MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021814	GC	3	6	25658	25663	0 %	0 %	50 %	50 %	525836807
502	NC_021814	TGT	2	6	25671	25676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836807
503	NC_021814	GC	3	6	25684	25689	0 %	0 %	50 %	50 %	525836807
504	NC_021814	TGGCG	2	10	25704	25713	0 %	20 %	60 %	20 %	525836807
505	NC_021814	CG	3	6	25787	25792	0 %	0 %	50 %	50 %	525836807
506	NC_021814	CGC	2	6	25794	25799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836807
507	NC_021814	TGC	2	6	25814	25819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836807
508	NC_021814	TGA	2	6	25847	25852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836807
509	NC_021814	CTG	2	6	25853	25858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836807
510	NC_021814	GCA	2	6	25875	25880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836807
511	NC_021814	TGG	2	6	25895	25900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836807
512	NC_021814	GCG	2	6	25958	25963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836807
513	NC_021814	GTT	2	6	26079	26084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836807
514	NC_021814	TTG	2	6	26135	26140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836808
515	NC_021814	CG	3	6	26163	26168	0 %	0 %	50 %	50 %	525836808
516	NC_021814	TTC	2	6	26190	26195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836808
517	NC_021814	GGC	2	6	26284	26289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836808
518	NC_021814	TTC	2	6	26322	26327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836808
519	NC_021814	GGCG	2	8	26362	26369	0 %	0 %	75 %	25 %	525836808
520	NC_021814	GC	3	6	26469	26474	0 %	0 %	50 %	50 %	525836808
521	NC_021814	CGAAAG	2	12	26557	26568	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525836808
522	NC_021814	GGT	2	6	26590	26595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836808
523	NC_021814	CGA	2	6	26608	26613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836808
524	NC_021814	TAT	2	6	26626	26631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836808
525	NC_021814	GT	3	6	26651	26656	0 %	50 %	50 %	0 %	525836808
526	NC_021814	CGC	2	6	26677	26682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836808
527	NC_021814	CTGGCG	2	12	26759	26770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525836808
528	NC_021814	TGC	2	6	26778	26783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836808
529	NC_021814	GCT	2	6	26845	26850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836808
530	NC_021814	GC	4	8	26953	26960	0 %	0 %	50 %	50 %	525836808
531	NC_021814	GAC	2	6	27022	27027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836808
532	NC_021814	CGA	2	6	27070	27075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836808
533	NC_021814	CATTAT	2	12	27148	27159	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525836808
534	NC_021814	AAT	2	6	27176	27181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836808
535	NC_021814	ATC	2	6	27186	27191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836808
536	NC_021814	GCC	2	6	27192	27197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836808
537	NC_021814	TGC	2	6	27201	27206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836808
538	NC_021814	TAAG	2	8	27225	27232	50 %	25 %	25 %	0 %	525836808
539	NC_021814	CGC	2	6	27264	27269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836808
540	NC_021814	TGG	2	6	27276	27281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836808
541	NC_021814	TCA	2	6	27415	27420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836808
542	NC_021814	GAA	2	6	27485	27490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836808
543	NC_021814	CGT	2	6	27577	27582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836808
544	NC_021814	ATG	2	6	27584	27589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836808
545	NC_021814	CGC	2	6	27639	27644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_021814	T	6	6	27674	27679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021814	GA	3	6	27690	27695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021814	GCT	2	6	27758	27763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836809
549	NC_021814	GCC	2	6	27855	27860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836809
550	NC_021814	ATA	2	6	27910	27915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836809
551	NC_021814	GCC	2	6	27921	27926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836809
552	NC_021814	GGC	2	6	27936	27941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836809
553	NC_021814	CGCTGG	2	12	27964	27975	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525836809
554	NC_021814	GACCT	2	10	28017	28026	20 %	20 %	20 %	40 %	525836809
555	NC_021814	AGC	2	6	28065	28070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
556	NC_021814	CG	3	6	28179	28184	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
557	NC_021814	TC	3	6	28253	28258	0 %	50 %	0 %	50 %	525836809
558	NC_021814	GCA	2	6	28271	28276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
559	NC_021814	GGAT	2	8	28294	28301	25 %	25 %	50 %	0 %	525836809
560	NC_021814	GAC	2	6	28311	28316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
561	NC_021814	CGA	2	6	28352	28357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
562	NC_021814	GGA	2	6	28467	28472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525836809
563	NC_021814	GCG	2	6	28492	28497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836809
564	NC_021814	ACG	2	6	28518	28523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
565	NC_021814	TGTC	2	8	28531	28538	0 %	50 %	25 %	25 %	525836809
566	NC_021814	AGC	2	6	28567	28572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
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568	NC_021814	GCA	2	6	28661	28666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
569	NC_021814	CGG	2	6	28673	28678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836809
570	NC_021814	CA	3	6	28686	28691	50 %	0 %	0 %	50 %	525836809
571	NC_021814	GGC	2	6	28760	28765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836809
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573	NC_021814	AGA	2	6	28961	28966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836809
574	NC_021814	GCA	2	6	28988	28993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
575	NC_021814	CG	3	6	29022	29027	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
576	NC_021814	GTTG	2	8	29062	29069	0 %	50 %	50 %	0 %	525836809
577	NC_021814	CAAAG	2	10	29114	29123	60 %	0 %	20 %	20 %	525836809
578	NC_021814	CG	4	8	29132	29139	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
579	NC_021814	CGA	2	6	29168	29173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
580	NC_021814	CGA	2	6	29207	29212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
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590	NC_021814	TTA	2	6	29764	29769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836809
591	NC_021814	GC	3	6	29824	29829	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
592	NC_021814	ACG	2	6	29889	29894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
593	NC_021814	CCG	2	6	29967	29972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836809
594	NC_021814	TAAA	2	8	30112	30119	75 %	25 %	0 %	0 %	525836809
595	NC_021814	TTA	2	6	30225	30230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836809
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597	NC_021814	CAA	2	6	30300	30305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836809
598	NC_021814	GC	3	6	30337	30342	0 %	0 %	50 %	50 %	525836809
599	NC_021814	TGGC	2	8	30345	30352	0 %	25 %	50 %	25 %	525836809
600	NC_021814	GCG	2	6	30369	30374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836809
601	NC_021814	CAG	2	6	30447	30452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836809
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605	NC_021814	TAC	2	6	30582	30587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836809
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607	NC_021814	TGGC	2	8	30668	30675	0 %	25 %	50 %	25 %	525836809
608	NC_021814	GAAC	2	8	30846	30853	50 %	0 %	25 %	25 %	525836809
609	NC_021814	GTA	2	6	30877	30882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836809
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611	NC_021814	TGA	2	6	30986	30991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836809
612	NC_021814	ACGC	2	8	31013	31020	25 %	0 %	25 %	50 %	525836809
613	NC_021814	GCT	2	6	31079	31084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836809
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617	NC_021814	CGC	3	9	31325	31333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836809
618	NC_021814	CGGCG	2	10	31355	31364	0 %	0 %	60 %	40 %	525836809
619	NC_021814	GCC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836809
620	NC_021814	CCGGT	2	10	31432	31441	0 %	20 %	40 %	40 %	525836809
621	NC_021814	AAAG	2	8	31482	31489	75 %	0 %	25 %	0 %	525836809
622	NC_021814	AAC	2	6	31581	31586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021814	GCG	2	6	31677	31682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836810
624	NC_021814	AGA	2	6	31793	31798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836810
625	NC_021814	CAT	2	6	31802	31807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836810
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887	NC_021814	GAA	2	6	43097	43102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836820
888	NC_021814	GTA	2	6	43152	43157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836820
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932	NC_021814	ATA	3	9	45240	45248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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986	NC_021814	CAGGC	2	10	47461	47470	20 %	0 %	40 %	40 %	525836824
987	NC_021814	CAT	2	6	47471	47476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836824
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993	NC_021814	CGG	2	6	47555	47560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836824
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996	NC_021814	CAC	2	6	47622	47627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836824
997	NC_021814	GC	3	6	47668	47673	0 %	0 %	50 %	50 %	525836824
998	NC_021814	GCGCTG	2	12	47703	47714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525836824
999	NC_021814	CGC	2	6	47815	47820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836824
1000	NC_021814	GCT	2	6	47864	47869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836824

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