MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021814	GCC	2	6	282448	282453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837016
6002	NC_021814	TTC	2	6	282492	282497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837016
6003	NC_021814	ATCA	2	8	282518	282525	50 %	25 %	0 %	25 %	525837016
6004	NC_021814	ATA	2	6	282565	282570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837016
6005	NC_021814	ATCAG	2	10	282588	282597	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6006	NC_021814	AG	3	6	282596	282601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_021814	AT	3	6	282618	282623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_021814	TGT	2	6	282688	282693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837017
6009	NC_021814	GA	4	8	282784	282791	50 %	0 %	50 %	0 %	525837017
6010	NC_021814	CAAT	2	8	282809	282816	50 %	25 %	0 %	25 %	525837017
6011	NC_021814	TTG	2	6	282817	282822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837017
6012	NC_021814	ATA	2	6	283003	283008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837017
6013	NC_021814	CGA	2	6	283018	283023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837017
6014	NC_021814	CA	3	6	283045	283050	50 %	0 %	0 %	50 %	525837017
6015	NC_021814	ATA	2	6	283074	283079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837017
6016	NC_021814	TCG	2	6	283112	283117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837017
6017	NC_021814	AAC	2	6	283125	283130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837017
6018	NC_021814	TTG	2	6	283188	283193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837017
6019	NC_021814	GT	3	6	283194	283199	0 %	50 %	50 %	0 %	525837017
6020	NC_021814	A	6	6	283259	283264	100 %	0 %	0 %	0 %	525837017
6021	NC_021814	CCG	2	6	283265	283270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837017
6022	NC_021814	AGT	2	6	283335	283340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837017
6023	NC_021814	TAA	2	6	283455	283460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_021814	T	6	6	283480	283485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_021814	AAAT	2	8	283498	283505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_021814	TTTAA	2	10	283509	283518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_021814	A	6	6	283536	283541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_021814	ATT	2	6	283551	283556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_021814	T	7	7	283564	283570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_021814	GAC	2	6	283638	283643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_021814	AAT	2	6	283863	283868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837018
6032	NC_021814	CAA	3	9	283891	283899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837018
6033	NC_021814	CG	3	6	283921	283926	0 %	0 %	50 %	50 %	525837018
6034	NC_021814	TTA	2	6	283992	283997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837018
6035	NC_021814	A	6	6	284021	284026	100 %	0 %	0 %	0 %	525837018
6036	NC_021814	TGAA	2	8	284027	284034	50 %	25 %	25 %	0 %	525837018
6037	NC_021814	GCG	2	6	284068	284073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837018
6038	NC_021814	AATT	2	8	284094	284101	50 %	50 %	0 %	0 %	525837018
6039	NC_021814	CAA	2	6	284167	284172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837018
6040	NC_021814	GTT	2	6	284226	284231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837018
6041	NC_021814	AAT	2	6	284263	284268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837018
6042	NC_021814	ATC	3	9	284312	284320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837018
6043	NC_021814	CGG	2	6	284351	284356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837018
6044	NC_021814	ACA	2	6	284379	284384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837018
6045	NC_021814	ATG	2	6	284420	284425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837018
6046	NC_021814	TGT	2	6	284460	284465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837018
6047	NC_021814	CGTT	2	8	284475	284482	0 %	50 %	25 %	25 %	525837018
6048	NC_021814	TGA	2	6	284501	284506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837018
6049	NC_021814	TGAT	2	8	284567	284574	25 %	50 %	25 %	0 %	525837018
6050	NC_021814	CCGC	2	8	284684	284691	0 %	0 %	25 %	75 %	525837018
6051	NC_021814	ATC	2	6	284741	284746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837018
6052	NC_021814	TAA	2	6	284781	284786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837018
6053	NC_021814	T	6	6	284952	284957	0 %	100 %	0 %	0 %	525837018
6054	NC_021814	CGC	2	6	285075	285080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_021814	ACA	2	6	285087	285092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_021814	A	6	6	285123	285128	100 %	0 %	0 %	0 %	525837019
6057	NC_021814	TCT	2	6	285157	285162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837019
6058	NC_021814	AACG	2	8	285186	285193	50 %	0 %	25 %	25 %	525837019
6059	NC_021814	TGA	2	6	285218	285223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837019
6060	NC_021814	CCCG	2	8	285339	285346	0 %	0 %	25 %	75 %	525837019
6061	NC_021814	TGG	2	6	285399	285404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837019
6062	NC_021814	AAGG	2	8	285423	285430	50 %	0 %	50 %	0 %	525837019
6063	NC_021814	CTGA	2	8	285444	285451	25 %	25 %	25 %	25 %	525837019
6064	NC_021814	GAC	2	6	285458	285463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837019
6065	NC_021814	G	6	6	285584	285589	0 %	0 %	100 %	0 %	525837019
6066	NC_021814	TGA	2	6	285605	285610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837019
6067	NC_021814	TGCCG	2	10	285611	285620	0 %	20 %	40 %	40 %	525837019
6068	NC_021814	TAT	2	6	285648	285653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837019
6069	NC_021814	GCCA	2	8	285711	285718	25 %	0 %	25 %	50 %	525837019
6070	NC_021814	AAC	2	6	285751	285756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837019
6071	NC_021814	GAA	2	6	285887	285892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837019
6072	NC_021814	TGA	2	6	285908	285913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837019
6073	NC_021814	CAG	2	6	285969	285974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837019
6074	NC_021814	GCT	2	6	286005	286010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837019
6075	NC_021814	A	6	6	286058	286063	100 %	0 %	0 %	0 %	525837019
6076	NC_021814	TCT	2	6	286093	286098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837019
6077	NC_021814	CGG	2	6	286120	286125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837019
6078	NC_021814	G	6	6	286283	286288	0 %	0 %	100 %	0 %	525837019
6079	NC_021814	ATC	2	6	286323	286328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837019
6080	NC_021814	CAT	2	6	286329	286334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837019
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6082	NC_021814	ATG	2	6	286366	286371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837019
6083	NC_021814	CA	3	6	286499	286504	50 %	0 %	0 %	50 %	525837019
6084	NC_021814	GGC	2	6	286529	286534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837019
6085	NC_021814	CGT	2	6	286560	286565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837019
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6087	NC_021814	GCA	2	6	286650	286655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837019
6088	NC_021814	AGC	2	6	286683	286688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837019
6089	NC_021814	AAT	2	6	286855	286860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837019
6090	NC_021814	ATT	2	6	286881	286886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_021814	CGC	2	6	286954	286959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837020
6092	NC_021814	TAC	2	6	287015	287020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837020
6093	NC_021814	TGAC	2	8	287092	287099	25 %	25 %	25 %	25 %	525837020
6094	NC_021814	A	8	8	287205	287212	100 %	0 %	0 %	0 %	525837020
6095	NC_021814	CGC	2	6	287249	287254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837020
6096	NC_021814	TTCA	2	8	287369	287376	25 %	50 %	0 %	25 %	525837020
6097	NC_021814	TCA	2	6	287379	287384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837020
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6099	NC_021814	AACG	2	8	287419	287426	50 %	0 %	25 %	25 %	525837020
6100	NC_021814	CAC	2	6	287465	287470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837020
6101	NC_021814	ACCC	2	8	287498	287505	25 %	0 %	0 %	75 %	525837020
6102	NC_021814	C	6	6	287521	287526	0 %	0 %	0 %	100 %	525837020
6103	NC_021814	GCC	2	6	287541	287546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837020
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6106	NC_021814	GCG	2	6	287692	287697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837020
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6108	NC_021814	AT	3	6	287821	287826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_021814	GAA	2	6	287829	287834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_021814	AGCG	2	8	287842	287849	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_021814	AGG	2	6	287865	287870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_021814	GCG	2	6	287964	287969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837021
6113	NC_021814	TAT	2	6	287978	287983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837021
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6115	NC_021814	T	7	7	288149	288155	0 %	100 %	0 %	0 %	525837021
6116	NC_021814	ATT	2	6	288165	288170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837021
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6122	NC_021814	CTT	2	6	288432	288437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837021
6123	NC_021814	CTT	2	6	288452	288457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837021
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6251	NC_021814	TA	3	6	294614	294619	50 %	50 %	0 %	0 %	525837025
6252	NC_021814	CCGATG	2	12	294626	294637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525837025
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6373	NC_021814	GGT	2	6	301029	301034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
6374	NC_021814	CAA	2	6	301042	301047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837033
6375	NC_021814	TGG	2	6	301087	301092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
6376	NC_021814	A	7	7	301194	301200	100 %	0 %	0 %	0 %	525837033
6377	NC_021814	GGT	2	6	301307	301312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
6378	NC_021814	GTA	2	6	301380	301385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837033
6379	NC_021814	TGG	2	6	301423	301428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
6380	NC_021814	AATG	2	8	301430	301437	50 %	25 %	25 %	0 %	525837033
6381	NC_021814	GGAC	2	8	301448	301455	25 %	0 %	50 %	25 %	525837033
6382	NC_021814	ACC	2	6	301575	301580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837033
6383	NC_021814	CCG	2	6	301759	301764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837033
6384	NC_021814	ACGGT	2	10	301771	301780	20 %	20 %	40 %	20 %	525837033
6385	NC_021814	GTG	2	6	301782	301787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837033
6386	NC_021814	TTC	2	6	301790	301795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837033
6387	NC_021814	CAAC	2	8	302016	302023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6388	NC_021814	TAT	2	6	302026	302031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6389	NC_021814	ATC	2	6	302042	302047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6390	NC_021814	A	6	6	302246	302251	100 %	0 %	0 %	0 %	525837034
6391	NC_021814	TTC	2	6	302300	302305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837034
6392	NC_021814	GGC	2	6	302336	302341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837034
6393	NC_021814	ATT	3	9	302344	302352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837034
6394	NC_021814	TTG	2	6	302353	302358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837034
6395	NC_021814	A	6	6	302359	302364	100 %	0 %	0 %	0 %	525837034
6396	NC_021814	CTGG	2	8	302428	302435	0 %	25 %	50 %	25 %	525837034
6397	NC_021814	CAGC	2	8	302464	302471	25 %	0 %	25 %	50 %	525837034
6398	NC_021814	GAC	2	6	302490	302495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837034
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6402	NC_021814	CT	3	6	302613	302618	0 %	50 %	0 %	50 %	525837034
6403	NC_021814	A	6	6	302646	302651	100 %	0 %	0 %	0 %	525837034
6404	NC_021814	GAT	2	6	302736	302741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837034
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6409	NC_021814	A	6	6	303060	303065	100 %	0 %	0 %	0 %	525837034
6410	NC_021814	CGT	2	6	303081	303086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837034
6411	NC_021814	TTA	2	6	303094	303099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837034
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6414	NC_021814	AAG	2	6	303216	303221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525837035
6415	NC_021814	AG	3	6	303220	303225	50 %	0 %	50 %	0 %	525837035
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6484	NC_021814	GCAA	2	8	306404	306411	50 %	0 %	25 %	25 %	525837038
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6491	NC_021814	GC	3	6	306752	306757	0 %	0 %	50 %	50 %	525837039
6492	NC_021814	CA	3	6	306767	306772	50 %	0 %	0 %	50 %	525837039
6493	NC_021814	CGC	2	6	306841	306846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837039
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6495	NC_021814	GGC	2	6	306929	306934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837039
6496	NC_021814	TGG	2	6	306937	306942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837039
6497	NC_021814	CAG	2	6	307029	307034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837039
6498	NC_021814	GCC	2	6	307065	307070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837039
6499	NC_021814	GC	3	6	307076	307081	0 %	0 %	50 %	50 %	525837039
6500	NC_021814	CGG	3	9	307156	307164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837039

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