MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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70005	NC_021814	GC	3	6	3328710	3328715	0 %	0 %	50 %	50 %	525839335
70006	NC_021814	GCC	2	6	3328793	3328798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839335
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70010	NC_021814	CGG	2	6	3329128	3329133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839336
70011	NC_021814	GGC	2	6	3329168	3329173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839336
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70047	NC_021814	T	9	9	3330414	3330422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70238	NC_021814	ACC	2	6	3339370	3339375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839343
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70241	NC_021814	CGA	2	6	3339443	3339448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839343
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70244	NC_021814	GC	3	6	3339530	3339535	0 %	0 %	50 %	50 %	525839343
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70263	NC_021814	CTGG	2	8	3340295	3340302	0 %	25 %	50 %	25 %	525839344
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70292	NC_021814	GGT	2	6	3341554	3341559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525841102
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70294	NC_021814	AGC	2	6	3341703	3341708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525839345
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70297	NC_021814	CATC	2	8	3341802	3341809	25 %	25 %	0 %	50 %	525839345
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70302	NC_021814	CGG	2	6	3342126	3342131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525839345
70303	NC_021814	AAC	3	9	3342172	3342180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525839345
70304	NC_021814	TGG	2	6	3342362	3342367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839345
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70308	NC_021814	TGTT	2	8	3342505	3342512	0 %	75 %	25 %	0 %	525839345
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70310	NC_021814	GC	3	6	3342594	3342599	0 %	0 %	50 %	50 %	525839345
70311	NC_021814	TACGCA	2	12	3342624	3342635	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525839345
70312	NC_021814	CCG	2	6	3342768	3342773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839345
70313	NC_021814	T	6	6	3342795	3342800	0 %	100 %	0 %	0 %	525839345
70314	NC_021814	CCA	2	6	3342879	3342884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839345
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70317	NC_021814	GTA	2	6	3342994	3342999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525839345
70318	NC_021814	GTTC	2	8	3343011	3343018	0 %	50 %	25 %	25 %	525839345
70319	NC_021814	TCA	2	6	3343052	3343057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839345
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70322	NC_021814	TGAAT	2	10	3343227	3343236	40 %	40 %	20 %	0 %	525839345
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70324	NC_021814	GGAC	2	8	3343311	3343318	25 %	0 %	50 %	25 %	525839345
70325	NC_021814	TCAAC	2	10	3343332	3343341	40 %	20 %	0 %	40 %	525839345
70326	NC_021814	GTT	2	6	3343414	3343419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525839345
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70329	NC_021814	ACTG	2	8	3343529	3343536	25 %	25 %	25 %	25 %	525839345
70330	NC_021814	TGCATC	2	12	3343544	3343555	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525839345
70331	NC_021814	ACC	2	6	3343568	3343573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525839345
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70333	NC_021814	TGG	4	12	3343614	3343625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525839345
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70335	NC_021814	CCG	2	6	3343722	3343727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525839345
70336	NC_021814	AGAC	2	8	3343737	3343744	50 %	0 %	25 %	25 %	525839345
70337	NC_021814	CTA	2	6	3343764	3343769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525839345
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70339	NC_021814	TGA	2	6	3343836	3343841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70340	NC_021814	ATT	3	9	3343866	3343874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70341	NC_021814	GCA	2	6	3343881	3343886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70342	NC_021814	TCG	2	6	3343901	3343906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70343	NC_021814	TAA	2	6	3343976	3343981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70344	NC_021814	TTAT	2	8	3343996	3344003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70345	NC_021814	GGA	2	6	3344004	3344009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70346	NC_021814	GCC	2	6	3344123	3344128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841103
70347	NC_021814	CTCTT	2	10	3344163	3344172	0 %	60 %	0 %	40 %	525841103
70348	NC_021814	CGG	2	6	3344177	3344182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525841103
70349	NC_021814	TGC	2	6	3344187	3344192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
70350	NC_021814	GCT	2	6	3344197	3344202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
70351	NC_021814	GAC	2	6	3344211	3344216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525841103
70352	NC_021814	GCT	3	9	3344239	3344247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
70353	NC_021814	TGC	2	6	3344250	3344255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
70354	NC_021814	ATC	2	6	3344256	3344261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525841103
70355	NC_021814	CTG	2	6	3344267	3344272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
70356	NC_021814	CGTC	2	8	3344290	3344297	0 %	25 %	25 %	50 %	525841103
70357	NC_021814	CCG	2	6	3344319	3344324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525841103
70358	NC_021814	CGT	2	6	3344341	3344346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
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70373	NC_021814	CCA	2	6	3344956	3344961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525841103
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70385	NC_021814	GCTG	2	8	3345417	3345424	0 %	25 %	50 %	25 %	525841103
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70388	NC_021814	GAT	2	6	3345497	3345502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525841103
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70414	NC_021814	TGC	2	6	3346554	3346559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525841103
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70419	NC_021814	TC	3	6	3346711	3346716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70420	NC_021814	CTT	2	6	3346789	3346794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525839346
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70422	NC_021814	CGCTG	2	10	3346931	3346940	0 %	20 %	40 %	40 %	525839346
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70457	NC_021814	GTC	2	6	3348231	3348236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525839346
70458	NC_021814	GC	3	6	3348239	3348244	0 %	0 %	50 %	50 %	525839346
70459	NC_021814	CG	3	6	3348247	3348252	0 %	0 %	50 %	50 %	525839346
70460	NC_021814	CTGA	2	8	3348268	3348275	25 %	25 %	25 %	25 %	525839346
70461	NC_021814	CG	3	6	3348308	3348313	0 %	0 %	50 %	50 %	525839346
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