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9530	NC_021814	CAA	2	6	454819	454824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837145
9531	NC_021814	GTG	2	6	454887	454892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837145
9532	NC_021814	T	6	6	455002	455007	0 %	100 %	0 %	0 %	525837145
9533	NC_021814	GGCT	2	8	455049	455056	0 %	25 %	50 %	25 %	525837145
9534	NC_021814	ATT	2	6	455160	455165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837145
9535	NC_021814	TGGT	2	8	455191	455198	0 %	50 %	50 %	0 %	525837145
9536	NC_021814	CTT	2	6	455212	455217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837145
9537	NC_021814	TTG	2	6	455236	455241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837145
9538	NC_021814	CGG	2	6	455272	455277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837145
9539	NC_021814	GCTG	2	8	455335	455342	0 %	25 %	50 %	25 %	525837145
9540	NC_021814	TCT	3	9	455368	455376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837145
9541	NC_021814	ATC	3	9	455394	455402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837145
9542	NC_021814	AAGA	2	8	455457	455464	75 %	0 %	25 %	0 %	525837145
9543	NC_021814	GGC	2	6	455484	455489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837145
9544	NC_021814	GC	3	6	455488	455493	0 %	0 %	50 %	50 %	525837145
9545	NC_021814	GCT	2	6	455564	455569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837145
9546	NC_021814	ATG	2	6	455580	455585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837145
9547	NC_021814	TTA	2	6	455635	455640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837145
9548	NC_021814	GC	3	6	455667	455672	0 %	0 %	50 %	50 %	525837145
9549	NC_021814	CGG	2	6	455732	455737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837145
9550	NC_021814	CAT	2	6	455750	455755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837145
9551	NC_021814	CGT	2	6	455772	455777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837145
9552	NC_021814	CG	3	6	455795	455800	0 %	0 %	50 %	50 %	525837145
9553	NC_021814	GAT	2	6	455873	455878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837145
9554	NC_021814	CTT	2	6	455900	455905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837145
9555	NC_021814	TGGGC	2	10	455926	455935	0 %	20 %	60 %	20 %	525837145
9556	NC_021814	CGG	2	6	455978	455983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837145
9557	NC_021814	CAC	2	6	456050	456055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837145
9558	NC_021814	TGG	2	6	456100	456105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837145
9559	NC_021814	CAT	2	6	456107	456112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837145
9560	NC_021814	TTA	2	6	456201	456206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837146
9561	NC_021814	CGG	2	6	456259	456264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837146
9562	NC_021814	CGCC	2	8	456406	456413	0 %	0 %	25 %	75 %	525837146
9563	NC_021814	GTG	2	6	456422	456427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837146
9564	NC_021814	CAG	2	6	456428	456433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837146
9565	NC_021814	GCT	2	6	456452	456457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837146
9566	NC_021814	GCG	2	6	456527	456532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837146
9567	NC_021814	TCT	2	6	456627	456632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837146
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9569	NC_021814	GCG	2	6	456798	456803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837146
9570	NC_021814	TGC	2	6	456804	456809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837146
9571	NC_021814	CG	3	6	456836	456841	0 %	0 %	50 %	50 %	525837146
9572	NC_021814	A	7	7	456844	456850	100 %	0 %	0 %	0 %	525837146
9573	NC_021814	CG	3	6	456862	456867	0 %	0 %	50 %	50 %	525837146
9574	NC_021814	ATG	2	6	456933	456938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837146
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9580	NC_021814	CGGCG	2	10	457237	457246	0 %	0 %	60 %	40 %	525837146
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9583	NC_021814	GGC	2	6	457430	457435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837146
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9585	NC_021814	ATG	2	6	457443	457448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837146
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9587	NC_021814	ACG	2	6	457555	457560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837147
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9593	NC_021814	A	6	6	457715	457720	100 %	0 %	0 %	0 %	525837147
9594	NC_021814	TGG	3	9	457751	457759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837147
9595	NC_021814	CCG	2	6	457793	457798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837147
9596	NC_021814	GCGG	2	8	457825	457832	0 %	0 %	75 %	25 %	525837147
9597	NC_021814	TCGCT	2	10	457934	457943	0 %	40 %	20 %	40 %	525837147
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9602	NC_021814	GGCG	2	8	458172	458179	0 %	0 %	75 %	25 %	525837147
9603	NC_021814	AAG	2	6	458180	458185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837147
9604	NC_021814	GC	3	6	458227	458232	0 %	0 %	50 %	50 %	525837147
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9607	NC_021814	CG	3	6	458377	458382	0 %	0 %	50 %	50 %	525837147
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9612	NC_021814	CGAT	2	8	458630	458637	25 %	25 %	25 %	25 %	525837147
9613	NC_021814	CAAC	2	8	458661	458668	50 %	0 %	0 %	50 %	525837147
9614	NC_021814	GGC	2	6	458698	458703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837147
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9619	NC_021814	ATA	2	6	458852	458857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837147
9620	NC_021814	TTC	2	6	458908	458913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9621	NC_021814	GAC	2	6	458950	458955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9622	NC_021814	GCTG	2	8	459077	459084	0 %	25 %	50 %	25 %	525837148
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9998	NC_021814	CGGG	2	8	478479	478486	0 %	0 %	75 %	25 %	525840540
9999	NC_021814	TAC	2	6	478492	478497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525840540
10000	NC_021814	CGAT	2	8	478512	478519	25 %	25 %	25 %	25 %	525840540

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