MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021814	TTG	2	6	256833	256838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836995
5502	NC_021814	TCC	2	6	256907	256912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525836995
5503	NC_021814	AAAAC	2	10	256916	256925	80 %	0 %	0 %	20 %	525836995
5504	NC_021814	CGT	2	6	257032	257037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836996
5505	NC_021814	GAA	2	6	257089	257094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836996
5506	NC_021814	CG	3	6	257103	257108	0 %	0 %	50 %	50 %	525836996
5507	NC_021814	GAT	2	6	257116	257121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836996
5508	NC_021814	GCG	2	6	257136	257141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836996
5509	NC_021814	TCC	2	6	257165	257170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525836996
5510	NC_021814	GCG	2	6	257177	257182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836996
5511	NC_021814	GC	3	6	257187	257192	0 %	0 %	50 %	50 %	525836996
5512	NC_021814	ATT	2	6	257234	257239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836996
5513	NC_021814	GGC	2	6	257242	257247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836996
5514	NC_021814	ACC	2	6	257252	257257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836996
5515	NC_021814	CT	3	6	257285	257290	0 %	50 %	0 %	50 %	525836996
5516	NC_021814	GT	3	6	257361	257366	0 %	50 %	50 %	0 %	525836996
5517	NC_021814	GC	3	6	257385	257390	0 %	0 %	50 %	50 %	525836996
5518	NC_021814	CCG	2	6	257492	257497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836996
5519	NC_021814	GTG	2	6	257564	257569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836996
5520	NC_021814	CGC	2	6	257589	257594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836996
5521	NC_021814	CGGT	2	8	257610	257617	0 %	25 %	50 %	25 %	525836996
5522	NC_021814	CTA	2	6	257755	257760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836996
5523	NC_021814	GC	3	6	257805	257810	0 %	0 %	50 %	50 %	525836996
5524	NC_021814	CGAC	2	8	257820	257827	25 %	0 %	25 %	50 %	525836996
5525	NC_021814	CGA	2	6	257911	257916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836996
5526	NC_021814	ACG	2	6	258012	258017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836996
5527	NC_021814	ATC	2	6	258227	258232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836996
5528	NC_021814	TGT	2	6	258248	258253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836996
5529	NC_021814	CG	3	6	258387	258392	0 %	0 %	50 %	50 %	525836996
5530	NC_021814	TAT	2	6	258427	258432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836996
5531	NC_021814	GTG	2	6	258449	258454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836996
5532	NC_021814	GTAC	2	8	258563	258570	25 %	25 %	25 %	25 %	525836996
5533	NC_021814	GTG	2	6	258611	258616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836996
5534	NC_021814	TTG	2	6	258722	258727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836997
5535	NC_021814	CGG	2	6	258785	258790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836997
5536	NC_021814	CTT	2	6	258799	258804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836997
5537	NC_021814	CGA	2	6	258891	258896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836997
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5539	NC_021814	C	6	6	258929	258934	0 %	0 %	0 %	100 %	525836997
5540	NC_021814	GAA	2	6	258990	258995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836997
5541	NC_021814	GAT	2	6	259065	259070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836997
5542	NC_021814	TGC	2	6	259095	259100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836997
5543	NC_021814	GGC	2	6	259195	259200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836998
5544	NC_021814	CGC	2	6	259479	259484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836998
5545	NC_021814	GC	3	6	259533	259538	0 %	0 %	50 %	50 %	525836998
5546	NC_021814	GCGT	2	8	259591	259598	0 %	25 %	50 %	25 %	525836998
5547	NC_021814	ATT	2	6	259662	259667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836999
5548	NC_021814	CAG	3	9	259668	259676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836999
5549	NC_021814	GC	3	6	259695	259700	0 %	0 %	50 %	50 %	525836999
5550	NC_021814	GC	3	6	259726	259731	0 %	0 %	50 %	50 %	525836999
5551	NC_021814	GC	3	6	259748	259753	0 %	0 %	50 %	50 %	525836999
5552	NC_021814	GGT	2	6	259859	259864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836999
5553	NC_021814	GGT	2	6	259984	259989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_021814	GAT	2	6	260034	260039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837000
5555	NC_021814	GT	3	6	260064	260069	0 %	50 %	50 %	0 %	525837000
5556	NC_021814	AGCC	2	8	260113	260120	25 %	0 %	25 %	50 %	525837000
5557	NC_021814	CAT	2	6	260168	260173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837000
5558	NC_021814	GACGAA	2	12	260175	260186	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525837000
5559	NC_021814	TGCGC	2	10	260204	260213	0 %	20 %	40 %	40 %	525837000
5560	NC_021814	TAT	2	6	260259	260264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_021814	TA	3	6	260281	260286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_021814	ATT	2	6	260287	260292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_021814	TA	3	6	260293	260298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_021814	CT	4	8	260340	260347	0 %	50 %	0 %	50 %	525837001
5565	NC_021814	T	6	6	260359	260364	0 %	100 %	0 %	0 %	525837001
5566	NC_021814	GGC	2	6	260384	260389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837001
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5569	NC_021814	TGG	2	6	260626	260631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837001
5570	NC_021814	GGT	2	6	260645	260650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837001
5571	NC_021814	GAT	2	6	260678	260683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837001
5572	NC_021814	ACC	2	6	260967	260972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837001
5573	NC_021814	TGA	2	6	260998	261003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837001
5574	NC_021814	GTC	2	6	261126	261131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837001
5575	NC_021814	CAT	2	6	261180	261185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837001
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5577	NC_021814	AAT	2	6	261367	261372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837001
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5581	NC_021814	T	6	6	261506	261511	0 %	100 %	0 %	0 %	525837002
5582	NC_021814	GCT	2	6	261541	261546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837002
5583	NC_021814	GCGG	2	8	261552	261559	0 %	0 %	75 %	25 %	525837002
5584	NC_021814	ACG	2	6	261581	261586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837002
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5586	NC_021814	CAG	2	6	261684	261689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837002
5587	NC_021814	GCA	2	6	261715	261720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837002
5588	NC_021814	T	6	6	261723	261728	0 %	100 %	0 %	0 %	525837002
5589	NC_021814	AGG	2	6	261741	261746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525837002
5590	NC_021814	CG	3	6	261764	261769	0 %	0 %	50 %	50 %	525837002
5591	NC_021814	GGC	2	6	261782	261787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837002
5592	NC_021814	CGG	2	6	261807	261812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837002
5593	NC_021814	TCA	2	6	261834	261839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837002
5594	NC_021814	TGCC	2	8	261961	261968	0 %	25 %	25 %	50 %	525837002
5595	NC_021814	GAGC	2	8	261970	261977	25 %	0 %	50 %	25 %	525837002
5596	NC_021814	AAGCG	2	10	262083	262092	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5597	NC_021814	CAG	2	6	262094	262099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_021814	GAC	2	6	262117	262122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_021814	TAC	2	6	262125	262130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_021814	GTTC	2	8	262214	262221	0 %	50 %	25 %	25 %	525837003
5601	NC_021814	CCG	2	6	262262	262267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837003
5602	NC_021814	CAT	2	6	262337	262342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837003
5603	NC_021814	CAC	2	6	262356	262361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837003
5604	NC_021814	GTG	2	6	262425	262430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525837003
5605	NC_021814	CAG	2	6	262455	262460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837003
5606	NC_021814	GCGCC	2	10	262553	262562	0 %	0 %	40 %	60 %	525837003
5607	NC_021814	AAC	2	6	262573	262578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837003
5608	NC_021814	CGG	2	6	262680	262685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837003
5609	NC_021814	TG	3	6	262688	262693	0 %	50 %	50 %	0 %	525837003
5610	NC_021814	CAA	2	6	262736	262741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837003
5611	NC_021814	ATA	2	6	262834	262839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525837003
5612	NC_021814	CGC	3	9	262955	262963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837003
5613	NC_021814	TAT	2	6	263003	263008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837003
5614	NC_021814	GTG	3	9	263033	263041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_021814	AGC	2	6	263054	263059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_021814	GCT	2	6	263209	263214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_021814	ACC	2	6	263254	263259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525837004
5618	NC_021814	ATT	2	6	263283	263288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525837004
5619	NC_021814	CGG	2	6	263301	263306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837004
5620	NC_021814	GAC	4	12	263350	263361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837004
5621	NC_021814	CGA	2	6	263382	263387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837004
5622	NC_021814	CCG	2	6	263427	263432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837004
5623	NC_021814	GTT	2	6	263455	263460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525837004
5624	NC_021814	TCT	2	6	263489	263494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525837004
5625	NC_021814	CGC	2	6	263561	263566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837004
5626	NC_021814	GC	4	8	263565	263572	0 %	0 %	50 %	50 %	525837004
5627	NC_021814	GCT	2	6	263586	263591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837004
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5656	NC_021814	TGT	2	6	265146	265151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5657	NC_021814	ATA	2	6	265203	265208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5659	NC_021814	ATA	2	6	265369	265374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5661	NC_021814	ATT	2	6	265395	265400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5662	NC_021814	ATT	3	9	265512	265520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5663	NC_021814	TAT	2	6	265525	265530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5664	NC_021814	ATA	2	6	265545	265550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5665	NC_021814	AGCGA	2	10	265562	265571	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5671	NC_021814	ATA	2	6	265749	265754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5696	NC_021814	AGA	2	6	266934	266939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5728	NC_021814	CG	4	8	268106	268113	0 %	0 %	50 %	50 %	525837006
5729	NC_021814	AT	3	6	268279	268284	50 %	50 %	0 %	0 %	525837006
5730	NC_021814	CCAG	2	8	268373	268380	25 %	0 %	25 %	50 %	525837006
5731	NC_021814	TCG	2	6	268408	268413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837006
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5744	NC_021814	CAA	2	6	268958	268963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525837007
5745	NC_021814	TCA	2	6	269019	269024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837007
5746	NC_021814	CAGCGC	2	12	269030	269041	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525837007
5747	NC_021814	CG	3	6	269042	269047	0 %	0 %	50 %	50 %	525837007
5748	NC_021814	CCG	2	6	269091	269096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837007
5749	NC_021814	TCA	2	6	269149	269154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837007
5750	NC_021814	GC	3	6	269185	269190	0 %	0 %	50 %	50 %	525837007
5751	NC_021814	GCG	2	6	269385	269390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525837007
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5755	NC_021814	GC	3	6	269669	269674	0 %	0 %	50 %	50 %	525837007
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5766	NC_021814	AAAG	2	8	270142	270149	75 %	0 %	25 %	0 %	525837008
5767	NC_021814	CGC	2	6	270171	270176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525837008
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5867	NC_021814	A	6	6	275192	275197	100 %	0 %	0 %	0 %	525837010
5868	NC_021814	GAT	2	6	275236	275241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837010
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5997	NC_021814	CAT	2	6	282386	282391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525837016
5998	NC_021814	GCA	2	6	282405	282410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525837016
5999	NC_021814	GCT	2	6	282422	282427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525837016
6000	NC_021814	AGT	2	6	282433	282438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525837016

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