MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium var. 5- str. CFSAN001921

Total Repeats: 102537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021814	GAAAG	2	10	210033	210042	60 %	0 %	40 %	0 %	525836955
4502	NC_021814	ATG	2	6	210105	210110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836955
4503	NC_021814	TGC	2	6	210149	210154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836955
4504	NC_021814	CGC	2	6	210162	210167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836955
4505	NC_021814	CGC	2	6	210210	210215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836955
4506	NC_021814	AC	3	6	210262	210267	50 %	0 %	0 %	50 %	525836955
4507	NC_021814	GAA	2	6	210300	210305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836955
4508	NC_021814	TAAT	2	8	210320	210327	50 %	50 %	0 %	0 %	525836955
4509	NC_021814	TAA	2	6	210428	210433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836955
4510	NC_021814	T	6	6	210458	210463	0 %	100 %	0 %	0 %	525836956
4511	NC_021814	GAC	2	6	210542	210547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836956
4512	NC_021814	GGC	2	6	210584	210589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836956
4513	NC_021814	GCG	2	6	210663	210668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836956
4514	NC_021814	TAA	2	6	210682	210687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836956
4515	NC_021814	GCC	2	6	210690	210695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836956
4516	NC_021814	TCTT	2	8	210720	210727	0 %	75 %	0 %	25 %	525836956
4517	NC_021814	T	6	6	210761	210766	0 %	100 %	0 %	0 %	525836956
4518	NC_021814	TGC	2	6	211073	211078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836956
4519	NC_021814	TAC	2	6	211085	211090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836956
4520	NC_021814	TAAA	2	8	211096	211103	75 %	25 %	0 %	0 %	525836956
4521	NC_021814	TTCC	2	8	211132	211139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_021814	TTAT	2	8	211142	211149	25 %	75 %	0 %	0 %	525836957
4523	NC_021814	CTT	2	6	211235	211240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836957
4524	NC_021814	CAA	2	6	211349	211354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836957
4525	NC_021814	TTG	2	6	211410	211415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836957
4526	NC_021814	TCT	2	6	211427	211432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836957
4527	NC_021814	GAAATC	2	12	211569	211580	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525836957
4528	NC_021814	GCT	2	6	211661	211666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4529	NC_021814	GAA	2	6	211744	211749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836957
4530	NC_021814	GAT	2	6	211752	211757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836957
4531	NC_021814	GTC	2	6	211761	211766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4532	NC_021814	CTG	2	6	211863	211868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4533	NC_021814	GC	3	6	211916	211921	0 %	0 %	50 %	50 %	525836957
4534	NC_021814	AGC	2	6	211924	211929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4535	NC_021814	CTA	2	6	211973	211978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836957
4536	NC_021814	TCT	2	6	212038	212043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525836957
4537	NC_021814	GCA	2	6	212069	212074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4538	NC_021814	CG	3	6	212126	212131	0 %	0 %	50 %	50 %	525836957
4539	NC_021814	CAT	2	6	212160	212165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836957
4540	NC_021814	TTG	2	6	212248	212253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836957
4541	NC_021814	CGT	2	6	212270	212275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836957
4542	NC_021814	CCA	2	6	212295	212300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836957
4543	NC_021814	CGCC	2	8	212363	212370	0 %	0 %	25 %	75 %	525836957
4544	NC_021814	GCG	2	6	212435	212440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836957
4545	NC_021814	TAA	2	6	212495	212500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836957
4546	NC_021814	CAC	2	6	212568	212573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836957
4547	NC_021814	GTT	2	6	212622	212627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836957
4548	NC_021814	ATA	2	6	212755	212760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836957
4549	NC_021814	CCA	2	6	212774	212779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836957
4550	NC_021814	AT	3	6	212945	212950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_021814	TA	3	6	212956	212961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_021814	ATA	2	6	212974	212979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_021814	AAT	2	6	213005	213010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_021814	ATG	2	6	213046	213051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_021814	T	6	6	213087	213092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_021814	TGAG	2	8	213100	213107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_021814	TAG	2	6	213112	213117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_021814	ATT	2	6	213198	213203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_021814	CAC	2	6	213210	213215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_021814	ATTT	2	8	213236	213243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_021814	ATA	2	6	213363	213368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525840487
4562	NC_021814	TGG	2	6	213379	213384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525840487
4563	NC_021814	TAG	2	6	213385	213390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840487
4564	NC_021814	CGAA	2	8	213459	213466	50 %	0 %	25 %	25 %	525840487
4565	NC_021814	TGA	2	6	213499	213504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525840487
4566	NC_021814	ATG	2	6	213628	213633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836958
4567	NC_021814	GATC	2	8	213674	213681	25 %	25 %	25 %	25 %	525836958
4568	NC_021814	CCA	2	6	213719	213724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525836958
4569	NC_021814	GCC	2	6	213739	213744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836958
4570	NC_021814	GCC	2	6	213751	213756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836958
4571	NC_021814	CGC	2	6	213803	213808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836958
4572	NC_021814	A	6	6	213842	213847	100 %	0 %	0 %	0 %	525836958
4573	NC_021814	TGC	2	6	213959	213964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836958
4574	NC_021814	GCT	2	6	214061	214066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836958
4575	NC_021814	T	6	6	214070	214075	0 %	100 %	0 %	0 %	525836958
4576	NC_021814	ATA	2	6	214141	214146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836958
4577	NC_021814	GCG	2	6	214192	214197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836958
4578	NC_021814	GCA	2	6	214199	214204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836958
4579	NC_021814	AGC	2	6	214222	214227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836958
4580	NC_021814	GCG	2	6	214237	214242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836958
4581	NC_021814	GGC	2	6	214317	214322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836958
4582	NC_021814	TGA	2	6	214407	214412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_021814	TCA	2	6	214416	214421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_021814	TTC	2	6	214434	214439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_021814	GAA	2	6	214446	214451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_021814	CAT	2	6	214495	214500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836959
4587	NC_021814	GGC	2	6	214584	214589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836959
4588	NC_021814	GTG	3	9	214625	214633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836959
4589	NC_021814	TCCCGT	2	12	214789	214800	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525836959
4590	NC_021814	AAG	2	6	214812	214817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525836959
4591	NC_021814	CGG	2	6	214914	214919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836959
4592	NC_021814	TGG	2	6	214977	214982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836959
4593	NC_021814	GCG	2	6	215051	215056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836959
4594	NC_021814	TGTA	2	8	215187	215194	25 %	50 %	25 %	0 %	525836959
4595	NC_021814	TGT	2	6	215265	215270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836959
4596	NC_021814	GA	3	6	215383	215388	50 %	0 %	50 %	0 %	525836960
4597	NC_021814	CGG	2	6	215429	215434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836960
4598	NC_021814	CAGC	2	8	215448	215455	25 %	0 %	25 %	50 %	525836960
4599	NC_021814	AAT	2	6	215568	215573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836960
4600	NC_021814	CAA	2	6	215703	215708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525836960
4601	NC_021814	CCAG	2	8	215744	215751	25 %	0 %	25 %	50 %	525836960
4602	NC_021814	TGG	2	6	215774	215779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836960
4603	NC_021814	GCA	2	6	215792	215797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4604	NC_021814	TCG	2	6	215884	215889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4605	NC_021814	CAG	2	6	215977	215982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4606	NC_021814	GCA	2	6	215990	215995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4607	NC_021814	TGATC	2	10	216095	216104	20 %	40 %	20 %	20 %	525836960
4608	NC_021814	CGC	2	6	216129	216134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836960
4609	NC_021814	ATT	2	6	216162	216167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525836960
4610	NC_021814	AGC	2	6	216172	216177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836960
4611	NC_021814	GTT	2	6	216230	216235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836960
4612	NC_021814	TCA	2	6	216293	216298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836960
4613	NC_021814	CTA	2	6	216323	216328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836960
4614	NC_021814	CGG	2	6	216353	216358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836960
4615	NC_021814	TAA	2	6	216400	216405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836960
4616	NC_021814	CATA	2	8	216431	216438	50 %	25 %	0 %	25 %	525836960
4617	NC_021814	GCC	2	6	216521	216526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836961
4618	NC_021814	CCG	2	6	216597	216602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836961
4619	NC_021814	GTT	2	6	216612	216617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836961
4620	NC_021814	GTG	2	6	216618	216623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525836961
4621	NC_021814	GCGCC	2	10	216676	216685	0 %	0 %	40 %	60 %	525836961
4622	NC_021814	GCC	3	9	216776	216784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836961
4623	NC_021814	CAT	2	6	216797	216802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836961
4624	NC_021814	TTG	2	6	216842	216847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525836961
4625	NC_021814	CGC	2	6	217022	217027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525836961
4626	NC_021814	TCA	2	6	217035	217040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836961
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4628	NC_021814	CAGC	3	12	217080	217091	25 %	0 %	25 %	50 %	525836961
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4640	NC_021814	TGC	2	6	217661	217666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836962
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4652	NC_021814	CTTC	2	8	218160	218167	0 %	50 %	0 %	50 %	525836962
4653	NC_021814	TAA	2	6	218237	218242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525836962
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4656	NC_021814	CGT	2	6	218383	218388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836962
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4732	NC_021814	GTA	2	6	221941	221946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836967
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4734	NC_021814	TC	3	6	222131	222136	0 %	50 %	0 %	50 %	525836967
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4738	NC_021814	CG	3	6	222494	222499	0 %	0 %	50 %	50 %	525836967
4739	NC_021814	CGG	2	6	222512	222517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836967
4740	NC_021814	GTC	2	6	222600	222605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525836967
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4746	NC_021814	GC	3	6	222729	222734	0 %	0 %	50 %	50 %	525836967
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4869	NC_021814	ACT	2	6	228297	228302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525836973
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4991	NC_021814	GGC	2	6	234041	234046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525836976
4992	NC_021814	A	6	6	234120	234125	100 %	0 %	0 %	0 %	525836976
4993	NC_021814	CAG	2	6	234135	234140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836976
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4995	NC_021814	GAC	2	6	234229	234234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525836976
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4998	NC_021814	AT	3	6	234328	234333	50 %	50 %	0 %	0 %	525836976
4999	NC_021814	TGA	2	6	234356	234361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525836977
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